Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2UPK0

Protein Details
Accession Q2UPK0    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MDASKSSKKRKAVTRDVEEEAHydrophilic
685-707ELSQRPYKTLRYHRKAIRSVRFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-263RRFVPSKHEAKRV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028598  BOP1/Erb1  
IPR012953  BOP1_N_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0070545  C:PeBoW complex  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG aor:AO090005001611  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08145  BOP1NT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDASKSSKKRKAVTRDVEEEAGVFSGDELQVDVLDGALSDNANDLSSDEDVSDSEIELVDDFSDEEDGDEEEELDSDEIPSDGGESFKKASGTGNARDESSSDEEQLNYRIEKDANGNDRYVYDEINPDDNSDYSDVEENANTIGNIPLSFYDQYPHIGYDINGKKIMRPATGEALDALLDSIEIPKGWTGLTDPSTGKPLELSQDELELLRKVQMNEIPEEGYNPYEPTVEWFSSKQEIMPLSAAPEPKRRFVPSKHEAKRVMKIVKAIREGRILPYKPPTEEEDKEQDVVNYDLWADETERPDHPMHIPAPKLPPPGYEESYHPPPEYLPDKKERKAWEEADPEDREREYLPNDFGSLRKVPGYESFVKEKFERCLDLYLAPRVRRSKLNIDPESLLPKLPSPEELKPFPTACATVFRGHKGRVRTLAVDPSGLWLATGGDDGTARVWELLTGRQLWSVKLSEEDPVNVVRWRPGKDAVILAAAAGDDIFLAVPPIADPKIEKTSLEIIDAGWGYAASKPPPSAAEENKKNVPPQWIRPSLSLAESGVCAVIPLRYVVKSLSWHRRGDYFVTVCPGSSTPASVAISIHTLSKHLTQFPFRRRIKGGGPPQTAHFHPSKPILFVANQRTIRAYDLSRQLLVKIIQPGARWISSFDIHPTSSTASGGDNLIVGSYDRRLLWHDLELSQRPYKTLRYHRKAIRSVRFHPSGRYPLFADASDDGSLQIFHGSVTGDMLSNASIVPLKVLKGHKITGELGVLDVDWHPREAWCVSAGADGTCRLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.77
4 0.69
5 0.59
6 0.49
7 0.38
8 0.28
9 0.19
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.08
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.11
39 0.12
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.13
74 0.15
75 0.16
76 0.15
77 0.18
78 0.25
79 0.31
80 0.35
81 0.39
82 0.38
83 0.38
84 0.38
85 0.35
86 0.32
87 0.32
88 0.26
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.24
93 0.26
94 0.24
95 0.18
96 0.18
97 0.19
98 0.19
99 0.2
100 0.24
101 0.3
102 0.34
103 0.35
104 0.34
105 0.32
106 0.32
107 0.34
108 0.29
109 0.22
110 0.17
111 0.19
112 0.21
113 0.25
114 0.24
115 0.21
116 0.22
117 0.2
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.12
127 0.11
128 0.12
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.22
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.28
152 0.3
153 0.35
154 0.38
155 0.3
156 0.29
157 0.29
158 0.33
159 0.34
160 0.32
161 0.26
162 0.22
163 0.2
164 0.16
165 0.12
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.12
179 0.14
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.22
184 0.22
185 0.2
186 0.16
187 0.15
188 0.17
189 0.17
190 0.19
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.15
200 0.14
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.23
205 0.23
206 0.21
207 0.18
208 0.19
209 0.16
210 0.15
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.13
217 0.16
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.19
222 0.21
223 0.22
224 0.18
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.14
230 0.14
231 0.16
232 0.19
233 0.18
234 0.26
235 0.27
236 0.29
237 0.33
238 0.36
239 0.4
240 0.44
241 0.51
242 0.51
243 0.6
244 0.63
245 0.67
246 0.69
247 0.67
248 0.68
249 0.65
250 0.6
251 0.51
252 0.51
253 0.49
254 0.48
255 0.5
256 0.45
257 0.4
258 0.4
259 0.39
260 0.38
261 0.41
262 0.35
263 0.32
264 0.36
265 0.36
266 0.33
267 0.35
268 0.34
269 0.33
270 0.33
271 0.36
272 0.35
273 0.34
274 0.34
275 0.31
276 0.27
277 0.22
278 0.21
279 0.16
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.22
297 0.23
298 0.22
299 0.27
300 0.29
301 0.31
302 0.27
303 0.26
304 0.27
305 0.31
306 0.3
307 0.27
308 0.27
309 0.29
310 0.34
311 0.34
312 0.29
313 0.24
314 0.22
315 0.25
316 0.27
317 0.26
318 0.25
319 0.33
320 0.38
321 0.41
322 0.46
323 0.45
324 0.45
325 0.48
326 0.47
327 0.45
328 0.45
329 0.44
330 0.45
331 0.42
332 0.38
333 0.32
334 0.29
335 0.21
336 0.18
337 0.17
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.13
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.2
353 0.2
354 0.22
355 0.26
356 0.27
357 0.29
358 0.29
359 0.28
360 0.25
361 0.22
362 0.21
363 0.18
364 0.19
365 0.18
366 0.2
367 0.2
368 0.23
369 0.25
370 0.23
371 0.26
372 0.27
373 0.28
374 0.29
375 0.32
376 0.36
377 0.4
378 0.49
379 0.47
380 0.46
381 0.46
382 0.43
383 0.41
384 0.32
385 0.24
386 0.14
387 0.14
388 0.12
389 0.11
390 0.13
391 0.14
392 0.18
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.26
397 0.26
398 0.24
399 0.2
400 0.17
401 0.13
402 0.16
403 0.17
404 0.19
405 0.2
406 0.22
407 0.24
408 0.26
409 0.29
410 0.29
411 0.3
412 0.29
413 0.3
414 0.3
415 0.29
416 0.31
417 0.27
418 0.24
419 0.2
420 0.17
421 0.15
422 0.12
423 0.1
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.03
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.14
447 0.14
448 0.12
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.18
461 0.2
462 0.22
463 0.24
464 0.24
465 0.25
466 0.26
467 0.22
468 0.18
469 0.15
470 0.12
471 0.09
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.03
476 0.02
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.11
489 0.15
490 0.16
491 0.16
492 0.17
493 0.23
494 0.23
495 0.23
496 0.19
497 0.14
498 0.16
499 0.16
500 0.13
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.13
511 0.17
512 0.21
513 0.27
514 0.36
515 0.4
516 0.45
517 0.49
518 0.49
519 0.46
520 0.44
521 0.46
522 0.42
523 0.45
524 0.5
525 0.52
526 0.52
527 0.52
528 0.52
529 0.44
530 0.39
531 0.31
532 0.22
533 0.16
534 0.14
535 0.12
536 0.08
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.09
547 0.11
548 0.16
549 0.25
550 0.34
551 0.38
552 0.4
553 0.41
554 0.43
555 0.43
556 0.42
557 0.41
558 0.33
559 0.28
560 0.3
561 0.28
562 0.25
563 0.24
564 0.21
565 0.15
566 0.13
567 0.13
568 0.1
569 0.14
570 0.14
571 0.13
572 0.13
573 0.11
574 0.13
575 0.12
576 0.13
577 0.09
578 0.1
579 0.11
580 0.16
581 0.18
582 0.21
583 0.24
584 0.32
585 0.4
586 0.48
587 0.57
588 0.55
589 0.58
590 0.57
591 0.6
592 0.58
593 0.59
594 0.61
595 0.6
596 0.62
597 0.57
598 0.57
599 0.55
600 0.49
601 0.44
602 0.37
603 0.28
604 0.27
605 0.32
606 0.3
607 0.28
608 0.29
609 0.27
610 0.27
611 0.33
612 0.36
613 0.39
614 0.38
615 0.37
616 0.38
617 0.36
618 0.35
619 0.31
620 0.26
621 0.24
622 0.31
623 0.33
624 0.33
625 0.32
626 0.3
627 0.31
628 0.3
629 0.27
630 0.24
631 0.25
632 0.25
633 0.25
634 0.29
635 0.28
636 0.28
637 0.24
638 0.21
639 0.22
640 0.21
641 0.22
642 0.22
643 0.21
644 0.21
645 0.21
646 0.21
647 0.2
648 0.19
649 0.18
650 0.15
651 0.12
652 0.13
653 0.13
654 0.11
655 0.09
656 0.08
657 0.08
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.1
663 0.1
664 0.11
665 0.15
666 0.2
667 0.22
668 0.25
669 0.26
670 0.27
671 0.33
672 0.37
673 0.38
674 0.39
675 0.36
676 0.34
677 0.34
678 0.39
679 0.43
680 0.49
681 0.55
682 0.58
683 0.68
684 0.74
685 0.81
686 0.83
687 0.83
688 0.83
689 0.8
690 0.78
691 0.78
692 0.77
693 0.69
694 0.66
695 0.64
696 0.63
697 0.57
698 0.53
699 0.46
700 0.43
701 0.44
702 0.38
703 0.33
704 0.25
705 0.26
706 0.23
707 0.21
708 0.16
709 0.14
710 0.14
711 0.1
712 0.1
713 0.07
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.09
720 0.08
721 0.08
722 0.09
723 0.08
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.07
729 0.1
730 0.11
731 0.12
732 0.19
733 0.23
734 0.29
735 0.32
736 0.35
737 0.35
738 0.38
739 0.39
740 0.35
741 0.33
742 0.27
743 0.22
744 0.19
745 0.17
746 0.13
747 0.13
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.18
754 0.18
755 0.19
756 0.16
757 0.16
758 0.16
759 0.18
760 0.18
761 0.16
762 0.16
763 0.15