FuNGI

A0A1Y2WCI0

Protein Details

Accession

A0A1Y2WCI0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
142-165	SALRSNKPAPKRPLKRPSPEPDAD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
146-159	SNKPAPKRPLKRPS

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MASSSRNGEHRSVHQDFIARIRFSNALPPPPFPPKLLDIPNIGISEYVKPGYASRLSREQPLNIEADAELGMPLSLVGMPGIFDGDESSIQAPDEPPVLHPRDRALLRGPGNLGPKVNEANVSFLRRTEYISSVTTKHNPGSALRSNKPAPKRPLKRPSPEPDADSPAAIKRKIDQGFAVTAANLKDKTRVKHPTKHNVKLVDAFPLIPDLDAFPDSGAYVAFKFTHNPLPSGRVYDRRLLNGILKPINKSEEEEAAFQMAMQAHERDPQHVPKPQNMMDFDYFLNDNQDGSDRFRQKFDIENPDHDDEGLYTHTDANGKSNFKFPRLRAYETSQEVELNNQTKYDEEVVLAFNEDDMIDQKAAFYYPIMQRSVIKPQRTKKIARSIGFVPADVDLEERNIDQLDVSVEDPSDDIREWMNLYRDHPYGKEDDEEAEGEAGHAPNGNDDDDAEHREANGQSTQVIDVEDEDQDAEGDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.44
3	0.42
4	0.45
5	0.46
6	0.37
7	0.34
8	0.35
9	0.35
10	0.31
11	0.39
12	0.36
13	0.37
14	0.38
15	0.4
16	0.43
17	0.49
18	0.5
19	0.43
20	0.42
21	0.38
22	0.44
23	0.47
24	0.45
25	0.4
26	0.41
27	0.44
28	0.39
29	0.33
30	0.26
31	0.22
32	0.21
33	0.2
34	0.17
35	0.14
36	0.14
37	0.15
38	0.2
39	0.25
40	0.25
41	0.28
42	0.36
43	0.38
44	0.45
45	0.48
46	0.45
47	0.43
48	0.43
49	0.4
50	0.3
51	0.3
52	0.21
53	0.19
54	0.15
55	0.11
56	0.08
57	0.06
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.05
69	0.04
70	0.04
71	0.05
72	0.06
73	0.07
74	0.08
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.12
82	0.11
83	0.12
84	0.19
85	0.24
86	0.25
87	0.26
88	0.27
89	0.32
90	0.33
91	0.34
92	0.31
93	0.34
94	0.35
95	0.37
96	0.36
97	0.33
98	0.36
99	0.35
100	0.31
101	0.25
102	0.25
103	0.24
104	0.22
105	0.21
106	0.18
107	0.21
108	0.24
109	0.26
110	0.24
111	0.22
112	0.25
113	0.22
114	0.25
115	0.23
116	0.22
117	0.21
118	0.23
119	0.24
120	0.24
121	0.28
122	0.29
123	0.28
124	0.27
125	0.26
126	0.25
127	0.25
128	0.3
129	0.33
130	0.36
131	0.36
132	0.41
133	0.43
134	0.49
135	0.54
136	0.56
137	0.58
138	0.61
139	0.68
140	0.73
141	0.79
142	0.82
143	0.83
144	0.83
145	0.82
146	0.8
147	0.74
148	0.68
149	0.61
150	0.58
151	0.49
152	0.4
153	0.33
154	0.29
155	0.29
156	0.25
157	0.21
158	0.17
159	0.25
160	0.27
161	0.27
162	0.23
163	0.22
164	0.23
165	0.24
166	0.21
167	0.13
168	0.13
169	0.12
170	0.13
171	0.12
172	0.11
173	0.17
174	0.21
175	0.24
176	0.31
177	0.4
178	0.45
179	0.53
180	0.62
181	0.66
182	0.72
183	0.77
184	0.74
185	0.66
186	0.62
187	0.57
188	0.49
189	0.41
190	0.32
191	0.24
192	0.19
193	0.17
194	0.15
195	0.09
196	0.09
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.09
213	0.17
214	0.17
215	0.18
216	0.19
217	0.22
218	0.22
219	0.26
220	0.26
221	0.25
222	0.27
223	0.32
224	0.32
225	0.29
226	0.3
227	0.26
228	0.29
229	0.24
230	0.25
231	0.23
232	0.23
233	0.22
234	0.22
235	0.23
236	0.19
237	0.19
238	0.17
239	0.17
240	0.18
241	0.18
242	0.16
243	0.15
244	0.14
245	0.12
246	0.12
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.13
253	0.14
254	0.15
255	0.17
256	0.22
257	0.26
258	0.31
259	0.33
260	0.33
261	0.39
262	0.39
263	0.4
264	0.37
265	0.36
266	0.31
267	0.31
268	0.26
269	0.22
270	0.19
271	0.15
272	0.15
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.14
279	0.22
280	0.26
281	0.27
282	0.28
283	0.3
284	0.29
285	0.36
286	0.37
287	0.4
288	0.37
289	0.4
290	0.44
291	0.44
292	0.43
293	0.35
294	0.29
295	0.18
296	0.17
297	0.13
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.13
305	0.17
306	0.19
307	0.19
308	0.27
309	0.27
310	0.31
311	0.38
312	0.34
313	0.41
314	0.44
315	0.48
316	0.45
317	0.5
318	0.52
319	0.48
320	0.49
321	0.38
322	0.34
323	0.29
324	0.27
325	0.26
326	0.21
327	0.18
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.18
332	0.17
333	0.13
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.1
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.12
354	0.16
355	0.21
356	0.22
357	0.22
358	0.25
359	0.28
360	0.39
361	0.39
362	0.43
363	0.47
364	0.54
365	0.63
366	0.67
367	0.7
368	0.69
369	0.73
370	0.74
371	0.68
372	0.65
373	0.57
374	0.59
375	0.53
376	0.44
377	0.33
378	0.25
379	0.24
380	0.19
381	0.17
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.11
404	0.13
405	0.17
406	0.21
407	0.22
408	0.24
409	0.28
410	0.29
411	0.31
412	0.3
413	0.29
414	0.28
415	0.28
416	0.28
417	0.24
418	0.24
419	0.24
420	0.23
421	0.2
422	0.17
423	0.14
424	0.12
425	0.13
426	0.12
427	0.1
428	0.11
429	0.1
430	0.13
431	0.15
432	0.15
433	0.12
434	0.13
435	0.16
436	0.17
437	0.22
438	0.2
439	0.19
440	0.18
441	0.23
442	0.23
443	0.23
444	0.22
445	0.19
446	0.18
447	0.19
448	0.19
449	0.15
450	0.15
451	0.12
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.1
458	0.09
459	0.1
460	0.09

A0A1Y2WCI0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer