Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F6L9

Protein Details
Accession A0A178F6L9    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-156NTTNTQKEHKEQQKEQKEQKELKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-247GSRKKADPATSEKKKATDGSRKSAR
290-298EKEKPAGSR
324-343ARRGGRSGGPRGGAREGGSR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 5.833, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008233  F:peptidase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MPVFSYAQAAKGLASDSNSKQTPTPPSVEETGTTTASTSTTTMVDGDDAGKAVSASPSLGLSASTASTLVKEDDLSTTTPNGTTTATASESEWEKQSQASTAADNKEKSAGSSSSTAPLADDEKPKSEASWENTTNTQKEHKEQQKEQKEQKELKAAPPPAVNIWQQRQEALEAKAKANALKPAATTTATTTASTTTPPTTTTKNTSTQTPSGDVRSEHYKGGSRKKADPATSEKKKATDGSRKSARPARQDAESLPPVNDASSWPTPQTAQGEDLRKAQDQADKPERPEKEKPAGSRAHGKEKWMPVPYVPTAVFNTPLPPAARRGGRSGGPRGGAREGGSRGGAHAGGDRATTTTSTSKPSSAGEREKGDATESAQKSTTAADASLKNGDVAAPAEATKDNRPVQNSINTAATTSSDPTSSSQSPTRPHQSKSYHKSHEDSSSSYKNAHADQHASRQANSDSHAGGHSRYANHDRRFDMGARSGEFFKDYQPRGDRDFSKDREYSREYTRESRSERGGRGGYRGGRGGHSNYNNTNNTTSTTQTSSASASSSYHSAPIPQHPFPSSKTYNNFSDRHRIQPSANGTQQQQQQQQPHSSTTTNNRLNMRSPSMPNPGIFPAPYPIQTDMNILYPYPHALPAGPMTAMSYQPYMEHYSLMGTISMQLEYYFSVDNLCKDLFLRRHMDSQGYVLLSVIASFKRIKSLTEDMELLRFVCRQLRNVEYRPGEDGVDRLRKREEWAQWVLSMDERDPSARNEGPSSATAQEYIPQHQQAHMNGHAHAHAHAHVHGKGTYVNTNYVPADNSYSADEPKRSAKLSSAAPEFSPLSANGHTPSFEQGTSAPVDAQGQGQGQVQRADGSNFVAVQNVGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.2
3 0.22
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.32
8 0.37
9 0.42
10 0.41
11 0.43
12 0.37
13 0.41
14 0.43
15 0.42
16 0.37
17 0.33
18 0.31
19 0.27
20 0.24
21 0.2
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.18
77 0.2
78 0.21
79 0.22
80 0.21
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.2
88 0.25
89 0.3
90 0.34
91 0.33
92 0.32
93 0.33
94 0.32
95 0.29
96 0.28
97 0.24
98 0.22
99 0.24
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.22
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.2
108 0.25
109 0.24
110 0.26
111 0.29
112 0.29
113 0.28
114 0.3
115 0.32
116 0.32
117 0.38
118 0.37
119 0.38
120 0.43
121 0.48
122 0.44
123 0.41
124 0.42
125 0.37
126 0.41
127 0.49
128 0.52
129 0.57
130 0.64
131 0.72
132 0.75
133 0.81
134 0.84
135 0.83
136 0.83
137 0.8
138 0.77
139 0.76
140 0.68
141 0.65
142 0.66
143 0.58
144 0.53
145 0.48
146 0.43
147 0.36
148 0.38
149 0.35
150 0.33
151 0.37
152 0.4
153 0.38
154 0.37
155 0.36
156 0.35
157 0.35
158 0.32
159 0.33
160 0.29
161 0.29
162 0.31
163 0.31
164 0.3
165 0.29
166 0.3
167 0.25
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.2
174 0.18
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.17
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.18
187 0.2
188 0.24
189 0.29
190 0.32
191 0.36
192 0.38
193 0.41
194 0.44
195 0.43
196 0.41
197 0.39
198 0.36
199 0.32
200 0.33
201 0.28
202 0.25
203 0.29
204 0.28
205 0.25
206 0.26
207 0.3
208 0.34
209 0.44
210 0.49
211 0.47
212 0.51
213 0.59
214 0.63
215 0.59
216 0.58
217 0.57
218 0.6
219 0.63
220 0.63
221 0.57
222 0.52
223 0.51
224 0.52
225 0.51
226 0.51
227 0.49
228 0.53
229 0.6
230 0.59
231 0.63
232 0.64
233 0.62
234 0.6
235 0.61
236 0.54
237 0.49
238 0.5
239 0.45
240 0.45
241 0.42
242 0.35
243 0.28
244 0.25
245 0.22
246 0.2
247 0.18
248 0.12
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.17
255 0.2
256 0.22
257 0.17
258 0.18
259 0.23
260 0.26
261 0.27
262 0.3
263 0.29
264 0.27
265 0.27
266 0.27
267 0.28
268 0.27
269 0.35
270 0.4
271 0.4
272 0.43
273 0.49
274 0.49
275 0.49
276 0.52
277 0.5
278 0.5
279 0.53
280 0.53
281 0.53
282 0.54
283 0.5
284 0.53
285 0.5
286 0.51
287 0.47
288 0.48
289 0.47
290 0.49
291 0.52
292 0.44
293 0.41
294 0.32
295 0.36
296 0.33
297 0.29
298 0.24
299 0.2
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.15
304 0.15
305 0.12
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.16
310 0.19
311 0.22
312 0.22
313 0.26
314 0.26
315 0.29
316 0.33
317 0.35
318 0.33
319 0.32
320 0.31
321 0.29
322 0.28
323 0.24
324 0.21
325 0.2
326 0.18
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.13
332 0.11
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.1
344 0.11
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.21
351 0.24
352 0.28
353 0.28
354 0.29
355 0.3
356 0.3
357 0.28
358 0.24
359 0.19
360 0.16
361 0.22
362 0.2
363 0.2
364 0.19
365 0.19
366 0.18
367 0.18
368 0.17
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.1
388 0.15
389 0.17
390 0.19
391 0.21
392 0.23
393 0.25
394 0.29
395 0.29
396 0.25
397 0.24
398 0.21
399 0.2
400 0.17
401 0.15
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.14
409 0.13
410 0.15
411 0.17
412 0.2
413 0.23
414 0.28
415 0.36
416 0.35
417 0.36
418 0.42
419 0.47
420 0.54
421 0.59
422 0.63
423 0.59
424 0.57
425 0.57
426 0.52
427 0.5
428 0.42
429 0.37
430 0.33
431 0.31
432 0.29
433 0.28
434 0.26
435 0.21
436 0.21
437 0.21
438 0.17
439 0.18
440 0.19
441 0.25
442 0.29
443 0.28
444 0.27
445 0.27
446 0.27
447 0.23
448 0.24
449 0.19
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.12
454 0.1
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.14
459 0.22
460 0.29
461 0.32
462 0.36
463 0.34
464 0.35
465 0.37
466 0.35
467 0.3
468 0.27
469 0.25
470 0.22
471 0.23
472 0.21
473 0.19
474 0.18
475 0.16
476 0.15
477 0.2
478 0.2
479 0.25
480 0.28
481 0.3
482 0.33
483 0.39
484 0.37
485 0.37
486 0.44
487 0.41
488 0.44
489 0.44
490 0.41
491 0.42
492 0.44
493 0.4
494 0.38
495 0.41
496 0.38
497 0.42
498 0.45
499 0.45
500 0.45
501 0.44
502 0.45
503 0.45
504 0.43
505 0.41
506 0.4
507 0.34
508 0.33
509 0.34
510 0.29
511 0.26
512 0.27
513 0.23
514 0.21
515 0.22
516 0.23
517 0.25
518 0.26
519 0.27
520 0.28
521 0.34
522 0.34
523 0.34
524 0.32
525 0.25
526 0.25
527 0.24
528 0.22
529 0.18
530 0.19
531 0.18
532 0.17
533 0.17
534 0.15
535 0.14
536 0.13
537 0.11
