FuNGI

A0A1Y2VP55

Protein Details

Accession

A0A1Y2VP55

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
485-506	SQEKSAKRPKTITKAAKPKETP	Hydrophilic
522-549	TSPSVSTPTRKPKKDSKVKYSATKPAKQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
80-101	RKKYAAKQASKNKTAPRPKVNA
454-469	KKTKKSDAANGKLKRK
492-492	R

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKNRPRPQIGSLNAMASNIRDQKTTSATKLSGLNGSRTISSSTLAKSSSSDNESSSSSSDSDGSGSGSDSDGDLEAARKKYAAKQASKNKTAPRPKVNASKATSDAKKSPPAQSPAKATTTSPDDSESESDSDSGSESDSSKASNASAKKVSKEGPSKPKEQDQDGSDSGSSSESEDDDEPSTEKAAPQPAQKPQEAESSSSSESESDDGKSDSGSSDSGEESAEEDAMEVYGDETTVTRVNGETDIDSQLSRIAWLNNSEFALRKASNDISAKEVADALRQANLEGKQLWYFTAPASLPLTILRDLEIDLSKATTGEMLLNHKGDDYGLSLESHTTSSQIQLVIPTKTGDRYNTLDRSVDSTVHLRQIAKFGPNSSVSATATDAYTPIPKPIRNQPQGLKTRFTPIGVPSPQVQLAQPRPSQDVPSSAPESADVEMTTIPNSQPQSSGPAKKTKKSDAANGKLKRKQPSSEEQSSSVPESQSQEKSAKRPKTITKAAKPKETPIQAPTPAHLVPMPNGTSPSVSTPTRKPKKDSKVKYSATKPAKQTPVPVPVVPSMKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.46
3	0.4
4	0.33
5	0.24
6	0.28
7	0.27
8	0.26
9	0.24
10	0.26
11	0.3
12	0.37
13	0.41
14	0.37
15	0.37
16	0.36
17	0.39
18	0.41
19	0.38
20	0.38
21	0.34
22	0.34
23	0.31
24	0.32
25	0.3
26	0.28
27	0.28
28	0.22
29	0.21
30	0.21
31	0.2
32	0.21
33	0.21
34	0.19
35	0.18
36	0.22
37	0.26
38	0.27
39	0.27
40	0.25
41	0.27
42	0.28
43	0.28
44	0.25
45	0.21
46	0.17
47	0.17
48	0.16
49	0.14
50	0.14
51	0.12
52	0.12
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.08
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.1
64	0.15
65	0.17
66	0.17
67	0.17
68	0.19
69	0.26
70	0.35
71	0.42
72	0.45
73	0.53
74	0.64
75	0.73
76	0.77
77	0.76
78	0.76
79	0.77
80	0.79
81	0.78
82	0.77
83	0.74
84	0.75
85	0.79
86	0.77
87	0.75
88	0.68
89	0.64
90	0.59
91	0.6
92	0.56
93	0.51
94	0.5
95	0.46
96	0.5
97	0.49
98	0.52
99	0.51
100	0.54
101	0.56
102	0.55
103	0.57
104	0.54
105	0.53
106	0.47
107	0.39
108	0.37
109	0.36
110	0.32
111	0.26
112	0.24
113	0.22
114	0.23
115	0.24
116	0.22
117	0.18
118	0.17
119	0.16
120	0.14
121	0.12
122	0.11
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.11
133	0.16
134	0.17
135	0.21
136	0.28
137	0.29
138	0.31
139	0.35
140	0.38
141	0.4
142	0.46
143	0.5
144	0.54
145	0.56
146	0.61
147	0.61
148	0.65
149	0.61
150	0.57
151	0.54
152	0.46
153	0.47
154	0.41
155	0.38
156	0.31
157	0.26
158	0.22
159	0.17
160	0.14
161	0.09
162	0.09
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.11
167	0.11
168	0.12
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.12
175	0.17
176	0.19
177	0.24
178	0.29
179	0.36
180	0.4
181	0.4
182	0.39
183	0.36
184	0.41
185	0.37
186	0.34
187	0.28
188	0.28
189	0.27
190	0.25
191	0.23
192	0.16
193	0.15
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.09
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.15
253	0.13
254	0.12
255	0.14
256	0.14
257	0.18
258	0.2
259	0.19
260	0.18
261	0.19
262	0.18
263	0.15
264	0.16
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.07
269	0.09
270	0.08
271	0.08
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.09
281	0.09
282	0.07
283	0.1
284	0.09
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.12
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.09
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.07
308	0.1
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.11
314	0.1
315	0.09
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.11
332	0.14
333	0.13
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.15
338	0.16
339	0.15
340	0.16
341	0.2
342	0.26
343	0.28
344	0.28
345	0.27
346	0.26
347	0.28
348	0.25
349	0.22
350	0.17
351	0.18
352	0.18
353	0.2
354	0.21
355	0.18
356	0.17
357	0.21
358	0.22
359	0.22
360	0.22
361	0.2
362	0.22
363	0.22
364	0.22
365	0.2
366	0.19
367	0.16
368	0.16
369	0.16
370	0.13
371	0.11
372	0.1
373	0.09
374	0.08
375	0.11
376	0.1
377	0.15
378	0.18
379	0.19
380	0.24
381	0.34
382	0.44
383	0.45
384	0.51
385	0.53
386	0.59
387	0.67
388	0.66
389	0.59
390	0.49
391	0.51
392	0.46
393	0.41
394	0.34
395	0.28
396	0.33
397	0.31
398	0.32
399	0.26
400	0.28
401	0.28
402	0.26
403	0.23
404	0.23
405	0.27
406	0.32
407	0.32
408	0.32
409	0.36
410	0.37
411	0.39
412	0.33
413	0.32
414	0.28
415	0.32
416	0.32
417	0.28
418	0.26
419	0.24
420	0.24
421	0.19
422	0.17
423	0.11
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.13
431	0.14
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.22
436	0.28
437	0.35
438	0.35
439	0.44
440	0.49
441	0.54
442	0.6
443	0.62
444	0.64
445	0.61
446	0.67
447	0.67
448	0.72
449	0.75
450	0.76
451	0.77
452	0.74
453	0.76
454	0.75
455	0.7
456	0.67
457	0.64
458	0.67
459	0.67
460	0.7
461	0.67
462	0.6
463	0.57
464	0.53
465	0.49
466	0.41
467	0.32
468	0.26
469	0.26
470	0.3
471	0.3
472	0.31
473	0.34
474	0.36
475	0.45
476	0.52
477	0.56
478	0.57
479	0.62
480	0.68
481	0.72
482	0.78
483	0.79
484	0.8
485	0.83
486	0.83
487	0.85
488	0.78
489	0.74
490	0.74
491	0.69
492	0.63
493	0.58
494	0.58
495	0.54
496	0.53
497	0.47
498	0.42
499	0.36
500	0.33
501	0.29
502	0.24
503	0.21
504	0.25
505	0.25
506	0.22
507	0.24
508	0.23
509	0.23
510	0.22
511	0.24
512	0.24
513	0.24
514	0.28
515	0.36
516	0.46
517	0.55
518	0.6
519	0.63
520	0.69
521	0.77
522	0.84
523	0.85
524	0.84
525	0.85
526	0.86
527	0.88
528	0.85
529	0.84
530	0.82
531	0.79
532	0.76
533	0.75
534	0.76
535	0.69
536	0.69
537	0.67
538	0.67
539	0.64
540	0.58
541	0.52
542	0.49

A0A1Y2VP55

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer