Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2WHG6

Protein Details
Accession A0A1Y2WHG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-128YREIDEKMDKRRKARREAREKAEQEEBasic
805-826SEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-123KRRKARREAREK
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.333, mito 11, nucl 10.5, cyto_mito 7.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MTGRRDFLSQPAPDNYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEDQIKEALAKRAAALGFSDAATPSKKEEEDDNDERYQDPDNEVGLFAGGVYDKEDDEADRIYREIDEKMDKRRKARREAREKAEQEEYERKNPKIQQQFADLKRGLESVTEEEWAALPEVGDLTGKNRRSKQARQQRFYAVPDSVLAAAGSSGELGSTVMDDGAASATGGSNNQDGTMTNFAKIGQARDKVLQVRLDQASQVGTATSGSATSVDPKGYLTSLAKSQLPDSAAQVGDINRVRELLESVIKTNPNNGPGWIAAARLEELAGKIVAARNVIARGCEHCPKSEDVWLESIRLNEGRNAKVIAAQAIQKNNRSVRLWVEAMKLEDDARSKKRVIRHSLDHIPESEALWKEAVNLEEDPSDAKLLLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKHCPTSYEIWIAAARLQEQLGQGEKVNVMKRAAQVLVKESAMPKREEWITEAEKCEQEGAVITCGAIIRETLGYSLDEDDDRKDTWLDDARGSINRGMYETARAIYAYALRVFPTSRKIWLAAADLERNHGSKEDLWQVLEKAVNAVPRSEVLWMMLAKEKWQAGEIDNARRVLARAFQQNPNNEDIWLAAVKLEAENGQIEQARGLLKTARQEAPTDRVWMKSAAFERQLDDLDAALDLVQQALSLFPTSAKLWMMKGQIYEDLGKPLQARESYSTGVKAVPKSVPLWLLYSRLEEKLGQLPKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRVERRAQNTKQAESLMERALRDVAKPDQGILWSEKIWHLTTRPQRKPRALEAIKEVDNDPSLLVAVARIFWGERRLEKAQNWFEKALVRDSDLGDSWAWYYKFLLEHGTEEKREEVISKCISVEPRHGEVWQAVAKNPKNARKGIEEILKLVTAELH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.32
40 0.3
41 0.25
42 0.22
43 0.18
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.12
48 0.14
49 0.16
50 0.15
51 0.16
52 0.2
53 0.21
54 0.22
55 0.28
56 0.34
57 0.41
58 0.45
59 0.47
60 0.44
61 0.44
62 0.42
63 0.37
64 0.33
65 0.26
66 0.24
67 0.21
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.14
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.27
95 0.3
96 0.41
97 0.49
98 0.53
99 0.6
100 0.68
101 0.72
102 0.74
103 0.8
104 0.8
105 0.82
106 0.87
107 0.86
108 0.87
109 0.8
110 0.74
111 0.72
112 0.62
113 0.58
114 0.58
115 0.55
116 0.54
117 0.57
118 0.53
119 0.53
120 0.58
121 0.61
122 0.62
123 0.63
124 0.57
125 0.6
126 0.69
127 0.63
128 0.66
129 0.58
130 0.48
131 0.43
132 0.39
133 0.3
134 0.22
135 0.22
136 0.17
137 0.17
138 0.17
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.13
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.1
152 0.17
153 0.22
154 0.28
155 0.33
156 0.42
157 0.5
158 0.6
159 0.67
160 0.71
161 0.78
162 0.76
163 0.77
164 0.76
165 0.73
166 0.67
167 0.6
168 0.49
169 0.39
170 0.34
171 0.3
172 0.21
173 0.16
174 0.12
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.17
210 0.21
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.25
215 0.27
216 0.29
217 0.33
218 0.33
219 0.35
220 0.34
221 0.29
222 0.32
223 0.32
224 0.3
225 0.26
226 0.23
227 0.19
228 0.15
229 0.14
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.18
264 0.19
265 0.19
266 0.15
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.15
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.16
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.21
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.17
310 0.22
311 0.22
312 0.22
313 0.25
314 0.27
315 0.28
316 0.3
317 0.28
318 0.23
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.22
323 0.2
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.16
328 0.19
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.19
334 0.19
335 0.16
336 0.14
337 0.16
338 0.18
339 0.23
340 0.26
341 0.25
342 0.3
343 0.3
344 0.33
345 0.31
346 0.29
347 0.27
348 0.29
349 0.28
350 0.26
351 0.26
352 0.24
353 0.23
354 0.21
355 0.18
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.17
360 0.19
361 0.21
362 0.23
363 0.26
364 0.33
365 0.4
366 0.45
367 0.47
368 0.5
369 0.54
370 0.6
371 0.59
372 0.52
373 0.45
374 0.38
375 0.32
376 0.26
377 0.23
378 0.16
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.06
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.07
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.14
426 0.19
427 0.28
428 0.32
429 0.31
430 0.36
431 0.44
432 0.52
433 0.55
434 0.51
435 0.46
436 0.45
437 0.46
438 0.45
439 0.38
440 0.3
441 0.26
442 0.25
443 0.21
444 0.18
445 0.14
446 0.1
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.11
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.15
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.15
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.18
477 0.19
478 0.19
479 0.19
480 0.21
481 0.22
482 0.23
483 0.24
484 0.23
485 0.22
486 0.21
487 0.2
488 0.14
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.12
518 0.17
519 0.17
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.21
525 0.19
526 0.14
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.12
531 0.13
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.15
547 0.15
548 0.16
549 0.18
550 0.18
551 0.19
552 0.2
553 0.21
554 0.19
555 0.2
556 0.2
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.18
561 0.16
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.15
566 0.18
567 0.18
568 0.19
569 0.19
570 0.19
571 0.2
572 0.19
573 0.15
574 0.11
575 0.12
576 0.14
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.11
581 0.12
582 0.11
583 0.1
584 0.07
585 0.1
586 0.09
587 0.1
588 0.14
589 0.13
590 0.13
591 0.16
592 0.16
593 0.14
594 0.15
595 0.15
596 0.12
597 0.21
598 0.23
599 0.26
600 0.29
601 0.29
602 0.28
603 0.27
604 0.26
605 0.19
606 0.19
607 0.18
608 0.24
609 0.28
610 0.34
611 0.4
612 0.44
613 0.45
614 0.44
615 0.4
616 0.32
617 0.28
618 0.21
619 0.18
620 0.13
621 0.1
622 0.07
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.08
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.1
639 0.11
640 0.12
641 0.17
642 0.22
643 0.24
644 0.24
645 0.27
646 0.29
647 0.32
648 0.32
649 0.32
650 0.28
651 0.26
652 0.27
653 0.25
654 0.22
655 0.23
656 0.24
657 0.24
658 0.26
659 0.25
660 0.25
661 0.25
662 0.26
663 0.21
664 0.18
665 0.13
666 0.11
667 0.1
668 0.08
669 0.06
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.04
677 0.04
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.08
682 0.08
683 0.1
684 0.11
685 0.12
686 0.13
687 0.18
688 0.2
689 0.19
690 0.2
691 0.2
692 0.2
693 0.21
694 0.22
695 0.18
696 0.2
697 0.18
698 0.19
699 0.18
700 0.17
701 0.2
702 0.19
703 0.21
704 0.21
705 0.24
706 0.25
707 0.25
708 0.25
709 0.21
710 0.23
711 0.24
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.21
716 0.22
717 0.23
718 0.23
719 0.2
720 0.22
721 0.2
722 0.22
723 0.21
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.23
728 0.2
729 0.21
730 0.26
731 0.29
732 0.28
733 0.31
734 0.32
735 0.35
736 0.38
737 0.37
738 0.3
739 0.34
740 0.39
741 0.4
742 0.41
743 0.39
744 0.41
745 0.44
746 0.44
747 0.41
748 0.35
749 0.29
750 0.3
751 0.29
752 0.24
753 0.22
754 0.25
755 0.2
756 0.2
757 0.19
758 0.24
759 0.29
760 0.31
761 0.35
762 0.37
763 0.44
764 0.51
765 0.54
766 0.57
767 0.56
768 0.55
769 0.52
770 0.48
771 0.42
772 0.37
773 0.38
774 0.32
775 0.29
776 0.26
777 0.25
778 0.27
779 0.25
780 0.22
781 0.23
782 0.22
783 0.25
784 0.25
785 0.25
786 0.23
787 0.24
788 0.26
789 0.25
790 0.23
791 0.18
792 0.2
793 0.21
794 0.22
795 0.22
796 0.22
797 0.22
798 0.29
799 0.39
800 0.48
801 0.57
802 0.63
803 0.71
804 0.77
805 0.81
806 0.8
807 0.82
808 0.75
809 0.7
810 0.68
811 0.66
812 0.58
813 0.53
814 0.45
815 0.36
816 0.33
817 0.28
818 0.2
819 0.13
820 0.11
821 0.1
822 0.09
823 0.07
824 0.06
825 0.06
826 0.07
827 0.07
828 0.07
829 0.09
830 0.14
831 0.17
832 0.2
833 0.27
834 0.32
835 0.38
836 0.42
837 0.51
838 0.56
839 0.6
840 0.62
841 0.56
842 0.52
843 0.51
844 0.49
845 0.45
846 0.37
847 0.31
848 0.29
849 0.3
850 0.31
851 0.26
852 0.25
853 0.19
854 0.18
855 0.17
856 0.2
857 0.19
858 0.16
859 0.17
860 0.19
861 0.2
862 0.2
863 0.24
864 0.19
865 0.23
866 0.29
867 0.34
868 0.32
869 0.33
870 0.33
871 0.29
872 0.28
873 0.28
874 0.24
875 0.26
876 0.28
877 0.27
878 0.27
879 0.3
880 0.34
881 0.35
882 0.4
883 0.38
884 0.4
885 0.4
886 0.39
887 0.38
888 0.33
889 0.36
890 0.33
891 0.28
892 0.27
893 0.35
894 0.38
895 0.44
896 0.52
897 0.54
898 0.56
899 0.59
900 0.61
901 0.58
902 0.61
903 0.6
904 0.6
905 0.54
906 0.49
907 0.47
908 0.43
909 0.35