Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0D6Z8

Protein Details
Accession J0D6Z8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-239QQASKPEPARKGRKPPPPKNAQDAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-233KPEPARKGRKPPPPK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR034398  Prp24_RRM2  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG adl:AURDEDRAFT_109252  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12297  RRM2_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MVMVMAAPPDVWLPLLEFKEKELGDTLEGVKEVHELYQRAEQDYLSTSVLLKHMSFIIDRQDLFALGAGGDDDDDTDEAAVTRDALAAIVDRGAWHLTEGHEVWNKYCEWEMQQLETLDASEREAQLDRIDKMFLARLQTPHSAFEETSQAYSSFNSTHRPAEDYEKIMVAVTKTRSSAVKAWNTRETSEIALRNASNSLEAYGTYLSEEKHRLQQASKPEPARKGRKPPPPKNAQDAQIALSLLRTLHERAITAAAQRVWAGEDGAAAKLRAFWLSYAGFLRTAKTPEPRKELATLYRATRSVPASGDAWAAYLRALERHADVEGPKESVEEAFGRALGMGVVQDSVEDIVPLVQARADFERRSASSAQDEENGEEGGPVERLVQTLEGGIELVRNAGPAGDPRLRLEKHLGAIYEDMDETERALEMWEATAKFFKTSYLAWDAYLRLLTKSDPPKARTVFRDVSAKNLDWPEMLWEAWLGFEHIHGSVEDVDDCVARVTVLNEKLTAKRAKEAEAYQTAYAQQAAAAAPVAEAQDAMQVDEPPQDGGAVSKKRKAEDDDTSTRDEGEANKRVKIDDSVLKRDRENSTVLVADLSADASEAALKKFFKDCGAIREIKLTQLASGPVASVEFMSRESVPAALTRDKKRIDGQEVAVHVGWKSTLYVTNFPERTDDTAMRDLFGQFGVLLDVRWPSKKFKSTRRFCYVQFTSPAAAEASLSLHGRELEPGMKLSVLMSDPTRKKERTDADANERELYIAGLSRFTKREELQALFQQFGTIKDIRISLDDNGHCKGFAFVEFAEPRSAHSGLSANNFELKSRRIAVTLADPRVKAKHKHDATGLGRKSNLRSRSVRVRGLPSGTQEGLLQQAFEKEFEGVKRVELFVSTNEAVVEFDSQAAVGKVMLKTTTTPFVFQGQELALVEESVAPAAPQKANAVPSAANASSSATSFIPRGVASRPRAGIGSRKRGGAAAVSAGAGIVSKASTNPTASLGAAATSEQGGKGQDDFRKMLGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.19
3 0.22
4 0.22
5 0.24
6 0.31
7 0.3
8 0.29
9 0.26
10 0.25
11 0.23
12 0.26
13 0.26
14 0.2
15 0.21
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.14
20 0.15
21 0.19
22 0.18
23 0.21
24 0.28
25 0.3
26 0.31
27 0.31
28 0.27
29 0.24
30 0.27
31 0.26
32 0.2
33 0.18
34 0.16
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.22
45 0.24
46 0.24
47 0.25
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.21
52 0.14
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.16
86 0.17
87 0.22
88 0.26
89 0.27
90 0.28
91 0.29
92 0.28
93 0.25
94 0.26
95 0.23
96 0.21
97 0.29
98 0.3
99 0.29
100 0.33
101 0.32
102 0.31
103 0.28
104 0.24
105 0.18
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.19
114 0.24
115 0.23
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.24
121 0.22
122 0.22
123 0.24
124 0.26
125 0.3
126 0.35
127 0.35
128 0.33
129 0.33
130 0.31
131 0.27
132 0.26
133 0.27
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.14
142 0.15
143 0.19
144 0.2
145 0.24
146 0.25
147 0.27
148 0.28
149 0.33
150 0.36
151 0.34
152 0.33
153 0.3
154 0.28
155 0.26
156 0.25
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.19
161 0.19
162 0.22
163 0.23
164 0.25
165 0.31
166 0.34
167 0.41
168 0.45
169 0.5
170 0.55
171 0.56
172 0.52
173 0.48
174 0.41
175 0.35
176 0.35
177 0.33
178 0.26
179 0.27
180 0.26
181 0.25
182 0.24
183 0.21
184 0.16
185 0.13
186 0.13
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.13
196 0.17
197 0.18
198 0.25
199 0.29
200 0.31
201 0.32
202 0.37
203 0.44
204 0.48
205 0.53
206 0.52
207 0.53
208 0.59
209 0.66
210 0.71
211 0.69
212 0.72
213 0.74
214 0.79
215 0.84
216 0.86
217 0.87
218 0.87
219 0.85
220 0.82
221 0.79
222 0.72
223 0.66
224 0.57
225 0.48
226 0.39
227 0.33
228 0.25
229 0.19
230 0.16
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.11
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.18
272 0.2
273 0.27
274 0.35
275 0.4
276 0.47
277 0.48
278 0.47
279 0.48
280 0.48
281 0.45
282 0.42
283 0.38
284 0.33
285 0.34
286 0.32
287 0.29
288 0.29
289 0.25
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.13
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.12
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.07
345 0.1
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.19
350 0.19
351 0.22
352 0.22
353 0.2
354 0.21
355 0.22
356 0.22
357 0.21
358 0.21
359 0.18
360 0.18
361 0.16
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.11
389 0.13
390 0.14
391 0.15
392 0.22
393 0.23
394 0.24
395 0.28
396 0.25
397 0.25
398 0.26
399 0.24
400 0.19
401 0.19
402 0.17
403 0.13
404 0.1
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.13
427 0.16
428 0.16
429 0.16
430 0.17
431 0.17
432 0.16
433 0.17
434 0.13
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.15
439 0.2
440 0.27
441 0.3
442 0.32
443 0.39
444 0.42
445 0.45
446 0.41
447 0.44
448 0.39
449 0.37
450 0.42
451 0.35
452 0.38
453 0.36
454 0.33
455 0.29
456 0.27
457 0.25
458 0.17
459 0.17
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.04
487 0.05
488 0.09
489 0.11
490 0.11
491 0.12
492 0.14
493 0.15
494 0.2
495 0.22
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.23
500 0.25
501 0.26
502 0.25
503 0.25
504 0.26
505 0.22
506 0.21
507 0.19
508 0.16
509 0.15
510 0.09
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.06
536 0.12
537 0.17
538 0.18
539 0.23
540 0.25
541 0.26
542 0.29
543 0.33
544 0.33
545 0.34
546 0.41
547 0.42
548 0.43
549 0.44
550 0.41
551 0.35
552 0.29
553 0.23
554 0.19
555 0.21
556 0.26
557 0.25
558 0.27
559 0.27
560 0.27
561 0.28
562 0.25
563 0.22
564 0.22
565 0.26
566 0.33
567 0.36
568 0.37
569 0.37
570 0.4
571 0.38
572 0.34
573 0.31
574 0.23
575 0.21
576 0.2
577 0.19
578 0.14
579 0.11
580 0.09
581 0.07
582 0.06
583 0.04
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.08
591 0.08
592 0.1
593 0.12
594 0.13
595 0.13
596 0.17
597 0.18
598 0.22
599 0.27
600 0.28
601 0.26
602 0.3
603 0.29
604 0.25
605 0.25
606 0.2
607 0.15
608 0.14
609 0.14
610 0.1
611 0.1
612 0.08
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.12
628 0.16
629 0.23
630 0.26
631 0.33
632 0.34
633 0.36
634 0.4
635 0.43
636 0.43
637 0.41
638 0.4
639 0.38
640 0.38
641 0.37
642 0.31
643 0.25
644 0.19
645 0.14
646 0.11
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.1
651 0.13
652 0.17
653 0.2
654 0.27
655 0.28
656 0.27
657 0.28
658 0.26
659 0.27
660 0.27
661 0.26
662 0.22
663 0.27
664 0.27
665 0.25
666 0.25
667 0.21
668 0.17
669 0.16
670 0.11
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.07
678 0.09
679 0.12
680 0.14
681 0.19
682 0.26
683 0.35
684 0.41
685 0.51
686 0.6
687 0.67
688 0.75
689 0.77
690 0.74
691 0.67
692 0.7
693 0.63
694 0.57
695 0.51
696 0.43
697 0.36
698 0.32
699 0.31
700 0.21
701 0.17
702 0.12
703 0.08
704 0.07
705 0.08
706 0.08
707 0.07
708 0.08
709 0.09
710 0.09
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.11
715 0.11
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.1
721 0.08
722 0.09
723 0.1
724 0.18
725 0.22
726 0.28
727 0.34
728 0.34
729 0.36
730 0.44
731 0.48
732 0.47
733 0.53
734 0.54
735 0.57
736 0.62
737 0.61
738 0.53
739 0.46
740 0.39
741 0.3
742 0.23
743 0.14
744 0.1
745 0.08
746 0.1
747 0.12
748 0.15
749 0.16
750 0.18
751 0.23
752 0.22
753 0.29
754 0.32
755 0.34
756 0.35
757 0.4
758 0.4
759 0.35
760 0.34
761 0.28
762 0.23
763 0.22
764 0.22
765 0.16
766 0.15
767 0.16
768 0.17
769 0.16
770 0.18
771 0.18
772 0.15
773 0.22
774 0.24
775 0.25
776 0.26
777 0.25
778 0.23
779 0.21
780 0.2
781 0.14
782 0.13
783 0.13
784 0.11
785 0.18
786 0.19
787 0.2
788 0.22
789 0.21
790 0.21
791 0.23
792 0.23
793 0.16
794 0.17
795 0.18
796 0.18
797 0.24
798 0.23
799 0.2
800 0.24
801 0.24
802 0.23
803 0.24
804 0.23
805 0.22
806 0.24
807 0.25
808 0.21
809 0.22
810 0.23
811 0.3
812 0.35
813 0.36
814 0.36
815 0.35
816 0.36
817 0.43
818 0.47
819 0.44
820 0.44
821 0.5
822 0.51
823 0.55
824 0.56
825 0.59
826 0.6
827 0.63
828 0.58
829 0.5
830 0.49
831 0.47
832 0.49
833 0.48
834 0.46
835 0.43
836 0.46
837 0.5
838 0.58
839 0.63
840 0.63
841 0.6
842 0.61
843 0.59
844 0.59
845 0.54
846 0.47
847 0.45
848 0.39
849 0.34
850 0.28
851 0.24
852 0.23
853 0.2
854 0.16
855 0.11
856 0.15
857 0.15
858 0.15
859 0.15
860 0.13
861 0.15
862 0.16
863 0.2
864 0.16
865 0.18
866 0.2
867 0.2
868 0.19
869 0.17
870 0.18
871 0.15
872 0.22
873 0.2
874 0.18
875 0.17
876 0.17
877 0.16
878 0.15
879 0.15
880 0.08
881 0.08
882 0.08
883 0.07
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.07
888 0.1
889 0.1
890 0.12
891 0.13
892 0.13
893 0.15
894 0.18
895 0.26
896 0.23
897 0.24
898 0.25
899 0.29
900 0.29
901 0.27
902 0.26
903 0.19
904 0.2
905 0.19
906 0.19
907 0.14
908 0.12
909 0.12
910 0.1
911 0.09
912 0.07
913 0.07
914 0.05
915 0.08
916 0.12
917 0.13
918 0.13
919 0.16
920 0.2
921 0.22
922 0.23
923 0.23
924 0.19
925 0.2
926 0.25
927 0.22
928 0.19
929 0.17
930 0.19
931 0.17
932 0.17
933 0.17
934 0.12
935 0.14
936 0.14
937 0.14
938 0.14
939 0.13
940 0.15
941 0.19
942 0.27
943 0.3
944 0.37
945 0.37
946 0.37
947 0.38
948 0.39
949 0.43
950 0.45
951 0.51
952 0.46
953 0.47
954 0.46
955 0.45
956 0.44
957 0.37
958 0.29
959 0.21
960 0.19
961 0.18
962 0.16
963 0.15
964 0.13
965 0.09
966 0.07
967 0.05
968 0.04
969 0.05
970 0.06
971 0.1
972 0.13
973 0.14
974 0.16
975 0.18
976 0.19
977 0.19
978 0.2
979 0.16
980 0.14
981 0.12
982 0.11
983 0.09
984 0.09
985 0.09
986 0.08
987 0.1
988 0.11
989 0.12
990 0.15
991 0.21
992 0.25
993 0.29
994 0.31