Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178F081

Protein Details
Accession A0A178F081    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-127SNIWVIRKQNRRRQPGMQEEIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, cysk 7, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005269  LOG  
IPR031100  LOG_fam  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0009691  P:cytokinin biosynthetic process  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03641  Lysine_decarbox  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MENSTDVVLEEITWRSPQHVQLMGGFLHSNNILFYFAESPFFDSTSNNATLTLQAMHNENFRQFIETREAFEGRLKTMQGLEFVVAQDPIQEAAAAVAAGNAPQEPSNIWVIRKQNRRRQPGMQEEIQILATYFVVGDSVYMAPSLMSVVGRRMLSTVTSLTKVLPVASKQLLFTPSHGHTYTPPIQKHTEAGQTTATQSAQAGKEATPVPGTQNTTPGAVSPPSKLGAAASQDMRTLADALNLLSRYGDEYMDEMPLVGEPGSFIISMNAANTLTVPGTENPSGSVGATKSTVRSPSRTPVPKLGGPDTPGASPALGGVTDSNQPSIGKALQIRLLPCWTLNFPVLQPKYQNHATVKMSAASNQPRPVVCVFCGSAAGKSPAHIEAARSLAQLFHREGVKLVYGGGTAGLMGEVARTLVSLSGPESVHGIIPSALVKIENGHQTPLATTDKRAGKLPERTESTNVNTAESGGMSSFVNPEYGMTTIVPDMHTRKRMMAGEVISGGPGSGFLVLPGGFGTIEEAMEMTTWNQLGIHDKGIVLLNIDNYWDGVLAWVDKSVEQGFVSTVNKEILVECKDVEHALDALRNYKLSQGRFGLTWEVEFGKDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.21
4 0.25
5 0.29
6 0.33
7 0.33
8 0.34
9 0.37
10 0.33
11 0.3
12 0.27
13 0.2
14 0.17
15 0.16
16 0.14
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.16
25 0.16
26 0.19
27 0.19
28 0.2
29 0.18
30 0.16
31 0.19
32 0.21
33 0.23
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.19
44 0.22
45 0.24
46 0.23
47 0.23
48 0.23
49 0.26
50 0.23
51 0.24
52 0.3
53 0.28
54 0.31
55 0.33
56 0.33
57 0.29
58 0.35
59 0.33
60 0.27
61 0.29
62 0.25
63 0.22
64 0.25
65 0.25
66 0.21
67 0.2
68 0.18
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.1
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.24
98 0.32
99 0.41
100 0.51
101 0.58
102 0.62
103 0.7
104 0.78
105 0.79
106 0.8
107 0.81
108 0.81
109 0.78
110 0.72
111 0.64
112 0.56
113 0.5
114 0.41
115 0.31
116 0.2
117 0.13
118 0.09
119 0.07
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.16
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.2
159 0.22
160 0.2
161 0.2
162 0.21
163 0.21
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.21
168 0.28
169 0.35
170 0.37
171 0.36
172 0.36
173 0.39
174 0.39
175 0.4
176 0.36
177 0.35
178 0.28
179 0.28
180 0.26
181 0.24
182 0.24
183 0.23
184 0.19
185 0.11
186 0.11
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.18
199 0.21
200 0.17
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.16
281 0.16
282 0.19
283 0.21
284 0.25
285 0.34
286 0.38
287 0.39
288 0.4
289 0.42
290 0.41
291 0.42
292 0.38
293 0.31
294 0.28
295 0.27
296 0.22
297 0.18
298 0.16
299 0.13
300 0.1
301 0.09
302 0.07
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.14
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.22
336 0.22
337 0.27
338 0.28
339 0.33
340 0.26
341 0.3
342 0.3
343 0.3
344 0.29
345 0.26
346 0.24
347 0.21
348 0.25
349 0.24
350 0.26
351 0.26
352 0.28
353 0.25
354 0.28
355 0.27
356 0.23
357 0.19
358 0.18
359 0.16
360 0.14
361 0.16
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.15
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.12
370 0.14
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.15
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.12
389 0.11
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.02
400 0.02
401 0.02
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.1
417 0.1
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.11
427 0.16
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.2
434 0.22
435 0.17
436 0.18
437 0.24
438 0.29
439 0.3
440 0.33
441 0.34
442 0.37
443 0.45
444 0.49
445 0.49
446 0.5
447 0.52
448 0.51
449 0.5
450 0.47
451 0.45
452 0.4
453 0.33
454 0.28
455 0.25
456 0.22
457 0.18
458 0.14
459 0.07
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.13
477 0.17
478 0.23
479 0.28
480 0.28
481 0.3
482 0.35
483 0.36
484 0.36
485 0.36
486 0.31
487 0.28
488 0.28
489 0.26
490 0.2
491 0.17
492 0.14
493 0.08
494 0.07
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.08
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.05
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.14
521 0.16
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.18
526 0.19
527 0.18
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.12
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.08
537 0.07
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.1
544 0.09
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.13
550 0.12
551 0.16
552 0.17
553 0.15
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.16
559 0.18
560 0.2
561 0.21
562 0.19
563 0.19
564 0.21
565 0.2
566 0.2
567 0.16
568 0.13
569 0.14
570 0.17
571 0.17
572 0.19
573 0.2
574 0.2
575 0.19
576 0.25
577 0.3
578 0.29
579 0.35
580 0.35
581 0.36
582 0.36
583 0.38
584 0.37
585 0.32
586 0.3
587 0.25
588 0.23