Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VPX5

Protein Details
Accession A0A1Y2VPX5    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-109LKAGRRKGTATKKPKEGRRAKKRARDDDNDGABasic
152-174RAARNQPKAKGVRRKKKDEVDLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-102KAGRRKGTATKKPKEGRRAKKRAR
145-168RRRRAIERAARNQPKAKGVRRKKK
417-422KAKRKG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDAGSAAQSLHEEETNDQPREGLGDYDVARAGDSDKDSDALSDIDEDQFDDYDPTTARLDEKRPEPQVIDEDVARTLKAGRRKGTATKKPKEGRRAKKRARDDDNDGADGEILTTKRVRKATGADAPEPQAEPENEENLTPDERRRRAIERAARNQPKAKGVRRKKKDEVDLEDELDERIADLKVRMENACQADNQAREAGQPALHKLKLLPEVMALLNRNNNQAAVIDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFLALTRLPIEKETLRSSGIGKVVLFYTKSKKPEVGIKRMAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRQIETRDFDYQAAKLRQVQESTSSQLTLNQRHTPQSIAEAERARVLAPVREVSRARVMGLPSTYTIAPRSTFDPTRAQDYRPIGASGHEAFRKMTQKAKRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.26
3 0.33
4 0.34
5 0.32
6 0.3
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.19
11 0.12
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.18
46 0.21
47 0.26
48 0.31
49 0.36
50 0.42
51 0.45
52 0.47
53 0.45
54 0.44
55 0.44
56 0.4
57 0.36
58 0.28
59 0.26
60 0.25
61 0.23
62 0.19
63 0.14
64 0.15
65 0.18
66 0.25
67 0.31
68 0.33
69 0.38
70 0.43
71 0.53
72 0.59
73 0.66
74 0.68
75 0.7
76 0.76
77 0.79
78 0.83
79 0.84
80 0.84
81 0.85
82 0.85
83 0.89
84 0.88
85 0.89
86 0.91
87 0.91
88 0.89
89 0.85
90 0.82
91 0.8
92 0.74
93 0.65
94 0.54
95 0.44
96 0.35
97 0.27
98 0.19
99 0.12
100 0.08
101 0.09
102 0.12
103 0.14
104 0.2
105 0.22
106 0.23
107 0.25
108 0.3
109 0.37
110 0.41
111 0.43
112 0.39
113 0.4
114 0.4
115 0.37
116 0.32
117 0.24
118 0.2
119 0.16
120 0.18
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.18
128 0.14
129 0.18
130 0.25
131 0.27
132 0.31
133 0.34
134 0.37
135 0.41
136 0.5
137 0.53
138 0.55
139 0.61
140 0.69
141 0.71
142 0.7
143 0.69
144 0.62
145 0.62
146 0.59
147 0.6
148 0.6
149 0.64
150 0.71
151 0.74
152 0.8
153 0.81
154 0.81
155 0.81
156 0.79
157 0.75
158 0.71
159 0.64
160 0.56
161 0.47
162 0.39
163 0.3
164 0.21
165 0.13
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.15
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.16
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.16
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.12
205 0.09
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.18
260 0.19
261 0.19
262 0.2
263 0.2
264 0.21
265 0.21
266 0.18
267 0.15
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.19
274 0.23
275 0.26
276 0.28
277 0.29
278 0.3
279 0.39
280 0.44
281 0.48
282 0.5
283 0.5
284 0.53
285 0.53
286 0.51
287 0.42
288 0.34
289 0.27
290 0.26
291 0.24
292 0.2
293 0.18
294 0.2
295 0.25
296 0.25
297 0.25
298 0.21
299 0.24
300 0.31
301 0.37
302 0.46
303 0.5
304 0.57
305 0.65
306 0.69
307 0.69
308 0.69
309 0.7
310 0.69
311 0.67
312 0.66
313 0.63
314 0.57
315 0.55
316 0.5
317 0.43
318 0.42
319 0.37
320 0.32
321 0.29
322 0.32
323 0.35
324 0.34
325 0.34
326 0.3
327 0.31
328 0.33
329 0.29
330 0.26
331 0.22
332 0.27
333 0.32
334 0.33
335 0.35
336 0.38
337 0.4
338 0.43
339 0.44
340 0.4
341 0.35
342 0.34
343 0.34
344 0.3
345 0.33
346 0.32
347 0.31
348 0.31
349 0.3
350 0.24
351 0.22
352 0.2
353 0.19
354 0.19
355 0.24
356 0.24
357 0.3
358 0.3
359 0.32
360 0.38
361 0.35
362 0.33
363 0.32
364 0.32
365 0.3
366 0.31
367 0.29
368 0.22
369 0.24
370 0.23
371 0.2
372 0.21
373 0.19
374 0.18
375 0.19
376 0.21
377 0.26
378 0.28
379 0.31
380 0.38
381 0.38
382 0.45
383 0.46
384 0.45
385 0.45
386 0.47
387 0.48
388 0.41
389 0.4
390 0.31
391 0.3
392 0.33
393 0.28
394 0.31
395 0.28
396 0.27
397 0.27
398 0.34
399 0.39
400 0.37
401 0.43
402 0.46