Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VT00

Protein Details
Accession A0A1Y2VT00    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-75DAFGNTGRVSRKKKERRQKVAVKLSGDHydrophilic
535-557LEVWCAQKERRERDKGKGKAFLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-67SRKKKERRQK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, cyto 4.5, mito 2, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033599  TAF1B/Rrn7  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
Amino Acid Sequences MAPLKYHRFKGGERCEECGARQWYSQDALRYCRNGHRLEGFAEHEADEDAFGNTGRVSRKKKERRQKVAVKLSGDEGQELYLEALQLVLLKQVWWLIHEKGFPQDFEEIVRALWSLRVRNLPLRESGNGSRRRNAESNEDTEGWASSAGLFSSQSEMSGVESSDVDFSDATTANWAPDPSRRWKLPKLVDTLALCYLGCLVRRLPITTADFCNWAQKGDIEYLAARNCIPRNVLDRLPPRHHSALQTKDRVYPTRLQAAVKELIISYRVNFDTIFPPLNYPPILAKFITELTLPIEVYLTVKCLAEILDRDYSYPTGGKRIRTMDNPEVLLISLVVVSAKLLYPLDGVERPPRTHQDPRIMKFDWVKWQGVTSDESAPATTTGLPRGEEYKVTPEDVLTMDKEKLDDYMDWFEKMWTGTSDLKTEERIREPFEAQKRVSAPRNLDQQLVDQEETKRIKDRYQDLHSSITTVEPVPDDEDQEIENKEKQDRDFLPVWRTEEDLPDAANGFYKKAASLAVIPLDTLLRGAVQVERQLEVWCAQKERRERDKGKGKAFLSGNESDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.62
3 0.59
4 0.54
5 0.53
6 0.47
7 0.39
8 0.39
9 0.36
10 0.34
11 0.37
12 0.39
13 0.37
14 0.36
15 0.39
16 0.43
17 0.45
18 0.45
19 0.49
20 0.53
21 0.48
22 0.5
23 0.5
24 0.46
25 0.45
26 0.46
27 0.41
28 0.36
29 0.34
30 0.28
31 0.23
32 0.21
33 0.18
34 0.14
35 0.11
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.11
42 0.17
43 0.25
44 0.32
45 0.41
46 0.53
47 0.63
48 0.74
49 0.81
50 0.87
51 0.89
52 0.93
53 0.93
54 0.93
55 0.93
56 0.88
57 0.8
58 0.7
59 0.62
60 0.56
61 0.46
62 0.36
63 0.25
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.12
68 0.08
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.15
83 0.16
84 0.2
85 0.22
86 0.22
87 0.27
88 0.29
89 0.27
90 0.26
91 0.25
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.15
96 0.13
97 0.14
98 0.11
99 0.09
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.19
104 0.24
105 0.27
106 0.34
107 0.38
108 0.36
109 0.37
110 0.38
111 0.36
112 0.37
113 0.41
114 0.43
115 0.48
116 0.49
117 0.51
118 0.5
119 0.55
120 0.54
121 0.5
122 0.51
123 0.46
124 0.47
125 0.46
126 0.44
127 0.37
128 0.33
129 0.3
130 0.2
131 0.15
132 0.11
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.15
165 0.2
166 0.25
167 0.32
168 0.36
169 0.41
170 0.47
171 0.56
172 0.59
173 0.61
174 0.6
175 0.55
176 0.55
177 0.5
178 0.45
179 0.37
180 0.28
181 0.21
182 0.14
183 0.14
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.19
193 0.22
194 0.24
195 0.26
196 0.23
197 0.24
198 0.23
199 0.27
200 0.22
201 0.19
202 0.16
203 0.15
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.1
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.18
219 0.22
220 0.24
221 0.28
222 0.34
223 0.4
224 0.44
225 0.44
226 0.45
227 0.44
228 0.44
229 0.43
230 0.43
231 0.46
232 0.48
233 0.5
234 0.46
235 0.48
236 0.48
237 0.45
238 0.41
239 0.37
240 0.33
241 0.36
242 0.36
243 0.31
244 0.29
245 0.31
246 0.28
247 0.22
248 0.19
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.11
263 0.13
264 0.12
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.14
302 0.11
303 0.17
304 0.19
305 0.21
306 0.24
307 0.28
308 0.31
309 0.33
310 0.4
311 0.37
312 0.37
313 0.36
314 0.32
315 0.28
316 0.24
317 0.2
318 0.12
319 0.07
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.16
336 0.19
337 0.2
338 0.23
339 0.28
340 0.32
341 0.39
342 0.43
343 0.48
344 0.53
345 0.55
346 0.58
347 0.55
348 0.51
349 0.48
350 0.46
351 0.44
352 0.39
353 0.37
354 0.31
355 0.31
356 0.29
357 0.26
358 0.24
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.17
377 0.2
378 0.21
379 0.21
380 0.2
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.2
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.2
400 0.19
401 0.19
402 0.17
403 0.11
404 0.14
405 0.18
406 0.2
407 0.21
408 0.22
409 0.23
410 0.26
411 0.29
412 0.3
413 0.3
414 0.31
415 0.33
416 0.35
417 0.37
418 0.41
419 0.44
420 0.46
421 0.41
422 0.44
423 0.44
424 0.47
425 0.52
426 0.49
427 0.47
428 0.47
429 0.56
430 0.52
431 0.5
432 0.44
433 0.41
434 0.4
435 0.38
436 0.32
437 0.26
438 0.26
439 0.31
440 0.33
441 0.31
442 0.33
443 0.3
444 0.35
445 0.4
446 0.47
447 0.49
448 0.54
449 0.59
450 0.55
451 0.58
452 0.53
453 0.46
454 0.38
455 0.29
456 0.23
457 0.17
458 0.15
459 0.11
460 0.12
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.19
471 0.2
472 0.24
473 0.28
474 0.29
475 0.35
476 0.36
477 0.4
478 0.42
479 0.44
480 0.45
481 0.45
482 0.47
483 0.39
484 0.39
485 0.34
486 0.32
487 0.31
488 0.26
489 0.22
490 0.2
491 0.2
492 0.17
493 0.2
494 0.17
495 0.14
496 0.15
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.12
502 0.14
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.17
507 0.17
508 0.17
509 0.14
510 0.12
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.1
516 0.12
517 0.16
518 0.18
519 0.19
520 0.19
521 0.21
522 0.21
523 0.21
524 0.25
525 0.25
526 0.28
527 0.31
528 0.38
529 0.47
530 0.55
531 0.63
532 0.67
533 0.69
534 0.74
535 0.81
536 0.83
537 0.82
538 0.8
539 0.71
540 0.69
541 0.66
542 0.6
543 0.56