Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0D4R5

Protein Details
Accession J0D4R5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-108NERPTDKRGKEQQYKERGIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-482AKAREQPRTGKKRAA
499-513RKAARREASPSPSRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG adl:AURDEDRAFT_177170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGVKDLWSILQPAAEKLPLAQMAVQAFEANTSRYRGYTVGIDISIWIGHMKVFNKIPQCGPTAGIQMLLFRCAHLLELPLLPLFVFDGNERPTDKRGKEQQYKERGIEFDAKKVLDAYGFAWAQARGEAEAELAYLNALGVIDAVWTDDGDAFLFGAMTIIRNPSAKLSSNIHANVFTSGKHDANRVQVFKIADLLNNDEIQLNRAGLILIALLRGGDYHKGIDGVGMTIAHGLARCGFGDSLAAVMQSQRSQDVDSFTSSVLEWRAGVVHELRTNSSGQLGTRHPKLAADFPQDFPDIDIYNAYANPVVTSAGEIEIDWYRMPDITKLAETCEHYFSWGSQTEILERFRSIVWPGAVCRALRQHTLEEDGMGDHLQPGLPQLGNLVAQIHRERRHYSTGGLRELRVEIAPAQLAAAARRGTHYLRIPSANYTHGKVHIPPDEPLQIWLPAALVRAALPELVRAFDKAKAREQPRTGKKRAARQSTSDSSASDHETAPRKAARREASPSPSRRPRPTDQSSAASSLSRHVKSTIIILSGSEDDQPNLAVRARPVASAARRQDDADVIVISSSDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.21
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.19
11 0.19
12 0.14
13 0.13
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.17
19 0.18
20 0.18
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.2
28 0.2
29 0.18
30 0.18
31 0.15
32 0.12
33 0.09
34 0.06
35 0.07
36 0.12
37 0.13
38 0.18
39 0.22
40 0.27
41 0.33
42 0.36
43 0.38
44 0.38
45 0.41
46 0.36
47 0.34
48 0.31
49 0.3
50 0.26
51 0.24
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.21
56 0.18
57 0.14
58 0.15
59 0.13
60 0.14
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.13
75 0.15
76 0.18
77 0.2
78 0.21
79 0.26
80 0.34
81 0.36
82 0.4
83 0.49
84 0.57
85 0.65
86 0.72
87 0.77
88 0.79
89 0.82
90 0.75
91 0.69
92 0.59
93 0.53
94 0.53
95 0.44
96 0.4
97 0.38
98 0.35
99 0.31
100 0.3
101 0.27
102 0.17
103 0.17
104 0.12
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.15
153 0.16
154 0.19
155 0.22
156 0.24
157 0.29
158 0.3
159 0.28
160 0.25
161 0.24
162 0.23
163 0.19
164 0.16
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.19
171 0.27
172 0.32
173 0.31
174 0.29
175 0.31
176 0.3
177 0.28
178 0.29
179 0.21
180 0.17
181 0.17
182 0.2
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.12
268 0.15
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.26
281 0.26
282 0.24
283 0.2
284 0.17
285 0.11
286 0.09
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.18
332 0.19
333 0.16
334 0.15
335 0.16
336 0.14
337 0.15
338 0.13
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.17
344 0.19
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.21
349 0.23
350 0.24
351 0.22
352 0.22
353 0.26
354 0.24
355 0.19
356 0.17
357 0.14
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.11
376 0.14
377 0.2
378 0.23
379 0.26
380 0.29
381 0.32
382 0.38
383 0.36
384 0.37
385 0.39
386 0.41
387 0.44
388 0.42
389 0.38
390 0.33
391 0.33
392 0.3
393 0.22
394 0.17
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.11
404 0.1
405 0.1
406 0.12
407 0.14
408 0.14
409 0.2
410 0.25
411 0.26
412 0.29
413 0.32
414 0.32
415 0.33
416 0.34
417 0.34
418 0.3
419 0.28
420 0.27
421 0.27
422 0.28
423 0.27
424 0.31
425 0.31
426 0.32
427 0.3
428 0.32
429 0.33
430 0.31
431 0.3
432 0.26
433 0.21
434 0.18
435 0.17
436 0.13
437 0.1
438 0.11
439 0.09
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.18
453 0.25
454 0.26
455 0.33
456 0.41
457 0.46
458 0.53
459 0.59
460 0.64
461 0.69
462 0.75
463 0.73
464 0.73
465 0.74
466 0.76
467 0.78
468 0.78
469 0.72
470 0.69
471 0.73
472 0.7
473 0.68
474 0.58
475 0.49
476 0.41
477 0.37
478 0.35
479 0.27
480 0.22
481 0.24
482 0.3
483 0.3
484 0.33
485 0.36
486 0.38
487 0.4
488 0.48
489 0.48
490 0.48
491 0.54
492 0.57
493 0.6
494 0.65
495 0.67
496 0.69
497 0.73
498 0.74
499 0.77
500 0.76
501 0.76
502 0.77
503 0.78
504 0.78
505 0.73
506 0.7
507 0.64
508 0.59
509 0.51
510 0.42
511 0.35
512 0.32
513 0.34
514 0.3
515 0.28
516 0.27
517 0.27
518 0.27
519 0.32
520 0.28
521 0.22
522 0.2
523 0.19
524 0.21
525 0.2
526 0.2
527 0.18
528 0.15
529 0.14
530 0.15
531 0.15
532 0.14
533 0.15
534 0.17
535 0.16
536 0.17
537 0.23
538 0.24
539 0.23
540 0.25
541 0.31
542 0.34
543 0.41
544 0.47
545 0.45
546 0.45
547 0.46
548 0.46
549 0.4
550 0.36
551 0.29
552 0.23
553 0.18
554 0.16