FuNGI

A0A178F9J5

Protein Details

Accession

A0A178F9J5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-51	GPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQ	Hydrophilic
544-565	SGTDSSRKKPKNKHLSAQISNS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-46	VRRRPKPADPLVRPKKRPIPRP
525-535	KRAQAAARKRP
551-553	KKP

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSTTPPNPPLGRTPPGGPNGPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGQPQPQGQSQGYGQGQVRSTTANGTSTLPLQPPRHQPPASTLPQPRPIPSADDLTTNGFSGPLLSETYSDYPLVTTKRALREGLRHHIAKLISKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTTASAGNEKEDANPRRGFRDPYAGLTEAERQEMEAKKEARAKEREDNLAQIAPSVNSGPKKVNAPKQRTQQVFKSIITPEEAAKSQIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGKYEAAMSETYATFVLERSGKMRMIPIDKWYKFTAKNQFKVLTIEEAEKHMARKIRDPRWFMEKEQARAQERELQRYARQRKIYTGQSRNAPVTDRFEGDDMDFDEDRFADDEEHVGLFDDDEDAKTAEKRIKQDQLKANIFDLKDEKDYDEEEHLEKKQKEDLKSFGKQVRKALQRREKNYDYSSGSDANPYSDDESTDESELERQKEEQKKSEEDPKRKDNQADKPSGTSTKGTNTPSGRNKHTDPLKRAQAAARKRPGSPNLSDASGTDSSRKKPKNKHLSAQISNSQPTSRPISPVPQAQRKSSGTANANDATPSTAQTAAGAKKRIRTGPGKAGSASDVEKAANSGAEMSDSTMAKRMKLNVPAAKSKTGTPIGSRAGSPTPAGKAVAGSRASSPESSRGVSTPSGSGSRRGSVSGANPGAGAPPPASFPTASEIHAAIPASGILSNDLLRMFRSRLGNSRENHRRFIGIVKDVSVFGKEDKLLRPGVIKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.47
3	0.51
4	0.53
5	0.45
6	0.43
7	0.43
8	0.44
9	0.44
10	0.41
11	0.47
12	0.5
13	0.55
14	0.6
15	0.63
16	0.65
17	0.7
18	0.76
19	0.76
20	0.77
21	0.82
22	0.83
23	0.86
24	0.84
25	0.84
26	0.84
27	0.82
28	0.83
29	0.82
30	0.81
31	0.79
32	0.83
33	0.78
34	0.79
35	0.76
36	0.76
37	0.72
38	0.68
39	0.64
40	0.6
41	0.61
42	0.56
43	0.5
44	0.44
45	0.38
46	0.4
47	0.35
48	0.36
49	0.32
50	0.3
51	0.31
52	0.28
53	0.28
54	0.22
55	0.22
56	0.21
57	0.21
58	0.18
59	0.18
60	0.19
61	0.2
62	0.2
63	0.23
64	0.22
65	0.28
66	0.31
67	0.36
68	0.44
69	0.5
70	0.57
71	0.55
72	0.53
73	0.54
74	0.59
75	0.56
76	0.55
77	0.54
78	0.52
79	0.61
80	0.61
81	0.55
82	0.5
83	0.46
84	0.43
85	0.39
86	0.38
87	0.3
88	0.3
89	0.29
90	0.3
91	0.29
92	0.24
93	0.21
94	0.14
95	0.13
96	0.12
97	0.11
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.13
103	0.16
104	0.16
105	0.15
106	0.14
107	0.13
108	0.17
109	0.19
110	0.17
111	0.19
112	0.24
113	0.31
114	0.34
115	0.36
116	0.37
117	0.43
118	0.49
119	0.54
120	0.55
121	0.5
122	0.47
123	0.49
124	0.46
125	0.45
126	0.45
127	0.42
128	0.39
129	0.4
130	0.44
131	0.49
132	0.56
133	0.52
134	0.49
135	0.49
136	0.54
137	0.56
138	0.54
139	0.5
140	0.48
141	0.45
142	0.46
143	0.45
144	0.45
145	0.52
146	0.57
147	0.62
148	0.65
149	0.74
150	0.75
151	0.73
152	0.71
153	0.65
154	0.61
155	0.52
156	0.45
157	0.4
158	0.34
159	0.34
160	0.27
161	0.25
162	0.23
163	0.21
164	0.22
165	0.27
166	0.29
167	0.31
168	0.36
169	0.36
170	0.39
171	0.42
172	0.43
173	0.36
174	0.43
175	0.39
176	0.38
177	0.41
178	0.38
179	0.34
180	0.31
181	0.33
182	0.24
183	0.24
184	0.19
185	0.15
186	0.2
187	0.23
188	0.25
189	0.26
190	0.27
191	0.31
192	0.37
193	0.4
194	0.43
195	0.45
196	0.48
197	0.5
198	0.54
199	0.55
200	0.51
201	0.5
202	0.43
203	0.39
204	0.33
205	0.25
206	0.2
207	0.14
208	0.13
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.14
213	0.16
214	0.18
215	0.25
216	0.32
217	0.4
218	0.47
219	0.54
220	0.6
221	0.67
222	0.73
223	0.71
224	0.69
225	0.66
226	0.65
227	0.61
228	0.54
229	0.49
230	0.41
231	0.36
232	0.33
233	0.27
234	0.2
235	0.18
236	0.18
237	0.16
238	0.18
239	0.17
240	0.16
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.17
245	0.2
246	0.19
247	0.21
248	0.2
249	0.19
250	0.18
251	0.18
252	0.16
253	0.14
254	0.17
255	0.18
256	0.19
257	0.18
258	0.19
259	0.2
260	0.2
261	0.19
262	0.16
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.09
278	0.08
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.15
285	0.17
286	0.2
287	0.21
288	0.26
289	0.34
290	0.34
291	0.37
292	0.36
293	0.37
294	0.36
295	0.42
296	0.46
297	0.45
298	0.48
299	0.5
300	0.49
301	0.45
302	0.45
303	0.39
304	0.3
305	0.23
306	0.21
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.18
314	0.17
315	0.25
316	0.33
317	0.4
318	0.47
319	0.49
320	0.49
321	0.54
322	0.55
323	0.48
324	0.49
325	0.45
326	0.4
327	0.42
328	0.45
329	0.4
330	0.38
331	0.39
332	0.37
333	0.34
334	0.37
335	0.34
336	0.3
337	0.32
338	0.41
339	0.47
340	0.46
341	0.49
342	0.44
343	0.47
344	0.51
345	0.55
346	0.55
347	0.54
348	0.51
349	0.5
350	0.51
351	0.47
352	0.42
353	0.35
354	0.26
355	0.25
356	0.22
357	0.19
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.14
362	0.14
363	0.1
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.12
391	0.15
392	0.18
393	0.24
394	0.32
395	0.35
396	0.43
397	0.48
398	0.53
399	0.53
400	0.51
401	0.46
402	0.41
403	0.37
404	0.31
405	0.26
406	0.19
407	0.17
408	0.17
409	0.16
410	0.13
411	0.15
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.13
416	0.15
417	0.16
418	0.23
419	0.22
420	0.22
421	0.27
422	0.3
423	0.33
424	0.34
425	0.39
426	0.39
427	0.42
428	0.46
429	0.45
430	0.46
431	0.45
432	0.47
433	0.49
434	0.51
435	0.54
436	0.59
437	0.64
438	0.66
439	0.7
440	0.73
441	0.68
442	0.64
443	0.6
444	0.54
445	0.47
446	0.41
447	0.37
448	0.3
449	0.27
450	0.23
451	0.21
452	0.17
453	0.15
454	0.13
455	0.13
456	0.11
457	0.11
458	0.1
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.15
465	0.17
466	0.17
467	0.15
468	0.15
469	0.23
470	0.32
471	0.36
472	0.39
473	0.41
474	0.44
475	0.47
476	0.56
477	0.57
478	0.58
479	0.61
480	0.63
481	0.65
482	0.65
483	0.68
484	0.67
485	0.68
486	0.67
487	0.66
488	0.58
489	0.54
490	0.52
491	0.47
492	0.41
493	0.32
494	0.25
495	0.23
496	0.27
497	0.26
498	0.3
499	0.3
500	0.37
501	0.43
502	0.47
503	0.47
504	0.47
505	0.47
506	0.5
507	0.56
508	0.57
509	0.55
510	0.58
511	0.61
512	0.57
513	0.57
514	0.53
515	0.53
516	0.53
517	0.56
518	0.56
519	0.51
520	0.52
521	0.57
522	0.58
523	0.55
524	0.49
525	0.45
526	0.38
527	0.37
528	0.34
529	0.28
530	0.27
531	0.23
532	0.21
533	0.21
534	0.23
535	0.26
536	0.36
537	0.43
538	0.46
539	0.55
540	0.65
541	0.71
542	0.76
543	0.8
544	0.81
545	0.84
546	0.8
547	0.76
548	0.71
549	0.63
550	0.56
551	0.49
552	0.39
553	0.31
554	0.28
555	0.29
556	0.25
557	0.24
558	0.25
559	0.3
560	0.33
561	0.4
562	0.45
563	0.47
564	0.48
565	0.48
566	0.53
567	0.49
568	0.48
569	0.43
570	0.43
571	0.38
572	0.37
573	0.39
574	0.33
575	0.32
576	0.28
577	0.26
578	0.2
579	0.16
580	0.14
581	0.12
582	0.11
583	0.1
584	0.12
585	0.16
586	0.2
587	0.24
588	0.29
589	0.29
590	0.34
591	0.39
592	0.42
593	0.43
594	0.45
595	0.48
596	0.53
597	0.56
598	0.53
599	0.48
600	0.46
601	0.4
602	0.36
603	0.29
604	0.2
605	0.15
606	0.13
607	0.13
608	0.12
609	0.11
610	0.09
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.18
621	0.18
622	0.2
623	0.23
624	0.28
625	0.3
626	0.37
627	0.45
628	0.45
629	0.5
630	0.56
631	0.57
632	0.55
633	0.5
634	0.45
635	0.44
636	0.42
637	0.39
638	0.33
639	0.36
640	0.35
641	0.36
642	0.34
643	0.3
644	0.28
645	0.27
646	0.25
647	0.22
648	0.2
649	0.2
650	0.21
651	0.18
652	0.18
653	0.18
654	0.23
655	0.21
656	0.2
657	0.2
658	0.22
659	0.24
660	0.23
661	0.24
662	0.23
663	0.25
664	0.26
665	0.26
666	0.24
667	0.25
668	0.25
669	0.24
670	0.2
671	0.2
672	0.24
673	0.23
674	0.28
675	0.28
676	0.3
677	0.29
678	0.28
679	0.27
680	0.26
681	0.28
682	0.32
683	0.29
684	0.26
685	0.25
686	0.24
687	0.24
688	0.2
689	0.18
690	0.1
691	0.1
692	0.12
693	0.13
694	0.15
695	0.14
696	0.14
697	0.18
698	0.19
699	0.2
700	0.19
701	0.19
702	0.17
703	0.2
704	0.18
705	0.13
706	0.12
707	0.11
708	0.09
709	0.1
710	0.09
711	0.08
712	0.09
713	0.1
714	0.11
715	0.12
716	0.11
717	0.12
718	0.16
719	0.17
720	0.21
721	0.27
722	0.3
723	0.38
724	0.46
725	0.51
726	0.51
727	0.6
728	0.65
729	0.64
730	0.65
731	0.58
732	0.53
733	0.47
734	0.51
735	0.49
736	0.45
737	0.42
738	0.39
739	0.38
740	0.36
741	0.36
742	0.29
743	0.22
744	0.17
745	0.2
746	0.2
747	0.24
748	0.26
749	0.29
750	0.3
751	0.3
752	0.33

A0A178F9J5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer