Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2W9N0

Protein Details
Accession A0A1Y2W9N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-358EAEPVSKKAKKTKTAKASKLPEGDHydrophilic
364-386KEIADRKAALKKQKKAAKKALEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-383GKKRKSLEGQPEEAEPVSKKAKKTKTAKASKLPEGDDSKLDKEIADRKAALKKQKKAAKKA
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 12.333, nucl 8, mito_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSSSKTVTLRSETAIAPVDPDQTLKASKALLAHMKKASKEKAANSEKKDLLADLDDEEGTKELPVWLTLTTKRHISDSRSLKPGKIVLPHPLNTDPEVGICLITAQPQRAYKNLVASEEFPAEWRKRVNRVIDINKLKTKFKTYETQRKLFAEHDVFLGDSRIINRLPGVLGKTFYKSTAKRPIPVEIQARVPKSDGKRVKRTKDAETVNACTPAQLAGEIERAVGAALVNLSPTVNTAVRVGNANWTAEQIAENVDVVAKTLVEKFVPGKWKNVKSIYIKGPETVALPVWLTDELWLEQEDIVADESEEAKAILSAEKANIGKKRKSLEGQPEEAEPVSKKAKKTKTAKASKLPEGDDSKLDKEIADRKAALKKQKKAAKKALEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.22
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.17
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.16
14 0.18
15 0.2
16 0.24
17 0.3
18 0.32
19 0.37
20 0.42
21 0.45
22 0.48
23 0.54
24 0.54
25 0.53
26 0.56
27 0.57
28 0.61
29 0.68
30 0.72
31 0.69
32 0.72
33 0.65
34 0.6
35 0.54
36 0.44
37 0.35
38 0.29
39 0.24
40 0.16
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.12
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.14
55 0.19
56 0.22
57 0.23
58 0.26
59 0.27
60 0.31
61 0.34
62 0.36
63 0.41
64 0.47
65 0.51
66 0.55
67 0.55
68 0.51
69 0.51
70 0.49
71 0.44
72 0.41
73 0.37
74 0.38
75 0.43
76 0.43
77 0.43
78 0.41
79 0.39
80 0.34
81 0.33
82 0.24
83 0.18
84 0.18
85 0.14
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.17
94 0.21
95 0.23
96 0.24
97 0.29
98 0.26
99 0.31
100 0.32
101 0.3
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.24
106 0.22
107 0.17
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.24
112 0.26
113 0.32
114 0.38
115 0.43
116 0.45
117 0.52
118 0.57
119 0.61
120 0.63
121 0.61
122 0.61
123 0.57
124 0.53
125 0.46
126 0.46
127 0.4
128 0.37
129 0.42
130 0.46
131 0.55
132 0.59
133 0.6
134 0.58
135 0.55
136 0.53
137 0.44
138 0.41
139 0.32
140 0.26
141 0.22
142 0.19
143 0.18
144 0.16
145 0.15
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.09
158 0.11
159 0.11
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.19
164 0.19
165 0.26
166 0.35
167 0.36
168 0.39
169 0.4
170 0.43
171 0.4
172 0.44
173 0.4
174 0.31
175 0.35
176 0.34
177 0.33
178 0.29
179 0.27
180 0.26
181 0.25
182 0.33
183 0.35
184 0.39
185 0.48
186 0.56
187 0.61
188 0.65
189 0.67
190 0.63
191 0.64
192 0.59
193 0.56
194 0.51
195 0.49
196 0.41
197 0.38
198 0.32
199 0.23
200 0.21
201 0.14
202 0.1
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.04
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.14
255 0.23
256 0.24
257 0.31
258 0.39
259 0.45
260 0.5
261 0.52
262 0.55
263 0.52
264 0.59
265 0.57
266 0.55
267 0.51
268 0.45
269 0.42
270 0.35
271 0.31
272 0.24
273 0.17
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.15
306 0.16
307 0.21
308 0.28
309 0.33
310 0.37
311 0.42
312 0.46
313 0.49
314 0.53
315 0.57
316 0.61
317 0.62
318 0.62
319 0.58
320 0.54
321 0.49
322 0.44
323 0.37
324 0.27
325 0.24
326 0.28
327 0.31
328 0.35
329 0.42
330 0.52
331 0.59
332 0.67
333 0.73
334 0.75
335 0.81
336 0.85
337 0.86
338 0.84
339 0.83
340 0.8
341 0.71
342 0.68
343 0.62
344 0.56
345 0.51
346 0.48
347 0.41
348 0.37
349 0.35
350 0.28
351 0.29
352 0.34
353 0.33
354 0.34
355 0.33
356 0.37
357 0.46
358 0.52
359 0.57
360 0.59
361 0.64
362 0.68
363 0.76
364 0.8
365 0.81
366 0.85