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.1
544 0.13
545 0.14
546 0.21
547 0.26
548 0.25
549 0.27
550 0.27
551 0.3
552 0.3
553 0.36
554 0.33
555 0.33
556 0.37
557 0.4
558 0.44
559 0.48
560 0.48
561 0.43
562 0.49
563 0.45
564 0.48
565 0.47
566 0.43
567 0.38
568 0.42
569 0.45
570 0.41
571 0.42
572 0.37
573 0.35
574 0.39
575 0.43
576 0.43
577 0.43
578 0.41
579 0.45
580 0.47
581 0.5
582 0.46
583 0.44
584 0.4
585 0.35
586 0.34
587 0.36
588 0.41
589 0.4
590 0.42
591 0.43
592 0.42
593 0.45
594 0.45
595 0.43
596 0.38
597 0.37
598 0.38
599 0.41
600 0.41
601 0.37
602 0.35
603 0.32
604 0.28
605 0.25
606 0.2
607 0.17
608 0.16
609 0.17
610 0.17
611 0.18
612 0.18
613 0.19
614 0.2
615 0.18
616 0.19
617 0.18
618 0.15
619 0.14
620 0.12
621 0.14
622 0.12
623 0.12
624 0.09
625 0.09
626 0.11
627 0.11
628 0.12
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.11
633 0.12
634 0.11
635 0.1
636 0.09
637 0.1
638 0.13
639 0.15
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.13
644 0.14
645 0.13
646 0.11
647 0.07
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.08
652 0.07
653 0.07
654 0.08
655 0.09
656 0.07
657 0.07
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.14
662 0.13
663 0.12
664 0.13
665 0.21
666 0.22
667 0.26
668 0.31
669 0.3
670 0.36
671 0.37
672 0.39
673 0.32
674 0.3
675 0.28
676 0.23
677 0.21
678 0.15
679 0.14
680 0.11
681 0.11
682 0.1
683 0.06
684 0.09
685 0.1
686 0.11
687 0.17
688 0.18
689 0.18
690 0.24
691 0.31
692 0.32
693 0.33
694 0.35
695 0.29
696 0.3
697 0.29
698 0.23
699 0.17
700 0.15
701 0.13
702 0.18
703 0.19
704 0.22
705 0.27
706 0.34
707 0.41
708 0.45
709 0.52
710 0.48
711 0.48
712 0.47
713 0.43
714 0.36
715 0.29
716 0.27
717 0.26
718 0.34
719 0.32
720 0.31
721 0.34
722 0.34
723 0.39
724 0.45
725 0.44
726 0.42
727 0.48
728 0.47
729 0.45
730 0.44
731 0.4
732 0.34
733 0.28
734 0.21
735 0.17
736 0.15
737 0.16
738 0.17
739 0.18
740 0.22
741 0.24
742 0.26
743 0.26
744 0.27
745 0.28
746 0.27
747 0.28
748 0.23
749 0.21
750 0.2
751 0.17
752 0.21
753 0.2
754 0.24
755 0.25
756 0.27
757 0.28
758 0.3
759 0.35
760 0.34
761 0.37
762 0.38
763 0.35
764 0.32
765 0.33
766 0.31
767 0.27
768 0.24
769 0.19
770 0.16
771 0.17
772 0.19
773 0.22
774 0.22
775 0.24
776 0.23
777 0.23
778 0.23
779 0.25
780 0.27
781 0.25
782 0.27
783 0.25
784 0.28
785 0.27
786 0.26
787 0.24
788 0.2
789 0.23
790 0.21
791 0.21
792 0.22
793 0.23
794 0.25
795 0.28
796 0.28
797 0.26
798 0.31
799 0.35
800 0.33
801 0.32
802 0.34
803 0.35
804 0.4
805 0.44
806 0.42
807 0.39
808 0.38
809 0.4
810 0.36
811 0.31
812 0.26
813 0.19
814 0.19
815 0.19
816 0.21
817 0.19
818 0.19
819 0.2
820 0.19
821 0.23
822 0.21
823 0.19
824 0.19
825 0.17
826 0.19
827 0.2
828 0.2
829 0.15
830 0.14
831 0.15
832 0.15
833 0.15
834 0.15
835 0.14
836 0.15
837 0.19
838 0.21
839 0.23
840 0.24
841 0.23
842 0.23
843 0.24
844 0.24
845 0.21
846 0.2
847 0.19
848 0.18
849 0.18
850 0.17