Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VXB3

Protein Details
Accession A0A1Y2VXB3    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-413QKRKAAPSVFMKPKPKVRRMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-132GRRKGI
384-413PKAKPPMPGQKRKAAPSVFMKPKPKVRRMS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MAPKLEIDDVGGAPFSILRPILLRVDNPEQLLTLEENSPHIRDDTGECWQRLINRDFPVLAKKHRFEPRNPASWHKIYRKYAVMEAEAKREAEEKLKNSFSNMKKEKQDKAVKAINFNPRTLGPVPGRRKGIPGPRGDSGTGGLRFTGGSRTKTNTGQSILRKARREAAEIGRRNRLVTSSGQLPVPQGQITRAPKGMQEEHRTAALPKVRRPQVPRPALGATNRSRESDREKQMRERLLNAKNGIHTKGATIVSDDDLDDQDELFDEEYESDEGRGGLNIDDLEDVFEEEKPTKSSYAQPMTSLASRSKASSSNPAPATKPASSNLSGLAKMKMGRAHRDKVITVETPVSKPSPKPTASASSTAPKLPAHSPPSGSPDPESLPKAKPPMPGQKRKAAPSVFMKPKPKVRRMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.11
7 0.14
8 0.19
9 0.21
10 0.22
11 0.26
12 0.33
13 0.35
14 0.34
15 0.32
16 0.27
17 0.25
18 0.26
19 0.2
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.18
24 0.19
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.17
30 0.21
31 0.21
32 0.28
33 0.34
34 0.32
35 0.33
36 0.34
37 0.37
38 0.4
39 0.41
40 0.39
41 0.36
42 0.38
43 0.38
44 0.39
45 0.43
46 0.4
47 0.44
48 0.46
49 0.45
50 0.52
51 0.6
52 0.63
53 0.61
54 0.67
55 0.66
56 0.67
57 0.68
58 0.66
59 0.65
60 0.68
61 0.7
62 0.68
63 0.69
64 0.64
65 0.67
66 0.66
67 0.6
68 0.57
69 0.51
70 0.46
71 0.44
72 0.41
73 0.4
74 0.35
75 0.32
76 0.28
77 0.27
78 0.24
79 0.24
80 0.28
81 0.26
82 0.32
83 0.35
84 0.35
85 0.37
86 0.45
87 0.43
88 0.48
89 0.5
90 0.51
91 0.56
92 0.63
93 0.65
94 0.66
95 0.71
96 0.64
97 0.66
98 0.66
99 0.59
100 0.58
101 0.59
102 0.59
103 0.51
104 0.47
105 0.41
106 0.34
107 0.37
108 0.33
109 0.32
110 0.28
111 0.35
112 0.41
113 0.44
114 0.48
115 0.43
116 0.46
117 0.47
118 0.51
119 0.48
120 0.48
121 0.47
122 0.45
123 0.47
124 0.43
125 0.36
126 0.28
127 0.27
128 0.22
129 0.17
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.13
134 0.18
135 0.16
136 0.19
137 0.21
138 0.25
139 0.28
140 0.32
141 0.34
142 0.29
143 0.29
144 0.32
145 0.33
146 0.38
147 0.43
148 0.45
149 0.46
150 0.44
151 0.48
152 0.44
153 0.45
154 0.4
155 0.42
156 0.46
157 0.49
158 0.51
159 0.49
160 0.48
161 0.44
162 0.39
163 0.31
164 0.24
165 0.2
166 0.19
167 0.17
168 0.18
169 0.18
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.13
175 0.1
176 0.1
177 0.17
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.19
182 0.2
183 0.24
184 0.28
185 0.28
186 0.31
187 0.31
188 0.31
189 0.31
190 0.3
191 0.26
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.23
196 0.31
197 0.34
198 0.39
199 0.45
200 0.51
201 0.56
202 0.59
203 0.56
204 0.51
205 0.48
206 0.46
207 0.41
208 0.38
209 0.31
210 0.32
211 0.32
212 0.29
213 0.29
214 0.29
215 0.35
216 0.37
217 0.43
218 0.45
219 0.47
220 0.52
221 0.58
222 0.62
223 0.55
224 0.51
225 0.51
226 0.48
227 0.5
228 0.45
229 0.4
230 0.37
231 0.38
232 0.34
233 0.26
234 0.21
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.12
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.22
284 0.3
285 0.35
286 0.35
287 0.34
288 0.34
289 0.36
290 0.35
291 0.31
292 0.23
293 0.2
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.21
298 0.22
299 0.29
300 0.31
301 0.36
302 0.38
303 0.39
304 0.39
305 0.39
306 0.42
307 0.35
308 0.34
309 0.28
310 0.31
311 0.3
312 0.29
313 0.29
314 0.25
315 0.24
316 0.24
317 0.22
318 0.2
319 0.19
320 0.22
321 0.23
322 0.25
323 0.34
324 0.4
325 0.44
326 0.47
327 0.49
328 0.47
329 0.46
330 0.47
331 0.38
332 0.33
333 0.34
334 0.31
335 0.29
336 0.3
337 0.29
338 0.27
339 0.28
340 0.34
341 0.37
342 0.36
343 0.37
344 0.4
345 0.46
346 0.46
347 0.47
348 0.43
349 0.41
350 0.42
351 0.41
352 0.37
353 0.29
354 0.29
355 0.3
356 0.34
357 0.33
358 0.35
359 0.37
360 0.38
361 0.46
362 0.45
363 0.43
364 0.37
365 0.35
366 0.35
367 0.37
368 0.38
369 0.34
370 0.35
371 0.38
372 0.43
373 0.44
374 0.47
375 0.51
376 0.58
377 0.64
378 0.72
379 0.73
380 0.75
381 0.78
382 0.77
383 0.77
384 0.69
385 0.65
386 0.64
387 0.68
388 0.68
389 0.69
390 0.71
391 0.7
392 0.77
393 0.81