FuNGI

A0A1Y2W5T0

Protein Details

Accession

A0A1Y2W5T0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-106	RTTNSPPRKPNPGGTRKKKASASKNTA	Hydrophilic
358-385	KKGKGKESKAPAKPKRKKKSGTANNPIL	Basic
611-630	TEPVNPPRLRGRPRKNSSAE	Hydrophilic
635-663	TKASAPKVTTPKKPRGRQRKDVPKPVEIA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-100	PRKPNPGGTRKKKAS
147-173	TKATTKGKAKKTETVSKHFAAKEGGAK
358-377	KKGKGKESKAPAKPKRKKKS
618-655	RLRGRPRKNSSAESSAPTKASAPKVTTPKKPRGRQRKD

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027784 Slx4_ascomycetes IPR018574 Structure-sp_endonuc_su_Slx4
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0006260 P:DNA replication GO:0006996 P:organelle organization
Pfam	View protein in Pfam PF09494 Slx4
CDD	cd22999 SAP_SLX4

Amino Acid Sequences

MSTTDVFLSSPPGPSRSNHYTMSSSPSLPPVDELLRKTPKRPPLRSGDNAAPIPNDVRATFTSAASLLREVPEIDIDTERTTNSPPRKPNPGGTRKKKASASKNTAVPAEAPILIESSPGDKSWQKFKSENLGSKSEKPSTSKNPATKATTKGKAKKTETVSKHFAAKEGGAKRSEKGSDNEAAVRKLETQSAGGPSCSEPALRRRDDWTPPPTSAHVILELGSDDPELLSSIDKMSRSKDVFQSLQDQYGCKDIRSVASGQPPPQVDALRKRKMIELVSTGSEVEQHSRETSLSKPAVPKKKTRTITELATAPYMLPTGPELDIAGPSTKDSLLNYFDSDGAVKALVEHQTAVMSQKKGKGKESKAPAKPKRKKKSGTANNPILLSPSSALKQSSNQDFVFGTSSQLVMEESPTTLRDLQLAIQASNQVDSDPFTESDSQGLWRAGARDTDGTLMKVDDVEVVNDVPSLPPLKGQSRYLREEFVDINDILKSSDIDESTEKPLQQDSHFEPQAPSSAQLLEVATQGHVKPQSAQETADPRPEFESWGDTQLSKQIASYGFKPVKKRQAMIALLDQCWSSKNPKTATTQSNPMSTSSSLNVPKMKPEVTTTEPVNPPRLRGRPRKNSSAESSAPTKASAPKVTTPKKPRGRQRKDVPKPVEIADSEVDESASSSRASSPDVDHIFSSPPAVDLSIAEEADMSLTMSPSSHQADLFKHITKAVISAPRSRDPSQPSWHEKMLLYDPIVLEDLAAWLNTGALSGAGYDGEVSPFDVKKWCESKSVICLWRQNLHGKERKRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.36
3	0.39
4	0.42
5	0.4
6	0.42
7	0.43
8	0.43
9	0.49
10	0.43
11	0.37
12	0.34
13	0.35
14	0.32
15	0.29
16	0.28
17	0.25
18	0.28
19	0.3
20	0.33
21	0.37
22	0.46
23	0.48
24	0.51
25	0.55
26	0.59
27	0.66
28	0.69
29	0.68
30	0.68
31	0.76
32	0.77
33	0.76
34	0.73
35	0.7
36	0.64
37	0.57
38	0.47
39	0.39
40	0.34
41	0.3
42	0.24
43	0.16
44	0.19
45	0.19
46	0.24
47	0.24
48	0.22
49	0.21
50	0.2
51	0.21
52	0.18
53	0.18
54	0.13
55	0.13
56	0.14
57	0.13
58	0.13
59	0.14
60	0.15
61	0.16
62	0.16
63	0.16
64	0.18
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.19
69	0.26
70	0.33
71	0.39
72	0.46
73	0.52
74	0.62
75	0.65
76	0.71
77	0.74
78	0.76
79	0.79
80	0.8
81	0.84
82	0.81
83	0.84
84	0.82
85	0.81
86	0.8
87	0.8
88	0.8
89	0.76
90	0.75
91	0.7
92	0.62
93	0.53
94	0.43
95	0.34
96	0.28
97	0.21
98	0.16
99	0.14
100	0.14
101	0.12
102	0.12
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.1
107	0.13
108	0.17
109	0.2
110	0.3
111	0.35
112	0.38
113	0.4
114	0.44
115	0.52
116	0.56
117	0.6
118	0.55
119	0.58
120	0.56
121	0.61
122	0.62
123	0.57
124	0.52
125	0.48
126	0.52
127	0.53
128	0.59
129	0.6
130	0.6
131	0.61
132	0.63
133	0.66
134	0.63
135	0.62
136	0.61
137	0.62
138	0.65
139	0.68
140	0.71
141	0.73
142	0.73
143	0.73
144	0.73
145	0.74
146	0.71
147	0.7
148	0.67
149	0.6
150	0.61
151	0.53
152	0.47
153	0.4
154	0.35
155	0.35
156	0.35
157	0.36
158	0.33
159	0.34
160	0.33
161	0.36
162	0.37
163	0.33
164	0.31
165	0.31
166	0.32
167	0.32
168	0.37
169	0.34
170	0.31
171	0.28
172	0.26
173	0.23
174	0.21
175	0.21
176	0.16
177	0.15
178	0.17
179	0.21
180	0.2
181	0.18
182	0.18
183	0.17
184	0.17
185	0.16
186	0.14
187	0.13
188	0.21
189	0.29
190	0.3
191	0.31
192	0.34
193	0.41
194	0.47
195	0.51
196	0.5
197	0.46
198	0.45
199	0.45
200	0.43
201	0.39
202	0.34
203	0.27
204	0.21
205	0.17
206	0.16
207	0.14
208	0.12
209	0.1
210	0.08
211	0.07
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.07
220	0.09
221	0.11
222	0.12
223	0.14
224	0.2
225	0.22
226	0.26
227	0.29
228	0.33
229	0.34
230	0.34
231	0.39
232	0.34
233	0.36
234	0.32
235	0.28
236	0.23
237	0.29
238	0.27
239	0.2
240	0.2
241	0.17
242	0.18
243	0.2
244	0.22
245	0.19
246	0.27
247	0.29
248	0.29
249	0.32
250	0.31
251	0.29
252	0.29
253	0.27
254	0.24
255	0.32
256	0.4
257	0.42
258	0.43
259	0.43
260	0.44
261	0.47
262	0.45
263	0.38
264	0.33
265	0.29
266	0.28
267	0.27
268	0.23
269	0.18
270	0.17
271	0.14
272	0.12
273	0.11
274	0.1
275	0.11
276	0.11
277	0.12
278	0.12
279	0.13
280	0.19
281	0.19
282	0.2
283	0.27
284	0.35
285	0.44
286	0.46
287	0.53
288	0.54
289	0.63
290	0.66
291	0.64
292	0.62
293	0.57
294	0.57
295	0.52
296	0.46
297	0.37
298	0.31
299	0.26
300	0.19
301	0.15
302	0.12
303	0.08
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.09
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.1
341	0.12
342	0.13
343	0.15
344	0.21
345	0.25
346	0.27
347	0.34
348	0.41
349	0.42
350	0.48
351	0.55
352	0.59
353	0.62
354	0.71
355	0.73
356	0.75
357	0.8
358	0.83
359	0.84
360	0.84
361	0.82
362	0.81
363	0.83
364	0.82
365	0.84
366	0.82
367	0.77
368	0.69
369	0.64
370	0.54
371	0.44
372	0.33
373	0.23
374	0.14
375	0.09
376	0.08
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.12
381	0.16
382	0.19
383	0.21
384	0.21
385	0.21
386	0.2
387	0.2
388	0.19
389	0.15
390	0.12
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.12
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.07
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.1
438	0.12
439	0.11
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.04
455	0.05
456	0.06
457	0.05
458	0.07
459	0.11
460	0.14
461	0.17
462	0.22
463	0.3
464	0.34
465	0.4
466	0.39
467	0.38
468	0.35
469	0.34
470	0.3
471	0.24
472	0.21
473	0.16
474	0.15
475	0.13
476	0.12
477	0.1
478	0.1
479	0.08
480	0.06
481	0.08
482	0.08
483	0.1
484	0.11
485	0.13
486	0.18
487	0.2
488	0.18
489	0.17
490	0.19
491	0.2
492	0.19
493	0.23
494	0.23
495	0.3
496	0.3
497	0.3
498	0.28
499	0.26
500	0.29
501	0.24
502	0.2
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.11
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.07
512	0.09
513	0.08
514	0.11
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.17
519	0.22
520	0.22
521	0.23
522	0.24
523	0.28
524	0.3
525	0.35
526	0.31
527	0.26
528	0.28
529	0.28
530	0.25
531	0.2
532	0.23
533	0.17
534	0.2
535	0.2
536	0.17
537	0.17
538	0.19
539	0.19
540	0.15
541	0.14
542	0.14
543	0.16
544	0.18
545	0.2
546	0.25
547	0.3
548	0.33
549	0.4
550	0.44
551	0.51
552	0.53
553	0.54
554	0.5
555	0.53
556	0.52
557	0.49
558	0.49
559	0.42
560	0.38
561	0.37
562	0.31
563	0.22
564	0.21
565	0.2
566	0.17
567	0.2
568	0.26
569	0.28
570	0.33
571	0.4
572	0.47
573	0.53
574	0.52
575	0.55
576	0.51
577	0.51
578	0.47
579	0.41
580	0.36
581	0.29
582	0.27
583	0.2
584	0.24
585	0.23
586	0.25
587	0.29
588	0.27
589	0.3
590	0.31
591	0.31
592	0.26
593	0.27
594	0.3
595	0.3
596	0.34
597	0.32
598	0.36
599	0.39
600	0.4
601	0.45
602	0.39
603	0.38
604	0.42
605	0.49
606	0.51
607	0.57
608	0.66
609	0.69
610	0.75
611	0.82
612	0.79
613	0.77
614	0.74
615	0.71
616	0.63
617	0.56
618	0.52
619	0.45
620	0.39
621	0.33
622	0.29
623	0.27
624	0.3
625	0.3
626	0.31
627	0.36
628	0.45
629	0.52
630	0.59
631	0.62
632	0.67
633	0.73
634	0.78
635	0.81
636	0.83
637	0.86
638	0.87
639	0.9
640	0.9
641	0.91
642	0.92
643	0.87
644	0.81
645	0.74
646	0.65
647	0.59
648	0.48
649	0.41
650	0.31
651	0.27
652	0.22
653	0.19
654	0.17
655	0.12
656	0.12
657	0.09
658	0.09
659	0.08
660	0.08
661	0.1
662	0.1
663	0.13
664	0.14
665	0.16
666	0.24
667	0.26
668	0.27
669	0.25
670	0.26
671	0.26
672	0.23
673	0.22
674	0.14
675	0.12
676	0.11
677	0.11
678	0.1
679	0.08
680	0.12
681	0.13
682	0.12
683	0.11
684	0.11
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.07
689	0.05
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.1
695	0.14
696	0.14
697	0.15
698	0.18
699	0.21
700	0.27
701	0.31
702	0.3
703	0.28
704	0.27
705	0.28
706	0.25
707	0.25
708	0.24
709	0.28
710	0.28
711	0.35
712	0.4
713	0.45
714	0.5
715	0.51
716	0.52
717	0.52
718	0.57
719	0.59
720	0.63
721	0.64
722	0.64
723	0.64
724	0.6
725	0.53
726	0.51
727	0.47
728	0.42
729	0.35
730	0.31
731	0.29
732	0.27
733	0.27
734	0.21
735	0.16
736	0.11
737	0.11
738	0.09
739	0.08
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.05
746	0.04
747	0.04
748	0.04
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.06
753	0.06
754	0.07
755	0.07
756	0.09
757	0.12
758	0.13
759	0.15
760	0.2
761	0.21
762	0.3
763	0.35
764	0.36
765	0.38
766	0.42
767	0.47
768	0.5
769	0.57
770	0.53
771	0.54
772	0.59
773	0.58
774	0.6
775	0.58
776	0.59
777	0.56
778	0.62
779	0.65

A0A1Y2W5T0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer