Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VKN9

Protein Details
Accession A0A1Y2VKN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-82SPEPRTDADGPRRRKKRNRWGDASENKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-73KRGRSPEPRTDADGPRRRKKRNR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MSWRNQGITGSNNIPLGKSRRFGGEPEDAPPAQRDIGGNGFGTPNGDRDLKRGRSPEPRTDADGPRRRKKRNRWGDASENKAAGLMGLPTAIVANMTSEQLEAYTLHLRIEEISQKLRINDVVPADGDRSPSPPPQYDNHGRRVNTREYRYRKRLEDERHKLVEKAMKTIPNYHPPQDYRRPTKTQEKVYVPVNDYPEINFSEIANPLTFLTMFLAPSCSGCYQECRHISMDDMPVLGLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.31
4 0.31
5 0.31
6 0.3
7 0.34
8 0.36
9 0.37
10 0.37
11 0.4
12 0.36
13 0.37
14 0.4
15 0.34
16 0.33
17 0.33
18 0.28
19 0.2
20 0.2
21 0.17
22 0.16
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.16
34 0.15
35 0.2
36 0.3
37 0.32
38 0.37
39 0.4
40 0.43
41 0.51
42 0.58
43 0.62
44 0.59
45 0.57
46 0.58
47 0.61
48 0.62
49 0.62
50 0.64
51 0.63
52 0.67
53 0.73
54 0.76
55 0.8
56 0.84
57 0.84
58 0.87
59 0.88
60 0.86
61 0.85
62 0.86
63 0.83
64 0.78
65 0.69
66 0.58
67 0.48
68 0.39
69 0.31
70 0.2
71 0.13
72 0.07
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.15
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.2
123 0.27
124 0.35
125 0.37
126 0.43
127 0.46
128 0.45
129 0.48
130 0.51
131 0.53
132 0.5
133 0.52
134 0.53
135 0.57
136 0.66
137 0.69
138 0.7
139 0.65
140 0.65
141 0.68
142 0.69
143 0.71
144 0.7
145 0.69
146 0.68
147 0.65
148 0.58
149 0.53
150 0.49
151 0.38
152 0.35
153 0.31
154 0.3
155 0.31
156 0.38
157 0.39
158 0.42
159 0.45
160 0.44
161 0.46
162 0.45
163 0.52
164 0.54
165 0.58
166 0.57
167 0.61
168 0.63
169 0.64
170 0.71
171 0.71
172 0.71
173 0.7
174 0.67
175 0.64
176 0.64
177 0.64
178 0.56
179 0.52
180 0.46
181 0.39
182 0.34
183 0.31
184 0.27
185 0.23
186 0.21
187 0.16
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.22
210 0.25
211 0.34
212 0.36
213 0.36
214 0.38
215 0.36
216 0.38
217 0.37
218 0.38
219 0.3
220 0.27