Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2W1T3

Protein Details
Accession A0A1Y2W1T3    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-158QTTDASESKKPRKGKKGKTSEKESDQNQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-148KKPRKGKKGK
325-334AGPKKSGKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSNSATFSYAQAAKGQSAVQSIASQSSSTQSQAPSTTSTQSRDVAATPSTRAPSVAISTTSNEPDGSQNTRSSSVKPESVSPANNDSDNVSPAEKATESPGVPDQETEKPLAEVVPQSTERRGRGQTLNSQTTDASESKKPRKGKKGKTSEKESDQNQDQDKKENVVPKPELSEAPVPTVNVWTQRQEARAAKFKASPSTIAQPRGLNGSNAGQQEALSTPTTEDQKQKATQNDGVDATVVQSRASPHGARTPKNHSEQSRNSGNQGSRRGAPRGGRNNGEERASLESLGSIANNTSWPTPERAANGLKVQGQTGKSEREQKEEAGPKKSGKKKEWSTIDFVPTVNFETPIPTRSSRGGRAGGARGGRSTGVRGSHAASASIGISSHSPGTSEFANNKKDRTQENGTAPGAASVPPATSERASVDAAIPREARKPLGQVANGRASGDNSSASSKAEVSKSTPSSDSVQGTANQQHSARAASSNQRADETAKSSPTTKENGANGTRDFGFQGQNNGNRTERTRGNTRSRVGHSSMNGIPHQSHFSQGSSSYNFMNNSGPRQSSHPYTNGYGQMPYGQPYPVQAAGSQHRSRPSSGNNRSQGNGRHQSRPVSYSFGGLPYDAAMYPHGTPQYPPLFPDPNTILSAILVQLEYYFSIDNLCKDYYLRKFMDSQGFVPLRVVAQFKRMQEIASDYQLIRIACDNSSLIEFVITEDEQDMVRRGDGWGHWTLPMPDRHQTARNEGPTNYRPSNLQMAYYPQAHPYGGEAPPMFQAGMDPYYTHYANGNNLVSPTSNGVSGQSRASESQLSATVPEFSPTGISGMGSASQQGSISSEGLRNGLKSGNTDKKATAPSFDQQAPLLANGSYEPMGTEQIGLGEAPVNGVNGDHATKAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.17
10 0.17
11 0.15
12 0.14
13 0.16
14 0.17
15 0.17
16 0.2
17 0.18
18 0.21
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.26
23 0.31
24 0.32
25 0.34
26 0.35
27 0.34
28 0.34
29 0.31
30 0.3
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.26
38 0.25
39 0.22
40 0.22
41 0.24
42 0.24
43 0.21
44 0.21
45 0.24
46 0.27
47 0.28
48 0.25
49 0.22
50 0.2
51 0.23
52 0.25
53 0.27
54 0.26
55 0.28
56 0.3
57 0.35
58 0.35
59 0.33
60 0.37
61 0.38
62 0.39
63 0.37
64 0.39
65 0.42
66 0.46
67 0.46
68 0.42
69 0.42
70 0.39
71 0.38
72 0.34
73 0.3
74 0.27
75 0.25
76 0.22
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.15
82 0.14
83 0.16
84 0.2
85 0.19
86 0.22
87 0.26
88 0.26
89 0.26
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.29
94 0.28
95 0.24
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.19
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.21
104 0.23
105 0.29
106 0.34
107 0.34
108 0.38
109 0.39
110 0.4
111 0.44
112 0.48
113 0.52
114 0.56
115 0.59
116 0.53
117 0.51
118 0.45
119 0.4
120 0.37
121 0.29
122 0.25
123 0.26
124 0.34
125 0.42
126 0.49
127 0.56
128 0.62
129 0.71
130 0.78
131 0.82
132 0.84
133 0.87
134 0.91
135 0.91
136 0.91
137 0.88
138 0.86
139 0.82
140 0.74
141 0.72
142 0.66
143 0.64
144 0.61
145 0.6
146 0.53
147 0.52
148 0.51
149 0.47
150 0.45
151 0.47
152 0.43
153 0.44
154 0.45
155 0.4
156 0.41
157 0.4
158 0.36
159 0.33
160 0.35
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.24
165 0.22
166 0.24
167 0.21
168 0.21
169 0.22
170 0.21
171 0.24
172 0.27
173 0.28
174 0.33
175 0.37
176 0.38
177 0.45
178 0.45
179 0.44
180 0.46
181 0.47
182 0.46
183 0.43
184 0.4
185 0.35
186 0.41
187 0.43
188 0.42
189 0.42
190 0.36
191 0.35
192 0.37
193 0.34
194 0.25
195 0.22
196 0.21
197 0.23
198 0.23
199 0.22
200 0.17
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.14
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.14
209 0.17
210 0.19
211 0.23
212 0.24
213 0.3
214 0.35
215 0.4
216 0.42
217 0.45
218 0.46
219 0.43
220 0.43
221 0.38
222 0.33
223 0.27
224 0.22
225 0.17
226 0.14
227 0.12
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.13
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.24
236 0.3
237 0.33
238 0.37
239 0.44
240 0.48
241 0.53
242 0.58
243 0.55
244 0.59
245 0.61
246 0.62
247 0.62
248 0.56
249 0.52
250 0.51
251 0.49
252 0.46
253 0.45
254 0.41
255 0.37
256 0.4
257 0.4
258 0.39
259 0.41
260 0.44
261 0.48
262 0.5
263 0.49
264 0.49
265 0.51
266 0.49
267 0.45
268 0.36
269 0.28
270 0.28
271 0.25
272 0.21
273 0.16
274 0.13
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.13
287 0.15
288 0.17
289 0.18
290 0.21
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.23
295 0.24
296 0.22
297 0.21
298 0.21
299 0.2
300 0.21
301 0.22
302 0.23
303 0.24
304 0.33
305 0.34
306 0.36
307 0.36
308 0.35
309 0.4
310 0.45
311 0.46
312 0.41
313 0.42
314 0.41
315 0.49
316 0.55
317 0.55
318 0.53
319 0.59
320 0.61
321 0.67
322 0.71
323 0.65
324 0.64
325 0.58
326 0.55
327 0.46
328 0.39
329 0.3
330 0.22
331 0.21
332 0.15
333 0.12
334 0.09
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.21
342 0.25
343 0.25
344 0.29
345 0.29
346 0.27
347 0.29
348 0.29
349 0.28
350 0.25
351 0.22
352 0.18
353 0.17
354 0.16
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.14
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.1
380 0.13
381 0.18
382 0.25
383 0.25
384 0.27
385 0.28
386 0.32
387 0.32
388 0.36
389 0.37
390 0.36
391 0.39
392 0.42
393 0.39
394 0.35
395 0.32
396 0.26
397 0.2
398 0.13
399 0.1
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.15
418 0.15
419 0.16
420 0.14
421 0.15
422 0.18
423 0.22
424 0.23
425 0.23
426 0.26
427 0.28
428 0.27
429 0.26
430 0.21
431 0.17
432 0.16
433 0.14
434 0.11
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.17
446 0.18
447 0.19
448 0.19
449 0.19
450 0.21
451 0.23
452 0.21
453 0.17
454 0.17
455 0.17
456 0.18
457 0.2
458 0.18
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.13
465 0.11
466 0.12
467 0.16
468 0.21
469 0.23
470 0.23
471 0.23
472 0.23
473 0.23
474 0.23
475 0.21
476 0.18
477 0.17
478 0.17
479 0.18
480 0.2
481 0.2
482 0.21
483 0.2
484 0.22
485 0.23
486 0.27
487 0.27
488 0.27
489 0.25
490 0.24
491 0.22
492 0.18
493 0.17
494 0.13
495 0.14
496 0.12
497 0.17
498 0.19
499 0.23
500 0.25
501 0.26
502 0.26
503 0.25
504 0.27
505 0.27
506 0.27
507 0.27
508 0.34
509 0.39
510 0.47
511 0.53
512 0.53
513 0.54
514 0.54
515 0.54
516 0.48
517 0.44
518 0.36
519 0.34
520 0.33
521 0.29
522 0.26
523 0.22
524 0.2
525 0.18
526 0.2
527 0.15
528 0.16
529 0.14
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.16
536 0.15
537 0.16
538 0.16
539 0.16
540 0.19
541 0.17
542 0.19
543 0.21
544 0.21
545 0.19
546 0.23
547 0.25
548 0.25
549 0.28
550 0.27
551 0.28
552 0.29
553 0.31
554 0.3
555 0.28
556 0.24
557 0.2
558 0.2
559 0.18
560 0.17
561 0.15
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.14
566 0.13
567 0.13
568 0.12
569 0.15
570 0.19
571 0.27
572 0.28
573 0.28
574 0.31
575 0.32
576 0.34
577 0.35
578 0.39
579 0.42
580 0.49
581 0.56
582 0.56
583 0.56
584 0.55
585 0.55
586 0.52
587 0.5
588 0.52
589 0.46
590 0.48
591 0.48
592 0.52
593 0.49
594 0.47
595 0.39
596 0.35
597 0.31
598 0.27
599 0.25
600 0.22
601 0.19
602 0.16
603 0.15
604 0.09
605 0.1
606 0.08
607 0.08
608 0.07
609 0.08
610 0.09
611 0.11
612 0.12
613 0.11
614 0.12
615 0.18
616 0.23
617 0.21
618 0.22
619 0.25
620 0.28
621 0.29
622 0.34
623 0.3
624 0.27
625 0.28
626 0.27
627 0.21
628 0.17
629 0.17
630 0.12
631 0.1
632 0.07
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.13
644 0.13
645 0.12
646 0.13
647 0.21
648 0.24
649 0.3
650 0.3
651 0.29
652 0.32
653 0.38
654 0.46
655 0.4
656 0.36
657 0.38
658 0.37
659 0.35
660 0.33
661 0.27
662 0.19
663 0.19
664 0.21
665 0.12
666 0.19
667 0.23
668 0.23
669 0.27
670 0.27
671 0.25
672 0.24
673 0.3
674 0.26
675 0.24
676 0.26
677 0.21
678 0.22
679 0.25
680 0.23
681 0.18
682 0.17
683 0.16
684 0.14
685 0.16
686 0.14
687 0.12
688 0.14
689 0.13
690 0.1
691 0.09
692 0.08
693 0.07
694 0.1
695 0.09
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.09
700 0.1
701 0.11
702 0.09
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.13
707 0.13
708 0.17
709 0.18
710 0.18
711 0.19
712 0.2
713 0.23
714 0.25
715 0.3
716 0.29
717 0.31
718 0.34
719 0.37
720 0.42
721 0.43
722 0.45
723 0.48
724 0.51
725 0.49
726 0.46
727 0.51
728 0.5
729 0.54
730 0.48
731 0.4
732 0.36
733 0.36
734 0.44
735 0.36
736 0.32
737 0.26
738 0.3
739 0.33
740 0.34
741 0.31
742 0.24
743 0.25
744 0.23
745 0.22
746 0.19
747 0.21
748 0.18
749 0.22
750 0.2
751 0.2
752 0.21
753 0.21
754 0.18
755 0.12
756 0.13
757 0.11
758 0.13
759 0.12
760 0.11
761 0.13
762 0.17
763 0.18
764 0.17
765 0.17
766 0.18
767 0.21
768 0.26
769 0.24
770 0.21
771 0.21
772 0.22
773 0.2
774 0.19
775 0.19
776 0.14
777 0.14
778 0.13
779 0.15
780 0.17
781 0.18
782 0.19
783 0.17
784 0.19
785 0.19
786 0.21
787 0.21
788 0.18
789 0.19
790 0.2
791 0.19
792 0.17
793 0.17
794 0.18
795 0.16
796 0.16
797 0.14
798 0.12
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.09
803 0.09
804 0.08
805 0.09
806 0.1
807 0.09
808 0.09
809 0.09
810 0.09
811 0.09
812 0.09
813 0.1
814 0.11
815 0.12
816 0.13
817 0.14
818 0.15
819 0.17
820 0.18
821 0.17
822 0.17
823 0.19
824 0.19
825 0.21
826 0.3
827 0.38
828 0.4
829 0.42
830 0.41
831 0.44
832 0.51
833 0.48
834 0.43
835 0.38
836 0.39
837 0.43
838 0.44
839 0.39
840 0.31
841 0.33
842 0.29
843 0.25
844 0.22
845 0.15
846 0.14
847 0.12
848 0.15
849 0.12
850 0.1
851 0.11
852 0.1
853 0.12
854 0.12
855 0.12
856 0.1
857 0.1
858 0.11
859 0.09
860 0.09
861 0.09
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.09
866 0.09
867 0.09
868 0.1
869 0.1
870 0.12