FuNGI

Q2UM88

Protein Details

Accession

Q2UM88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-105	ETPEQKKARQAEGRKAPKRNKLHVRIKEVFL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
80-98	KKARQAEGRKAPKRNKLHV

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007120 DNA-dir_RNAP_su2_dom IPR037033 DNA-dir_RNAP_su2_hyb_sf IPR007121 RNA_pol_bsu_CS IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf IPR007645 RNA_pol_Rpb2_3 IPR007641 RNA_pol_Rpb2_7 IPR014724 RNA_pol_RPB2_OB-fold IPR009674 Rpa2_dom_4
Gene Ontology	GO:0005736 C:RNA polymerase I complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0001054 F:RNA polymerase I activity GO:0006363 P:termination of RNA polymerase I transcription GO:0006362 P:transcription elongation by RNA polymerase I GO:0006361 P:transcription initiation at RNA polymerase I promoter
KEGG	aor:AO090003000096 -
Pfam	View protein in Pfam PF06883 RNA_pol_Rpa2_4 PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2 PF04565 RNA_pol_Rpb2_3 PF00562 RNA_pol_Rpb2_6 PF04560 RNA_pol_Rpb2_7
PROSITE	View protein in PROSITE PS01166 RNA_POL_BETA
CDD	cd00653 RNA_pol_B_RPB2

Amino Acid Sequences

MAPAKTDTNWSVNYDVLRREHLFKNPPKDRTAYPALAASIKPHVDSFNALFEDSKILQAGLKDIGTKTFIDGEAETPEQKKARQAEGRKAPKRNKLHVRIKEVFLEKPAIPPTNKFTTRNRNIYPSECRERHATYRGKLRARIEYRVNNGDWMEAVRELGQVPIMMRTNRCHLEKATPAELVEHKEESEELGGYFIVNGNEKLIRMLIVGKRNFPMAIVRGSFVKRGHTYTKFGVQIRSVRPDQTSQTNVLHYLSDGNVTFRFSWRKNEYLVPVMMILKALVETNDREIFEGLVGSASSEGINNTFVTDRVELLLRTYKGYNLHSRSACRAYLGEKFKPVLGVPMDMSNEEAGTEFLRKVVLPHLGNQNVTETQDYDKFKLIMFMIRKLYALVAGDCAPDNPDAVSNQEILLGGFLYGMILKERLEEWVRSFGPILRDWSMRNHGAKFTDPSFERDFLSKVVKRSNENIGGALEYFLSTGNLVSPTGLDLQQTSGYTVMAEKINFYRFISHFRMIHRGSFFAQLKTTTVRKLLPESWGFLCPVHTPDGSPCGLLNHLAHKCLISTSDIDVSHLPRLLVQLGVRSESSVSLEESVTVQLDGRIVGFCSPKQARMIADTLRHWKVEGSHNVPRELEIGYVPNSNGGQYPGIYMFSQAARMYREVKYLPLDKLDYVGPFEQPFMEIACLPSDLVAGISTHIEFTPTNILSIVANMTPFSDYNQSPRNMYQCQMSKQTMGTPGTAIDYRTDNKLYRLQTGQTPIVRPPLYNAYGLDNFPNGTNAVVAIISYTGYDMDDAMIINKSSHERGFGHGTIYKTKVHSLDEKESRRNKSRREITKLFGFAPGGEIRAEWRNTIDEDGLPHIGARVKEGSLVAAYHNVRYDAASDSYVNVDGITHFVKYKDAEEGYIDSIRIMGAETGIEPCQSLSVKYRIPRKPVIGDKFSSRHGQKGVCSQLWPAVDMPFSESGIQPDLIINPHAFPSRMTIAQMIESMAGKAGALHGHPQDSTPFQFSEENTAADYFGHQLRKAGYNYYGNEPLYSGITGKEFAADIFIGVVHYQRLRHMVNDKFQVRTTGPVNSLTGQPVKGRAKGGGIRVGEMERDSLIAHGAAFILQDRLMNCSDTQRAWLCRDCGSFLSTQVALAGGSGKARNQGAAAAAAKAASSQLTQASGSSGIVRCRRCAREAVFDDSRAITWEDGDGRRYVGGDNVTVVAVPGVLRYLDVELAAMGIRMKFKVDN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.33
3	0.31
4	0.35
5	0.35
6	0.39
7	0.42
8	0.48
9	0.54
10	0.57
11	0.66
12	0.68
13	0.7
14	0.69
15	0.68
16	0.62
17	0.6
18	0.6
19	0.52
20	0.45
21	0.43
22	0.4
23	0.38
24	0.35
25	0.3
26	0.27
27	0.25
28	0.24
29	0.22
30	0.22
31	0.2
32	0.25
33	0.24
34	0.25
35	0.25
36	0.24
37	0.23
38	0.23
39	0.27
40	0.23
41	0.22
42	0.16
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.18
47	0.15
48	0.15
49	0.16
50	0.16
51	0.18
52	0.19
53	0.19
54	0.18
55	0.19
56	0.18
57	0.18
58	0.19
59	0.18
60	0.21
61	0.22
62	0.23
63	0.21
64	0.26
65	0.26
66	0.27
67	0.32
68	0.34
69	0.42
70	0.49
71	0.56
72	0.61
73	0.7
74	0.79
75	0.8
76	0.84
77	0.83
78	0.84
79	0.86
80	0.86
81	0.86
82	0.86
83	0.88
84	0.87
85	0.88
86	0.84
87	0.78
88	0.76
89	0.68
90	0.59
91	0.51
92	0.47
93	0.37
94	0.36
95	0.38
96	0.36
97	0.34
98	0.36
99	0.39
100	0.44
101	0.49
102	0.48
103	0.53
104	0.58
105	0.66
106	0.72
107	0.7
108	0.67
109	0.67
110	0.7
111	0.69
112	0.67
113	0.68
114	0.6
115	0.58
116	0.56
117	0.57
118	0.57
119	0.57
120	0.57
121	0.53
122	0.62
123	0.68
124	0.68
125	0.68
126	0.67
127	0.68
128	0.65
129	0.65
130	0.64
131	0.64
132	0.64
133	0.64
134	0.6
135	0.52
136	0.47
137	0.4
138	0.31
139	0.25
140	0.2
141	0.14
142	0.13
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.09
150	0.13
151	0.16
152	0.18
153	0.21
154	0.24
155	0.31
156	0.36
157	0.38
158	0.37
159	0.36
160	0.41
161	0.46
162	0.49
163	0.45
164	0.4
165	0.38
166	0.38
167	0.38
168	0.34
169	0.3
170	0.24
171	0.21
172	0.21
173	0.2
174	0.18
175	0.17
176	0.13
177	0.1
178	0.09
179	0.09
180	0.08
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.1
186	0.11
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.16
194	0.2
195	0.27
196	0.29
197	0.31
198	0.32
199	0.33
200	0.32
201	0.26
202	0.26
203	0.21
204	0.24
205	0.22
206	0.22
207	0.25
208	0.26
209	0.3
210	0.25
211	0.29
212	0.27
213	0.31
214	0.38
215	0.38
216	0.42
217	0.42
218	0.48
219	0.47
220	0.47
221	0.45
222	0.42
223	0.45
224	0.45
225	0.48
226	0.42
227	0.39
228	0.39
229	0.4
230	0.39
231	0.39
232	0.37
233	0.34
234	0.35
235	0.33
236	0.32
237	0.29
238	0.25
239	0.18
240	0.16
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.13
246	0.15
247	0.15
248	0.18
249	0.25
250	0.24
251	0.34
252	0.37
253	0.39
254	0.4
255	0.45
256	0.45
257	0.43
258	0.41
259	0.32
260	0.28
261	0.26
262	0.23
263	0.17
264	0.13
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.17
275	0.17
276	0.17
277	0.15
278	0.14
279	0.09
280	0.07
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.11
300	0.14
301	0.2
302	0.17
303	0.19
304	0.19
305	0.21
306	0.24
307	0.29
308	0.35
309	0.33
310	0.4
311	0.4
312	0.43
313	0.46
314	0.45
315	0.41
316	0.33
317	0.3
318	0.26
319	0.31
320	0.35
321	0.32
322	0.31
323	0.32
324	0.31
325	0.31
326	0.27
327	0.24
328	0.19
329	0.18
330	0.16
331	0.18
332	0.18
333	0.16
334	0.17
