Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VPB3

Protein Details
Accession A0A1Y2VPB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-116EDLPPPRMTRRSRSRSPRKVPARIKTEEHydrophilic
125-144ATPSPTKRKLRASSRPLQTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-111TRRSRSRSPRKVPAR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.5, cyto 8.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR011015  LEM/LEM-like_dom_sf  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MADPENLAYLQPGFDPNSITMSHLRSILVNYNVPYTSNAKKGQLVDLFNQHVAPQAKKILAERARAKRTSKGIFDAETQSSSNPFEEHEDLPPPRMTRRSRSRSPRKVPARIKTEEPEDLQIPAATPSPTKRKLRASSRPLQTSDTEAGAEPEVSRPLNKVRRPPVAMPKVKTEDSDEGLFRRTSDVFTSDNPFQSGSSPSALDQVTPSVRRRTAETENARSTSSGTRRRLDGYAAPKEERRSMPRNITPSVILKAPLQAPDSPVIEAGEEFTPEEQLELAAEDAANGNIEPVAARRPRQTNQTSWGTLFSILSVTVAGIYAGWYRQEKIAVGYCGVGQFGSSIPNEVETPEWAQSVLPPQITIPQSFIDAVEPECEPCPAHAYCYADFSVRCEQDYILKAHPLSLGGIVPLPPTCEPDGARVRRVQAVADKAIEELRERTAKYECGDPIDEEGTKLETAAVEEAELKQIIDKKRSKKMNNQEFEDLWGAALGEIKDRDEVEVDVQEKKALTILTNQRTAGHLSSPDSGAVPNTYLTSTSLARIPLTCAVRRSIRLGLARYRLHISVVIAAILTMIYAQYQYKSNRAAAAKVPGLVDIVLERLATQKQLGDEDIDDPWLFLPNLRDDVLRSVHSLSQREKIWQRVRAVVEQNSNIRTSQREGRSGEVGRAWEWIGPMTGDHSGRRRRSGRASYGPDTSIDSPSVDAARHQKWEESRPIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.22
7 0.23
8 0.23
9 0.24
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.24
14 0.29
15 0.28
16 0.28
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.29
21 0.29
22 0.27
23 0.28
24 0.32
25 0.35
26 0.35
27 0.4
28 0.41
29 0.46
30 0.47
31 0.45
32 0.43
33 0.46
34 0.46
35 0.41
36 0.39
37 0.31
38 0.32
39 0.32
40 0.29
41 0.26
42 0.28
43 0.29
44 0.31
45 0.34
46 0.37
47 0.39
48 0.46
49 0.52
50 0.57
51 0.63
52 0.66
53 0.67
54 0.64
55 0.67
56 0.66
57 0.61
58 0.58
59 0.54
60 0.51
61 0.52
62 0.49
63 0.42
64 0.36
65 0.32
66 0.26
67 0.24
68 0.24
69 0.2
70 0.15
71 0.14
72 0.18
73 0.21
74 0.22
75 0.23
76 0.28
77 0.29
78 0.32
79 0.35
80 0.31
81 0.33
82 0.39
83 0.42
84 0.46
85 0.56
86 0.61
87 0.68
88 0.78
89 0.83
90 0.86
91 0.89
92 0.9
93 0.89
94 0.9
95 0.9
96 0.88
97 0.84
98 0.77
99 0.74
100 0.69
101 0.64
102 0.58
103 0.51
104 0.46
105 0.39
106 0.35
107 0.3
108 0.24
109 0.19
110 0.16
111 0.15
112 0.12
113 0.13
114 0.18
115 0.27
116 0.35
117 0.4
118 0.46
119 0.54
120 0.63
121 0.72
122 0.77
123 0.76
124 0.78
125 0.81
126 0.8
127 0.72
128 0.66
129 0.57
130 0.51
131 0.44
132 0.35
133 0.27
134 0.21
135 0.2
136 0.17
137 0.16
138 0.11
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.23
145 0.31
146 0.36
147 0.44
148 0.5
149 0.58
150 0.63
151 0.68
152 0.7
153 0.71
154 0.73
155 0.67
156 0.67
157 0.63
158 0.58
159 0.52
160 0.47
161 0.4
162 0.36
163 0.36
164 0.29
165 0.25
166 0.27
167 0.26
168 0.2
169 0.19
170 0.16
171 0.15
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.19
176 0.24
177 0.24
178 0.24
179 0.23
180 0.22
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.13
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.13
192 0.15
193 0.17
194 0.2
195 0.23
196 0.25
197 0.27
198 0.28
199 0.31
200 0.35
201 0.38
202 0.44
203 0.49
204 0.51
205 0.52
206 0.53
207 0.49
208 0.42
209 0.38
210 0.35
211 0.36
212 0.37
213 0.38
214 0.4
215 0.41
216 0.44
217 0.43
218 0.39
219 0.37
220 0.36
221 0.39
222 0.4
223 0.39
224 0.39
225 0.4
226 0.42
227 0.4
228 0.39
229 0.37
230 0.4
231 0.47
232 0.5
233 0.52
234 0.48
235 0.45
236 0.4
237 0.37
238 0.33
239 0.25
240 0.21
241 0.16
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.19
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.1
281 0.12
282 0.14
283 0.19
284 0.25
285 0.28
286 0.36
287 0.4
288 0.38
289 0.43
290 0.47
291 0.43
292 0.38
293 0.36
294 0.28
295 0.24
296 0.2
297 0.13
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.09
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.14
349 0.16
350 0.15
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.11
367 0.09
368 0.11
369 0.13
370 0.16
371 0.16
372 0.18
373 0.18
374 0.16
375 0.16
376 0.18
377 0.21
378 0.19
379 0.19
380 0.17
381 0.17
382 0.21
383 0.23
384 0.23
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.19
389 0.19
390 0.14
391 0.12
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.12
405 0.18
406 0.27
407 0.28
408 0.3
409 0.3
410 0.31
411 0.32
412 0.32
413 0.27
414 0.23
415 0.24
416 0.23
417 0.22
418 0.2
419 0.17
420 0.18
421 0.16
422 0.13
423 0.1
424 0.12
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.17
429 0.19
430 0.19
431 0.23
432 0.2
433 0.21
434 0.23
435 0.21
436 0.21
437 0.2
438 0.19
439 0.14
440 0.14
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.08
456 0.14
457 0.17
458 0.25
459 0.32
460 0.38
461 0.47
462 0.57
463 0.61
464 0.66
465 0.74
466 0.76
467 0.75
468 0.73
469 0.69
470 0.6
471 0.56
472 0.47
473 0.36
474 0.25
475 0.18
476 0.13
477 0.09
478 0.1
479 0.07
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.13
490 0.14
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.14
495 0.14
496 0.14
497 0.11
498 0.11
499 0.17
500 0.26
501 0.3
502 0.33
503 0.33
504 0.32
505 0.33
506 0.34
507 0.27
508 0.2
509 0.17
510 0.17
511 0.18
512 0.18
513 0.17
514 0.15
515 0.14
516 0.12
517 0.11
518 0.1
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.12
527 0.14
528 0.14
529 0.14
530 0.14
531 0.16
532 0.19
533 0.22
534 0.24
535 0.23
536 0.27
537 0.3
538 0.31
539 0.33
540 0.3
541 0.32
542 0.35
543 0.37
544 0.4
545 0.44
546 0.43
547 0.42
548 0.41
549 0.36
550 0.32
551 0.29
552 0.23
553 0.19
554 0.18
555 0.15
556 0.12
557 0.11
558 0.1
559 0.08
560 0.07
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.04
565 0.05
566 0.07
567 0.13
568 0.15
569 0.2
570 0.24
571 0.25
572 0.31
573 0.32
574 0.34
575 0.32
576 0.37
577 0.33
578 0.31
579 0.3
580 0.24
581 0.23
582 0.19
583 0.15
584 0.09
585 0.08
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.11
593 0.12
594 0.13
595 0.15
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.17
600 0.17
601 0.16
602 0.15
603 0.13
604 0.12
605 0.13
606 0.12
607 0.12
608 0.15
609 0.17
610 0.2
611 0.21
612 0.21
613 0.2
614 0.25
615 0.26
616 0.24
617 0.22
618 0.22
619 0.25
620 0.29
621 0.33
622 0.32
623 0.35
624 0.36
625 0.43
626 0.46
627 0.52
628 0.56
629 0.57
630 0.58
631 0.59
632 0.61
633 0.61
634 0.62
635 0.58
636 0.56
637 0.54
638 0.55
639 0.49
640 0.46
641 0.39
642 0.34
643 0.31
644 0.3
645 0.34
646 0.35
647 0.4
648 0.42
649 0.45
650 0.5
651 0.49
652 0.47
653 0.41
654 0.36
655 0.3
656 0.29
657 0.26
658 0.2
659 0.19
660 0.16
661 0.14
662 0.12
663 0.12
664 0.13
665 0.17
666 0.17
667 0.22
668 0.29
669 0.38
670 0.43
671 0.52
672 0.54
673 0.57
674 0.66
675 0.71
676 0.72
677 0.73
678 0.76
679 0.71
680 0.71
681 0.64
682 0.55
683 0.5
684 0.42
685 0.34
686 0.27
687 0.23
688 0.2
689 0.21
690 0.22
691 0.17
692 0.19
693 0.24
694 0.28
695 0.33
696 0.35
697 0.39
698 0.44
699 0.52