FuNGI

A0A1Y2WBT4

Protein Details

Accession

A0A1Y2WBT4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1130-1154	YHPNRSDKTTKERNGQRVRRLQLSD	Hydrophilic
1202-1221	LIPSIHSRSRRQAQRGHRKR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1209-1221	RSRRQAQRGHRKR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRSRKRELLSLNQRAWDGETDIFPVGSSLDSSLKKNTAFIKRLRTVITPSTLTTFLQEIRTLSLSKYLSEIISACYEGLSKLKTPGEIDAAIEIVSALHQRFGPGEFTEFLGWLLGKGMATPDKSLLKSLAPEVREKEEKERLIRQRALLRVITELWLVGVLRTLDDVKPDDATRGANGKNVELKIKSANSTKGGGAEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLLVIFVKSFGWDILGVKSAGSEGRKTVEEDGVTKSTDENSERTSGQEEDGVTGSEDPPFAGPELRERFRNILKRYFEDVKAHLVRDQKNIVTQRGRNSEAYVKSGEVFEDRQANFERQLKAQERLVSNAQVIADAIGADMPDLKETGDGFSTTNGAIGLVKTGEYLRGQSEGAGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPGILLEDGKKKKTDTDEQVGRRADSSETNDASKPVDTNDDQSTAIANKTIGAQVDVLLTRLPELTQKDAVDQAAIDFCFLNSKASRNRLIKGLTEVPKGRTDLLPFWSRLVATLGRYMPDIPKGVVEYLDAEFRSLQRRKEKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGIVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRNADTSPRMATFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAIYYVDPPERASIQQKERTPTELFIRKLIYIDLTKRNYTKVLKQIRRLHWEESEVVAILTKVFSRPAKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPDFTVTVIDNVIESVVFGLEQNDFKFNQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMTFGYGGVPIPGRHNPFDLPDDYFRIRLVATMLETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFLQYYIHTKHPLPMDIEFIVQDTFSLTRPQWKLATTLEEATKAFQLAVAQDQKSAGLDKSAEPDEASSGASSDNEDVEGDGDMVLPEADGDGDDSELGDDDDAEDTENQPQSPQNYDSEEEAIVVTRKAEEIDPEDEADFEREYAKMMAESLESRKFDRKPLFDVPLPVRPKTRDVSSTTDTDNTTDENAPSTMAFSLLTKKGNRQQTRTVALPSDSTFAVAMKTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRESEDPDGDTHMTPINPNNNIHSSSGHEKPPSYHPNRSDKTTKERNGQRVRRLQLSDVDWYGKPQYNHNNIKQNGQIPETISADEPNEDKSAPSQVGENSVNKRLIPSIHSRSRRQAQRGHRKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.52
3	0.48
4	0.39
5	0.32
6	0.24
7	0.22
8	0.21
9	0.21
10	0.2
11	0.17
12	0.14
13	0.12
14	0.1
15	0.09
16	0.09
17	0.15
18	0.17
19	0.2
20	0.25
21	0.29
22	0.29
23	0.33
24	0.39
25	0.43
26	0.48
27	0.52
28	0.58
29	0.59
30	0.63
31	0.62
32	0.57
33	0.53
34	0.53
35	0.51
36	0.43
37	0.39
38	0.39
39	0.36
40	0.32
41	0.28
42	0.24
43	0.21
44	0.22
45	0.22
46	0.19
47	0.22
48	0.24
49	0.23
50	0.21
51	0.25
52	0.23
53	0.22
54	0.23
55	0.21
56	0.19
57	0.2
58	0.2
59	0.15
60	0.17
61	0.16
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.12
66	0.15
67	0.15
68	0.15
69	0.2
70	0.23
71	0.25
72	0.26
73	0.28
74	0.29
75	0.27
76	0.26
77	0.21
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.11
82	0.06
83	0.07
84	0.09
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.11
89	0.12
90	0.14
91	0.17
92	0.15
93	0.18
94	0.17
95	0.19
96	0.19
97	0.18
98	0.16
99	0.15
100	0.13
101	0.1
102	0.1
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.12
107	0.14
108	0.16
109	0.17
110	0.2
111	0.24
112	0.25
113	0.27
114	0.26
115	0.24
116	0.25
117	0.3
118	0.31
119	0.28
120	0.32
121	0.34
122	0.39
123	0.43
124	0.43
125	0.45
126	0.48
127	0.53
128	0.54
129	0.6
130	0.62
131	0.66
132	0.67
133	0.65
134	0.64
135	0.63
136	0.62
137	0.54
138	0.46
139	0.39
140	0.36
141	0.31
142	0.23
143	0.18
144	0.13
145	0.12
146	0.11
147	0.08
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.11
153	0.11
154	0.14
155	0.17
156	0.15
157	0.18
158	0.18
159	0.19
160	0.18
161	0.19
162	0.19
163	0.22
164	0.21
165	0.23
166	0.23
167	0.25
168	0.3
169	0.3
170	0.32
171	0.27
172	0.29
173	0.32
174	0.33
175	0.34
176	0.33
177	0.37
178	0.35
179	0.36
180	0.35
181	0.31
182	0.3
183	0.27
184	0.23
185	0.21
186	0.19
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.1
196	0.15
197	0.17
198	0.17
199	0.19
200	0.19
201	0.2
202	0.23
203	0.23
204	0.19
205	0.18
206	0.18
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.1
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.1
226	0.12
227	0.13
228	0.13
229	0.12
230	0.15
231	0.17
232	0.19
233	0.21
234	0.21
235	0.21
236	0.21
237	0.25
238	0.24
239	0.23
240	0.21
241	0.19
242	0.17
243	0.2
244	0.21
245	0.18
246	0.2
247	0.22
248	0.22
249	0.23
250	0.24
251	0.2
252	0.19
253	0.19
254	0.16
255	0.15
256	0.16
257	0.15
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.18
270	0.25
271	0.27
272	0.29
273	0.31
274	0.36
275	0.42
276	0.51
277	0.47
278	0.49
279	0.52
280	0.54
281	0.58
282	0.58
283	0.54
284	0.49
285	0.45
286	0.46
287	0.44
288	0.4
289	0.36
290	0.38
291	0.38
292	0.39
293	0.41
294	0.33
295	0.37
296	0.4
297	0.43
298	0.44
299	0.44
300	0.47
301	0.49
302	0.51
303	0.45
304	0.45
305	0.46
306	0.4
307	0.39
308	0.32
309	0.27
310	0.24
311	0.23
312	0.2
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.2
317	0.19
318	0.22
319	0.24
320	0.26
321	0.28
322	0.32
323	0.33
324	0.27
325	0.35
326	0.36
327	0.37
328	0.39
329	0.4
330	0.36
331	0.37
332	0.38
333	0.31
334	0.28
335	0.26
336	0.21
337	0.15
338	0.14
339	0.1
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.12
390	0.11
391	0.12
392	0.14
393	0.19
394	0.19
395	0.21
396	0.21
397	0.19
398	0.2
399	0.22
400	0.18
401	0.13
402	0.12
403	0.1
404	0.12
405	0.13
406	0.14
407	0.16
408	0.23
409	0.26
410	0.27
411	0.28
412	0.25
413	0.28
414	0.33
415	0.38
416	0.38
417	0.45
418	0.52
419	0.54
420	0.6
421	0.56
422	0.5
423	0.41
424	0.35
425	0.27
426	0.22
427	0.24
428	0.23
429	0.23
430	0.24
431	0.24
432	0.23
433	0.23
434	0.2
435	0.15
436	0.11
437	0.14
438	0.13
439	0.16
440	0.18
441	0.18
442	0.18
443	0.17
444	0.17
445	0.14
446	0.13
447	0.1
448	0.08
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.08
465	0.11
466	0.13
467	0.16
468	0.16
469	0.17
470	0.18
471	0.18
472	0.14
473	0.12
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.08
481	0.08
482	0.11
483	0.1
484	0.15
485	0.2
486	0.24
487	0.32
488	0.33
489	0.34
490	0.35
491	0.36
492	0.33
493	0.33
494	0.37
495	0.33
496	0.34
497	0.34
498	0.32
499	0.33
500	0.32
501	0.29
502	0.22
503	0.21
504	0.2
505	0.22
506	0.23
507	0.21
508	0.21
509	0.2
510	0.18
511	0.16
512	0.16
513	0.13
514	0.11
515	0.15
516	0.14
517	0.14
518	0.14
519	0.15
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.1
532	0.09
533	0.09
534	0.09
535	0.1
536	0.18
537	0.19
538	0.24
539	0.32
540	0.37
541	0.42
542	0.48
543	0.49
544	0.47
545	0.53
546	0.52
547	0.49
548	0.47
549	0.42
550	0.39
551	0.39
552	0.32
553	0.24
554	0.2
555	0.13
556	0.12
557	0.13
558	0.12
559	0.11
560	0.11
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.1
566	0.08
567	0.09
568	0.09
569	0.1
570	0.09
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.11
575	0.09
576	0.09
577	0.08
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.11
582	0.1
583	0.11
584	0.12
585	0.11
586	0.1
587	0.09
588	0.09
589	0.06
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.06
595	0.06
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.11
602	0.14
603	0.15
604	0.16
605	0.17
606	0.2
607	0.21
608	0.21
609	0.19
610	0.16
611	0.15
612	0.14
613	0.13
614	0.09
615	0.1
616	0.15
617	0.17
618	0.18
619	0.19
620	0.21
621	0.21
622	0.22
623	0.28
624	0.31
625	0.32
626	0.38
627	0.45
628	0.48
629	0.51
630	0.5
631	0.42
632	0.34
633	0.31
634	0.25
635	0.15
636	0.1
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.07
644	0.06
645	0.07
646	0.08
647	0.09
648	0.1
649	0.15
650	0.21
651	0.27
652	0.33
653	0.35
654	0.38
655	0.38
656	0.41
657	0.37
658	0.32
659	0.33
660	0.33
661	0.31
662	0.29
663	0.3
664	0.26
665	0.25
666	0.23
667	0.18
668	0.14
669	0.18
670	0.23
671	0.24
672	0.26
673	0.27
674	0.28
675	0.3
676	0.31
677	0.33
678	0.35
679	0.43
680	0.47
681	0.55
682	0.64
683	0.66
684	0.7
685	0.67
686	0.61
687	0.52
688	0.49
689	0.41
690	0.32
691	0.26
692	0.18
693	0.14
694	0.11
695	0.09
696	0.06
697	0.05
698	0.05
699	0.04
700	0.07
701	0.08
702	0.11
703	0.16
704	0.2
705	0.27
706	0.28
707	0.31
708	0.3
709	0.35
710	0.34
711	0.3
712	0.27
713	0.19
714	0.18
715	0.15
716	0.13
717	0.07
718	0.04
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.05
724	0.06
725	0.08
726	0.08
727	0.1
728	0.1
729	0.12
730	0.16
731	0.15
732	0.15
733	0.13
734	0.13
735	0.11
736	0.1
737	0.09
738	0.04
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.04
745	0.05
746	0.07
747	0.08
748	0.09
749	0.1
750	0.14
751	0.22
752	0.22
753	0.29
754	0.28
755	0.31
756	0.33
757	0.37
758	0.37
759	0.32
760	0.31
761	0.25
762	0.25
763	0.22
764	0.19
765	0.15
766	0.14
767	0.18
768	0.17
769	0.16
770	0.16
771	0.18
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.12
776	0.13
777	0.12
778	0.12
779	0.12
780	0.1
781	0.1
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.08
793	0.09
794	0.12
795	0.16
796	0.18
797	0.18
798	0.2
799	0.2
800	0.22
801	0.25
802	0.23
803	0.23
804	0.22
805	0.25
806	0.24
807	0.24
808	0.21
809	0.18
810	0.16
811	0.13
812	0.12
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.08
822	0.08
823	0.07
824	0.08
825	0.1
826	0.13
827	0.15
828	0.15
829	0.18
830	0.18
831	0.2
832	0.2
833	0.18
834	0.16
835	0.17
836	0.16
837	0.18
838	0.16
839	0.15
840	0.15
841	0.16
842	0.18
843	0.18
844	0.22
845	0.2
846	0.21
847	0.25
848	0.27
849	0.28
850	0.28
851	0.26
852	0.25
853	0.23
854	0.23
855	0.18
856	0.16
857	0.13
858	0.1
859	0.09
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.1
864	0.1
865	0.19
866	0.2
867	0.24
868	0.25
869	0.25
870	0.27
871	0.26
872	0.31
873	0.25
874	0.26
875	0.24
876	0.23
877	0.23
878	0.21
879	0.19
880	0.14
881	0.12
882	0.09
883	0.09
884	0.09
885	0.15
886	0.18
887	0.18
888	0.18
889	0.18
890	0.18
891	0.18
892	0.19
893	0.13
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.16
898	0.17
899	0.16
900	0.14
901	0.15
902	0.14
903	0.13
904	0.13
905	0.08
906	0.07
907	0.08
908	0.08
909	0.08
910	0.08
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.07
917	0.06
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.04
924	0.03
925	0.03
926	0.03
927	0.03
928	0.04
929	0.04
930	0.04
931	0.04
932	0.04
933	0.05
934	0.05
935	0.05
936	0.04
937	0.04
938	0.04
939	0.05
940	0.05
941	0.06
942	0.07
943	0.08
944	0.12
945	0.14
946	0.13
947	0.14
948	0.17
949	0.18
950	0.22
951	0.23
952	0.22
953	0.24
954	0.26
955	0.26
956	0.25
957	0.23
958	0.19
959	0.16
960	0.15
961	0.12
962	0.11
963	0.09
964	0.08
965	0.08
966	0.09
967	0.1
968	0.11
969	0.15
970	0.17
971	0.18
972	0.19
973	0.18
974	0.17
975	0.18
976	0.16
977	0.12
978	0.1
979	0.1
980	0.09
981	0.1
982	0.11
983	0.11
984	0.09
985	0.09
986	0.1
987	0.1
988	0.13
989	0.16
990	0.21
991	0.22
992	0.25
993	0.31
994	0.33
995	0.4
996	0.46
997	0.46
998	0.47
999	0.53
1000	0.57
1001	0.52
1002	0.58
1003	0.54
1004	0.54
1005	0.53
1006	0.49
1007	0.46
1008	0.43
1009	0.45
1010	0.43
1011	0.44
1012	0.41
1013	0.42
1014	0.47
1015	0.46
1016	0.46
1017	0.43
1018	0.41
1019	0.36
1020	0.31
1021	0.27
1022	0.21
1023	0.2
1024	0.19
1025	0.17
1026	0.16
1027	0.16
1028	0.15
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.14
1036	0.17
1037	0.22
1038	0.23
1039	0.31
1040	0.38
1041	0.49
1042	0.55
1043	0.55
1044	0.61
1045	0.65
1046	0.69
1047	0.64
1048	0.6
1049	0.52
1050	0.46
1051	0.42
1052	0.34
1053	0.28
1054	0.22
1055	0.19
1056	0.16
1057	0.13
1058	0.13
1059	0.11
1060	0.13
1061	0.16
1062	0.2
1063	0.22
1064	0.25
1065	0.28
1066	0.31
1067	0.36
1068	0.43
1069	0.42
1070	0.47
1071	0.5
1072	0.52
1073	0.58
1074	0.56
1075	0.52
1076	0.48
1077	0.45
1078	0.4
1079	0.4
1080	0.38
1081	0.32
1082	0.34
1083	0.32
1084	0.3
1085	0.3
1086	0.29
1087	0.27
1088	0.27
1089	0.24
1090	0.21
1091	0.24
1092	0.23
1093	0.21
1094	0.2
1095	0.2
1096	0.17
1097	0.18
1098	0.24
1099	0.28
1100	0.3
1101	0.31
1102	0.36
1103	0.36
1104	0.38
1105	0.37
1106	0.33
1107	0.31
1108	0.33
1109	0.37
1110	0.37
1111	0.36
1112	0.35
1113	0.37
1114	0.46
1115	0.5
1116	0.52
1117	0.55
1118	0.58
1119	0.66
1120	0.69
1121	0.73
1122	0.71
1123	0.68
1124	0.71
1125	0.73
1126	0.72
1127	0.72
1128	0.76
1129	0.8
1130	0.83
1131	0.85
1132	0.85
1133	0.84
1134	0.82
1135	0.8
1136	0.74
1137	0.67
1138	0.64
1139	0.58
1140	0.53
1141	0.46
1142	0.44
1143	0.36
1144	0.36
1145	0.37
1146	0.35
1147	0.32
1148	0.36
1149	0.43
1150	0.5
1151	0.6
1152	0.65
1153	0.69
1154	0.66
1155	0.71
1156	0.69
1157	0.65
1158	0.59
1159	0.51
1160	0.45
1161	0.38
1162	0.41
1163	0.36
1164	0.31
1165	0.25
1166	0.22
1167	0.21
1168	0.21
1169	0.19
1170	0.18
1171	0.18
1172	0.16
1173	0.16
1174	0.17
1175	0.22
1176	0.2
1177	0.2
1178	0.21
1179	0.21
1180	0.27
1181	0.31
1182	0.35
1183	0.34
1184	0.4
1185	0.41
1186	0.37
1187	0.38
1188	0.35
1189	0.34
1190	0.33
1191	0.38
1192	0.41
1193	0.5
1194	0.57
1195	0.61
1196	0.68
1197	0.75
1198	0.79
1199	0.77
1200	0.77
1201	0.78

A0A1Y2WBT4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer