Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F388

Protein Details
Accession A0A178F388    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-258RPSLAKSKPTAKKRERGIGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-230KATQKEERRRREA
238-264ERPSLAKSKPTAKKRERGIGGPSVGKF
272-274SRR
278-300AIQGPKSSKKAGRGSGKGKGKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027973  DUF4602  
Pfam View protein in Pfam  
PF15375  DUF4602  
Amino Acid Sequences MLGKRKREVTVASRKRAVAVKDESTLDTAAQERLRKYFESRFEPLELPSSRSGAVLDGSSNASDTDDSDQGEWDGIEEEDSGEDEDSNGPEPEVVDYSKPLKLRTELVDKAAVKKFMSSKPPSLLSDSTKPATTAKTRKGGEEATDDLTTDAANLKNDLALQRLLKESHLLDSASDLNPTGVNRHKALDLRAQTAGAKTSIFTQRNMPMSHRKGISAKATQKEERRRREAQENGIILERPSLAKSKPTAKKRERGIGGPSVGKFVGGTLKLSRRDVMAIQGPKSSKKAGRGSGKGKGKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.62
3 0.6
4 0.52
5 0.5
6 0.47
7 0.43
8 0.42
9 0.43
10 0.4
11 0.36
12 0.33
13 0.25
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.2
18 0.23
19 0.23
20 0.26
21 0.29
22 0.3
23 0.34
24 0.38
25 0.43
26 0.46
27 0.48
28 0.48
29 0.49
30 0.48
31 0.43
32 0.42
33 0.35
34 0.32
35 0.29
36 0.27
37 0.24
38 0.23
39 0.22
40 0.15
41 0.14
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.1
84 0.13
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.23
91 0.25
92 0.31
93 0.29
94 0.3
95 0.35
96 0.33
97 0.37
98 0.36
99 0.32
100 0.25
101 0.26
102 0.29
103 0.28
104 0.36
105 0.34
106 0.35
107 0.37
108 0.4
109 0.38
110 0.37
111 0.35
112 0.31
113 0.31
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.24
118 0.21
119 0.22
120 0.25
121 0.27
122 0.3
123 0.37
124 0.37
125 0.37
126 0.39
127 0.37
128 0.31
129 0.28
130 0.24
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.15
135 0.14
136 0.11
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.13
157 0.11
158 0.09
159 0.11
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.2
173 0.21
174 0.24
175 0.28
176 0.26
177 0.26
178 0.26
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.21
183 0.13
184 0.11
185 0.08
186 0.13
187 0.21
188 0.21
189 0.22
190 0.25
191 0.3
192 0.35
193 0.36
194 0.36
195 0.37
196 0.41
197 0.45
198 0.41
199 0.39
200 0.37
201 0.4
202 0.42
203 0.41
204 0.44
205 0.44
206 0.49
207 0.52
208 0.59
209 0.65
210 0.68
211 0.69
212 0.7
213 0.7
214 0.7
215 0.74
216 0.73
217 0.7
218 0.69
219 0.61
220 0.55
221 0.5
222 0.44
223 0.34
224 0.28
225 0.2
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.19
231 0.23
232 0.32
233 0.41
234 0.49
235 0.59
236 0.64
237 0.72
238 0.75
239 0.8
240 0.75
241 0.7
242 0.67
243 0.64
244 0.59
245 0.56
246 0.48
247 0.4
248 0.35
249 0.3
250 0.23
251 0.17
252 0.19
253 0.15
254 0.17
255 0.21
256 0.28
257 0.32
258 0.34
259 0.34
260 0.3
261 0.32
262 0.31
263 0.31
264 0.33
265 0.34
266 0.34
267 0.38
268 0.38
269 0.39
270 0.42
271 0.43
272 0.39
273 0.43
274 0.5
275 0.54
276 0.63
277 0.68
278 0.71
279 0.73
280 0.79