Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VS27

Protein Details
Accession A0A1Y2VS27    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-52DHPVQPPSKRRKPSTMSQTSQHydrophilic
92-114QVSGAPAKKKRGRKSKAERASEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-110PAKKKRGRKSKAER
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPHAYSPSGSPPYSSAQLPLKKRGSTGADHPVQPPSKRRKPSTMSQTSQGSAHPLRQTSFPPDEAQQKFSPSLRRSPSIDTMSFVSGSQVSGAPAKKKRGRKSKAERASEAAAEALRDGSPSVVGGRAPTVVSGVSGSHANKDGDGGAGKEEEFEIPENMASMSATRTKEQLEEEKELLALLKTQMDSQQFDRYEVWHRQTLKSSDVKRHINSVTSQSCPPNVHQMMQTVCKMYLGDIVEAAREVQDEWVQLGEKQTDLPDDELQPMNELSKHRRQAPLRPEHLREAYRRHKTSTEHGGALGSLLVWNQQTQNGADRFAVKAGGRQIFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.37
4 0.32
5 0.28
6 0.32
7 0.4
8 0.44
9 0.51
10 0.52
11 0.5
12 0.5
13 0.52
14 0.49
15 0.46
16 0.48
17 0.48
18 0.46
19 0.47
20 0.48
21 0.48
22 0.49
23 0.49
24 0.51
25 0.52
26 0.57
27 0.64
28 0.69
29 0.72
30 0.73
31 0.79
32 0.8
33 0.8
34 0.74
35 0.71
36 0.67
37 0.59
38 0.53
39 0.43
40 0.38
41 0.29
42 0.31
43 0.29
44 0.27
45 0.28
46 0.29
47 0.32
48 0.33
49 0.35
50 0.31
51 0.3
52 0.32
53 0.4
54 0.39
55 0.41
56 0.35
57 0.35
58 0.36
59 0.37
60 0.42
61 0.36
62 0.42
63 0.42
64 0.45
65 0.45
66 0.48
67 0.52
68 0.48
69 0.45
70 0.38
71 0.35
72 0.32
73 0.29
74 0.23
75 0.17
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.12
82 0.14
83 0.2
84 0.25
85 0.35
86 0.41
87 0.5
88 0.59
89 0.66
90 0.71
91 0.76
92 0.81
93 0.83
94 0.86
95 0.83
96 0.76
97 0.69
98 0.64
99 0.53
100 0.42
101 0.32
102 0.22
103 0.15
104 0.13
105 0.09
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.22
162 0.21
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.11
170 0.08
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.1
176 0.12
177 0.14
178 0.15
179 0.22
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.21
184 0.26
185 0.29
186 0.3
187 0.28
188 0.3
189 0.31
190 0.36
191 0.36
192 0.36
193 0.38
194 0.39
195 0.42
196 0.48
197 0.51
198 0.46
199 0.49
200 0.45
201 0.4
202 0.38
203 0.38
204 0.34
205 0.3
206 0.32
207 0.28
208 0.29
209 0.28
210 0.28
211 0.3
212 0.28
213 0.27
214 0.26
215 0.29
216 0.29
217 0.31
218 0.31
219 0.22
220 0.21
221 0.19
222 0.18
223 0.14
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.13
243 0.12
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.2
253 0.21
254 0.2
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.24
261 0.31
262 0.37
263 0.41
264 0.49
265 0.53
266 0.6
267 0.66
268 0.7
269 0.69
270 0.71
271 0.7
272 0.68
273 0.71
274 0.66
275 0.61
276 0.6
277 0.62
278 0.65
279 0.64
280 0.61
281 0.6
282 0.6
283 0.63
284 0.64
285 0.59
286 0.5
287 0.47
288 0.43
289 0.37
290 0.32
291 0.23
292 0.12
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.12
300 0.15
301 0.16
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.25
306 0.26
307 0.25
308 0.24
309 0.26
310 0.18
311 0.22
312 0.28