Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2WHG6

Protein Details
Accession A0A1Y2WHG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-128YREIDEKMDKRRKARREAREKAEQEEBasic
805-826SEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-123KRRKARREAREK
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.333, mito 11, nucl 10.5, cyto_mito 7.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPDNYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAALGFSDAATPSKKEEEDDNDERYQDPDNEVGLFAGGVYDKEDDEADRIYREIDEKMDKRRKARREAREKAEQEEYERKNPKIQQQFADLKRGLESVTEEEWAALPEVGDLTGKNRRSKQARQQRFYAVPDSVLAAAGSSGELGSTVMDDGAASATGGSNNQDGTMTNFAKIGQARDKVLQVRLDQASQVGTATSGSATSVDPKGYLTSLAKSQLPDSAAQVGDINRVRELLESVIKTNPNNGPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEHCPKSEDVWLESIRLNEGRNAKVIAAQAIQKNNRSVRLWVEAMKLEDDARSKKRVIRHSLDHIPESEALWKEAVNLEEDPSDAKLLLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKHCPTSYEIWIAAARLQEQLGQGEKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWITEAEKCEQEGAVITCGAIIRETLGYSLDEDDDRKDTWLDDARGSINRGMYETARAIYAYALRVFPTSRKIWLAAADLERNHGSKEDLWQVLEKAVNAVPRSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENGQIEQARGLLKTARQEAPTDRVWMKSAAFERQLDDLDAALDLVQQALSLFPTSAKLWMMKGQIYEDLGKPLQARESYSTGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKLGQLPKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRVERRAQNTKQAESLMERALRDVAKPDQGILWSEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKEVDNDPSLLVAVARIFWGERRLEKAQNWFEKALVRDSDLGDSWAWYYKFLLEHGTEEKREEVISKCISVEPRHGEVWQAVAKNPKNARKGIEEILKLVTAELH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.32
40 0.3
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.14
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.2
53 0.21
54 0.22
55 0.28
56 0.34
57 0.41
58 0.45
59 0.47
60 0.44
61 0.44
62 0.42
63 0.37
64 0.33
65 0.26
66 0.24
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.14
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.27
95 0.3
96 0.41
97 0.49
98 0.53
99 0.6
100 0.68
101 0.72
102 0.74
103 0.8
104 0.8
105 0.82
106 0.87
107 0.86
108 0.87
109 0.8
110 0.74
111 0.72
112 0.62
113 0.58
114 0.58
115 0.55
116 0.54
117 0.57
118 0.53
119 0.53
120 0.58
121 0.61
122 0.62
123 0.63
124 0.57
125 0.6
126 0.69
127 0.63
128 0.66
129 0.58
130 0.48
131 0.43
132 0.39
133 0.3
134 0.22
135 0.22
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.1
152 0.17
153 0.22
154 0.28
155 0.33
156 0.42
157 0.5
158 0.6
159 0.67
160 0.71
161 0.78
162 0.76
163 0.77
164 0.76
165 0.73
166 0.67
167 0.6
168 0.49
169 0.39
170 0.34
171 0.3
172 0.21
173 0.16
174 0.12
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.25
215 0.27
216 0.29
217 0.33
218 0.33
219 0.35
220 0.34
221 0.29
222 0.32
223 0.32
224 0.3
225 0.26
226 0.23
227 0.19
228 0.15
229 0.14
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.18
264 0.19
265 0.19
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.15
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.21
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.17
310 0.22
311 0.22
312 0.22
313 0.25
314 0.27
315 0.28
316 0.3
317 0.28
318 0.23
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.22
323 0.2
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.16
328 0.19
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.16
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.23
340 0.26
341 0.25
342 0.3
343 0.3
344 0.33
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.29
349 0.28
350 0.26
351 0.26
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.18
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.17
360 0.19
361 0.21
362 0.23
363 0.26
364 0.33
365 0.4
366 0.45
367 0.47
368 0.5
369 0.54
370 0.6
371 0.59
372 0.52
373 0.45
374 0.38
375 0.32
376 0.26
377 0.23
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.07
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.14
426 0.19
427 0.28
428 0.32
429 0.31
430 0.36
431 0.44
432 0.52
433 0.55
434 0.51
435 0.46
436 0.45
437 0.46
438 0.45
439 0.38
440 0.3
441 0.26
442 0.25
443 0.21
444 0.18
445 0.14
446 0.1
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.15
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.18
477 0.19
478 0.19
479 0.19
480 0.21
481 0.22
482 0.23
483 0.24
484 0.23
485 0.22
486 0.21
487 0.2
488 0.14
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.12
518 0.17
519 0.17
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.21
525 0.19
526 0.14
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.12
531 0.13
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.18
550 0.18
551 0.19
552 0.2
553 0.21
554 0.19
555 0.2
556 0.2
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.18
561 0.16
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.15
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.19
570 0.19
571 0.2
572 0.19
573 0.15
574 0.11
575 0.12
576 0.14
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.11
581 0.12
582 0.11
583 0.1
584 0.07
585 0.1
586 0.09
587 0.1
588 0.14
589 0.13
590 0.13
591 0.16
592 0.16
593 0.14
594 0.15
595 0.15
596 0.12
597 0.21
598 0.23
599 0.26
600 0.29
601 0.29
602 0.28
603 0.27
604 0.26
605 0.19
606 0.19
607 0.18
608 0.24
609 0.28
610 0.34
611 0.4
612 0.44
613 0.45
614 0.44
615 0.4
616 0.32
617 0.28
618 0.21
619 0.18
620 0.13
621 0.1
622 0.07
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.08
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.12
641 0.17
642 0.22
643 0.24
644 0.24
645 0.27
646 0.29
647 0.32
648 0.32
649 0.32
650 0.28
651 0.26
652 0.27
653 0.25
654 0.22
655 0.23
656 0.24
657 0.24
658 0.26
659 0.25
660 0.25
661 0.25
662 0.26
663 0.21
664 0.18
665 0.13
666 0.11
667 0.1
668 0.08
669 0.06
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.08
682 0.08
683 0.1
684 0.11
685 0.12
686 0.13
687 0.18
688 0.2
689 0.19
690 0.2
691 0.2
692 0.2
693 0.21
694 0.22
695 0.18
696 0.2
697 0.18
698 0.19
699 0.18
700 0.17
701 0.2
702 0.19
703 0.21
704 0.21
705 0.24
706 0.25
707 0.25
708 0.25
709 0.21
710 0.23
711 0.24
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.21
716 0.22
717 0.23
718 0.23
719 0.2
720 0.22
721 0.2
722 0.22
723 0.21
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.23
728 0.2
729 0.21
730 0.26
731 0.29
732 0.28
733 0.31
734 0.32
735 0.35
736 0.38
737 0.37
738 0.3
739 0.34
740 0.39
741 0.4
742 0.41
743 0.39
744 0.41
745 0.44
746 0.44
747 0.41
748 0.35
749 0.29
750 0.3
751 0.29
752 0.24
753 0.22
754 0.25
755 0.2
756 0.2
757 0.19
758 0.24
759 0.29
760 0.31
761 0.35
762 0.37
763 0.44
764 0.51
765 0.54
766 0.57
767 0.56
768 0.55
769 0.52
770 0.48
771 0.42
772 0.37
773 0.38
774 0.32
775 0.29
776 0.26
777 0.25
778 0.27
779 0.25
780 0.22
781 0.23
782 0.22
783 0.25
784 0.25
785 0.25
786 0.23
787 0.24
788 0.26
789 0.25
790 0.23
791 0.18
792 0.2
793 0.21
794 0.22
795 0.22
796 0.22
797 0.22
798 0.29
799 0.39
800 0.48
801 0.57
802 0.63
803 0.71
804 0.77
805 0.81
806 0.8
807 0.82
808 0.75
809 0.7
810 0.68
811 0.66
812 0.58
813 0.53
814 0.45
815 0.36
816 0.33
817 0.28
818 0.2
819 0.13
820 0.11
821 0.1
822 0.09
823 0.07
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.09
830 0.14
831 0.17
832 0.2
833 0.27
834 0.32
835 0.38
836 0.42
837 0.51
838 0.56
839 0.6
840 0.62
841 0.56
842 0.52
843 0.51
844 0.49
845 0.45
846 0.37
847 0.31
848 0.29
849 0.3
850 0.31
851 0.26
852 0.25
853 0.19
854 0.18
855 0.17
856 0.2
857 0.19
858 0.16
859 0.17
860 0.19
861 0.2
862 0.2
863 0.24
864 0.19
865 0.23
866 0.29
867 0.34
868 0.32
869 0.33
870 0.33
871 0.29
872 0.28
873 0.28
874 0.24
875 0.26
876 0.28
877 0.27
878 0.27
879 0.3
880 0.34
881 0.35
882 0.4
883 0.38
884 0.4
885 0.4
886 0.39
887 0.38
888 0.33
889 0.36
890 0.33
891 0.28
892 0.27
893 0.35
894 0.38
895 0.44
896 0.52
897 0.54
898 0.56
899 0.59
900 0.61
901 0.58
902 0.61
903 0.6
904 0.6
905 0.54
906 0.49
907 0.47
908 0.43
909 0.35