Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VTI0

Protein Details
Accession A0A1Y2VTI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-402GGYSMHGKKHLKKGKWKSGTAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-305RRKKRK
388-397KKHLKKGKWK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDVDAPSMILNPTALPNASKVRKLDDLASELGSDAEQIRSNEGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRDLDSGNTAGEVVFIEADSGNKNKGKGKQKQSLEDALRKLDVADEERKKGELFGDDFLPSKNLQHLTYQAQQDIPDAIGGFQPDMDPRLREVLEALEDEAFVDDDDDVFKELAKDGHELEDIEFDGEFDEDDGWESDHTAKPTKEYKNGSEAPKLVPVVNEQDGEVMTNEDWLEDFKKFKKDQGKPSRLVAPSQSDLQSSLMTTTTNGGRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLVRTEQLGILDARFDKIEEQYNEDDFEDGDDTASMSQVSAVSSVTGPVRNDFDGIMDEFLGGYSMHGKKHLKKGKWKSGTAELDEIRRELGPARIRGKYGQQQPSGVASVSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.51
11 0.43
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.34
16 0.31
17 0.23
18 0.22
19 0.19
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.15
31 0.24
32 0.27
33 0.31
34 0.31
35 0.34
36 0.39
37 0.4
38 0.42
39 0.37
40 0.37
41 0.35
42 0.34
43 0.28
44 0.24
45 0.21
46 0.16
47 0.12
48 0.09
49 0.09
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.13
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.1
87 0.08
88 0.07
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.14
99 0.17
100 0.22
101 0.31
102 0.4
103 0.48
104 0.57
105 0.62
106 0.67
107 0.72
108 0.72
109 0.72
110 0.68
111 0.64
112 0.57
113 0.49
114 0.43
115 0.36
116 0.3
117 0.23
118 0.19
119 0.17
120 0.24
121 0.26
122 0.28
123 0.29
124 0.29
125 0.28
126 0.26
127 0.24
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.13
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.2
143 0.23
144 0.29
145 0.29
146 0.26
147 0.24
148 0.24
149 0.23
150 0.2
151 0.15
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.14
217 0.14
218 0.17
219 0.25
220 0.29
221 0.33
222 0.36
223 0.37
224 0.41
225 0.47
226 0.46
227 0.42
228 0.4
229 0.34
230 0.33
231 0.31
232 0.24
233 0.19
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.08
251 0.08
252 0.11
253 0.14
254 0.22
255 0.23
256 0.29
257 0.39
258 0.45
259 0.56
260 0.64
261 0.69
262 0.64
263 0.67
264 0.69
265 0.59
266 0.53
267 0.45
268 0.39
269 0.32
270 0.32
271 0.29
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.17
276 0.12
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.13
283 0.19
284 0.25
285 0.32
286 0.42
287 0.51
288 0.6
289 0.67
290 0.7
291 0.73
292 0.76
293 0.79
294 0.78
295 0.78
296 0.71
297 0.62
298 0.57
299 0.48
300 0.39
301 0.29
302 0.2
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.21
325 0.2
326 0.25
327 0.27
328 0.28
329 0.29
330 0.28
331 0.25
332 0.17
333 0.17
334 0.13
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.09
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.19
356 0.18
357 0.19
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.06
369 0.06
370 0.12
371 0.15
372 0.16
373 0.22
374 0.29
375 0.36
376 0.47
377 0.57
378 0.58
379 0.67
380 0.78
381 0.82
382 0.85
383 0.82
384 0.78
385 0.79
386 0.77
387 0.7
388 0.67
389 0.58
390 0.53
391 0.5
392 0.44
393 0.35
394 0.28
395 0.24
396 0.19
397 0.25
398 0.28
399 0.34
400 0.39
401 0.41
402 0.44
403 0.47
404 0.54
405 0.55
406 0.58
407 0.59
408 0.57
409 0.56
410 0.56
411 0.56
412 0.49