Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2W8M9

Protein Details
Accession A0A1Y2W8M9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-281GRAKSSRTPTRRRRRGGPGSARGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-288RAKSSRTPTRRRRRGGPGSARGGAGKRKA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MATKRGPSPQLVGNPFIKKQNLEWTLDPSGLSHKNYGIISQYEETSSEEEEPEAPAVEAGEAKIEDHLGYFSSRLVKAMLFPYPPGIPRLSIESYRKLYETNWGNPKGAHFIVHQHDHPIAGTHYDLRLQINETSSVSWAIMYGLPGDPNSQRLNRNATETRIHCLWNHLIETASHSTGSLLIWDTGTYTILPSRDLHKRIGSNSQSEDEDASSPQLTEQEKLHQAFQSRKIRIRLHGTRLPRNYVLNLRLTKEEDVAGRAKSSRTPTRRRRRGGPGSARGGAGKRKAAELETSSDSENGNGDEEELELSEIVKAPVEQADPDAVSAMEREIRELEDEQVCRRNAYAGATNSIGSVHQRRWYLSLDREACGFVKRPKAGRVVWEPAVDAETREGGKDTGRLAFPFYVHGAEVERSVVTGRMGADVLKDEGVEGYVRRKGWRPVLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.52
4 0.48
5 0.41
6 0.42
7 0.48
8 0.45
9 0.45
10 0.44
11 0.45
12 0.44
13 0.42
14 0.38
15 0.28
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.26
20 0.25
21 0.28
22 0.29
23 0.29
24 0.26
25 0.23
26 0.25
27 0.24
28 0.24
29 0.2
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.19
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.07
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.18
65 0.21
66 0.22
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.23
72 0.22
73 0.2
74 0.17
75 0.18
76 0.23
77 0.24
78 0.28
79 0.31
80 0.36
81 0.37
82 0.38
83 0.37
84 0.32
85 0.29
86 0.32
87 0.35
88 0.36
89 0.41
90 0.42
91 0.42
92 0.42
93 0.43
94 0.4
95 0.33
96 0.27
97 0.19
98 0.24
99 0.29
100 0.32
101 0.3
102 0.27
103 0.27
104 0.26
105 0.25
106 0.2
107 0.15
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.12
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.13
137 0.16
138 0.19
139 0.21
140 0.24
141 0.31
142 0.3
143 0.36
144 0.35
145 0.35
146 0.38
147 0.37
148 0.37
149 0.32
150 0.32
151 0.25
152 0.27
153 0.27
154 0.22
155 0.22
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.2
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.13
182 0.2
183 0.22
184 0.24
185 0.27
186 0.29
187 0.3
188 0.38
189 0.36
190 0.33
191 0.32
192 0.32
193 0.28
194 0.26
195 0.24
196 0.16
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.15
208 0.19
209 0.2
210 0.21
211 0.19
212 0.22
213 0.25
214 0.34
215 0.38
216 0.37
217 0.42
218 0.47
219 0.48
220 0.5
221 0.54
222 0.52
223 0.5
224 0.52
225 0.53
226 0.55
227 0.54
228 0.54
229 0.46
230 0.41
231 0.36
232 0.35
233 0.32
234 0.31
235 0.3
236 0.27
237 0.27
238 0.28
239 0.26
240 0.22
241 0.2
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.16
250 0.22
251 0.29
252 0.35
253 0.46
254 0.56
255 0.66
256 0.76
257 0.77
258 0.79
259 0.81
260 0.83
261 0.83
262 0.82
263 0.78
264 0.73
265 0.69
266 0.6
267 0.51
268 0.43
269 0.37
270 0.3
271 0.25
272 0.21
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.2
278 0.21
279 0.2
280 0.21
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.16
285 0.14
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.15
322 0.18
323 0.19
324 0.21
325 0.23
326 0.28
327 0.28
328 0.26
329 0.25
330 0.24
331 0.2
332 0.23
333 0.27
334 0.23
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.23
339 0.22
340 0.18
341 0.15
342 0.18
343 0.18
344 0.23
345 0.24
346 0.26
347 0.29
348 0.34
349 0.36
350 0.37
351 0.44
352 0.41
353 0.4
354 0.4
355 0.38
356 0.34
357 0.3
358 0.3
359 0.26
360 0.32
361 0.37
362 0.41
363 0.45
364 0.51
365 0.5
366 0.53
367 0.55
368 0.53
369 0.51
370 0.47
371 0.42
372 0.36
373 0.35
374 0.27
375 0.2
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.14
383 0.16
384 0.17
385 0.19
386 0.21
387 0.2
388 0.23
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.23
393 0.19
394 0.17
395 0.18
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.11
420 0.15
421 0.2
422 0.21
423 0.25
424 0.31
425 0.39