FuNGI

A0A1Y2W8B6

Protein Details

Accession

A0A1Y2W8B6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-40	QRPTPPGAPPLRRPRNNANPLVARKRP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-45	PPLRRPRNNANPLVARKRPTTRPP
439-444	KKALKR
504-547	QGKKAAAEAAKKGKSLKRAGSPVSDSSGAESTRKKKKTTHDSRA
556-556	R
580-588	RPKKKRLSP

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSATPSPSGGPNGQRPTPPGAPPLRRPRNNANPLVARKRPTTRPPPSALGRGAAPNAIGRPAQQQQQRPPQRGPAPINFDAMRNQNGGWSQPLPPGGQEYPLFITKKSLKEGLRFHVMRFAPHGGKLAQPGNPGIDPTNQDDFTRPVTLHRRDPRQPPPGREIKEDEIMEEEQNPADAAESERIAQIKAEREAQREANNAQKAPVGNVPNPRAKQSKEPKPSVQVHYEPRTEQQKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGQYEAPLSNCKVALKIHNGGFRMFPLEKWYKFTSKRGSFKVMSIEEAEKNMNKKVAPSRWAIRDTQRQEAEKAMAESRAIVNGRVPVKQESGTFRQASRAEKMDHDDIDMSGDEFQDDDETAGYEPDRDEDTMTANTKIRRDQLNANLFGDADEVKVEKEEEDEQKEELQRKLLGKTLKKALKRRDKQFQYDSDSERERDPFFSSDDDDSDTDSDAEKEDEDKKAEKDKDKDAGTSSKGTNTPQGKKAAAEAAKKGKSLKRAGSPVSDSSGAESTRKKKKTTHDSRAGTPMPSGPRRGKTGAGFTSDGEGTAGEMSDSARPKKKRLSPSAAGGVSSKKGTPAGSRATSPAPSQPVTQKVAIRANSPNAPAQSPPPKGPITPQEIIDCLPPLPAGIAISVLIKRFQDRVDKPGGVSRQEWLNMVKANCNYDAAEKVLRRKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.48
3	0.52
4	0.52
5	0.48
6	0.48
7	0.51
8	0.55
9	0.62
10	0.7
11	0.73
12	0.73
13	0.78
14	0.8
15	0.82
16	0.83
17	0.8
18	0.77
19	0.76
20	0.79
21	0.8
22	0.75
23	0.69
24	0.66
25	0.68
26	0.68
27	0.69
28	0.71
29	0.72
30	0.75
31	0.76
32	0.77
33	0.75
34	0.72
35	0.64
36	0.55
37	0.48
38	0.42
39	0.37
40	0.3
41	0.24
42	0.19
43	0.18
44	0.18
45	0.16
46	0.15
47	0.2
48	0.24
49	0.31
50	0.35
51	0.43
52	0.5
53	0.61
54	0.69
55	0.69
56	0.69
57	0.71
58	0.71
59	0.71
60	0.69
61	0.66
62	0.66
63	0.61
64	0.62
65	0.53
66	0.47
67	0.43
68	0.4
69	0.34
70	0.27
71	0.25
72	0.24
73	0.24
74	0.24
75	0.23
76	0.21
77	0.21
78	0.23
79	0.25
80	0.22
81	0.22
82	0.26
83	0.22
84	0.24
85	0.23
86	0.22
87	0.24
88	0.28
89	0.28
90	0.23
91	0.3
92	0.32
93	0.36
94	0.38
95	0.41
96	0.4
97	0.47
98	0.53
99	0.51
100	0.55
101	0.52
102	0.48
103	0.49
104	0.45
105	0.39
106	0.38
107	0.38
108	0.3
109	0.3
110	0.33
111	0.25
112	0.27
113	0.3
114	0.29
115	0.25
116	0.25
117	0.25
118	0.25
119	0.24
120	0.23
121	0.2
122	0.2
123	0.2
124	0.24
125	0.28
126	0.26
127	0.26
128	0.27
129	0.27
130	0.27
131	0.27
132	0.22
133	0.24
134	0.32
135	0.37
136	0.45
137	0.51
138	0.56
139	0.61
140	0.7
141	0.73
142	0.74
143	0.76
144	0.72
145	0.73
146	0.73
147	0.7
148	0.66
149	0.63
150	0.56
151	0.55
152	0.49
153	0.41
154	0.35
155	0.33
156	0.28
157	0.22
158	0.18
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.11
172	0.12
173	0.14
174	0.17
175	0.19
176	0.26
177	0.28
178	0.31
179	0.35
180	0.37
181	0.37
182	0.36
183	0.36
184	0.36
185	0.36
186	0.33
187	0.3
188	0.29
189	0.26
190	0.25
191	0.28
192	0.24
193	0.24
194	0.31
195	0.35
196	0.4
197	0.4
198	0.43
199	0.42
200	0.41
201	0.47
202	0.51
203	0.57
204	0.59
205	0.64
206	0.64
207	0.67
208	0.72
209	0.66
210	0.62
211	0.58
212	0.57
213	0.56
214	0.54
215	0.46
216	0.45
217	0.5
218	0.48
219	0.47
220	0.5
221	0.53
222	0.56
223	0.64
224	0.64
225	0.62
226	0.64
227	0.63
228	0.57
229	0.48
230	0.44
231	0.38
232	0.33
233	0.26
234	0.2
235	0.16
236	0.11
237	0.1
238	0.11
239	0.12
240	0.13
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.11
247	0.1
248	0.06
249	0.08
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.12
258	0.12
259	0.13
260	0.17
261	0.2
262	0.25
263	0.27
264	0.3
265	0.31
266	0.3
267	0.28
268	0.24
269	0.23
270	0.18
271	0.15
272	0.18
273	0.23
274	0.23
275	0.28
276	0.31
277	0.33
278	0.36
279	0.43
280	0.46
281	0.49
282	0.55
283	0.54
284	0.57
285	0.51
286	0.5
287	0.5
288	0.4
289	0.33
290	0.29
291	0.27
292	0.21
293	0.21
294	0.2
295	0.15
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.14
300	0.17
301	0.24
302	0.27
303	0.29
304	0.32
305	0.35
306	0.39
307	0.41
308	0.39
309	0.38
310	0.43
311	0.43
312	0.46
313	0.45
314	0.41
315	0.39
316	0.39
317	0.33
318	0.25
319	0.23
320	0.16
321	0.13
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.15
334	0.17
335	0.18
336	0.19
337	0.19
338	0.23
339	0.26
340	0.26
341	0.24
342	0.28
343	0.29
344	0.3
345	0.27
346	0.26
347	0.23
348	0.23
349	0.27
350	0.24
351	0.22
352	0.2
353	0.17
354	0.14
355	0.13
356	0.12
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.1
379	0.12
380	0.13
381	0.14
382	0.15
383	0.17
384	0.19
385	0.21
386	0.23
387	0.25
388	0.27
389	0.32
390	0.38
391	0.43
392	0.43
393	0.41
394	0.36
395	0.32
396	0.29
397	0.23
398	0.14
399	0.07
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.07
407	0.11
408	0.14
409	0.18
410	0.19
411	0.19
412	0.22
413	0.25
414	0.27
415	0.24
416	0.23
417	0.23
418	0.24
419	0.25
420	0.26
421	0.3
422	0.3
423	0.34
424	0.41
425	0.43
426	0.48
427	0.55
428	0.61
429	0.65
430	0.71
431	0.74
432	0.76
433	0.77
434	0.78
435	0.77
436	0.73
437	0.7
438	0.66
439	0.61
440	0.54
441	0.5
442	0.43
443	0.38
444	0.34
445	0.27
446	0.24
447	0.23
448	0.2
449	0.19
450	0.19
451	0.2
452	0.19
453	0.18
454	0.19
455	0.16
456	0.16
457	0.15
458	0.13
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.1
466	0.12
467	0.14
468	0.16
469	0.19
470	0.21
471	0.29
472	0.35
473	0.4
474	0.42
475	0.46
476	0.51
477	0.5
478	0.49
479	0.44
480	0.43
481	0.38
482	0.37
483	0.32
484	0.29
485	0.29
486	0.29
487	0.33
488	0.35
489	0.39
490	0.39
491	0.43
492	0.39
493	0.38
494	0.39
495	0.39
496	0.37
497	0.34
498	0.35
499	0.4
500	0.41
501	0.41
502	0.45
503	0.41
504	0.44
505	0.47
506	0.48
507	0.47
508	0.52
509	0.53
510	0.53
511	0.53
512	0.47
513	0.43
514	0.37
515	0.29
516	0.25
517	0.26
518	0.21
519	0.2
520	0.24
521	0.29
522	0.38
523	0.43
524	0.44
525	0.48
526	0.58
527	0.66
528	0.71
529	0.74
530	0.75
531	0.75
532	0.76
533	0.77
534	0.68
535	0.57
536	0.47
537	0.41
538	0.38
539	0.37
540	0.39
541	0.37
542	0.4
543	0.44
544	0.46
545	0.46
546	0.42
547	0.47
548	0.44
549	0.42
550	0.39
551	0.34
552	0.35
553	0.3
554	0.25
555	0.17
556	0.14
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.1
564	0.15
565	0.2
566	0.28
567	0.31
568	0.38
569	0.48
570	0.56
571	0.62
572	0.68
573	0.72
574	0.7
575	0.74
576	0.77
577	0.67
578	0.59
579	0.5
580	0.42
581	0.35
582	0.3
583	0.23
584	0.16
585	0.17
586	0.18
587	0.22
588	0.25
589	0.3
590	0.32
591	0.33
592	0.34
593	0.36
594	0.36
595	0.33
596	0.33
597	0.3
598	0.29
599	0.31
600	0.35
601	0.37
602	0.39
603	0.42
604	0.39
605	0.41
606	0.47
607	0.45
608	0.43
609	0.42
610	0.44
611	0.43
612	0.42
613	0.41
614	0.36
615	0.36
616	0.33
617	0.36
618	0.4
619	0.4
620	0.41
621	0.41
622	0.41
623	0.4
624	0.46
625	0.46
626	0.45
627	0.43
628	0.43
629	0.4
630	0.39
631	0.39
632	0.34
633	0.27
634	0.18
635	0.16
636	0.13
637	0.11
638	0.11
639	0.1
640	0.09
641	0.07
642	0.08
643	0.08
644	0.1
645	0.12
646	0.12
647	0.14
648	0.14
649	0.17
650	0.19
651	0.23
652	0.31
653	0.33
654	0.39
655	0.45
656	0.46
657	0.45
658	0.5
659	0.5
660	0.44
661	0.41
662	0.38
663	0.36
664	0.36
665	0.37
666	0.31
667	0.31
668	0.33
669	0.34
670	0.37
671	0.34
672	0.36
673	0.35
674	0.35
675	0.31
676	0.28
677	0.3
678	0.27
679	0.31
680	0.32

A0A1Y2W8B6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer