Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EYW5

Protein Details
Accession A0A178EYW5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-281VGPGSEFEKKPKKAKKRRNKNKSGSKKWMLDDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-275KKPKKAKKRRNKNKSGSKK
Subcellular Location(s) plas 19, E.R. 5, mito 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSSCEGVDFINNEDVTFSWVIIVGGAWEAIAYGLRAAGAKNIYQKGFGLPHQILIALAPLWINAYVYMVLGRMVHFFLPDKRCFGISARRLTVIFVCLDVIAFLTQGASTSLLNSDTASTIKIGIDLCTFTSLTLQTIQLPNMSIDMGGIGLQELFILIFIGLAVRFQYKMAIVEQIEQSKGPWRPLLYTVYAALVLITIRIIYRLVEFSGGLHSAIATNEAAFYILDATPMFLALLALNIFHPGRFLVGPGSEFEKKPKKAKKRRNKNKSGSKKWMLDDDGQGHFQELPLNERV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.19
4 0.15
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.09
25 0.11
26 0.13
27 0.2
28 0.25
29 0.25
30 0.26
31 0.26
32 0.27
33 0.29
34 0.28
35 0.28
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.23
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.07
44 0.07
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.11
64 0.18
65 0.23
66 0.24
67 0.26
68 0.26
69 0.27
70 0.28
71 0.29
72 0.32
73 0.32
74 0.38
75 0.37
76 0.37
77 0.36
78 0.36
79 0.33
80 0.25
81 0.19
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.03
149 0.02
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.13
162 0.14
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.17
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.2
173 0.23
174 0.26
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.17
179 0.16
180 0.14
181 0.11
182 0.07
183 0.05
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.29
243 0.37
244 0.42
245 0.51
246 0.6
247 0.65
248 0.73
249 0.84
250 0.87
251 0.89
252 0.94
253 0.96
254 0.96
255 0.96
256 0.96
257 0.96
258 0.96
259 0.95
260 0.92
261 0.88
262 0.8
263 0.77
264 0.7
265 0.64
266 0.6
267 0.54
268 0.49
269 0.43
270 0.39
271 0.32
272 0.28
273 0.23
274 0.22
275 0.18