FuNGI

A0A1Y2WBC7

Protein Details

Accession

A0A1Y2WBC7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1052-1077	ENLLKIVKAKKPEKKPEPEVKPEAKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1059-1068	KAKKPEKKPE

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MFSNSGARKSVDSLPPLSPNARSEFPFHRQGSVSSHPTARRGSTASSIHSIGGHLDTTSSWSQTLHETGQNAISTLLQPPIVRTGLQPHTSAPASSAHKPPTARDIPPVTLTNIPRIDISEFTPYLTQVGALYEQLKRVKESDDDGSDHVFGRGRGEEHGSVGDDSHLKPNSRPSSSRKVSASSTRSMSPIDSHAVRPLRRRSSSGFSRKAATQGPPPLSTIPNVYFDDDFHLENPRTFDVVSERSEVVRPPPGSTEEKNAANGNAPAPRKTLATNAILQEKLSWYMDTIEMHLIASISTASTTFFTALGSLRELHSEAAESVERIKTLRQELEALDREIAASGLEIVQKQRRRENLQQLNDAVKQLKEIVESVATCEALVDSGEIEKALDGIDSLEKLIAGERISRPSKDNSYSPQLCDLRDAVALQGVNGDISTLRFRIGKGFETKLIDILLGDLRRHVDTVSNQEVLLRWSSAAMRSRGAPGREPSAYPAYLTETSGLRSQLMPILNGLHRSKHVTIAIASYREVVMREIRVLIKRPLPTSNEDDNESMMSASTMNSKRLTQQEKSSILARNLRALDERDAEALFVKMYISVTETLRRLGTQVKVLFDVASSMGEQPIDAGLKSPNPLKSPPLNSANRDLQEDIHLTMDMANLLGQAVDTSQEKIVKVLRVRSDQSSHLPLIWFLRYFTLNLYFANECEAISGRSGTSLKNIVNSQIKDFIQSHGDAEKQKLAQGMESDQWSAKDFTDENTVLLNRILESSTKDSAAWLEGSKIWEPIEEKTKEPPSGRPRAESSVKEKTRSAMIDGETFILPNSAILCLEGMSHFLHLISGIPSMAADVSSSLIAYLQLFNSRCTQLILGAGATKSAGLKNITTRHLALASQALAFISTLIPHVREFVRRHAGSGPNVNNNNVAALMGEFDKVKRLFQEHQNNIYDKLVEIMSGRAAAHARSMKALQWDQEVEASVNLYVETLAKETVTLHRVLTKHLPEGTVRLIMTPVFESYENQLGKTLQGLESKSETAVKRMESDIEYLISRLGKIDGFGDTGENLLKIVKAKKPEKKPEPEVKPEAKLEGNTEPDEKADEDNNESKDEKNGAAEEAASDEATEKQGEDEKADSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.44
4	0.42
5	0.38
6	0.35
7	0.37
8	0.36
9	0.34
10	0.36
11	0.4
12	0.43
13	0.49
14	0.47
15	0.46
16	0.44
17	0.45
18	0.46
19	0.47
20	0.46
21	0.4
22	0.45
23	0.43
24	0.46
25	0.48
26	0.42
27	0.39
28	0.37
29	0.36
30	0.38
31	0.39
32	0.38
33	0.38
34	0.36
35	0.32
36	0.3
37	0.27
38	0.21
39	0.19
40	0.15
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.15
45	0.16
46	0.15
47	0.14
48	0.14
49	0.15
50	0.19
51	0.23
52	0.21
53	0.23
54	0.23
55	0.24
56	0.28
57	0.27
58	0.23
59	0.2
60	0.17
61	0.15
62	0.16
63	0.16
64	0.14
65	0.14
66	0.15
67	0.19
68	0.19
69	0.19
70	0.19
71	0.25
72	0.31
73	0.34
74	0.33
75	0.29
76	0.33
77	0.34
78	0.32
79	0.25
80	0.25
81	0.27
82	0.32
83	0.37
84	0.36
85	0.39
86	0.41
87	0.42
88	0.45
89	0.46
90	0.42
91	0.44
92	0.45
93	0.44
94	0.47
95	0.46
96	0.39
97	0.4
98	0.39
99	0.4
100	0.35
101	0.33
102	0.29
103	0.29
104	0.28
105	0.23
106	0.25
107	0.24
108	0.22
109	0.23
110	0.23
111	0.21
112	0.19
113	0.18
114	0.15
115	0.08
116	0.1
117	0.1
118	0.1
119	0.13
120	0.13
121	0.19
122	0.23
123	0.24
124	0.24
125	0.25
126	0.27
127	0.28
128	0.31
129	0.32
130	0.32
131	0.33
132	0.33
133	0.33
134	0.3
135	0.28
136	0.25
137	0.19
138	0.15
139	0.17
140	0.18
141	0.17
142	0.18
143	0.23
144	0.22
145	0.21
146	0.23
147	0.21
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.15
152	0.16
153	0.21
154	0.24
155	0.24
156	0.26
157	0.36
158	0.41
159	0.45
160	0.49
161	0.49
162	0.56
163	0.6
164	0.64
165	0.57
166	0.53
167	0.53
168	0.57
169	0.54
170	0.48
171	0.46
172	0.41
173	0.39
174	0.36
175	0.32
176	0.25
177	0.23
178	0.23
179	0.22
180	0.22
181	0.28
182	0.33
183	0.35
184	0.41
185	0.48
186	0.52
187	0.53
188	0.56
189	0.55
190	0.58
191	0.66
192	0.68
193	0.65
194	0.58
195	0.59
196	0.56
197	0.54
198	0.49
199	0.42
200	0.39
201	0.4
202	0.42
203	0.39
204	0.4
205	0.38
206	0.35
207	0.32
208	0.29
209	0.24
210	0.24
211	0.25
212	0.25
213	0.22
214	0.22
215	0.26
216	0.23
217	0.21
218	0.17
219	0.22
220	0.21
221	0.22
222	0.25
223	0.2
224	0.2
225	0.19
226	0.19
227	0.19
228	0.22
229	0.23
230	0.23
231	0.22
232	0.23
233	0.24
234	0.24
235	0.21
236	0.26
237	0.24
238	0.23
239	0.25
240	0.29
241	0.33
242	0.34
243	0.38
244	0.35
245	0.35
246	0.36
247	0.34
248	0.3
249	0.27
250	0.26
251	0.21
252	0.23
253	0.23
254	0.22
255	0.22
256	0.23
257	0.22
258	0.22
259	0.24
260	0.23
261	0.25
262	0.27
263	0.28
264	0.31
265	0.3
266	0.28
267	0.25
268	0.21
269	0.2
270	0.17
271	0.14
272	0.11
273	0.13
274	0.15
275	0.14
276	0.14
277	0.13
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.09
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.13
314	0.15
315	0.19
316	0.21
317	0.2
318	0.22
319	0.23
320	0.3
321	0.31
322	0.27
323	0.23
324	0.2
325	0.19
326	0.17
327	0.16
328	0.08
329	0.05
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.07
334	0.1
335	0.17
336	0.22
337	0.26
338	0.32
339	0.38
340	0.46
341	0.55
342	0.63
343	0.66
344	0.67
345	0.67
346	0.63
347	0.59
348	0.52
349	0.44
350	0.35
351	0.25
352	0.2
353	0.17
354	0.16
355	0.12
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.11
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.09
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.1
390	0.12
391	0.18
392	0.21
393	0.22
394	0.24
395	0.28
396	0.33
397	0.33
398	0.35
399	0.33
400	0.41
401	0.42
402	0.4
403	0.43
404	0.39
405	0.35
406	0.34
407	0.29
408	0.21
409	0.19
410	0.18
411	0.1
412	0.11
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.03
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.08
426	0.08
427	0.13
428	0.16
429	0.19
430	0.22
431	0.24
432	0.26
433	0.28
434	0.28
435	0.24
436	0.22
437	0.17
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.19
451	0.22
452	0.21
453	0.21
454	0.21
455	0.21
456	0.19
457	0.17
458	0.11
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.11
463	0.15
464	0.15
465	0.15
466	0.16
467	0.2
468	0.23
469	0.24
470	0.24
471	0.22
472	0.25
473	0.25
474	0.24
475	0.23
476	0.23
477	0.22
478	0.18
479	0.17
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.14
484	0.11
485	0.12
486	0.14
487	0.13
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.12
492	0.12
493	0.11
494	0.1
495	0.12
496	0.12
497	0.16
498	0.16
499	0.14
500	0.14
501	0.18
502	0.18
503	0.19
504	0.19
505	0.16
506	0.16
507	0.18
508	0.19
509	0.15
510	0.15
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.09
517	0.08
518	0.09
519	0.1
520	0.12
521	0.13
522	0.16
523	0.18
524	0.21
525	0.23
526	0.24
527	0.26
528	0.26
529	0.29
530	0.32
531	0.34
532	0.31
533	0.31
534	0.29
535	0.26
536	0.23
537	0.19
538	0.13
539	0.08
540	0.06
541	0.04
542	0.04
543	0.1
544	0.11
545	0.13
546	0.14
547	0.15
548	0.19
549	0.26
550	0.31
551	0.27
552	0.31
553	0.36
554	0.37
555	0.38
556	0.38
557	0.34
558	0.31
559	0.34
560	0.29
561	0.27
562	0.25
563	0.25
564	0.22
565	0.21
566	0.21
567	0.18
568	0.18
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.11
573	0.09
574	0.07
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.07
582	0.08
583	0.11
584	0.11
585	0.12
586	0.12
587	0.12
588	0.12
589	0.14
590	0.15
591	0.18
592	0.19
593	0.19
594	0.19
595	0.2
596	0.18
597	0.14
598	0.13
599	0.08
600	0.06
601	0.06
602	0.05
603	0.06
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.09
614	0.12
615	0.14
616	0.16
617	0.17
618	0.21
619	0.26
620	0.29
621	0.33
622	0.38
623	0.39
624	0.39
625	0.44
626	0.44
627	0.39
628	0.37
629	0.32
630	0.24
631	0.23
632	0.22
633	0.17
634	0.12
635	0.11
636	0.09
637	0.09
638	0.09
639	0.06
640	0.05
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.04
649	0.04
650	0.06
651	0.07
652	0.09
653	0.09
654	0.11
655	0.14
656	0.17
657	0.19
658	0.23
659	0.27
660	0.3
661	0.32
662	0.34
663	0.34
664	0.32
665	0.34
666	0.32
667	0.28
668	0.24
669	0.22
670	0.19
671	0.19
672	0.18
673	0.14
674	0.11
675	0.12
676	0.12
677	0.12
678	0.13
679	0.14
680	0.13
681	0.13
682	0.16
683	0.14
684	0.13
685	0.16
686	0.14
687	0.1
688	0.11
689	0.11
690	0.09
691	0.09
692	0.1
693	0.07
694	0.09
695	0.1
696	0.09
697	0.11
698	0.14
699	0.14
700	0.17
701	0.17
702	0.2
703	0.26
704	0.27
705	0.26
706	0.28
707	0.27
708	0.28
709	0.28
710	0.25
711	0.21
712	0.2
713	0.2
714	0.16
715	0.19
716	0.16
717	0.17
718	0.2
719	0.17
720	0.19
721	0.2
722	0.18
723	0.17
724	0.17
725	0.18
726	0.16
727	0.17
728	0.16
729	0.14
730	0.14
731	0.15
732	0.15
733	0.12
734	0.13
735	0.12
736	0.13
737	0.19
738	0.19
739	0.17
740	0.18
741	0.18
742	0.16
743	0.16
744	0.15
745	0.08
746	0.09
747	0.09
748	0.07
749	0.11
750	0.15
751	0.16
752	0.16
753	0.16
754	0.15
755	0.15
756	0.16
757	0.14
758	0.1
759	0.1
760	0.11
761	0.14
762	0.14
763	0.14
764	0.13
765	0.14
766	0.15
767	0.17
768	0.24
769	0.23
770	0.24
771	0.3
772	0.35
773	0.38
774	0.38
775	0.44
776	0.44
777	0.52
778	0.52
779	0.49
780	0.49
781	0.51
782	0.55
783	0.51
784	0.49
785	0.5
786	0.51
787	0.5
788	0.46
789	0.41
790	0.41
791	0.37
792	0.32
793	0.26
794	0.25
795	0.24
796	0.24
797	0.24
798	0.19
799	0.18
800	0.15
801	0.1
802	0.08
803	0.07
804	0.07
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.06
809	0.05
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.05
828	0.04
829	0.04
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.04
834	0.05
835	0.05
836	0.06
837	0.07
838	0.07
839	0.12
840	0.13
841	0.15
842	0.19
843	0.19
844	0.19
845	0.2
846	0.19
847	0.15
848	0.16
849	0.15
850	0.11
851	0.12
852	0.12
853	0.1
854	0.1
855	0.09
856	0.08
857	0.08
858	0.11
859	0.1
860	0.12
861	0.19
862	0.25
863	0.27
864	0.28
865	0.29
866	0.28
867	0.28
868	0.26
869	0.21
870	0.18
871	0.17
872	0.14
873	0.13
874	0.11
875	0.1
876	0.09
877	0.08
878	0.06
879	0.05
880	0.06
881	0.07
882	0.09
883	0.08
884	0.12
885	0.14
886	0.21
887	0.23
888	0.31
889	0.4
890	0.39
891	0.41
892	0.44
893	0.48
894	0.45
895	0.52
896	0.48
897	0.47
898	0.48
899	0.47
900	0.42
901	0.36
902	0.32
903	0.22
904	0.17
905	0.09
906	0.07
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.07
911	0.08
912	0.15
913	0.15
914	0.16
915	0.19
916	0.23
917	0.3
918	0.39
919	0.5
920	0.51
921	0.58
922	0.62
923	0.6
924	0.57
925	0.52
926	0.42
927	0.31
928	0.25
929	0.18
930	0.13
931	0.12
932	0.11
933	0.1
934	0.1
935	0.1
936	0.1
937	0.11
938	0.11
939	0.16
940	0.19
941	0.19
942	0.21
943	0.22
944	0.23
945	0.3
946	0.32
947	0.28
948	0.29
949	0.29
950	0.27
951	0.28
952	0.26
953	0.2
954	0.17
955	0.16
956	0.11
957	0.1
958	0.09
959	0.07
960	0.06
961	0.07
962	0.07
963	0.08
964	0.08
965	0.07
966	0.08
967	0.1
968	0.15
969	0.17
970	0.17
971	0.17
972	0.22
973	0.23
974	0.27
975	0.34
976	0.32
977	0.35
978	0.36
979	0.36
980	0.32
981	0.36
982	0.34
983	0.29
984	0.25
985	0.21
986	0.2
987	0.18
988	0.18
989	0.16
990	0.13
991	0.12
992	0.13
993	0.14
994	0.17
995	0.25
996	0.23
997	0.22
998	0.24
999	0.22
1000	0.22
1001	0.23
1002	0.21
1003	0.17
1004	0.21
1005	0.22
1006	0.24
1007	0.26
1008	0.27
1009	0.25
1010	0.29
1011	0.26
1012	0.26
1013	0.29
1014	0.27
1015	0.27
1016	0.28
1017	0.3
1018	0.26
1019	0.28
1020	0.25
1021	0.23
1022	0.22
1023	0.19
1024	0.2
1025	0.16
1026	0.15
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.11
1030	0.12
1031	0.13
1032	0.12
1033	0.12
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.11
1037	0.12
1038	0.12
1039	0.1
1040	0.09
1041	0.09
1042	0.1
1043	0.14
1044	0.2
1045	0.24
1046	0.33
1047	0.43
1048	0.53
1049	0.63
1050	0.73
1051	0.79
1052	0.83
1053	0.88
1054	0.89
1055	0.89
1056	0.88
1057	0.87
1058	0.82
1059	0.78
1060	0.7
1061	0.64
1062	0.57
1063	0.49
1064	0.44
1065	0.41
1066	0.39
1067	0.36
1068	0.35
1069	0.31
1070	0.28
1071	0.29
1072	0.26
1073	0.23
1074	0.23
1075	0.23
1076	0.27
1077	0.33
1078	0.34
1079	0.35
1080	0.34
1081	0.32
1082	0.33
1083	0.33
1084	0.28
1085	0.26
1086	0.25
1087	0.24
1088	0.23
1089	0.22
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.12
1094	0.11
1095	0.1
1096	0.11
1097	0.13
1098	0.12
1099	0.1
1100	0.12
1101	0.19
1102	0.2
1103	0.22

A0A1Y2WBC7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer