Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VRL3

Protein Details
Accession A0A1Y2VRL3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-78SSVVETRKARSPKKAKKGPSVQLASNHydrophilic
134-160AQLSNFRPSKNNCQRRKDGRTVLKLSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-70RKARSPKKAKKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.833, nucl 11.5, cyto 11, cyto_mito 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MATNKRRKLDVAAEPPQAMSAFALRKKLLGQQTITSTPKIDPVDETPSSPKISSVVETRKARSPKKAKKGPSVQLASNHEYESNVNLKESILDEPLDEVVASKPTDVLSRSPSPPTSDDEEEEVSVNLPKAPPAQLSNFRPSKNNCQRRKDGRTVLKLSEGDRLVILGNYGIRVTAGELTINGAILKNSDKVYWVNAPHCHALPVIRCPEAANLELLPHPHAIDLRSLGKLSPQFRKLWNEPSPSDKDTASRSTFRILYTSADGPKKVALQDLISPPEWNREVAKLAKTSGSKPCSVMVTGPKSSGKSTFGKILANRLLTEVSSSSKSRTRRGVAVLDIDPGQPEYCVAGQIALVFLTEPVFNPSFCRPLPSSGIEIIRSHALASVSPASDPELFLEAAMDLMTHYRNTLGRYPLIINTPGWIQGTGLDLLTSLITDLRPTEVIYMSETGPTEAVEALQESCKASGFSMLPSQASQLTSRTAAHFRSMQTMSYFHANTHDTTDDQRTRWNPKPLTTVPPWQVSYQGPNAGILGIMCYDYQAPLDLLADAINGTVLAIVGVESVKAFRHSTRNKDVSDDATESMMDIDEIDGTSQSSAMPSFSSLAEKTVSTTPEGIPIIDTVNGTTLDPRYSHSLGLALVRGIDVENGVLQLLTPLSVSRIEEVVSKGGEIVLISGKFDTPSWAYTEDQYYRTHGNKGGNDDGDEPMDAQDDEVDDSSDEDGSTADATPIPWIEILHGNQKRGAGSKVWRVRRDLGRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.48
4 0.38
5 0.28
6 0.2
7 0.18
8 0.21
9 0.24
10 0.29
11 0.28
12 0.29
13 0.31
14 0.38
15 0.4
16 0.4
17 0.4
18 0.41
19 0.47
20 0.52
21 0.52
22 0.45
23 0.39
24 0.33
25 0.36
26 0.33
27 0.28
28 0.25
29 0.27
30 0.34
31 0.33
32 0.35
33 0.33
34 0.34
35 0.36
36 0.32
37 0.28
38 0.22
39 0.24
40 0.24
41 0.29
42 0.34
43 0.4
44 0.45
45 0.48
46 0.55
47 0.61
48 0.64
49 0.66
50 0.69
51 0.71
52 0.77
53 0.83
54 0.84
55 0.86
56 0.9
57 0.87
58 0.86
59 0.81
60 0.74
61 0.73
62 0.71
63 0.64
64 0.55
65 0.47
66 0.37
67 0.33
68 0.3
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.19
77 0.17
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.15
94 0.17
95 0.21
96 0.27
97 0.3
98 0.33
99 0.34
100 0.36
101 0.36
102 0.38
103 0.38
104 0.35
105 0.35
106 0.34
107 0.33
108 0.29
109 0.28
110 0.23
111 0.17
112 0.15
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.18
120 0.2
121 0.27
122 0.34
123 0.39
124 0.47
125 0.5
126 0.49
127 0.54
128 0.56
129 0.6
130 0.63
131 0.68
132 0.68
133 0.72
134 0.8
135 0.84
136 0.87
137 0.85
138 0.85
139 0.84
140 0.84
141 0.8
142 0.72
143 0.68
144 0.6
145 0.52
146 0.48
147 0.39
148 0.3
149 0.24
150 0.23
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.18
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.29
184 0.32
185 0.33
186 0.33
187 0.29
188 0.24
189 0.25
190 0.23
191 0.26
192 0.26
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.26
197 0.24
198 0.22
199 0.16
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.17
217 0.22
218 0.25
219 0.29
220 0.31
221 0.33
222 0.38
223 0.46
224 0.46
225 0.5
226 0.52
227 0.5
228 0.48
229 0.52
230 0.53
231 0.47
232 0.44
233 0.35
234 0.3
235 0.29
236 0.33
237 0.3
238 0.27
239 0.26
240 0.28
241 0.29
242 0.27
243 0.25
244 0.2
245 0.18
246 0.19
247 0.21
248 0.23
249 0.23
250 0.23
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.19
255 0.17
256 0.13
257 0.13
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.23
265 0.22
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.19
270 0.21
271 0.24
272 0.2
273 0.2
274 0.24
275 0.24
276 0.26
277 0.31
278 0.3
279 0.28
280 0.28
281 0.29
282 0.26
283 0.25
284 0.24
285 0.22
286 0.25
287 0.24
288 0.25
289 0.25
290 0.25
291 0.25
292 0.24
293 0.22
294 0.2
295 0.21
296 0.24
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.29
301 0.29
302 0.26
303 0.25
304 0.21
305 0.2
306 0.16
307 0.16
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.18
314 0.21
315 0.25
316 0.3
317 0.32
318 0.33
319 0.36
320 0.37
321 0.34
322 0.35
323 0.31
324 0.25
325 0.23
326 0.19
327 0.15
328 0.12
329 0.1
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.12
352 0.15
353 0.15
354 0.18
355 0.16
356 0.19
357 0.22
358 0.22
359 0.22
360 0.22
361 0.23
362 0.2
363 0.19
364 0.17
365 0.14
366 0.12
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.06
394 0.07
395 0.1
396 0.14
397 0.16
398 0.16
399 0.18
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.19
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.09
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.11
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.04
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.1
464 0.11
465 0.12
466 0.13
467 0.15
468 0.16
469 0.16
470 0.18
471 0.2
472 0.19
473 0.24
474 0.24
475 0.22
476 0.21
477 0.21
478 0.2
479 0.21
480 0.21
481 0.15
482 0.17
483 0.18
484 0.17
485 0.19
486 0.19
487 0.15
488 0.17
489 0.25
490 0.25
491 0.24
492 0.29
493 0.31
494 0.38
495 0.45
496 0.51
497 0.46
498 0.48
499 0.56
500 0.53
501 0.55
502 0.52
503 0.52
504 0.46
505 0.49
506 0.46
507 0.38
508 0.37
509 0.32
510 0.32
511 0.27
512 0.26
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.16
517 0.14
518 0.1
519 0.07
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.02
543 0.02
544 0.02
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.04
550 0.05
551 0.07
552 0.09
553 0.12
554 0.23
555 0.3
556 0.38
557 0.48
558 0.53
559 0.52
560 0.55
561 0.54
562 0.47
563 0.45
564 0.39
565 0.29
566 0.24
567 0.23
568 0.19
569 0.16
570 0.12
571 0.07
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.08
588 0.09
589 0.12
590 0.11
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.15
595 0.17
596 0.18
597 0.17
598 0.18
599 0.17
600 0.21
601 0.22
602 0.19
603 0.16
604 0.15
605 0.15
606 0.14
607 0.14
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.1
612 0.12
613 0.12
614 0.13
615 0.13
616 0.15
617 0.2
618 0.21
619 0.21
620 0.19
621 0.19
622 0.18
623 0.2
624 0.18
625 0.12
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.08
630 0.08
631 0.06
632 0.05
633 0.06
634 0.05
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.07
644 0.09
645 0.1
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.14
650 0.16
651 0.17
652 0.16
653 0.15
654 0.14
655 0.13
656 0.13
657 0.1
658 0.09
659 0.11
660 0.11
661 0.11
662 0.12
663 0.12
664 0.13
665 0.13
666 0.16
667 0.13
668 0.15
669 0.18
670 0.2
671 0.21
672 0.23
673 0.3
674 0.29
675 0.29
676 0.29
677 0.3
678 0.33
679 0.35
680 0.36
681 0.34
682 0.39
683 0.42
684 0.47
685 0.5
686 0.45
687 0.45
688 0.42
689 0.39
690 0.32
691 0.28
692 0.21
693 0.15
694 0.15
695 0.12
696 0.1
697 0.1
698 0.09
699 0.11
700 0.1
701 0.11
702 0.09
703 0.1
704 0.11
705 0.1
706 0.09
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.07
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.11
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.11
720 0.13
721 0.19
722 0.22
723 0.3
724 0.34
725 0.34
726 0.36
727 0.38
728 0.38
729 0.35
730 0.35
731 0.32
732 0.35
733 0.44
734 0.51
735 0.59
736 0.61
737 0.63
738 0.69