Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VPH1

Protein Details
Accession A0A1Y2VPH1    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-49SSRGRAGRGRHPRGQNAPRRSEABasic
1069-1089GRFVALRKEPKKKVEEQPVEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-46RGRGRQPRGGGSSRGRAGRGRHPRGQNAPRR
73-91GQRGRRGGRGGRGPRRGDG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
Amino Acid Sequences MAGDPVSETPPNSTNRGRGRQPRGGGSSRGRAGRGRHPRGQNAPRRSEAPSADSSAPAAPPVTETPSGSDTRGQRGRRGGRGGRGPRRGDGGNIRRTTMAGARTFGGQLTTSIETGESDSTSPTGLNIDAPEFVPGQPSAGPSNASSVKPQPKSSNVRKASKSTAPDLPTRIHEDINNGQYECVICTNEVLPNSKVWSCSICWTATHMTCVKKWYANRARNSDQQQSNWRCPGCNSPMVDEPSTYHCWCGKEIGPRSIPGLNPHSCGQTCSKPRATCPHPCPLKCHAGPCPPCLAMGPTQSCFCGKNSSTKRCSETDYTNGWSCHEICGDLLPCGEHECQRECHSGLCGSCHVPVFSLCYCGRESKEVSCDQRGDKLESYNYGQAKGDIPNDDDLPEGWYWGSFDCKAICGRVFDCGKHSCQKDCHPQDENEAHCPFSPDIITHCPCGKTPLVDILDQPRASCEDSVPNCSKTCNKLLSCGHLCQDSCHSGPCSPCMQQMEISCRCGRTKTNSRCHQGTIEAPECMRICRAQLNCGRHEHGEHCCPGEKKAAERVAAKRKNRNAAVTNSEIEAEHICTRPCGRSLKCGRHQCQQMCHRGPCPSCPEAIFEEIGCNCGRTVLQPPQPCGTRPPECRFDCTRPRPCGHPQVSHNCHTDEEPCPKCPFLVEKRCICGKKPLKNQPCWFEEPRCGLPCGRKLKCGTHTCTKPCHRLGECEDADVTGSRCKQPCGKTRSCGHLDIEPCHAPYPCKEEKPCQAKTFITCECQRRKQEVRCLATKKNPSPQRETLKCDEECLRLQRNARLADALNVDPQAHTDDHVPYSDTTLKFYKENPQFAQTYEREYRVFAMDPTQKLLRLKPMKSFQRAFLHSLAEDFGFDSESADPEPHRHVCLFKTPRFVSAPTKTLGQALNVRNLTQQQPLTQAPATSSKDVSTKLPYNALLLSNPRFALTADELDTALRAEYATYPDVKFETRFLAEDVIIKGSGPWRPQELESSLTSLKPSLLRAVQNAGLAQGVSLCHVDDQLNILQNEQVDQAAAAGGWSAVMRRSTRPKPAAAPPPAQSSSYGGRFVALRKEPKKKVEEQPVEDDWEAAAEKLDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.49
3 0.56
4 0.62
5 0.67
6 0.72
7 0.75
8 0.77
9 0.76
10 0.74
11 0.71
12 0.69
13 0.66
14 0.65
15 0.62
16 0.59
17 0.53
18 0.51
19 0.51
20 0.54
21 0.58
22 0.58
23 0.61
24 0.66
25 0.73
26 0.79
27 0.83
28 0.83
29 0.82
30 0.81
31 0.76
32 0.71
33 0.67
34 0.63
35 0.56
36 0.52
37 0.46
38 0.44
39 0.4
40 0.38
41 0.34
42 0.29
43 0.25
44 0.2
45 0.17
46 0.12
47 0.13
48 0.16
49 0.19
50 0.19
51 0.2
52 0.23
53 0.26
54 0.28
55 0.26
56 0.3
57 0.28
58 0.36
59 0.43
60 0.42
61 0.45
62 0.53
63 0.6
64 0.62
65 0.68
66 0.65
67 0.66
68 0.74
69 0.78
70 0.78
71 0.78
72 0.74
73 0.67
74 0.65
75 0.58
76 0.54
77 0.54
78 0.54
79 0.54
80 0.52
81 0.51
82 0.46
83 0.45
84 0.42
85 0.36
86 0.33
87 0.26
88 0.26
89 0.25
90 0.26
91 0.26
92 0.23
93 0.19
94 0.13
95 0.12
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.11
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.14
130 0.21
131 0.23
132 0.23
133 0.25
134 0.31
135 0.4
136 0.43
137 0.48
138 0.48
139 0.53
140 0.62
141 0.69
142 0.71
143 0.7
144 0.74
145 0.74
146 0.74
147 0.72
148 0.69
149 0.63
150 0.58
151 0.57
152 0.51
153 0.51
154 0.48
155 0.44
156 0.4
157 0.43
158 0.39
159 0.34
160 0.32
161 0.33
162 0.37
163 0.39
164 0.38
165 0.31
166 0.29
167 0.28
168 0.27
169 0.22
170 0.17
171 0.13
172 0.1
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.17
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.22
185 0.2
186 0.24
187 0.25
188 0.22
189 0.21
190 0.25
191 0.3
192 0.27
193 0.31
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.35
198 0.34
199 0.34
200 0.36
201 0.42
202 0.48
203 0.53
204 0.6
205 0.64
206 0.67
207 0.69
208 0.73
209 0.72
210 0.66
211 0.63
212 0.66
213 0.64
214 0.65
215 0.63
216 0.57
217 0.49
218 0.46
219 0.49
220 0.45
221 0.43
222 0.38
223 0.36
224 0.41
225 0.44
226 0.42
227 0.34
228 0.3
229 0.3
230 0.33
231 0.29
232 0.26
233 0.25
234 0.26
235 0.26
236 0.28
237 0.28
238 0.32
239 0.38
240 0.43
241 0.41
242 0.41
243 0.43
244 0.41
245 0.38
246 0.34
247 0.35
248 0.29
249 0.3
250 0.31
251 0.32
252 0.29
253 0.31
254 0.3
255 0.32
256 0.36
257 0.4
258 0.47
259 0.44
260 0.49
261 0.56
262 0.57
263 0.58
264 0.58
265 0.61
266 0.62
267 0.61
268 0.63
269 0.59
270 0.63
271 0.55
272 0.55
273 0.53
274 0.54
275 0.56
276 0.52
277 0.5
278 0.41
279 0.39
280 0.34
281 0.29
282 0.23
283 0.26
284 0.26
285 0.23
286 0.24
287 0.24
288 0.24
289 0.23
290 0.21
291 0.22
292 0.2
293 0.3
294 0.38
295 0.47
296 0.51
297 0.54
298 0.57
299 0.51
300 0.56
301 0.5
302 0.46
303 0.43
304 0.42
305 0.41
306 0.41
307 0.39
308 0.35
309 0.31
310 0.27
311 0.22
312 0.19
313 0.15
314 0.11
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.16
325 0.19
326 0.21
327 0.25
328 0.29
329 0.26
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.23
334 0.23
335 0.2
336 0.18
337 0.19
338 0.18
339 0.16
340 0.14
341 0.13
342 0.15
343 0.14
344 0.18
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.22
351 0.24
352 0.23
353 0.28
354 0.31
355 0.34
356 0.35
357 0.36
358 0.33
359 0.37
360 0.36
361 0.35
362 0.32
363 0.31
364 0.28
365 0.28
366 0.3
367 0.29
368 0.26
369 0.23
370 0.22
371 0.2
372 0.2
373 0.2
374 0.19
375 0.16
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.16
380 0.14
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.1
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.23
403 0.24
404 0.27
405 0.32
406 0.33
407 0.31
408 0.34
409 0.41
410 0.48
411 0.5
412 0.53
413 0.5
414 0.49
415 0.52
416 0.53
417 0.48
418 0.43
419 0.39
420 0.33
421 0.28
422 0.3
423 0.22
424 0.18
425 0.16
426 0.1
427 0.13
428 0.18
429 0.19
430 0.19
431 0.21
432 0.2
433 0.2
434 0.24
435 0.21
436 0.16
437 0.16
438 0.21
439 0.21
440 0.21
441 0.22
442 0.23
443 0.26
444 0.25
445 0.24
446 0.17
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.13
451 0.17
452 0.18
453 0.24
454 0.26
455 0.26
456 0.25
457 0.27
458 0.29
459 0.25
460 0.29
461 0.31
462 0.28
463 0.34
464 0.35
465 0.41
466 0.41
467 0.39
468 0.34
469 0.3
470 0.29
471 0.23
472 0.25
473 0.21
474 0.18
475 0.18
476 0.18
477 0.18
478 0.18
479 0.2
480 0.19
481 0.17
482 0.2
483 0.2
484 0.2
485 0.2
486 0.22
487 0.27
488 0.26
489 0.28
490 0.26
491 0.25
492 0.25
493 0.24
494 0.24
495 0.26
496 0.35
497 0.42
498 0.52
499 0.59
500 0.63
501 0.63
502 0.62
503 0.54
504 0.45
505 0.38
506 0.34
507 0.27
508 0.23
509 0.21
510 0.22
511 0.2
512 0.18
513 0.16
514 0.1
515 0.09
516 0.15
517 0.16
518 0.2
519 0.26
520 0.3
521 0.32
522 0.34
523 0.35
524 0.3
525 0.31
526 0.27
527 0.25
528 0.24
529 0.22
530 0.21
531 0.23
532 0.23
533 0.22
534 0.26
535 0.22
536 0.21
537 0.27
538 0.29
539 0.28
540 0.32
541 0.38
542 0.42
543 0.48
544 0.51
545 0.52
546 0.54
547 0.6
548 0.57
549 0.56
550 0.49
551 0.47
552 0.47
553 0.41
554 0.36
555 0.29
556 0.27
557 0.21
558 0.17
559 0.13
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.12
567 0.15
568 0.2
569 0.19
570 0.28
571 0.37
572 0.46
573 0.53
574 0.61
575 0.62
576 0.63
577 0.7
578 0.63
579 0.64
580 0.62
581 0.63
582 0.59
583 0.58
584 0.52
585 0.51
586 0.48
587 0.43
588 0.41
589 0.32
590 0.28
591 0.26
592 0.26
593 0.22
594 0.23
595 0.19
596 0.13
597 0.14
598 0.13
599 0.14
600 0.11
601 0.09
602 0.07
603 0.08
604 0.08
605 0.07
606 0.13
607 0.19
608 0.25
609 0.27
610 0.3
611 0.33
612 0.34
613 0.34
614 0.32
615 0.32
616 0.34
617 0.39
618 0.42
619 0.47
620 0.47
621 0.53
622 0.54
623 0.55
624 0.58
625 0.61
626 0.64
627 0.61
628 0.62
629 0.61
630 0.62
631 0.64
632 0.59
633 0.56
634 0.53
635 0.58
636 0.61
637 0.6
638 0.55
639 0.46
640 0.41
641 0.35
642 0.32
643 0.26
644 0.3
645 0.28
646 0.29
647 0.29
648 0.29
649 0.28
650 0.26
651 0.29
652 0.3
653 0.38
654 0.41
655 0.43
656 0.47
657 0.53
658 0.53
659 0.47
660 0.48
661 0.47
662 0.51
663 0.58
664 0.65
665 0.68
666 0.75
667 0.79
668 0.75
669 0.72
670 0.68
671 0.62
672 0.55
673 0.51
674 0.47
675 0.47
676 0.42
677 0.38
678 0.33
679 0.35
680 0.39
681 0.44
682 0.4
683 0.41
684 0.43
685 0.48
686 0.55
687 0.57
688 0.55
689 0.55
690 0.61
691 0.59
692 0.65
693 0.64
694 0.63
695 0.59
696 0.61
697 0.53
698 0.52
699 0.54
700 0.54
701 0.48
702 0.41
703 0.38
704 0.29
705 0.28
706 0.22
707 0.18
708 0.11
709 0.13
710 0.16
711 0.17
712 0.19
713 0.26
714 0.33
715 0.41
716 0.47
717 0.51
718 0.54
719 0.59
720 0.65
721 0.62
722 0.57
723 0.49
724 0.45
725 0.42
726 0.37
727 0.36
728 0.29
729 0.26
730 0.25
731 0.23
732 0.19
733 0.19
734 0.25
735 0.26
736 0.31
737 0.34
738 0.39
739 0.48
740 0.55
741 0.58
742 0.53
743 0.51
744 0.48
745 0.48
746 0.48
747 0.41
748 0.39
749 0.38
750 0.44
751 0.49
752 0.54
753 0.56
754 0.58
755 0.65
756 0.68
757 0.72
758 0.73
759 0.71
760 0.71
761 0.71
762 0.69
763 0.68
764 0.69
765 0.64
766 0.65
767 0.66
768 0.63
769 0.66
770 0.68
771 0.7
772 0.67
773 0.68
774 0.64
775 0.64
776 0.58
777 0.53
778 0.48
779 0.42
780 0.41
781 0.4
782 0.39
783 0.35
784 0.39
785 0.4
786 0.43
787 0.41
788 0.37
789 0.33
790 0.29
791 0.29
792 0.28
793 0.25
794 0.19
795 0.18
796 0.17
797 0.14
798 0.15
799 0.14
800 0.11
801 0.11
802 0.12
803 0.14
804 0.15
805 0.16
806 0.16
807 0.13
808 0.17
809 0.23
810 0.2
811 0.22
812 0.23
813 0.24
814 0.24
815 0.27
816 0.32
817 0.34
818 0.4
819 0.39
820 0.42
821 0.41
822 0.41
823 0.47
824 0.38
825 0.38
826 0.35
827 0.35
828 0.3
829 0.3
830 0.31
831 0.25
832 0.25
833 0.18
834 0.22
835 0.26
836 0.26
837 0.3
838 0.29
839 0.29
840 0.3
841 0.33
842 0.35
843 0.38
844 0.39
845 0.44
846 0.52
847 0.58
848 0.64
849 0.64
850 0.62
851 0.63
852 0.63
853 0.59
854 0.51
855 0.45
856 0.37
857 0.35
858 0.28
859 0.19
860 0.16
861 0.12
862 0.09
863 0.08
864 0.08
865 0.09
866 0.08
867 0.09
868 0.09
869 0.1
870 0.1
871 0.12
872 0.18
873 0.18
874 0.2
875 0.21
876 0.23
877 0.25
878 0.35
879 0.41
880 0.4
881 0.47
882 0.46
883 0.49
884 0.5
885 0.5
886 0.48
887 0.46
888 0.45
889 0.37
890 0.38
891 0.34
892 0.34
893 0.32
894 0.27
895 0.29
896 0.28
897 0.35
898 0.33
899 0.34
900 0.32
901 0.35
902 0.33
903 0.31
904 0.3
905 0.23
906 0.28
907 0.29
908 0.3
909 0.28
910 0.26
911 0.22
912 0.29
913 0.31
914 0.28
915 0.28
916 0.25
917 0.27
918 0.28
919 0.29
920 0.29
921 0.31
922 0.3
923 0.33
924 0.32
925 0.31
926 0.32
927 0.3
928 0.25
929 0.25
930 0.26
931 0.25
932 0.24
933 0.23
934 0.21
935 0.2
936 0.23
937 0.2
938 0.2
939 0.19
940 0.2
941 0.2
942 0.19
943 0.19
944 0.14
945 0.11
946 0.08
947 0.06
948 0.06
949 0.08
950 0.11
951 0.13
952 0.16
953 0.16
954 0.17
955 0.19
956 0.21
957 0.2
958 0.19
959 0.22
960 0.21
961 0.22
962 0.22
963 0.22
964 0.21
965 0.23
966 0.23
967 0.19
968 0.17
969 0.16
970 0.16
971 0.17
972 0.21
973 0.19
974 0.21
975 0.24
976 0.27
977 0.28
978 0.33
979 0.32
980 0.32
981 0.31
982 0.33
983 0.29
984 0.27
985 0.26
986 0.21
987 0.2
988 0.19
989 0.19
990 0.21
991 0.25
992 0.27
993 0.29
994 0.33
995 0.32
996 0.32
997 0.3
998 0.24
999 0.2
1000 0.16
1001 0.14
1002 0.1
1003 0.08
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.09
1011 0.13
1012 0.16
1013 0.22
1014 0.21
1015 0.22
1016 0.22
1017 0.21
1018 0.22
1019 0.19
1020 0.15
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.09
1024 0.07
1025 0.07
1026 0.05
1027 0.05
1028 0.04
1029 0.04
1030 0.05
1031 0.05
1032 0.08
1033 0.12
1034 0.15
1035 0.22
1036 0.33
1037 0.4
1038 0.5
1039 0.55
1040 0.58
1041 0.61
1042 0.68
1043 0.71
1044 0.69
1045 0.67
1046 0.61
1047 0.64
1048 0.6
1049 0.54
1050 0.46
1051 0.4
1052 0.4
1053 0.37
1054 0.35
1055 0.27
1056 0.26
1057 0.27
1058 0.29
1059 0.34
1060 0.35
1061 0.41
1062 0.49
1063 0.59
1064 0.66
1065 0.73
1066 0.77
1067 0.77
1068 0.79
1069 0.81
1070 0.82
1071 0.78
1072 0.78
1073 0.72
1074 0.7
1075 0.6
1076 0.5
1077 0.39
1078 0.3
1079 0.24
1080 0.17
1081 0.14