FuNGI

A0A178ER30

Protein Details

Accession

A0A178ER30

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1142-1161	KGSDKRTSSHRDSRNDKSAR	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.166, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MERARKRELRDLNALVWAGETDVFEVSKSLDSSLKKNTAFIKRLRTGITAAGLPTFITDVRSLSLHKYLSEIISAFYEGLCKLKTPGEIAAGVEIASAIHQRFGPDEFTKRLAWNLGRGLTSPDKAQLKAWTPEVREREEKERLSRHRVLLRVVTEFWLVGLLRSLDDVERPDDSMPKCKDSVPTLGGKSADGSSKPRQSAKPNQDRDEEPFPLEVLKDLLGYDREHVNLPLALLFARTYSWDILGIKTLEEGRKTVETNGTTTDTSKEAQGGTSGDEAGTNTAQLDDPLVSEKLQTRFKNVLNRYLEDVKKHVSRDQKALANQSRRNAEAYVKSGEILEDRQSNFEKQTKAHEKLVSNTQSLCEILGVEMPDLAEKDASDGSMSGSIGLVKTGEYLRGQGEGAGIWEDEEERRFYENLADFKGKVPAVLLEDGKKKKGDGDDQSKVKADPEGQNGTAALEGTSKPDSQAADSGVRETEESATTIANKSVGAQVDALLSKLPELANKEAVDQLALDFCFLNSKASRNRLIKAVQEVPKGRSDLLPLYARLVATLGQYLPDVPQGLITYLDDEFRSLQRRKQKEFLGQVRTSNIRYLAELTKFGVVPEHVIFHCFKVSLDEFSRMNIEIIGNLLENCGRYLLRNPETAPRMASFLETLGRKKSAQHLGQQERMIIENAMYYVDPPPRPAIQQKERTPMELYIRKLIYLDMNKRNYTKILKAIRKLHWEEPEASCYLYPSFYFFKDTNLVSGCQHPRAALYRYHQSFVIGVIDNVLERITIGLENNDFKFNQSRISEVKYLGELYNYKMVDSPVIFDTLYRIVTYGHEGGTPSPGKINPLDMPDDYFRIRLVCTILDTCGVCFDRGSAKKKLDFFLTFFQYYLHTKDPIPMDVDFVIQDTFALTRPQWKFAADFTEATKLFAEAVAQNYQVQETDKAPEPEDEAESSSSDEDIEDDGAPDIEEVSTDEAEVTANEPDDENESESEEEQIFVSRQEEERDPEAEAEFDRAFEKMVSESVESRKFERKTMFDVPLPMRRANLREPAQVEETKEPSPTPSSTMPFSLMTKRGNRQQTRTIDLPSDSSFAVAMKTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLGDDNDSNDGDSNSSPTHHFILRTNTNAKGSLKGSDKRTSSHRDSRNDKSARSGFRARKLQLSDVDWYE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.42
3	0.33
4	0.25
5	0.16
6	0.13
7	0.12
8	0.08
9	0.09
10	0.09
11	0.09
12	0.1
13	0.1
14	0.12
15	0.13
16	0.14
17	0.18
18	0.21
19	0.26
20	0.34
21	0.4
22	0.38
23	0.42
24	0.49
25	0.54
26	0.58
27	0.6
28	0.61
29	0.59
30	0.63
31	0.61
32	0.55
33	0.47
34	0.44
35	0.4
36	0.32
37	0.27
38	0.23
39	0.2
40	0.17
41	0.15
42	0.12
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.14
49	0.15
50	0.18
51	0.23
52	0.22
53	0.22
54	0.23
55	0.24
56	0.24
57	0.25
58	0.21
59	0.17
60	0.17
61	0.17
62	0.14
63	0.12
64	0.12
65	0.1
66	0.13
67	0.12
68	0.12
69	0.14
70	0.18
71	0.2
72	0.21
73	0.24
74	0.24
75	0.24
76	0.24
77	0.23
78	0.19
79	0.17
80	0.13
81	0.1
82	0.07
83	0.06
84	0.09
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.11
89	0.13
90	0.15
91	0.21
92	0.23
93	0.28
94	0.3
95	0.33
96	0.34
97	0.34
98	0.35
99	0.36
100	0.34
101	0.34
102	0.36
103	0.36
104	0.34
105	0.33
106	0.37
107	0.35
108	0.34
109	0.29
110	0.31
111	0.31
112	0.32
113	0.34
114	0.35
115	0.36
116	0.39
117	0.44
118	0.43
119	0.44
120	0.51
121	0.53
122	0.52
123	0.53
124	0.54
125	0.55
126	0.58
127	0.59
128	0.59
129	0.64
130	0.64
131	0.67
132	0.69
133	0.68
134	0.67
135	0.65
136	0.61
137	0.58
138	0.54
139	0.48
140	0.42
141	0.36
142	0.3
143	0.26
144	0.21
145	0.17
146	0.14
147	0.1
148	0.11
149	0.1
150	0.09
151	0.1
152	0.11
153	0.09
154	0.11
155	0.13
156	0.13
157	0.14
158	0.15
159	0.16
160	0.21
161	0.23
162	0.31
163	0.32
164	0.34
165	0.34
166	0.36
167	0.4
168	0.37
169	0.42
170	0.36
171	0.39
172	0.37
173	0.38
174	0.36
175	0.31
176	0.29
177	0.24
178	0.23
179	0.19
180	0.23
181	0.28
182	0.35
183	0.39
184	0.43
185	0.47
186	0.53
187	0.62
188	0.67
189	0.7
190	0.72
191	0.73
192	0.71
193	0.69
194	0.66
195	0.63
196	0.53
197	0.44
198	0.36
199	0.32
200	0.27
201	0.24
202	0.18
203	0.12
204	0.1
205	0.09
206	0.08
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.14
211	0.14
212	0.15
213	0.16
214	0.17
215	0.16
216	0.15
217	0.15
218	0.13
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.1
228	0.1
229	0.12
230	0.13
231	0.14
232	0.17
233	0.16
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.21
242	0.22
243	0.23
244	0.26
245	0.24
246	0.25
247	0.27
248	0.26
249	0.24
250	0.24
251	0.23
252	0.18
253	0.18
254	0.17
255	0.15
256	0.13
257	0.12
258	0.13
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.09
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.06
275	0.07
276	0.09
277	0.1
278	0.09
279	0.11
280	0.17
281	0.21
282	0.3
283	0.3
284	0.33
285	0.38
286	0.43
287	0.51
288	0.49
289	0.52
290	0.48
291	0.5
292	0.49
293	0.51
294	0.49
295	0.41
296	0.41
297	0.37
298	0.37
299	0.37
300	0.37
301	0.38
302	0.4
303	0.45
304	0.48
305	0.49
306	0.48
307	0.56
308	0.59
309	0.58
310	0.58
311	0.56
312	0.53
313	0.48
314	0.47
315	0.39
316	0.36
317	0.31
318	0.31
319	0.28
320	0.25
321	0.24
322	0.22
323	0.21
324	0.17
325	0.14
326	0.14
327	0.16
328	0.16
329	0.19
330	0.21
331	0.22
332	0.25
333	0.29
334	0.28
335	0.25
336	0.35
337	0.41
338	0.44
339	0.48
340	0.49
341	0.46
342	0.48
343	0.55
344	0.48
345	0.41
346	0.36
347	0.31
348	0.26
349	0.24
350	0.2
351	0.11
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.04
379	0.06
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.07
390	0.08
391	0.07
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.17
404	0.2
405	0.21
406	0.24
407	0.24
408	0.23
409	0.24
410	0.28
411	0.21
412	0.17
413	0.15
414	0.13
415	0.14
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.23
420	0.25
421	0.27
422	0.25
423	0.23
424	0.25
425	0.29
426	0.33
427	0.35
428	0.42
429	0.48
430	0.49
431	0.51
432	0.48
433	0.43
434	0.36
435	0.28
436	0.24
437	0.21
438	0.25
439	0.26
440	0.25
441	0.26
442	0.25
443	0.23
444	0.19
445	0.14
446	0.08
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.13
457	0.13
458	0.14
459	0.14
460	0.15
461	0.13
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.1
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.09
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.07
485	0.06
486	0.05
487	0.07
488	0.06
489	0.07
490	0.11
491	0.12
492	0.16
493	0.16
494	0.17
495	0.16
496	0.16
497	0.14
498	0.11
499	0.09
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.07
506	0.07
507	0.1
508	0.09
509	0.14
510	0.18
511	0.23
512	0.3
513	0.31
514	0.32
515	0.34
516	0.35
517	0.34
518	0.34
519	0.38
520	0.35
521	0.37
522	0.38
523	0.36
524	0.36
525	0.34
526	0.29
527	0.22
528	0.2
529	0.17
530	0.18
531	0.18
532	0.15
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.13
537	0.12
538	0.09
539	0.07
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.06
556	0.07
557	0.06
558	0.07
559	0.07
560	0.09
561	0.16
562	0.16
563	0.2
564	0.29
565	0.36
566	0.4
567	0.45
568	0.49
569	0.5
570	0.58
571	0.61
572	0.6
573	0.54
574	0.51
575	0.47
576	0.43
577	0.36
578	0.28
579	0.22
580	0.14
581	0.13
582	0.15
583	0.16
584	0.15
585	0.15
586	0.14
587	0.14
588	0.14
589	0.13
590	0.11
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.08
596	0.1
597	0.11
598	0.1
599	0.11
600	0.09
601	0.09
602	0.11
603	0.12
604	0.14
605	0.15
606	0.17
607	0.16
608	0.17
609	0.18
610	0.14
611	0.13
612	0.1
613	0.09
614	0.06
615	0.06
616	0.06
617	0.05
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.1
627	0.18
628	0.2
629	0.21
630	0.23
631	0.28
632	0.3
633	0.3
634	0.27
635	0.2
636	0.19
637	0.18
638	0.17
639	0.11
640	0.09
641	0.12
642	0.12
643	0.13
644	0.13
645	0.15
646	0.15
647	0.16
648	0.23
649	0.29
650	0.3
651	0.36
652	0.44
653	0.47
654	0.52
655	0.5
656	0.43
657	0.35
658	0.33
659	0.27
660	0.17
661	0.11
662	0.07
663	0.07
664	0.06
665	0.06
666	0.05
667	0.08
668	0.12
669	0.12
670	0.13
671	0.15
672	0.16
673	0.18
674	0.23
675	0.3
676	0.35
677	0.45
678	0.48
679	0.54
680	0.54
681	0.54
682	0.5
683	0.44
684	0.43
685	0.39
686	0.36
687	0.33
688	0.32
689	0.3
690	0.28
691	0.26
692	0.23
693	0.25
694	0.31
695	0.34
696	0.38
697	0.39
698	0.4
699	0.41
700	0.39
701	0.36
702	0.32
703	0.33
704	0.39
705	0.43
706	0.49
707	0.55
708	0.57
709	0.61
710	0.61
711	0.59
712	0.55
713	0.52
714	0.48
715	0.42
716	0.4
717	0.32
718	0.28
719	0.21
720	0.17
721	0.14
722	0.12
723	0.09
724	0.1
725	0.11
726	0.12
727	0.16
728	0.15
729	0.17
730	0.2
731	0.2
732	0.19
733	0.19
734	0.2
735	0.17
736	0.24
737	0.23
738	0.22
739	0.22
740	0.19
741	0.2
742	0.23
743	0.25
744	0.23
745	0.24
746	0.32
747	0.33
748	0.34
749	0.32
750	0.28
751	0.26
752	0.22
753	0.21
754	0.12
755	0.1
756	0.1
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.08
761	0.04
762	0.03
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.05
767	0.06
768	0.08
769	0.11
770	0.12
771	0.13
772	0.13
773	0.14
774	0.19
775	0.18
776	0.22
777	0.21
778	0.23
779	0.24
780	0.29
781	0.3
782	0.26
783	0.26
784	0.21
785	0.23
786	0.19
787	0.19
788	0.15
789	0.15
790	0.19
791	0.18
792	0.17
793	0.17
794	0.17
795	0.17
796	0.16
797	0.16
798	0.11
799	0.13
800	0.12
801	0.11
802	0.13
803	0.12
804	0.12
805	0.1
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.14
810	0.12
811	0.11
812	0.11
813	0.12
814	0.12
815	0.17
816	0.17
817	0.14
818	0.15
819	0.15
820	0.17
821	0.17
822	0.21
823	0.18
824	0.2
825	0.22
826	0.2
827	0.23
828	0.22
829	0.24
830	0.21
831	0.19
832	0.16
833	0.15
834	0.14
835	0.12
836	0.13
837	0.11
838	0.12
839	0.13
840	0.13
841	0.14
842	0.14
843	0.13
844	0.15
845	0.15
846	0.13
847	0.12
848	0.13
849	0.2
850	0.26
851	0.32
852	0.34
853	0.38
854	0.43
855	0.46
856	0.47
857	0.44
858	0.41
859	0.39
860	0.39
861	0.4
862	0.35
863	0.32
864	0.3
865	0.26
866	0.26
867	0.26
868	0.22
869	0.19
870	0.19
871	0.24
872	0.25
873	0.24
874	0.25
875	0.21
876	0.21
877	0.19
878	0.2
879	0.15
880	0.13
881	0.11
882	0.08
883	0.08
884	0.06
885	0.06
886	0.07
887	0.09
888	0.08
889	0.17
890	0.19
891	0.23
892	0.24
893	0.24
894	0.25
895	0.25
896	0.31
897	0.24
898	0.23
899	0.22
900	0.28
901	0.27
902	0.26
903	0.24
904	0.19
905	0.16
906	0.15
907	0.15
908	0.09
909	0.13
910	0.13
911	0.13
912	0.14
913	0.14
914	0.14
915	0.14
916	0.14
917	0.13
918	0.13
919	0.16
920	0.21
921	0.23
922	0.24
923	0.24
924	0.25
925	0.24
926	0.25
927	0.22
928	0.18
929	0.17
930	0.17
931	0.16
932	0.14
933	0.12
934	0.1
935	0.09
936	0.07
937	0.08
938	0.08
939	0.08
940	0.08
941	0.08
942	0.08
943	0.08
944	0.07
945	0.07
946	0.05
947	0.05
948	0.06
949	0.08
950	0.07
951	0.07
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.08
956	0.08
957	0.07
958	0.07
959	0.08
960	0.08
961	0.09
962	0.12
963	0.13
964	0.14
965	0.13
966	0.14
967	0.15
968	0.15
969	0.16
970	0.13
971	0.12
972	0.11
973	0.12
974	0.11
975	0.11
976	0.12
977	0.12
978	0.14
979	0.17
980	0.2
981	0.23
982	0.26
983	0.26
984	0.26
985	0.25
986	0.24
987	0.21
988	0.18
989	0.17
990	0.14
991	0.14
992	0.13
993	0.12
994	0.12
995	0.11
996	0.12
997	0.09
998	0.11
999	0.12
1000	0.13
1001	0.17
1002	0.23
1003	0.29
1004	0.29
1005	0.32
1006	0.4
1007	0.39
1008	0.43
1009	0.47
1010	0.45
1011	0.47
1012	0.53
1013	0.54
1014	0.48
1015	0.54
1016	0.53
1017	0.53
1018	0.53
1019	0.46
1020	0.41
1021	0.4
1022	0.42
1023	0.41
1024	0.46
1025	0.42
1026	0.45
1027	0.46
1028	0.48
1029	0.49
1030	0.47
1031	0.45
1032	0.41
1033	0.39
1034	0.34
1035	0.33
1036	0.29
1037	0.27
1038	0.29
1039	0.26
1040	0.25
1041	0.27
1042	0.29
1043	0.3
1044	0.32
1045	0.31
1046	0.28
1047	0.3
1048	0.32
1049	0.31
1050	0.35
1051	0.4
1052	0.45
1053	0.51
1054	0.59
1055	0.63
1056	0.64
1057	0.69
1058	0.69
1059	0.69
1060	0.66
1061	0.61
1062	0.54
1063	0.48
1064	0.44
1065	0.37
1066	0.32
1067	0.24
1068	0.21
1069	0.18
1070	0.14
1071	0.14
1072	0.12
1073	0.13
1074	0.16
1075	0.2
1076	0.23
1077	0.27
1078	0.29
1079	0.33
1080	0.38
1081	0.45
1082	0.44
1083	0.49
1084	0.52
1085	0.54
1086	0.6
1087	0.57
1088	0.54
1089	0.5
1090	0.47
1091	0.42
1092	0.39
1093	0.35
1094	0.27
1095	0.28
1096	0.25
1097	0.2
1098	0.22
1099	0.17
1100	0.16
1101	0.17
1102	0.16
1103	0.14
1104	0.14
1105	0.14
1106	0.13
1107	0.13
1108	0.15
1109	0.13
1110	0.15
1111	0.16
1112	0.18
1113	0.22
1114	0.23
1115	0.25
1116	0.26
1117	0.35
1118	0.4
1119	0.45
1120	0.46
1121	0.47
1122	0.46
1123	0.49
1124	0.45
1125	0.42
1126	0.37
1127	0.37
1128	0.41
1129	0.43
1130	0.47
1131	0.5
1132	0.51
1133	0.5
1134	0.56
1135	0.58
1136	0.6
1137	0.63
1138	0.66
1139	0.67
1140	0.73
1141	0.78
1142	0.8
1143	0.77
1144	0.68
1145	0.68
1146	0.68
1147	0.65
1148	0.65
1149	0.66
1150	0.63
1151	0.68
1152	0.76
1153	0.69
1154	0.69
1155	0.67
1156	0.66
1157	0.63
1158	0.59

A0A178ER30

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer