Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WE79

Protein Details
Accession A0A1Y2WE79    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273RGKGVAKRPNRNAYWRGRRPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-273GKGVAKRPNRNAYWRGRRP
Subcellular Location(s) cyto 9, cyto_mito 8.833, cyto_nucl 7.833, mito 7.5, nucl 5.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MTVLRGGTKAVESCCTCATLLTELPRYTSSEKPLPEDRQLECCQRVICGNCRNNNPRFNTYCPYCQISLIDTTLPPGLKDPPSYESSIAAGSSRVTSAPPPYTPSTTSKTSDQFDEKSVPLDSTEELAEDTLHFLNHAHDTIPSLSLRYGVPASALRRANNITSDHLILGRRTVIIPGEFYKGGASLSPRPIEGEEEEARKSKIRRWMVACKVHEYDVAVLYLEQAGYDLEMATEAFFADEEWERTHPVEAVGRGKGVAKRPNRNAYWRGRRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.21
5 0.22
6 0.19
7 0.21
8 0.23
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.29
13 0.31
14 0.31
15 0.33
16 0.34
17 0.35
18 0.37
19 0.41
20 0.48
21 0.49
22 0.51
23 0.52
24 0.47
25 0.49
26 0.52
27 0.52
28 0.46
29 0.44
30 0.37
31 0.34
32 0.37
33 0.34
34 0.38
35 0.41
36 0.47
37 0.5
38 0.58
39 0.64
40 0.66
41 0.69
42 0.67
43 0.65
44 0.63
45 0.62
46 0.6
47 0.57
48 0.55
49 0.51
50 0.48
51 0.41
52 0.37
53 0.33
54 0.27
55 0.25
56 0.21
57 0.18
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.2
69 0.23
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.2
74 0.18
75 0.16
76 0.12
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.08
84 0.11
85 0.14
86 0.14
87 0.18
88 0.2
89 0.22
90 0.25
91 0.28
92 0.28
93 0.29
94 0.31
95 0.3
96 0.32
97 0.31
98 0.31
99 0.3
100 0.27
101 0.26
102 0.26
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.16
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.09
111 0.09
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.12
141 0.17
142 0.19
143 0.18
144 0.2
145 0.22
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.14
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.21
180 0.19
181 0.2
182 0.2
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.23
187 0.25
188 0.26
189 0.25
190 0.32
191 0.37
192 0.43
193 0.49
194 0.58
195 0.63
196 0.71
197 0.67
198 0.63
199 0.59
200 0.52
201 0.46
202 0.37
203 0.3
204 0.22
205 0.2
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.09
228 0.11
229 0.14
230 0.15
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.17
235 0.18
236 0.21
237 0.23
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.24
242 0.28
243 0.3
244 0.34
245 0.38
246 0.43
247 0.52
248 0.62
249 0.71
250 0.72
251 0.76
252 0.77
253 0.8