Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178ETA0

Protein Details
Accession A0A178ETA0    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-97KERHPRSREKLPVESRHRKRRRLAGENDTDRBasic
255-285RELKALKREEKDKEKRRRRRHQGNVDSDDSLBasic
288-344FRLDAGAERRKRRHHRSRSRDRDRDRGSGRDRSRHDEAHRKRRNDRHESKTGPKPEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-88RHPRSREKLPVESRHRKRRR
233-275KKGVKQLKEVEKERTKWAEERERELKALKREEKDKEKRRRRRH
295-342ERRKRRHHRSRSRDRDRDRGSGRDRSRHDEAHRKRRNDRHESKTGPKP
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNKDNIERVRRDEARAKAEEEENERKQREEDAERRIDILRGKIPVPLNDVVDEKERHPRSREKLPVESRHRKRRRLAGENDTDRDIRFAKEDAELARQRVESKASRRRTDDAPIVDKSGHISLFPEESTSRTRRSDKNPEAEAETAKKNQEFENQYMMRLSNAAGYKQQLTSTPWYSSNTEISTQNAGLPNKNVWGDEDPRRQEREKIRIATNDPLAAMKKGVKQLKEVEKERTKWAEERERELKALKREEKDKEKRRRRRHQGNVDSDDSLDGFRLDAGAERRKRRHHRSRSRDRDRDRGSGRDRSRHDEAHRKRRNDRHESKTGPKPEKVSVAWSQAPGKRYSAQFAGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.61
4 0.63
5 0.63
6 0.64
7 0.63
8 0.63
9 0.62
10 0.59
11 0.59
12 0.61
13 0.62
14 0.61
15 0.59
16 0.55
17 0.5
18 0.5
19 0.49
20 0.48
21 0.5
22 0.49
23 0.54
24 0.53
25 0.5
26 0.47
27 0.48
28 0.48
29 0.49
30 0.48
31 0.49
32 0.54
33 0.53
34 0.54
35 0.49
36 0.44
37 0.38
38 0.36
39 0.31
40 0.28
41 0.28
42 0.32
43 0.34
44 0.33
45 0.35
46 0.32
47 0.29
48 0.28
49 0.29
50 0.25
51 0.28
52 0.27
53 0.23
54 0.31
55 0.34
56 0.37
57 0.42
58 0.49
59 0.5
60 0.59
61 0.66
62 0.63
63 0.69
64 0.73
65 0.78
66 0.79
67 0.83
68 0.82
69 0.84
70 0.86
71 0.85
72 0.84
73 0.84
74 0.84
75 0.83
76 0.82
77 0.81
78 0.82
79 0.79
80 0.73
81 0.66
82 0.55
83 0.45
84 0.39
85 0.3
86 0.21
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.17
92 0.16
93 0.23
94 0.24
95 0.23
96 0.24
97 0.23
98 0.23
99 0.23
100 0.26
101 0.25
102 0.33
103 0.41
104 0.47
105 0.51
106 0.54
107 0.57
108 0.55
109 0.55
110 0.53
111 0.48
112 0.45
113 0.41
114 0.38
115 0.34
116 0.3
117 0.25
118 0.2
119 0.15
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.11
128 0.17
129 0.18
130 0.21
131 0.24
132 0.3
133 0.35
134 0.44
135 0.53
136 0.55
137 0.6
138 0.59
139 0.56
140 0.53
141 0.47
142 0.41
143 0.33
144 0.28
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.19
150 0.25
151 0.25
152 0.25
153 0.32
154 0.31
155 0.3
156 0.3
157 0.28
158 0.2
159 0.17
160 0.15
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.11
170 0.13
171 0.17
172 0.18
173 0.19
174 0.19
175 0.21
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.12
195 0.15
196 0.19
197 0.26
198 0.32
199 0.34
200 0.37
201 0.41
202 0.4
203 0.44
204 0.48
205 0.49
206 0.49
207 0.5
208 0.5
209 0.51
210 0.53
211 0.5
212 0.43
213 0.35
214 0.27
215 0.24
216 0.22
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.16
221 0.22
222 0.26
223 0.26
224 0.29
225 0.37
226 0.45
227 0.5
228 0.5
229 0.52
230 0.56
231 0.57
232 0.59
233 0.55
234 0.49
235 0.45
236 0.51
237 0.51
238 0.47
239 0.52
240 0.52
241 0.49
242 0.48
243 0.48
244 0.45
245 0.42
246 0.49
247 0.48
248 0.48
249 0.53
250 0.61
251 0.67
252 0.72
253 0.75
254 0.77
255 0.81
256 0.86
257 0.91
258 0.93
259 0.93
260 0.94
261 0.95
262 0.95
263 0.94
264 0.94
265 0.89
266 0.8
267 0.7
268 0.58
269 0.47
270 0.36
271 0.26
272 0.16
273 0.09
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.09
279 0.14
280 0.23
281 0.3
282 0.39
283 0.46
284 0.56
285 0.67
286 0.74
287 0.8
288 0.82
289 0.87
290 0.9
291 0.94
292 0.95
293 0.96
294 0.95
295 0.91
296 0.9
297 0.85
298 0.84
299 0.78
300 0.76
301 0.71
302 0.71
303 0.71
304 0.69
305 0.68
306 0.65
307 0.67
308 0.65
309 0.67
310 0.67
311 0.71
312 0.73
313 0.78
314 0.78
315 0.81
316 0.84
317 0.86
318 0.86
319 0.85
320 0.83
321 0.84
322 0.85
323 0.84
324 0.83
325 0.83
326 0.79
327 0.74
328 0.7
329 0.65
330 0.64
331 0.57
332 0.54
333 0.5
334 0.5
335 0.48
336 0.47
337 0.49
338 0.46
339 0.47
340 0.43
341 0.41
342 0.4
343 0.4
344 0.42