335	0.12
336	0.1
337	0.09
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.12
348	0.18
349	0.17
350	0.22
351	0.3
352	0.31
353	0.32
354	0.31
355	0.3
356	0.24
357	0.24
358	0.2
359	0.14
360	0.14
361	0.2
362	0.22
363	0.21
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.23
368	0.21
369	0.22
370	0.22
371	0.25
372	0.25
373	0.25
374	0.25
375	0.22
376	0.21
377	0.16
378	0.15
379	0.1
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.1
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.08
398	0.08
399	0.06
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.04
406	0.04
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.1
412	0.12
413	0.13
414	0.15
415	0.21
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.21
420	0.22
421	0.22
422	0.24
423	0.2
424	0.21
425	0.21
426	0.25
427	0.28
428	0.29
429	0.3
430	0.28
431	0.28
432	0.29
433	0.3
434	0.28
435	0.25
436	0.26
437	0.24
438	0.27
439	0.28
440	0.28
441	0.26
442	0.24
443	0.24
444	0.21
445	0.27
446	0.25
447	0.25
448	0.3
449	0.32
450	0.33
451	0.36
452	0.41
453	0.38
454	0.35
455	0.33
456	0.27
457	0.25
458	0.22
459	0.18
460	0.11
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.04
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.17
494	0.16
495	0.23
496	0.27
497	0.28
498	0.29
499	0.3
500	0.37
501	0.33
502	0.36
503	0.3
504	0.27
505	0.25
506	0.3
507	0.3
508	0.23
509	0.23
510	0.2
511	0.2
512	0.22
513	0.22
514	0.16
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.22
519	0.22
520	0.24
521	0.23
522	0.25
523	0.24
524	0.24
525	0.23
526	0.18
527	0.18
528	0.13
529	0.14
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.12
538	0.1
539	0.1
540	0.11
541	0.11
542	0.14
543	0.15
544	0.15
545	0.15
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.13
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.12
554	0.12
555	0.13
556	0.14
557	0.14
558	0.14
559	0.14
560	0.12
561	0.09
562	0.1
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.08
580	0.08
581	0.06
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.06
591	0.07
592	0.07
593	0.14
594	0.14
595	0.16
596	0.17
597	0.18
598	0.17
599	0.18
600	0.21
601	0.17
602	0.19
603	0.19
604	0.24
605	0.24
606	0.23
607	0.2
608	0.19
609	0.2
610	0.25
611	0.28
612	0.29
613	0.32
614	0.34
615	0.35
616	0.34
617	0.31
618	0.24
619	0.19
620	0.13
621	0.09
622	0.08
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.09
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.08
631	0.07
632	0.06
633	0.08
634	0.07
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.08
639	0.07
640	0.09
641	0.08
642	0.09
643	0.1
644	0.11
645	0.14
646	0.14
647	0.16
648	0.15
649	0.16
650	0.19
651	0.21
652	0.21
653	0.2
654	0.2
655	0.17
656	0.18
657	0.17
658	0.14
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.1
663	0.1
664	0.09
665	0.08
666	0.08
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.07
672	0.07
673	0.06
674	0.06
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.05
684	0.05
685	0.06
686	0.05
687	0.07
688	0.12
689	0.11
690	0.12
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.11
695	0.11
696	0.06
697	0.06
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.07
703	0.11
704	0.11
705	0.15
706	0.21
707	0.21
708	0.22
709	0.24
710	0.27
711	0.25
712	0.25
713	0.28
714	0.27
715	0.3
716	0.33
717	0.32
718	0.29
719	0.28
720	0.3
721	0.29
722	0.25
723	0.22
724	0.17
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.14
729	0.1
730	0.11
731	0.12
732	0.15
733	0.17
734	0.16
735	0.18
736	0.24
737	0.24
738	0.26
739	0.26
740	0.26
741	0.27
742	0.3
743	0.31
744	0.28
745	0.28
746	0.25
747	0.3
748	0.28
749	0.25
750	0.23
751	0.25
752	0.24
753	0.24
754	0.23
755	0.21
756	0.22
757	0.23
758	0.2
759	0.15
760	0.13
761	0.13
762	0.13
763	0.08
764	0.07
765	0.06
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.04
770	0.04
771	0.04
772	0.04
773	0.03
774	0.04
775	0.03
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.09
788	0.1
789	0.11
790	0.13
791	0.14
792	0.17
793	0.22
794	0.22
795	0.22
796	0.24
797	0.25
798	0.26
799	0.27
800	0.26
801	0.21
802	0.24
803	0.23
804	0.23
805	0.28
806	0.3
807	0.37
808	0.44
809	0.48
810	0.54
811	0.59
812	0.63
813	0.66
814	0.67
815	0.66
816	0.68
817	0.73
818	0.74
819	0.76
820	0.74
821	0.69
822	0.69
823	0.64
824	0.54
825	0.46
826	0.36
827	0.26
828	0.25
829	0.2
830	0.14
831	0.11
832	0.1
833	0.11
834	0.16
835	0.17
836	0.14
837	0.15
838	0.16
839	0.17
840	0.18
841	0.17
842	0.12
843	0.13
844	0.15
845	0.14
846	0.12
847	0.11
848	0.11
849	0.13
850	0.12
851	0.13
852	0.13
853	0.12
854	0.14
855	0.14
856	0.13
857	0.11
858	0.11
859	0.09
860	0.13
861	0.14
862	0.14
863	0.15
864	0.14
865	0.14
866	0.14
867	0.15
868	0.12
869	0.12
870	0.13
871	0.12
872	0.12
873	0.13
874	0.13
875	0.12
876	0.09
877	0.07
878	0.06
879	0.08
880	0.08
881	0.08
882	0.09
883	0.09
884	0.11
885	0.12
886	0.14
887	0.16
888	0.16
889	0.16
890	0.17
891	0.19
892	0.19
893	0.19
894	0.18
895	0.12
896	0.12
897	0.11
898	0.09
899	0.07
900	0.05
901	0.04
902	0.04
903	0.05
904	0.07
905	0.07
906	0.07
907	0.07
908	0.07
909	0.09
910	0.09
911	0.1
912	0.13
913	0.18
914	0.23
915	0.28
916	0.38
917	0.42
918	0.48
919	0.53
920	0.53
921	0.57
922	0.63
923	0.65
924	0.61
925	0.57
926	0.57
927	0.53
928	0.51
929	0.5
930	0.42
931	0.39
932	0.38
933	0.39
934	0.35
935	0.41
936	0.45
937	0.38
938	0.38
939	0.34
940	0.34
941	0.32
942	0.3
943	0.22
944	0.17
945	0.16
946	0.15
947	0.17
948	0.13
949	0.14
950	0.13
951	0.13
952	0.13
953	0.15
954	0.14
955	0.12
956	0.11
957	0.12
958	0.12
959	0.13
960	0.12
961	0.1
962	0.13
963	0.14
964	0.13
965	0.12
966	0.17
967	0.19
968	0.19
969	0.2
970	0.19
971	0.19
972	0.2
973	0.2
974	0.15
975	0.12
976	0.11
977	0.1
978	0.09
979	0.08
980	0.06
981	0.06
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.11
986	0.13
987	0.14
988	0.14
989	0.15
990	0.17
991	0.19
992	0.21
993	0.2
994	0.19
995	0.2
996	0.23
997	0.22
998	0.28
999	0.25
1000	0.24
1001	0.22
1002	0.22
1003	0.19
1004	0.17
1005	0.17
1006	0.12
1007	0.15
1008	0.17
1009	0.16
1010	0.18
1011	0.21
1012	0.27
1013	0.28
1014	0.28
1015	0.29
1016	0.33
1017	0.35
1018	0.39
1019	0.41
1020	0.35
1021	0.34
1022	0.31
1023	0.26
1024	0.21
1025	0.19
1026	0.14
1027	0.1
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.1
1035	0.09
1036	0.08
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.08
1042	0.08
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.13
1046	0.19
1047	0.19
1048	0.25
1049	0.32
1050	0.37
1051	0.42
1052	0.51
1053	0.51
1054	0.48
1055	0.48
1056	0.47
1057	0.4
1058	0.39
1059	0.34
1060	0.3
1061	0.29
1062	0.29
1063	0.3
1064	0.27
1065	0.28
1066	0.26
1067	0.26
1068	0.23
1069	0.22
1070	0.29
1071	0.31
1072	0.33
1073	0.33
1074	0.31
1075	0.35
1076	0.38
1077	0.41
1078	0.4
1079	0.36
1080	0.34
1081	0.34
1082	0.33
1083	0.27
1084	0.23
1085	0.19
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.11
1089	0.09
1090	0.09
1091	0.08
1092	0.08
1093	0.07
1094	0.07
1095	0.06
1096	0.06
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.15
1106	0.19
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.26
1110	0.29
1111	0.32
1112	0.36
1113	0.41
1114	0.38
1115	0.4
1116	0.42
1117	0.39
1118	0.35
1119	0.34
1120	0.3
1121	0.25
1122	0.27
1123	0.22
1124	0.19
1125	0.17
1126	0.15
1127	0.12
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.07
1131	0.09
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.16
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.16
1138	0.17
1139	0.16
1140	0.2
1141	0.2
1142	0.16
1143	0.15
1144	0.14
1145	0.14
1146	0.12
1147	0.11
1148	0.08
1149	0.07
1150	0.08
1151	0.1
1152	0.11
1153	0.12
1154	0.12
1155	0.13
1156	0.13
1157	0.13
1158	0.16
1159	0.18
1160	0.23
1161	0.3
1162	0.32
1163	0.36
1164	0.44
1165	0.48
1166	0.47
1167	0.53
1168	0.51
1169	0.56
1170	0.59
1171	0.61
1172	0.56
1173	0.53
1174	0.51
1175	0.43
1176	0.38
1177	0.29
1178	0.26
1179	0.18
1180	0.15
1181	0.17
1182	0.21
1183	0.22
1184	0.24
1185	0.22
1186	0.22
1187	0.22
1188	0.22
1189	0.19
1190	0.18
1191	0.18
1192	0.16
1193	0.17
1194	0.17
1195	0.16
1196	0.15
1197	0.14
1198	0.1
1199	0.08
1200	0.07
1201	0.06
1202	0.06
1203	0.06
1204	0.06
1205	0.07
1206	0.09
1207	0.09
1208	0.09
1209	0.09
1210	0.08
1211	0.08
1212	0.08
1213	0.08
1214	0.07
1215	0.09
1216	0.11
1217	0.11

Q2UM88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer