Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QY03

Protein Details
Accession C4QY03    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61VPGKGKIGGKGKKNYRAERKFSLAHydrophilic
154-173YVQLTKEHKARKNLNNNAVPHydrophilic
696-719LKAGHSLIPKKSKKNKVLEQEVVMHydrophilic
721-745PVKSLRFKTGSKKKIKKSGLSVEADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-56ARTKGQGRGKGKGMVPGKGKIGGKGKKNYRAER
704-710PKKSKKN
726-739RFKTGSKKKIKKSG
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0288  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MAKTPRKNHTHGGKNLESFKATTARTKGQGRGKGKGMVPGKGKIGGKGKKNYRAERKFSLASDEESDDSSSSLSDVSDNNSRYDLASNFHNVPVFDSTDESDNSSDSDVHSSTSEEKDEEYWKATNAEVNAILGSSSSDSSSDESSSSDGELDYVQLTKEHKARKNLNNNAVPKSTENEHNMPDIIKSKHTKITKSASSTKIDRHNLSDEDLGEEVKPTPKQSNGAEQLEKSVDEPFTIEVPKFKEDEINSDNDYGFEEAKLIRTLQNDNDDLELRVRHTALDNNDDDGTTGEDDDERDSYVFLDEDYLLKEEADAILKDYENYSFPRSPTLKDIDTIQPRRASFFGKQNDELVLLYEPSNEKKNPNQGNSRDVFESDEFQEVFDNSDDSKESDGRSYRDDDDYEDDPGFDYNDFNRSGDEDDENEQETRFDDPYYADFPFSSRNNIQAAVERGSDQEQDSDDDSYLFNYFFKGEGDASSSDAIASDDDELEDDQKVDDNESSNSTDEDEALPKTSNKKIGTKIAKEVLASSKVDPIPPVIGIWTTSDCGKPFEIIDGFSMRSVSENKDSIKSKRVELSVKGAIRDRTKPKGKQTGSVPLLDLDDLLNISESDSDSKAFANTQLNIVTQSNQTAPNAGWAFIASSINPSNVPLSAFRNKGVVAEKDTNHLRRYSSSLQHFNSTTRRLSMAKDDRGLKAGHSLIPKKSKKNKVLEQEVVMAPVKSLRFKTGSKKKIKKSGLSVEADVSKKRIRRQSLAEAAAEGLVPTRGGLFNEDTLIEVEALYADIGKIDELSALLGIDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.71
3 0.64
4 0.55
5 0.46
6 0.42
7 0.39
8 0.34
9 0.36
10 0.37
11 0.4
12 0.46
13 0.51
14 0.55
15 0.58
16 0.66
17 0.64
18 0.65
19 0.63
20 0.63
21 0.59
22 0.6
23 0.54
24 0.52
25 0.51
26 0.48
27 0.46
28 0.45
29 0.44
30 0.42
31 0.48
32 0.48
33 0.53
34 0.59
35 0.65
36 0.69
37 0.77
38 0.81
39 0.82
40 0.85
41 0.84
42 0.81
43 0.79
44 0.74
45 0.65
46 0.62
47 0.53
48 0.47
49 0.43
50 0.38
51 0.31
52 0.28
53 0.28
54 0.2
55 0.18
56 0.15
57 0.11
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.08
62 0.08
63 0.13
64 0.2
65 0.21
66 0.22
67 0.23
68 0.23
69 0.22
70 0.25
71 0.22
72 0.17
73 0.2
74 0.24
75 0.24
76 0.26
77 0.26
78 0.23
79 0.24
80 0.25
81 0.23
82 0.19
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.15
91 0.15
92 0.13
93 0.12
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.2
101 0.2
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.22
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.19
114 0.2
115 0.17
116 0.16
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.1
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.11
145 0.16
146 0.22
147 0.3
148 0.36
149 0.45
150 0.55
151 0.63
152 0.72
153 0.76
154 0.8
155 0.79
156 0.78
157 0.73
158 0.65
159 0.57
160 0.47
161 0.41
162 0.35
163 0.34
164 0.35
165 0.33
166 0.33
167 0.33
168 0.32
169 0.29
170 0.27
171 0.27
172 0.23
173 0.25
174 0.28
175 0.3
176 0.37
177 0.41
178 0.42
179 0.44
180 0.5
181 0.51
182 0.54
183 0.58
184 0.55
185 0.56
186 0.56
187 0.55
188 0.56
189 0.55
190 0.5
191 0.46
192 0.47
193 0.42
194 0.42
195 0.38
196 0.29
197 0.25
198 0.23
199 0.19
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.18
207 0.2
208 0.25
209 0.26
210 0.35
211 0.38
212 0.42
213 0.41
214 0.38
215 0.38
216 0.35
217 0.32
218 0.23
219 0.19
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.21
233 0.2
234 0.28
235 0.27
236 0.27
237 0.26
238 0.27
239 0.27
240 0.21
241 0.21
242 0.15
243 0.13
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.17
253 0.19
254 0.24
255 0.23
256 0.23
257 0.24
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.16
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.16
268 0.17
269 0.22
270 0.22
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.2
275 0.16
276 0.14
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.24
315 0.25
316 0.26
317 0.29
318 0.31
319 0.27
320 0.25
321 0.29
322 0.29
323 0.37
324 0.37
325 0.36
326 0.36
327 0.35
328 0.37
329 0.34
330 0.3
331 0.26
332 0.32
333 0.35
334 0.35
335 0.36
336 0.34
337 0.34
338 0.31
339 0.26
340 0.19
341 0.12
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.14
348 0.13
349 0.16
350 0.2
351 0.29
352 0.34
353 0.39
354 0.46
355 0.45
356 0.51
357 0.5
358 0.47
359 0.38
360 0.32
361 0.29
362 0.21
363 0.2
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.12
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.19
385 0.19
386 0.2
387 0.2
388 0.18
389 0.2
390 0.2
391 0.19
392 0.16
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.11
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.12
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.11
422 0.13
423 0.13
424 0.11
425 0.1
426 0.11
427 0.15
428 0.15
429 0.18
430 0.16
431 0.18
432 0.19
433 0.2
434 0.2
435 0.19
436 0.21
437 0.17
438 0.17
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.12
489 0.13
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.17
502 0.19
503 0.25
504 0.27
505 0.32
506 0.35
507 0.44
508 0.51
509 0.5
510 0.52
511 0.49
512 0.47
513 0.42
514 0.39
515 0.33
516 0.28
517 0.25
518 0.21
519 0.22
520 0.22
521 0.22
522 0.2
523 0.17
524 0.16
525 0.14
526 0.14
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.1
534 0.12
535 0.12
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.15
541 0.14
542 0.13
543 0.15
544 0.14
545 0.14
546 0.13
547 0.13
548 0.09
549 0.11
550 0.12
551 0.14
552 0.17
553 0.19
554 0.21
555 0.27
556 0.31
557 0.33
558 0.39
559 0.38
560 0.37
561 0.4
562 0.43
563 0.41
564 0.4
565 0.43
566 0.42
567 0.41
568 0.4
569 0.38
570 0.38
571 0.38
572 0.43
573 0.43
574 0.46
575 0.54
576 0.58
577 0.64
578 0.7
579 0.68
580 0.66
581 0.66
582 0.66
583 0.6
584 0.54
585 0.45
586 0.35
587 0.34
588 0.27
589 0.21
590 0.1
591 0.08
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.11
606 0.14
607 0.17
608 0.17
609 0.18
610 0.19
611 0.19
612 0.21
613 0.21
614 0.19
615 0.15
616 0.17
617 0.17
618 0.17
619 0.17
620 0.16
621 0.15
622 0.2
623 0.2
624 0.19
625 0.17
626 0.15
627 0.16
628 0.16
629 0.16
630 0.08
631 0.12
632 0.12
633 0.13
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.13
638 0.14
639 0.13
640 0.18
641 0.24
642 0.26
643 0.26
644 0.27
645 0.26
646 0.28
647 0.31
648 0.28
649 0.28
650 0.34
651 0.34
652 0.38
653 0.45
654 0.45
655 0.43
656 0.41
657 0.36
658 0.33
659 0.4
660 0.41
661 0.43
662 0.47
663 0.53
664 0.53
665 0.56
666 0.54
667 0.51
668 0.51
669 0.47
670 0.41
671 0.34
672 0.35
673 0.32
674 0.34
675 0.4
676 0.42
677 0.44
678 0.47
679 0.49
680 0.48
681 0.49
682 0.46
683 0.36
684 0.33
685 0.29
686 0.28
687 0.32
688 0.35
689 0.4
690 0.5
691 0.56
692 0.6
693 0.68
694 0.74
695 0.76
696 0.82
697 0.83
698 0.83
699 0.86
700 0.81
701 0.74
702 0.7
703 0.6
704 0.53
705 0.44
706 0.34
707 0.24
708 0.22
709 0.21
710 0.19
711 0.21
712 0.23
713 0.27
714 0.32
715 0.43
716 0.5
717 0.58
718 0.65
719 0.74
720 0.78
721 0.84
722 0.87
723 0.85
724 0.84
725 0.85
726 0.82
727 0.77
728 0.69
729 0.63
730 0.6
731 0.53
732 0.45
733 0.39
734 0.36
735 0.37
736 0.44
737 0.49
738 0.51
739 0.57
740 0.64
741 0.7
742 0.74
743 0.73
744 0.65
745 0.56
746 0.48
747 0.4
748 0.31
749 0.2
750 0.11
751 0.08
752 0.07
753 0.06
754 0.08
755 0.09
756 0.1
757 0.14
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.18
762 0.17
763 0.17
764 0.17
765 0.13
766 0.1
767 0.09
768 0.08
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.05
773 0.05
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.07