FuNGI

A0A178EZN5

Protein Details

Accession

A0A178EZN5

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-58	SGAVPVQQPSKKKKKKRSKGAKGGDEYDA	Hydrophilic
304-342	IKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAREE	Basic
361-388	VQKAEKSKKVKREEKYKRAKQERMEKRA	Basic
396-425	AEQDEEKKEKKEKKKEKTEKKLKPEEKEEE	Acidic
566-585	KSEARKMKILEKNQKLKEER	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-51	SKKKKKKRSKGAK
299-343	KSSKKIKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAREEA
362-419	QKAEKSKKVKREEKYKRAKQERMEKRAKLAEEEKAEQDEEKKEKKEKKKEKTEKKLKP
564-587	GSKSEARKMKILEKNQKLKEERAR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032704 Cms1 IPR034228 Nop6_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF14617 CMS1 PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12400 RRM_Nop6

Amino Acid Sequences

MAASVTLQDMPAGSNKRKRVEEEDGAENTSGAVPVQQPSKKKKKKRSKGAKGGDEYDANKVMGKDGGIDESIGKMDGKLLGDYFVQRIKRHNKNLTAVELDDFYIPEHAFLDTSSWESSRELDNMPSFLKAFSPGKGESLSKASEVKGSPHTLVVTLAGLRAAEITRIGIGIGTPVRLNDLVNSGSLKLDSLKRIVVDGSYVDQKKRGIFDMKELHFPLMEFLNRAELRERYQSKKSDKVQIIGMQTSSKAFLGATVLDYPILPRVYRRDITATIMGDKRKRDEAAVDENDGAVVDLGKSSKKIKSGDKEKVKKERKTKKDKKEKKEKKKLEKELKKKAREEANGAAGEGKMEVDGEPNGVQKAEKSKKVKREEKYKRAKQERMEKRAKLAEEEKAEQDEEKKEKKEKKKEKTEKKLKPEEKEEEQEENGVNGAKAEEEQSAPAAPADTETPAENGTEEAAEGAVGDAEMEEARKSQRFIVFISNLPYTATQESVTKHFEKLQPTSVRVPLERGGKKGRGFAFVEFAGFDRMKTCLKQYHGTMFEDGDKPARKIKVELTAGGGGSKSEARKMKILEKNQKLKEERARDAQEAKRAKTASATTNGAGTSAADDQSHIHPSRRARVPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.43
3	0.51
4	0.55
5	0.6
6	0.62
7	0.64
8	0.66
9	0.63
10	0.63
11	0.58
12	0.55
13	0.49
14	0.4
15	0.31
16	0.22
17	0.17
18	0.1
19	0.1
20	0.09
21	0.13
22	0.21
23	0.25
24	0.33
25	0.43
26	0.55
27	0.63
28	0.72
29	0.8
30	0.84
31	0.9
32	0.94
33	0.95
34	0.95
35	0.96
36	0.96
37	0.95
38	0.9
39	0.82
40	0.75
41	0.68
42	0.58
43	0.52
44	0.43
45	0.33
46	0.29
47	0.25
48	0.22
49	0.19
50	0.17
51	0.15
52	0.14
53	0.16
54	0.14
55	0.14
56	0.13
57	0.12
58	0.13
59	0.11
60	0.1
61	0.08
62	0.09
63	0.12
64	0.12
65	0.13
66	0.12
67	0.13
68	0.14
69	0.16
70	0.17
71	0.19
72	0.22
73	0.23
74	0.32
75	0.41
76	0.5
77	0.59
78	0.65
79	0.68
80	0.72
81	0.75
82	0.7
83	0.64
84	0.54
85	0.45
86	0.37
87	0.3
88	0.22
89	0.17
90	0.13
91	0.12
92	0.11
93	0.1
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.1
99	0.08
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.12
104	0.13
105	0.15
106	0.16
107	0.17
108	0.17
109	0.2
110	0.21
111	0.22
112	0.22
113	0.21
114	0.18
115	0.16
116	0.15
117	0.16
118	0.16
119	0.16
120	0.2
121	0.2
122	0.21
123	0.23
124	0.23
125	0.21
126	0.23
127	0.22
128	0.19
129	0.2
130	0.19
131	0.21
132	0.21
133	0.23
134	0.24
135	0.26
136	0.25
137	0.24
138	0.24
139	0.2
140	0.19
141	0.16
142	0.12
143	0.09
144	0.09
145	0.07
146	0.07
147	0.06
148	0.07
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.09
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.13
177	0.14
178	0.15
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.17
183	0.14
184	0.11
185	0.1
186	0.11
187	0.17
188	0.18
189	0.18
190	0.2
191	0.21
192	0.23
193	0.24
194	0.26
195	0.26
196	0.25
197	0.33
198	0.4
199	0.4
200	0.42
201	0.41
202	0.37
203	0.3
204	0.29
205	0.22
206	0.15
207	0.14
208	0.1
209	0.1
210	0.17
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.18
215	0.21
216	0.29
217	0.34
218	0.32
219	0.38
220	0.45
221	0.48
222	0.56
223	0.58
224	0.58
225	0.56
226	0.53
227	0.51
228	0.48
229	0.44
230	0.36
231	0.31
232	0.22
233	0.2
234	0.18
235	0.14
236	0.09
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.09
252	0.14
253	0.2
254	0.21
255	0.22
256	0.23
257	0.24
258	0.27
259	0.29
260	0.24
261	0.22
262	0.24
263	0.26
264	0.25
265	0.25
266	0.24
267	0.24
268	0.24
269	0.22
270	0.22
271	0.24
272	0.29
273	0.3
274	0.28
275	0.25
276	0.24
277	0.23
278	0.2
279	0.14
280	0.05
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.08
288	0.11
289	0.15
290	0.19
291	0.26
292	0.35
293	0.44
294	0.52
295	0.6
296	0.66
297	0.69
298	0.76
299	0.78
300	0.76
301	0.77
302	0.78
303	0.78
304	0.82
305	0.85
306	0.86
307	0.88
308	0.91
309	0.91
310	0.92
311	0.93
312	0.93
313	0.94
314	0.93
315	0.93
316	0.93
317	0.93
318	0.93
319	0.92
320	0.9
321	0.9
322	0.9
323	0.86
324	0.78
325	0.74
326	0.71
327	0.64
328	0.59
329	0.51
330	0.47
331	0.39
332	0.36
333	0.3
334	0.21
335	0.18
336	0.13
337	0.09
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.18
351	0.22
352	0.29
353	0.36
354	0.43
355	0.52
356	0.63
357	0.7
358	0.68
359	0.74
360	0.78
361	0.81
362	0.85
363	0.84
364	0.85
365	0.85
366	0.84
367	0.81
368	0.81
369	0.8
370	0.79
371	0.79
372	0.7
373	0.65
374	0.64
375	0.56
376	0.51
377	0.44
378	0.4
379	0.36
380	0.37
381	0.33
382	0.29
383	0.28
384	0.24
385	0.23
386	0.23
387	0.25
388	0.28
389	0.32
390	0.38
391	0.48
392	0.57
393	0.66
394	0.7
395	0.75
396	0.81
397	0.88
398	0.91
399	0.93
400	0.94
401	0.93
402	0.92
403	0.92
404	0.88
405	0.84
406	0.82
407	0.78
408	0.73
409	0.69
410	0.63
411	0.55
412	0.48
413	0.42
414	0.34
415	0.27
416	0.2
417	0.15
418	0.11
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.07
424	0.08
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.07
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.08
443	0.07
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.02
455	0.03
456	0.03
457	0.04
458	0.04
459	0.06
460	0.09
461	0.11
462	0.12
463	0.17
464	0.21
465	0.22
466	0.24
467	0.31
468	0.31
469	0.31
470	0.34
471	0.29
472	0.25
473	0.25
474	0.23
475	0.18
476	0.17
477	0.16
478	0.13
479	0.15
480	0.17
481	0.2
482	0.24
483	0.23
484	0.24
485	0.29
486	0.32
487	0.36
488	0.38
489	0.43
490	0.43
491	0.46
492	0.49
493	0.47
494	0.46
495	0.41
496	0.41
497	0.37
498	0.41
499	0.4
500	0.4
501	0.43
502	0.46
503	0.47
504	0.51
505	0.48
506	0.44
507	0.43
508	0.4
509	0.37
510	0.31
511	0.29
512	0.22
513	0.2
514	0.19
515	0.17
516	0.16
517	0.12
518	0.15
519	0.17
520	0.18
521	0.23
522	0.25
523	0.3
524	0.36
525	0.39
526	0.46
527	0.47
528	0.48
529	0.44
530	0.39
531	0.39
532	0.35
533	0.31
534	0.29
535	0.29
536	0.28
537	0.33
538	0.35
539	0.32
540	0.34
541	0.39
542	0.42
543	0.42
544	0.42
545	0.4
546	0.38
547	0.36
548	0.33
549	0.27
550	0.17
551	0.16
552	0.18
553	0.14
554	0.19
555	0.24
556	0.27
557	0.33
558	0.38
559	0.46
560	0.52
561	0.61
562	0.65
563	0.7
564	0.77
565	0.78
566	0.82
567	0.77
568	0.77
569	0.77
570	0.75
571	0.71
572	0.71
573	0.7
574	0.66
575	0.7
576	0.67
577	0.66
578	0.64
579	0.6
580	0.57
581	0.52
582	0.48
583	0.46
584	0.45
585	0.42
586	0.41
587	0.42
588	0.35
589	0.36
590	0.35
591	0.29
592	0.24
593	0.17
594	0.14
595	0.12
596	0.13
597	0.11
598	0.12
599	0.14
600	0.18
601	0.25
602	0.24
603	0.26
604	0.31
605	0.38
606	0.47

A0A178EZN5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer