Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2W9I6

Protein Details
Accession A0A1Y2W9I6    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-128DTKAWLINQKKRQKQIEKARKLEEEHydrophilic
280-306LDISEVKIKKPKKKKSKSTRQRPIDEDBasic
351-375AAQRRDALKKRKRTRPEDIARQLREBasic
602-627KGSGKGKTDKRLKKIEDEKRRESQSMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
66-85AKKKREEKTAAIKKARDAAK
286-299KIKKPKKKKSKSTR
357-365ALKKRKRTR
414-423RKPRKPKSPR
602-620KGSGKGKTDKRLKKIEDEK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAAAIEETNRLRVSLGMKPLPIPGASGPQFKEKTSTSEEDAGSTLESREAAAYDNFKKIQDAEAAKKKREEKTAAIKKARDAAKRLETLQGKGFGDADEGELDTKAWLINQKKRQKQIEKARKLEEELAAAEAEAAAAIQYTSRDLAGVKVGHELGAFEDGEEQILTLKDSNVVGDDEEGDELENLNLREQEKLNKKLELKKKKPVYDPNATDETGERSLLGQYDEEISGKKSQRFTLDGLGNTIQADGAVGQPQNQQRQKINLDFLNEDQPQLASDYLDISEVKIKKPKKKKSKSTRQRPIDEDDIFPLPQPEPDESMDIDSGNTFVSRKRKTDDSTFADDEDLQATLAAQRRDALKKRKRTRPEDIARQLREEANTPEVENEDNGAQEGGLVLDEISEFVSGLKKEDIEDRKPRKPKSPREGPVTAMEDEGDEDEPMKDGYEVDNDRVKRETSTPAETAVIGVDEEKTIGSGLGATLQLLRERQLLKETGAAELNETQRQHQIFIAEKKRKLADIEQDARNQRERDRNSGRLDRMTVREREEWARQQNNMRDQQASRQLVDLFNKGYKPNVELKYHDEHGRSLDQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTDKRLKKIEDEKRRESQSMLDASQNVGMSSATAQQTKKRKEAGVRLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.32
4 0.32
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.35
9 0.3
10 0.26
11 0.2
12 0.26
13 0.28
14 0.32
15 0.32
16 0.39
17 0.41
18 0.39
19 0.42
20 0.35
21 0.38
22 0.4
23 0.42
24 0.38
25 0.43
26 0.42
27 0.38
28 0.37
29 0.31
30 0.25
31 0.21
32 0.17
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.19
41 0.22
42 0.27
43 0.28
44 0.28
45 0.29
46 0.28
47 0.29
48 0.31
49 0.34
50 0.38
51 0.47
52 0.53
53 0.55
54 0.61
55 0.64
56 0.63
57 0.66
58 0.63
59 0.61
60 0.67
61 0.74
62 0.76
63 0.76
64 0.71
65 0.66
66 0.68
67 0.66
68 0.61
69 0.55
70 0.55
71 0.56
72 0.57
73 0.55
74 0.55
75 0.51
76 0.48
77 0.48
78 0.45
79 0.37
80 0.34
81 0.33
82 0.24
83 0.23
84 0.19
85 0.15
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.14
96 0.22
97 0.31
98 0.41
99 0.51
100 0.59
101 0.68
102 0.77
103 0.8
104 0.83
105 0.85
106 0.86
107 0.86
108 0.85
109 0.83
110 0.75
111 0.69
112 0.64
113 0.54
114 0.45
115 0.35
116 0.29
117 0.22
118 0.19
119 0.15
120 0.1
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.03
128 0.03
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.09
144 0.11
145 0.1
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.24
180 0.3
181 0.38
182 0.4
183 0.43
184 0.48
185 0.55
186 0.64
187 0.66
188 0.65
189 0.68
190 0.74
191 0.75
192 0.79
193 0.8
194 0.77
195 0.76
196 0.73
197 0.68
198 0.63
199 0.55
200 0.47
201 0.37
202 0.34
203 0.24
204 0.2
205 0.14
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.08
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.16
218 0.2
219 0.23
220 0.24
221 0.26
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.34
226 0.34
227 0.3
228 0.3
229 0.28
230 0.24
231 0.21
232 0.19
233 0.11
234 0.07
235 0.07
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.13
242 0.17
243 0.25
244 0.28
245 0.31
246 0.32
247 0.39
248 0.43
249 0.41
250 0.42
251 0.35
252 0.35
253 0.33
254 0.31
255 0.31
256 0.26
257 0.23
258 0.19
259 0.17
260 0.14
261 0.14
262 0.12
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.2
274 0.26
275 0.35
276 0.45
277 0.55
278 0.61
279 0.71
280 0.8
281 0.85
282 0.91
283 0.93
284 0.94
285 0.94
286 0.92
287 0.87
288 0.8
289 0.74
290 0.69
291 0.59
292 0.49
293 0.4
294 0.33
295 0.26
296 0.22
297 0.18
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.1
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.07
316 0.15
317 0.18
318 0.2
319 0.23
320 0.29
321 0.32
322 0.39
323 0.44
324 0.42
325 0.46
326 0.44
327 0.41
328 0.37
329 0.33
330 0.26
331 0.18
332 0.12
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.07
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.11
341 0.15
342 0.21
343 0.29
344 0.37
345 0.42
346 0.53
347 0.63
348 0.71
349 0.77
350 0.79
351 0.81
352 0.81
353 0.82
354 0.82
355 0.81
356 0.8
357 0.72
358 0.65
359 0.57
360 0.48
361 0.4
362 0.31
363 0.24
364 0.19
365 0.18
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.13
370 0.11
371 0.1
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.02
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.04
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.18
397 0.23
398 0.28
399 0.38
400 0.44
401 0.52
402 0.6
403 0.63
404 0.66
405 0.71
406 0.74
407 0.74
408 0.78
409 0.77
410 0.77
411 0.75
412 0.67
413 0.63
414 0.55
415 0.45
416 0.34
417 0.27
418 0.19
419 0.17
420 0.16
421 0.1
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.13
432 0.14
433 0.16
434 0.22
435 0.22
436 0.23
437 0.25
438 0.24
439 0.2
440 0.22
441 0.27
442 0.27
443 0.31
444 0.3
445 0.3
446 0.3
447 0.27
448 0.25
449 0.17
450 0.12
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.09
469 0.09
470 0.11
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.2
475 0.21
476 0.2
477 0.24
478 0.23
479 0.2
480 0.21
481 0.2
482 0.17
483 0.2
484 0.21
485 0.21
486 0.21
487 0.21
488 0.24
489 0.25
490 0.24
491 0.21
492 0.23
493 0.26
494 0.35
495 0.44
496 0.46
497 0.48
498 0.51
499 0.52
500 0.5
501 0.47
502 0.45
503 0.44
504 0.47
505 0.52
506 0.51
507 0.56
508 0.58
509 0.57
510 0.56
511 0.48
512 0.45
513 0.48
514 0.49
515 0.52
516 0.57
517 0.61
518 0.63
519 0.69
520 0.66
521 0.61
522 0.6
523 0.55
524 0.54
525 0.53
526 0.49
527 0.46
528 0.45
529 0.45
530 0.46
531 0.48
532 0.5
533 0.52
534 0.54
535 0.53
536 0.58
537 0.62
538 0.66
539 0.65
540 0.6
541 0.55
542 0.51
543 0.55
544 0.56
545 0.52
546 0.43
547 0.39
548 0.38
549 0.38
550 0.4
551 0.34
552 0.28
553 0.28
554 0.29
555 0.27
556 0.29
557 0.27
558 0.28
559 0.34
560 0.37
561 0.38
562 0.39
563 0.44
564 0.47
565 0.49
566 0.5
567 0.42
568 0.37
569 0.38
570 0.42
571 0.4
572 0.34
573 0.37
574 0.36
575 0.39
576 0.4
577 0.43
578 0.37
579 0.35
580 0.42
581 0.43
582 0.46
583 0.46
584 0.51
585 0.46
586 0.47
587 0.54
588 0.5
589 0.49
590 0.47
591 0.5
592 0.47
593 0.53
594 0.56
595 0.59
596 0.65
597 0.68
598 0.71
599 0.75
600 0.75
601 0.77
602 0.81
603 0.82
604 0.82
605 0.82
606 0.81
607 0.8
608 0.81
609 0.72
610 0.63
611 0.58
612 0.55
613 0.52
614 0.46
615 0.41
616 0.36
617 0.35
618 0.36
619 0.3
620 0.22
621 0.16
622 0.14
623 0.11
624 0.12
625 0.16
626 0.16
627 0.2
628 0.23
629 0.3
630 0.41
631 0.48
632 0.54
633 0.55
634 0.59
635 0.65