Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VTH7

Protein Details
Accession A0A1Y2VTH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAPIPPPPSIKNKRPPPPGIQTNGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPIPPPPSIKNKRPPPPGIQTNGVSSSQSSPSPNMSSKRPPPALVKQQQQQQQQQQQTSNSTSTNGINGTNHKPSLSRSRRDTSNQTSGRNQKNNASMRSATLAPDTTLNQSFEPRPDVVTDSYILKKYSGNPPSLIVHLHPTHFRFDQQDGVFPYKSPMKLFLEHVRSRTVPHEILQDLTEAGVVFYEGCLIVQLHDHKSPTQSKDVARPAAKSTSEKQSSIHNYNPYITPSPWAPYPKDNAENGLSGGDENPSNVDSDEKESMPAPPAPNDGQKSKMPSKAKVFTIVLHPTSQSLHVDLMIKASTSSASADAKATADSNGVPPTPISAVPPTPTTSSMLPPPAKKQKREKMELDGHNVYHAEAQILLATTTPLHLEPTRNKEECIALLEKKVDPKNSEPPPQPKARKRTVAERAADEALAAEQEKYMLTYDERRSATTGASHTGDEGTDGNGQSGTTAFEPRFERFKLLADIQKEHEEKKEQEKARQAENERKLQQQKQEQTALLQRQQAEQERTRREEAQRQAQAQIRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAQRRAMAQQQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQSPQNTQVQMPQSSHGHPAQGLSSGTMPAQAAHRFPQQVSQAPVSSPVIRQNTPQNMSSPMVGNAPMQQTNSGMGQSPPRSASVAQSHGPMSVPMTVSMSARGSQQSHPSNTPRMPSATPQMAHGTPINRPMQTPRMTQASPPPGMMAQNSHVGQMLMGGQSMGQVPQAMVAQIQAQQRHQIAQQQMQSMQQNPNMMNGQNAQMRPNPMMQQHLMRQQLLNMQQQNPNMMNMNAAQQAQFIRFQQQQQQQQQQQQQMQGQMPNQQMGNQNFMNAANNMNQAQMMAMQQQMQQQMQQQGQAQGSISVAIANQIRARQQILYRQNIMQFAARFGGVVENIPRDALDQFKNNCLQKARETVQRELAQRRQNMAQNMQNGMQNGMPNGMPNGMPNGMQQGMQQGMPNGMNGMNGMSGMMPQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.82
4 0.84
5 0.82
6 0.78
7 0.74
8 0.66
9 0.61
10 0.57
11 0.49
12 0.39
13 0.32
14 0.3
15 0.27
16 0.27
17 0.25
18 0.24
19 0.28
20 0.33
21 0.37
22 0.37
23 0.42
24 0.49
25 0.55
26 0.63
27 0.61
28 0.6
29 0.62
30 0.69
31 0.73
32 0.72
33 0.72
34 0.69
35 0.73
36 0.76
37 0.77
38 0.76
39 0.75
40 0.76
41 0.75
42 0.75
43 0.72
44 0.69
45 0.66
46 0.6
47 0.53
48 0.44
49 0.38
50 0.34
51 0.29
52 0.28
53 0.23
54 0.21
55 0.21
56 0.26
57 0.3
58 0.33
59 0.33
60 0.31
61 0.31
62 0.35
63 0.43
64 0.47
65 0.48
66 0.5
67 0.57
68 0.63
69 0.7
70 0.74
71 0.71
72 0.72
73 0.7
74 0.67
75 0.69
76 0.72
77 0.74
78 0.72
79 0.66
80 0.63
81 0.67
82 0.7
83 0.64
84 0.61
85 0.52
86 0.47
87 0.47
88 0.41
89 0.33
90 0.28
91 0.25
92 0.19
93 0.21
94 0.2
95 0.21
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.25
100 0.27
101 0.28
102 0.31
103 0.27
104 0.24
105 0.25
106 0.27
107 0.24
108 0.24
109 0.22
110 0.22
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.23
115 0.23
116 0.27
117 0.35
118 0.37
119 0.36
120 0.35
121 0.37
122 0.39
123 0.37
124 0.34
125 0.25
126 0.27
127 0.26
128 0.27
129 0.29
130 0.28
131 0.32
132 0.32
133 0.33
134 0.3
135 0.3
136 0.36
137 0.32
138 0.36
139 0.35
140 0.38
141 0.36
142 0.32
143 0.34
144 0.31
145 0.32
146 0.28
147 0.3
148 0.29
149 0.32
150 0.37
151 0.42
152 0.46
153 0.47
154 0.48
155 0.46
156 0.42
157 0.42
158 0.4
159 0.37
160 0.3
161 0.28
162 0.32
163 0.28
164 0.29
165 0.27
166 0.23
167 0.17
168 0.15
169 0.14
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.1
183 0.14
184 0.17
185 0.2
186 0.22
187 0.23
188 0.3
189 0.37
190 0.36
191 0.39
192 0.41
193 0.41
194 0.49
195 0.54
196 0.55
197 0.5
198 0.48
199 0.45
200 0.46
201 0.45
202 0.41
203 0.38
204 0.41
205 0.42
206 0.41
207 0.38
208 0.41
209 0.47
210 0.47
211 0.49
212 0.43
213 0.41
214 0.43
215 0.44
216 0.39
217 0.34
218 0.29
219 0.26
220 0.23
221 0.24
222 0.26
223 0.28
224 0.27
225 0.28
226 0.34
227 0.38
228 0.41
229 0.39
230 0.39
231 0.36
232 0.34
233 0.3
234 0.24
235 0.17
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.14
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.19
254 0.21
255 0.18
256 0.17
257 0.21
258 0.23
259 0.28
260 0.31
261 0.3
262 0.3
263 0.32
264 0.38
265 0.39
266 0.45
267 0.43
268 0.46
269 0.52
270 0.54
271 0.53
272 0.52
273 0.47
274 0.41
275 0.43
276 0.41
277 0.34
278 0.29
279 0.27
280 0.22
281 0.22
282 0.22
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.18
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.24
329 0.25
330 0.26
331 0.33
332 0.42
333 0.47
334 0.53
335 0.61
336 0.64
337 0.7
338 0.75
339 0.71
340 0.7
341 0.73
342 0.69
343 0.65
344 0.59
345 0.49
346 0.43
347 0.38
348 0.29
349 0.21
350 0.16
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.07
364 0.09
365 0.14
366 0.2
367 0.27
368 0.35
369 0.35
370 0.35
371 0.34
372 0.34
373 0.3
374 0.29
375 0.24
376 0.18
377 0.19
378 0.21
379 0.2
380 0.25
381 0.27
382 0.26
383 0.26
384 0.3
385 0.37
386 0.41
387 0.47
388 0.47
389 0.51
390 0.54
391 0.6
392 0.64
393 0.63
394 0.65
395 0.66
396 0.69
397 0.65
398 0.69
399 0.69
400 0.68
401 0.62
402 0.56
403 0.51
404 0.43
405 0.39
406 0.29
407 0.19
408 0.11
409 0.09
410 0.07
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.13
420 0.15
421 0.22
422 0.22
423 0.23
424 0.24
425 0.24
426 0.23
427 0.19
428 0.18
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.12
434 0.11
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.08
448 0.07
449 0.11
450 0.14
451 0.15
452 0.19
453 0.18
454 0.21
455 0.2
456 0.22
457 0.21
458 0.22
459 0.24
460 0.23
461 0.24
462 0.23
463 0.29
464 0.27
465 0.25
466 0.25
467 0.26
468 0.26
469 0.32
470 0.39
471 0.35
472 0.4
473 0.46
474 0.46
475 0.47
476 0.5
477 0.46
478 0.47
479 0.5
480 0.52
481 0.46
482 0.5
483 0.5
484 0.48
485 0.52
486 0.51
487 0.51
488 0.48
489 0.48
490 0.42
491 0.39
492 0.4
493 0.36
494 0.31
495 0.28
496 0.24
497 0.23
498 0.26
499 0.28
500 0.28
501 0.29
502 0.34
503 0.36
504 0.39
505 0.4
506 0.41
507 0.4
508 0.44
509 0.44
510 0.46
511 0.46
512 0.44
513 0.46
514 0.45
515 0.45
516 0.41
517 0.43
518 0.38
519 0.38
520 0.39
521 0.42
522 0.46
523 0.51
524 0.54
525 0.54
526 0.56
527 0.59
528 0.63
529 0.62
530 0.62
531 0.6
532 0.59
533 0.58
534 0.58
535 0.58
536 0.58
537 0.57
538 0.54
539 0.49
540 0.47
541 0.46
542 0.47
543 0.44
544 0.38
545 0.34
546 0.31
547 0.3
548 0.31
549 0.29
550 0.23
551 0.24
552 0.26
553 0.27
554 0.26
555 0.25
556 0.2
557 0.2
558 0.18
559 0.16
560 0.13
561 0.12
562 0.12
563 0.14
564 0.14
565 0.13
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.11
578 0.14
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.19
583 0.2
584 0.22
585 0.22
586 0.22
587 0.21
588 0.22
589 0.26
590 0.21
591 0.18
592 0.16
593 0.16
594 0.14
595 0.14
596 0.12
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.09
602 0.08
603 0.07
604 0.1
605 0.1
606 0.11
607 0.13
608 0.17
609 0.17
610 0.18
611 0.23
612 0.23
613 0.26
614 0.28
615 0.27
616 0.25
617 0.23
618 0.26
619 0.22
620 0.2
621 0.17
622 0.2
623 0.22
624 0.22
625 0.24
626 0.3
627 0.35
628 0.37
629 0.37
630 0.32
631 0.31
632 0.32
633 0.3
634 0.24
635 0.17
636 0.15
637 0.15
638 0.14
639 0.13
640 0.14
641 0.14
642 0.13
643 0.13
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.11
648 0.09
649 0.09
650 0.15
651 0.16
652 0.17
653 0.16
654 0.17
655 0.18
656 0.18
657 0.22
658 0.22
659 0.24
660 0.23
661 0.24
662 0.24
663 0.22
664 0.22
665 0.17
666 0.12
667 0.11
668 0.11
669 0.1
670 0.11
671 0.11
672 0.11
673 0.12
674 0.12
675 0.1
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.16
680 0.24
681 0.28
682 0.31
683 0.35
684 0.38
685 0.42
686 0.41
687 0.41
688 0.35
689 0.33
690 0.31
691 0.3
692 0.32
693 0.31
694 0.3
695 0.29
696 0.31
697 0.27
698 0.28
699 0.27
700 0.22
701 0.19
702 0.25
703 0.26
704 0.23
705 0.23
706 0.27
707 0.32
708 0.34
709 0.35
710 0.31
711 0.35
712 0.35
713 0.36
714 0.39
715 0.38
716 0.35
717 0.33
718 0.3
719 0.25
720 0.26
721 0.25
722 0.18
723 0.13
724 0.18
725 0.18
726 0.17
727 0.17
728 0.16
729 0.15
730 0.13
731 0.12
732 0.07
733 0.07
734 0.06
735 0.05
736 0.06
737 0.07
738 0.06
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.07
743 0.07
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.07
748 0.12
749 0.16
750 0.17
751 0.17
752 0.22
753 0.23
754 0.24
755 0.25
756 0.27
757 0.28
758 0.32
759 0.35
760 0.34
761 0.34
762 0.36
763 0.37
764 0.35
765 0.35
766 0.31
767 0.31
768 0.28
769 0.31
770 0.29
771 0.26
772 0.24
773 0.21
774 0.23
775 0.24
776 0.24
777 0.23
778 0.24
779 0.27
780 0.27
781 0.29
782 0.29
783 0.26
784 0.3
785 0.3
786 0.32
787 0.35
788 0.4
789 0.39
790 0.36
791 0.35
792 0.32
793 0.36
794 0.36
795 0.38
796 0.35
797 0.37
798 0.39
799 0.4
800 0.43
801 0.37
802 0.34
803 0.28
804 0.23
805 0.21
806 0.17
807 0.2
808 0.17
809 0.17
810 0.15
811 0.14
812 0.16
813 0.16
814 0.18
815 0.16
816 0.19
817 0.23
818 0.26
819 0.34
820 0.42
821 0.5
822 0.57
823 0.66
824 0.66
825 0.69
826 0.73
827 0.71
828 0.67
829 0.63
830 0.57
831 0.52
832 0.49
833 0.47
834 0.41
835 0.41
836 0.38
837 0.35
838 0.31
839 0.3
840 0.34
841 0.32
842 0.36
843 0.29
844 0.28
845 0.27
846 0.27
847 0.26
848 0.18
849 0.18
850 0.15
851 0.18
852 0.18
853 0.17
854 0.16
855 0.13
856 0.13
857 0.12
858 0.1
859 0.1
860 0.1
861 0.12
862 0.14
863 0.18
864 0.22
865 0.21
866 0.22
867 0.26
868 0.31
869 0.31
870 0.32
871 0.32
872 0.33
873 0.33
874 0.32
875 0.26
876 0.21
877 0.19
878 0.16
879 0.13
880 0.08
881 0.08
882 0.1
883 0.11
884 0.12
885 0.14
886 0.16
887 0.18
888 0.2
889 0.22
890 0.23
891 0.26
892 0.34
893 0.41
894 0.46
895 0.47
896 0.49
897 0.5
898 0.47
899 0.45
900 0.4
901 0.33
902 0.28
903 0.25
904 0.21
905 0.18
906 0.16
907 0.18
908 0.13
909 0.14
910 0.15
911 0.16
912 0.16
913 0.16
914 0.16
915 0.14
916 0.16
917 0.18
918 0.2
919 0.26
920 0.29
921 0.35
922 0.43
923 0.44
924 0.48
925 0.48
926 0.47
927 0.46
928 0.53
929 0.52
930 0.53
931 0.56
932 0.55
933 0.59
934 0.61
935 0.61
936 0.6
937 0.64
938 0.63
939 0.62
940 0.62
941 0.6
942 0.6
943 0.61
944 0.6
945 0.58
946 0.55
947 0.53
948 0.51
949 0.46
950 0.4
951 0.35
952 0.29
953 0.25
954 0.21
955 0.19
956 0.16
957 0.15
958 0.15
959 0.15
960 0.13
961 0.13
962 0.16
963 0.16
964 0.16
965 0.16
966 0.19
967 0.19
968 0.19
969 0.18
970 0.19
971 0.2
972 0.2
973 0.21
974 0.17
975 0.2
976 0.2
977 0.2
978 0.16
979 0.15
980 0.14
981 0.13
982 0.12
983 0.09
984 0.08
985 0.08
986 0.06
987 0.06