Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EQX8

Protein Details
Accession A0A178EQX8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-362EELKARKSKLKAQKAKAVAKVNHydrophilic
369-390PQEASSSPKKPRTKLAKMKKATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-193KRVKAADKKR
308-326KKRKSIEGADAGKKSKKSK
344-357KARKSKLKAQKAKA
376-389PKKPRTKLAKMKKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.333, nucl 12, cyto 11.5, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAVSVVKTGSKYQLDADQAEDQRKAADSTVKKLPLGDGDDSEDDGSTGEHSPIWLILTTKKHLVDKNRMKPGKIAVPHPLNPSSTLNVCLITADPQRAVKDTIADPAFPPELAAKITKVIGFSKLRDRYKSFESRRQLLAEHDLFLADDRIILRLVNTLGKIFFKSSKRPIPVRLEEIQKVDGKRVKAADKKRPPTDEKIASVAAPAVVAREIERALACVPVNLSPAATAALRVGWSNWPAQKVVENVSAVVEAMVDKYVARGWKNLKAVHVKGANTAAMPVWLADELWLEEGDVKEDDVMKVEDSSKKRKSIEGADAGKKSKKSKLLTSAAVERDEEEEEELKARKSKLKAQKAKAVAKVNGDALLLPQEASSSPKKPRTKLAKMKKAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.34
4 0.35
5 0.36
6 0.39
7 0.37
8 0.31
9 0.29
10 0.29
11 0.26
12 0.21
13 0.26
14 0.26
15 0.31
16 0.4
17 0.4
18 0.39
19 0.39
20 0.38
21 0.35
22 0.36
23 0.33
24 0.26
25 0.28
26 0.29
27 0.29
28 0.27
29 0.21
30 0.15
31 0.13
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.16
44 0.21
45 0.23
46 0.28
47 0.31
48 0.35
49 0.4
50 0.47
51 0.52
52 0.58
53 0.65
54 0.72
55 0.71
56 0.67
57 0.66
58 0.64
59 0.62
60 0.55
61 0.49
62 0.47
63 0.51
64 0.54
65 0.55
66 0.5
67 0.42
68 0.41
69 0.4
70 0.34
71 0.28
72 0.26
73 0.22
74 0.2
75 0.18
76 0.15
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.21
85 0.22
86 0.18
87 0.2
88 0.19
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.17
96 0.17
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.18
108 0.2
109 0.22
110 0.3
111 0.38
112 0.41
113 0.44
114 0.47
115 0.45
116 0.5
117 0.58
118 0.56
119 0.56
120 0.59
121 0.58
122 0.58
123 0.54
124 0.47
125 0.4
126 0.4
127 0.32
128 0.27
129 0.22
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.15
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.17
151 0.19
152 0.25
153 0.32
154 0.39
155 0.44
156 0.46
157 0.51
158 0.54
159 0.54
160 0.53
161 0.5
162 0.47
163 0.44
164 0.43
165 0.38
166 0.33
167 0.29
168 0.28
169 0.27
170 0.23
171 0.24
172 0.25
173 0.29
174 0.34
175 0.42
176 0.47
177 0.54
178 0.6
179 0.63
180 0.66
181 0.64
182 0.63
183 0.63
184 0.57
185 0.49
186 0.44
187 0.39
188 0.33
189 0.28
190 0.21
191 0.13
192 0.08
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.12
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.2
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.13
238 0.11
239 0.07
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.15
250 0.19
251 0.26
252 0.31
253 0.33
254 0.37
255 0.42
256 0.42
257 0.44
258 0.44
259 0.38
260 0.36
261 0.35
262 0.3
263 0.22
264 0.21
265 0.14
266 0.1
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.11
290 0.15
291 0.21
292 0.25
293 0.34
294 0.38
295 0.43
296 0.44
297 0.47
298 0.5
299 0.52
300 0.56
301 0.56
302 0.58
303 0.58
304 0.6
305 0.6
306 0.58
307 0.54
308 0.5
309 0.47
310 0.48
311 0.48
312 0.53
313 0.59
314 0.62
315 0.63
316 0.63
317 0.64
318 0.58
319 0.53
320 0.44
321 0.35
322 0.3
323 0.27
324 0.22
325 0.17
326 0.15
327 0.15
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.23
332 0.25
333 0.3
334 0.35
335 0.44
336 0.52
337 0.61
338 0.69
339 0.72
340 0.78
341 0.8
342 0.83
343 0.81
344 0.78
345 0.71
346 0.66
347 0.61
348 0.53
349 0.45
350 0.37
351 0.29
352 0.21
353 0.21
354 0.16
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.16
360 0.2
361 0.23
362 0.32
363 0.41
364 0.5
365 0.53
366 0.64
367 0.7
368 0.76
369 0.8
370 0.83