FuNGI

A0A178F698

Protein Details

Accession

A0A178F698

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-66	IDSIASPEKKRKDKGESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGG	Basic
400-428	AVEAQPSKKKKEKKEKKSDCKKEISDKLH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-29	EKKRKDKGESKKRKR
43-78	EKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGGKGRDKLASRKPL
406-416	SKKKKEKKEKK

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029008 EMC6-like IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005789 C:endoplasmic reticulum membrane GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF07019 EMC6 PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSMDEMEIDSIASPEKKRKDKGESKKRKRQEQASETVVVDDGEKKKKKKKDKHPKKGEKQAVGDGGKGRDKLASRKPLSKASSNDKDTHSLSSTADQLPSFHRVTTTLYLPLSPIAISPTHAVSSLLAEHISPLLLTYYPPVRGVVLAYSNPSISATKPTPTPTSTHTPNPEPLTLAKTAGEYGVLHTYLTLTFLVFRPERGQTLEGWINVQSEDFLGAIVFNLFSIGIERRRLPADWKWIAPGQQSDRPSTTSASPTSSSKDEEDEDDDEPDSDKENFKPLASNSEASQFEDAASAETGYFQTRSGKRVRGTIRFRVRDVDVIPGSERDKGFLSLEGTMLSKEDEDKLVAEERSKASGAGRAKSGDNYHDPTSRELQEAPAVDIDLDADEDEDVTMAEAVEAQPSKKKKEKKEKKSDCKKEISDKLHQIIDDDIAFLLGTAAGILGLQSAYGFTFYLLGTIFVSFLANALLVKDNTPRTAEKSTNKGISGVGAYFPGDGELVPASGGGYVRKGAWKDLWFSGLVATEAISGFVLGWAGVGGILR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.35
3	0.43
4	0.51
5	0.59
6	0.67
7	0.74
8	0.83
9	0.85
10	0.87
11	0.9
12	0.93
13	0.94
14	0.93
15	0.93
16	0.92
17	0.92
18	0.9
19	0.87
20	0.81
21	0.75
22	0.64
23	0.55
24	0.44
25	0.33
26	0.25
27	0.24
28	0.25
29	0.31
30	0.38
31	0.45
32	0.54
33	0.64
34	0.74
35	0.78
36	0.83
37	0.85
38	0.89
39	0.93
40	0.95
41	0.97
42	0.97
43	0.97
44	0.95
45	0.92
46	0.85
47	0.81
48	0.78
49	0.67
50	0.6
51	0.53
52	0.47
53	0.43
54	0.38
55	0.32
56	0.28
57	0.31
58	0.36
59	0.42
60	0.48
61	0.49
62	0.57
63	0.61
64	0.65
65	0.66
66	0.65
67	0.62
68	0.62
69	0.66
70	0.63
71	0.63
72	0.57
73	0.57
74	0.51
75	0.48
76	0.4
77	0.32
78	0.28
79	0.26
80	0.27
81	0.24
82	0.24
83	0.2
84	0.19
85	0.2
86	0.24
87	0.23
88	0.19
89	0.18
90	0.18
91	0.22
92	0.25
93	0.24
94	0.22
95	0.21
96	0.21
97	0.21
98	0.2
99	0.16
100	0.12
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.1
105	0.11
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.1
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.06
123	0.06
124	0.08
125	0.11
126	0.12
127	0.13
128	0.13
129	0.12
130	0.13
131	0.13
132	0.13
133	0.13
134	0.12
135	0.14
136	0.14
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.12
141	0.1
142	0.16
143	0.16
144	0.17
145	0.19
146	0.23
147	0.25
148	0.26
149	0.27
150	0.26
151	0.32
152	0.34
153	0.38
154	0.4
155	0.4
156	0.43
157	0.45
158	0.4
159	0.34
160	0.31
161	0.28
162	0.24
163	0.22
164	0.17
165	0.14
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.07
170	0.08
171	0.1
172	0.09
173	0.09
174	0.08
175	0.09
176	0.08
177	0.09
178	0.07
179	0.05
180	0.07
181	0.07
182	0.12
183	0.12
184	0.13
185	0.15
186	0.16
187	0.18
188	0.19
189	0.19
190	0.15
191	0.21
192	0.22
193	0.19
194	0.19
195	0.18
196	0.16
197	0.15
198	0.14
199	0.08
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.05
214	0.07
215	0.09
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.16
220	0.17
221	0.2
222	0.23
223	0.3
224	0.31
225	0.31
226	0.31
227	0.31
228	0.32
229	0.29
230	0.28
231	0.23
232	0.26
233	0.27
234	0.27
235	0.27
236	0.27
237	0.26
238	0.23
239	0.2
240	0.18
241	0.18
242	0.18
243	0.18
244	0.17
245	0.19
246	0.18
247	0.18
248	0.16
249	0.16
250	0.15
251	0.15
252	0.16
253	0.16
254	0.15
255	0.14
256	0.13
257	0.12
258	0.12
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.13
265	0.14
266	0.13
267	0.16
268	0.14
269	0.19
270	0.2
271	0.2
272	0.17
273	0.22
274	0.22
275	0.2
276	0.2
277	0.14
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.13
291	0.15
292	0.19
293	0.23
294	0.28
295	0.29
296	0.36
297	0.42
298	0.44
299	0.49
300	0.55
301	0.6
302	0.58
303	0.57
304	0.53
305	0.48
306	0.42
307	0.36
308	0.33
309	0.24
310	0.22
311	0.21
312	0.19
313	0.19
314	0.19
315	0.18
316	0.13
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.15
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.09
327	0.09
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.15
340	0.16
341	0.17
342	0.17
343	0.16
344	0.13
345	0.18
346	0.21
347	0.19
348	0.2
349	0.2
350	0.2
351	0.23
352	0.24
353	0.23
354	0.24
355	0.26
356	0.28
357	0.3
358	0.31
359	0.31
360	0.35
361	0.32
362	0.29
363	0.25
364	0.24
365	0.23
366	0.23
367	0.2
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.11
372	0.1
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.04
387	0.04
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.14
392	0.18
393	0.26
394	0.33
395	0.42
396	0.5
397	0.61
398	0.72
399	0.77
400	0.86
401	0.9
402	0.94
403	0.96
404	0.96
405	0.93
406	0.91
407	0.86
408	0.85
409	0.83
410	0.79
411	0.77
412	0.73
413	0.68
414	0.61
415	0.54
416	0.44
417	0.36
418	0.31
419	0.22
420	0.15
421	0.11
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.06
426	0.04
427	0.04
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.07
458	0.1
459	0.1
460	0.12
461	0.17
462	0.19
463	0.21
464	0.25
465	0.26
466	0.28
467	0.35
468	0.41
469	0.42
470	0.48
471	0.53
472	0.54
473	0.53
474	0.48
475	0.41
476	0.36
477	0.32
478	0.25
479	0.18
480	0.14
481	0.13
482	0.12
483	0.12
484	0.1
485	0.08
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.07
494	0.08
495	0.08
496	0.09
497	0.1
498	0.12
499	0.18
500	0.19
501	0.22
502	0.29
503	0.31
504	0.35
505	0.36
506	0.37
507	0.32
508	0.31
509	0.28
510	0.23
511	0.19
512	0.14
513	0.12
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.08
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.04

A0A178F698

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer