FuNGI

A0A1Y2WJW6

Protein Details

Accession

A0A1Y2WJW6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-138	NAHREFQKHREKKGWKGKDKGKDKGKDKGKDKGKDKGKKKEKEVKEHHSLV	Basic
313-335	KAKAKAKAKAKAKKTSKKQDTES	Hydrophilic
475-503	LIITKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
95-130	KHREKKGWKGKDKGKDKGKDKGKDKGKDKGKKKEKE
313-330	KAKAKAKAKAKAKKTSKK
481-494	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MPNNSFIKPLSTSSQEPPSWLFSNNSNSNSNSNHSQSTPVLPSSDTESTMSVNMRARARRSTAGPRPPPPTQLMDLVESFLSDQGFDNAHREFQKHREKKGWKGKDKGKDKGKDKGKDKGKDKGKKKEKEVKEHHSLVSVFQTWKTFASQGNTPVVPKDNPMEKITKVSSSSSSSSSSSSSSDESSSESESEDDDVAMADAPAADDDSSSSESSSSSESSSDSDSDSDEEDAKPTKSATGVAKAAANPLKRKAESDSESSSDSDSDEDTSDSSSDDERPQAKKAKKSSSSDDDSSSSSSDSSSDESSEDEDDKAKAKAKAKAKAKKTSKKQDTESSSSSGSDSSDSESESDEEEKVDLKVAAEVPLPESSSDSSSDSDSDSDSKSDDEKPQQANGTGSDSSRTLDKVSPEFTPNPPLPPDPSTLKANNRGKNGAKPARSQNQPFSRIRQDVTVDPRLSSNAYVSHGYGEKAHQDLIITKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDIQMSRSIKFED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.41
3	0.41
4	0.4
5	0.41
6	0.38
7	0.36
8	0.33
9	0.3
10	0.39
11	0.43
12	0.44
13	0.41
14	0.41
15	0.44
16	0.44
17	0.43
18	0.4
19	0.38
20	0.37
21	0.34
22	0.36
23	0.34
24	0.37
25	0.35
26	0.3
27	0.28
28	0.25
29	0.25
30	0.28
31	0.27
32	0.23
33	0.2
34	0.2
35	0.2
36	0.22
37	0.22
38	0.19
39	0.22
40	0.25
41	0.3
42	0.35
43	0.37
44	0.42
45	0.46
46	0.47
47	0.49
48	0.54
49	0.58
50	0.63
51	0.68
52	0.68
53	0.69
54	0.67
55	0.65
56	0.59
57	0.54
58	0.47
59	0.44
60	0.4
61	0.36
62	0.33
63	0.3
64	0.25
65	0.2
66	0.18
67	0.13
68	0.11
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.11
73	0.11
74	0.14
75	0.13
76	0.18
77	0.19
78	0.21
79	0.23
80	0.32
81	0.43
82	0.47
83	0.53
84	0.59
85	0.64
86	0.73
87	0.8
88	0.81
89	0.79
90	0.82
91	0.84
92	0.84
93	0.86
94	0.85
95	0.83
96	0.82
97	0.78
98	0.78
99	0.79
100	0.78
101	0.75
102	0.75
103	0.74
104	0.74
105	0.74
106	0.74
107	0.75
108	0.75
109	0.79
110	0.81
111	0.81
112	0.81
113	0.85
114	0.86
115	0.85
116	0.86
117	0.86
118	0.84
119	0.82
120	0.77
121	0.67
122	0.61
123	0.53
124	0.43
125	0.37
126	0.32
127	0.24
128	0.21
129	0.22
130	0.18
131	0.19
132	0.19
133	0.17
134	0.17
135	0.2
136	0.21
137	0.23
138	0.27
139	0.26
140	0.24
141	0.24
142	0.25
143	0.22
144	0.2
145	0.22
146	0.23
147	0.26
148	0.28
149	0.29
150	0.27
151	0.31
152	0.31
153	0.28
154	0.25
155	0.23
156	0.24
157	0.24
158	0.26
159	0.23
160	0.23
161	0.22
162	0.21
163	0.2
164	0.18
165	0.15
166	0.15
167	0.14
168	0.13
169	0.13
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.09
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.04
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.08
198	0.07
199	0.08
200	0.09
201	0.1
202	0.09
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.09
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.12
225	0.12
226	0.15
227	0.15
228	0.15
229	0.17
230	0.16
231	0.19
232	0.19
233	0.2
234	0.18
235	0.22
236	0.25
237	0.24
238	0.25
239	0.25
240	0.29
241	0.3
242	0.32
243	0.3
244	0.27
245	0.28
246	0.27
247	0.24
248	0.17
249	0.14
250	0.1
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.09
263	0.12
264	0.16
265	0.18
266	0.22
267	0.3
268	0.34
269	0.39
270	0.46
271	0.52
272	0.55
273	0.58
274	0.61
275	0.6
276	0.61
277	0.56
278	0.5
279	0.42
280	0.36
281	0.32
282	0.25
283	0.18
284	0.12
285	0.1
286	0.09
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.16
302	0.2
303	0.24
304	0.31
305	0.38
306	0.46
307	0.54
308	0.61
309	0.64
310	0.7
311	0.75
312	0.78
313	0.81
314	0.84
315	0.83
316	0.82
317	0.8
318	0.79
319	0.76
320	0.73
321	0.65
322	0.56
323	0.47
324	0.4
325	0.34
326	0.25
327	0.18
328	0.13
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.08
346	0.1
347	0.1
348	0.11
349	0.11
350	0.11
351	0.12
352	0.12
353	0.13
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.12
358	0.13
359	0.13
360	0.13
361	0.13
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.12
366	0.13
367	0.12
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.14
372	0.18
373	0.22
374	0.27
375	0.33
376	0.35
377	0.38
378	0.39
379	0.39
380	0.36
381	0.32
382	0.3
383	0.23
384	0.21
385	0.19
386	0.17
387	0.16
388	0.16
389	0.15
390	0.13
391	0.15
392	0.19
393	0.21
394	0.23
395	0.25
396	0.28
397	0.31
398	0.3
399	0.35
400	0.32
401	0.32
402	0.33
403	0.33
404	0.32
405	0.32
406	0.34
407	0.31
408	0.34
409	0.37
410	0.4
411	0.45
412	0.51
413	0.56
414	0.58
415	0.58
416	0.62
417	0.59
418	0.61
419	0.65
420	0.64
421	0.59
422	0.6
423	0.65
424	0.67
425	0.71
426	0.68
427	0.68
428	0.69
429	0.72
430	0.69
431	0.67
432	0.66
433	0.62
434	0.58
435	0.53
436	0.47
437	0.46
438	0.5
439	0.52
440	0.44
441	0.4
442	0.4
443	0.37
444	0.35
445	0.28
446	0.23
447	0.17
448	0.19
449	0.2
450	0.2
451	0.21
452	0.21
453	0.21
454	0.21
455	0.2
456	0.21
457	0.21
458	0.21
459	0.18
460	0.18
461	0.2
462	0.24
463	0.3
464	0.26
465	0.26
466	0.31
467	0.33
468	0.39
469	0.41
470	0.46
471	0.49
472	0.59
473	0.69
474	0.75
475	0.82
476	0.84
477	0.9
478	0.91
479	0.9
480	0.9
481	0.89
482	0.89
483	0.89
484	0.84
485	0.74
486	0.65
487	0.61
488	0.52
489	0.44
490	0.4
491	0.32
492	0.28

A0A1Y2WJW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer