Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WFP5

Protein Details
Accession A0A1Y2WFP5    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-38MADQSRRRRNRPDSKQMWDESDRRSRHEPNPRDKRDDHBasic
42-86REDNYRERDRRYRSRSRSPRRDRRERPRERDRRDRDRDDDKPRQRBasic
92-114RPRGDDFRDRKERDRRRDRDEAPBasic
278-298AGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-120RRSRHEPNPRDKRDDHGRDREDNYRERDRRYRSRSRSPRRDRRERPRERDRRDRDRDDDKPRQRDDDRARPRGDDFRDRKERDRRRDRDEAPPKGAHH
135-161HGAAPARDRSPRRSASPRRSPDRGLAR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADQSRRRRNRPDSKQMWDESDRRSRHEPNPRDKRDDHGRDREDNYRERDRRYRSRSRSPRRDRRERPRERDRRDRDRDDDKPRQRDDDRARPRGDDFRDRKERDRRRDRDEAPPKGAHHNAPSQQPPSSNRVNHGAAPARDRSPRRSASPRRSPDRGLARHTHSNSPLPTRSKPGASKPEPSASLQFKVGGNKHDDEVTRGIKTAAGSRFHDSQEDELERGRRRTETPGSHGGDAMDEDEEEEDIMVEDDGLSAMQAMMGFGGFGTTKNTHIPGNNAGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.79
4 0.76
5 0.71
6 0.65
7 0.62
8 0.63
9 0.56
10 0.54
11 0.58
12 0.58
13 0.61
14 0.67
15 0.69
16 0.71
17 0.8
18 0.81
19 0.82
20 0.75
21 0.74
22 0.75
23 0.75
24 0.73
25 0.73
26 0.71
27 0.7
28 0.73
29 0.72
30 0.67
31 0.64
32 0.61
33 0.62
34 0.6
35 0.61
36 0.66
37 0.67
38 0.71
39 0.74
40 0.77
41 0.76
42 0.83
43 0.86
44 0.89
45 0.91
46 0.91
47 0.93
48 0.92
49 0.95
50 0.94
51 0.94
52 0.94
53 0.94
54 0.93
55 0.93
56 0.93
57 0.91
58 0.91
59 0.9
60 0.9
61 0.88
62 0.86
63 0.82
64 0.81
65 0.81
66 0.8
67 0.81
68 0.79
69 0.78
70 0.72
71 0.73
72 0.65
73 0.67
74 0.66
75 0.66
76 0.67
77 0.65
78 0.64
79 0.58
80 0.59
81 0.57
82 0.54
83 0.54
84 0.49
85 0.52
86 0.6
87 0.62
88 0.67
89 0.7
90 0.74
91 0.75
92 0.81
93 0.78
94 0.76
95 0.82
96 0.77
97 0.77
98 0.77
99 0.72
100 0.67
101 0.63
102 0.57
103 0.52
104 0.51
105 0.42
106 0.36
107 0.35
108 0.33
109 0.34
110 0.36
111 0.32
112 0.31
113 0.32
114 0.32
115 0.31
116 0.34
117 0.3
118 0.29
119 0.33
120 0.33
121 0.3
122 0.31
123 0.3
124 0.25
125 0.27
126 0.27
127 0.24
128 0.28
129 0.29
130 0.31
131 0.33
132 0.35
133 0.38
134 0.47
135 0.54
136 0.59
137 0.67
138 0.69
139 0.68
140 0.68
141 0.64
142 0.61
143 0.61
144 0.54
145 0.49
146 0.46
147 0.45
148 0.49
149 0.49
150 0.45
151 0.38
152 0.38
153 0.35
154 0.35
155 0.35
156 0.32
157 0.31
158 0.33
159 0.33
160 0.33
161 0.35
162 0.38
163 0.43
164 0.43
165 0.46
166 0.44
167 0.46
168 0.43
169 0.41
170 0.39
171 0.32
172 0.3
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.25
177 0.25
178 0.23
179 0.24
180 0.23
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.21
185 0.24
186 0.23
187 0.19
188 0.19
189 0.18
190 0.17
191 0.17
192 0.2
193 0.2
194 0.22
195 0.24
196 0.27
197 0.3
198 0.29
199 0.3
200 0.25
201 0.22
202 0.25
203 0.24
204 0.21
205 0.21
206 0.26
207 0.28
208 0.28
209 0.29
210 0.25
211 0.26
212 0.34
213 0.39
214 0.4
215 0.43
216 0.5
217 0.51
218 0.49
219 0.47
220 0.39
221 0.3
222 0.24
223 0.19
224 0.1
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.16
257 0.18
258 0.2
259 0.22
260 0.26
261 0.27
262 0.31
263 0.33
264 0.31
265 0.31
266 0.33
267 0.38
268 0.4
269 0.39
270 0.39
271 0.42
272 0.51
273 0.6
274 0.66
275 0.68
276 0.73
277 0.76
278 0.8
279 0.82
280 0.78
281 0.72
282 0.65
283 0.57
284 0.55
285 0.51
286 0.46
287 0.41
288 0.39