Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F1L3

Protein Details
Accession A0A178F1L3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-71KSEPVVRKPVSKSKRKSKLNLSFGVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-61SKSKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSSSFASRRKARRVGADDEDTDGAVEQGELSIYPAITVCIDGLTNKSEPVVRKPVSKSKRKSKLNLSFGVGGTSMTDDVSDEGEVVIPKKTGIRRNVLDRAANRKHLNSSETLPVRAGRDDDRPSYSKDYLQELRNSTPSTPKNVSRPDTEDEKDKALDIAGKFGEVAKYTRPSAIPSEAEIREKKERRSRLAKEQEYISLHDTGIEDEDDEWSLSKKPLETDTRLVRDDEDFAEGFDEYVEDGRIAMGKRAEIEQKRRQRANMKELINDAEDLSDEDDSETERRAAYESAQTRAGMDGLKRDADEPVTRPKTPPKITSLPTLASKLAGLRMNVVEMENNKTQLVNRLEELRKEKVEISERETEIQNFLKEAGEKYEKLRAEAGQTAATEKLITGDEVGADRGLDNLATMSLPAPDTEMDEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.72
3 0.69
4 0.6
5 0.55
6 0.49
7 0.39
8 0.32
9 0.24
10 0.16
11 0.1
12 0.09
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.1
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.18
35 0.21
36 0.28
37 0.36
38 0.35
39 0.41
40 0.49
41 0.58
42 0.64
43 0.71
44 0.73
45 0.74
46 0.83
47 0.85
48 0.87
49 0.87
50 0.88
51 0.86
52 0.81
53 0.75
54 0.68
55 0.59
56 0.52
57 0.4
58 0.29
59 0.21
60 0.17
61 0.12
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.15
77 0.21
78 0.28
79 0.33
80 0.41
81 0.45
82 0.53
83 0.6
84 0.59
85 0.58
86 0.55
87 0.59
88 0.56
89 0.58
90 0.52
91 0.48
92 0.49
93 0.46
94 0.44
95 0.37
96 0.35
97 0.36
98 0.35
99 0.33
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.25
104 0.24
105 0.18
106 0.23
107 0.27
108 0.29
109 0.32
110 0.32
111 0.35
112 0.39
113 0.38
114 0.34
115 0.33
116 0.36
117 0.36
118 0.39
119 0.4
120 0.37
121 0.39
122 0.39
123 0.38
124 0.32
125 0.35
126 0.33
127 0.35
128 0.36
129 0.37
130 0.41
131 0.47
132 0.49
133 0.44
134 0.47
135 0.44
136 0.46
137 0.43
138 0.42
139 0.36
140 0.35
141 0.31
142 0.27
143 0.23
144 0.17
145 0.2
146 0.13
147 0.15
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.2
162 0.22
163 0.2
164 0.19
165 0.24
166 0.23
167 0.26
168 0.25
169 0.26
170 0.32
171 0.35
172 0.41
173 0.44
174 0.49
175 0.53
176 0.62
177 0.64
178 0.66
179 0.72
180 0.68
181 0.62
182 0.57
183 0.53
184 0.44
185 0.4
186 0.31
187 0.21
188 0.18
189 0.17
190 0.15
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.15
207 0.2
208 0.23
209 0.28
210 0.33
211 0.35
212 0.35
213 0.34
214 0.29
215 0.25
216 0.23
217 0.18
218 0.14
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.19
240 0.23
241 0.31
242 0.39
243 0.48
244 0.56
245 0.58
246 0.61
247 0.63
248 0.66
249 0.67
250 0.66
251 0.59
252 0.53
253 0.52
254 0.48
255 0.39
256 0.31
257 0.22
258 0.13
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.18
276 0.2
277 0.21
278 0.23
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.19
283 0.13
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.19
293 0.18
294 0.27
295 0.31
296 0.31
297 0.33
298 0.41
299 0.48
300 0.5
301 0.52
302 0.49
303 0.52
304 0.54
305 0.58
306 0.53
307 0.47
308 0.43
309 0.41
310 0.33
311 0.26
312 0.24
313 0.18
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.26
331 0.28
332 0.25
333 0.25
334 0.33
335 0.35
336 0.41
337 0.45
338 0.43
339 0.4
340 0.4
341 0.41
342 0.4
343 0.45
344 0.43
345 0.43
346 0.46
347 0.45
348 0.46
349 0.45
350 0.39
351 0.35
352 0.35
353 0.29
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.21
358 0.21
359 0.24
360 0.25
361 0.26
362 0.29
363 0.36
364 0.34
365 0.34
366 0.36
367 0.3
368 0.3
369 0.33
370 0.32
371 0.28
372 0.27
373 0.27
374 0.24
375 0.22
376 0.17
377 0.13
378 0.12
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.13