Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXS3

Protein Details
Accession C4QXS3    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-602RPTTIISSTNKKRRTRLKPKHEAKEKYKRLDEERWLPLKDRSYYRPKKGKKIRNTTQGTVTSHydrophilic
605-625SEISGLKKTLPKKSSKKKGRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
551-593KKRRTRLKPKHEAKEKYKRLDEERWLPLKDRSYYRPKKGKKIR
611-625KKTLPKKSSKKKGRK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito_nucl 12.333, mito 9.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0210  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
Amino Acid Sequences MAEKLIGRKIKPSRTPISFKMSSLSELVSELAIHSEKRQYKEAYEKAKRIIDLGHPLDLDTLKLGLVASINLDQYHNAGRLISKSKDHIVYDGMKEFLLLIGYVYYKNGDSKNFETLLKDSAFQGRAFEHLKAQYYYKIGENEKALKIYRELSKNPLDEVVDLSVNERAVISQLLELDGVVEQPVSRPIDDSYDCKFNDALYQVKIGDYESALDLLEEAKAICEENTKDLPLDTREAEIVPILLQIAYVKQLKGKKEESLTALRSLSKPKDSLLDLIYRNNLLSLRIDEYGRNDTNFHILYRELGFPNSIDINKDKLTVSQRVALTRNESLLALELGKIPSQSDLKLFYDATSEFLDLNTKLEASMIYNYFMRRPGQQEVPNALLTAQLAINVGNINNARTVLETVVSNDEKNLLEPSIVVSLYLIYDKLQSGRLQVELLKKVADLLLESEISSTQQRKFFKDIAFKTLNHDAVLANRLFEKLHSIYPNDELVSTYLNSSSNASNNNTTTTNFSELDDLVLGIDTDKLISEGFDTFESSKRPTTIISSTNKKRRTRLKPKHEAKEKYKRLDEERWLPLKDRSYYRPKKGKKIRNTTQGTVTSNTSEISGLKKTLPKKSSKKKGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.77
3 0.74
4 0.74
5 0.66
6 0.59
7 0.54
8 0.47
9 0.4
10 0.34
11 0.29
12 0.2
13 0.18
14 0.18
15 0.13
16 0.12
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.14
22 0.22
23 0.28
24 0.32
25 0.39
26 0.39
27 0.45
28 0.55
29 0.61
30 0.63
31 0.66
32 0.67
33 0.67
34 0.68
35 0.62
36 0.53
37 0.49
38 0.44
39 0.45
40 0.42
41 0.38
42 0.33
43 0.33
44 0.34
45 0.3
46 0.23
47 0.15
48 0.12
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.13
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.2
68 0.26
69 0.28
70 0.27
71 0.3
72 0.35
73 0.39
74 0.39
75 0.35
76 0.34
77 0.36
78 0.36
79 0.35
80 0.29
81 0.24
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.12
86 0.08
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.13
95 0.16
96 0.18
97 0.24
98 0.26
99 0.32
100 0.32
101 0.32
102 0.31
103 0.3
104 0.31
105 0.26
106 0.24
107 0.2
108 0.24
109 0.25
110 0.22
111 0.22
112 0.18
113 0.22
114 0.24
115 0.23
116 0.22
117 0.23
118 0.26
119 0.26
120 0.28
121 0.27
122 0.26
123 0.27
124 0.26
125 0.29
126 0.27
127 0.3
128 0.32
129 0.34
130 0.34
131 0.35
132 0.32
133 0.28
134 0.28
135 0.3
136 0.32
137 0.32
138 0.33
139 0.37
140 0.42
141 0.41
142 0.4
143 0.37
144 0.31
145 0.26
146 0.25
147 0.21
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.17
177 0.19
178 0.21
179 0.21
180 0.26
181 0.26
182 0.26
183 0.26
184 0.2
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.13
194 0.11
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.08
211 0.09
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.17
218 0.15
219 0.17
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.09
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.13
238 0.17
239 0.2
240 0.26
241 0.28
242 0.29
243 0.31
244 0.33
245 0.33
246 0.35
247 0.34
248 0.3
249 0.29
250 0.26
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.23
255 0.21
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.23
260 0.2
261 0.22
262 0.2
263 0.21
264 0.21
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.14
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.14
277 0.19
278 0.19
279 0.18
280 0.16
281 0.16
282 0.19
283 0.19
284 0.16
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.14
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.12
300 0.12
301 0.14
302 0.12
303 0.15
304 0.19
305 0.21
306 0.22
307 0.24
308 0.25
309 0.26
310 0.28
311 0.25
312 0.25
313 0.21
314 0.2
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.13
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.14
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.09
345 0.1
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.15
361 0.18
362 0.22
363 0.28
364 0.32
365 0.35
366 0.36
367 0.37
368 0.34
369 0.3
370 0.25
371 0.19
372 0.14
373 0.11
374 0.07
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.14
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.11
418 0.11
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.14
423 0.18
424 0.23
425 0.22
426 0.23
427 0.2
428 0.19
429 0.19
430 0.18
431 0.15
432 0.09
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.12
441 0.14
442 0.17
443 0.23
444 0.26
445 0.3
446 0.35
447 0.4
448 0.43
449 0.5
450 0.48
451 0.51
452 0.52
453 0.48
454 0.48
455 0.49
456 0.43
457 0.33
458 0.31
459 0.23
460 0.22
461 0.26
462 0.2
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.17
469 0.15
470 0.2
471 0.22
472 0.23
473 0.25
474 0.27
475 0.29
476 0.23
477 0.21
478 0.17
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.15
489 0.19
490 0.21
491 0.24
492 0.24
493 0.26
494 0.25
495 0.24
496 0.26
497 0.25
498 0.27
499 0.24
500 0.23
501 0.22
502 0.21
503 0.21
504 0.17
505 0.14
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.07
519 0.09
520 0.09
521 0.12
522 0.13
523 0.16
524 0.19
525 0.2
526 0.23
527 0.23
528 0.23
529 0.22
530 0.27
531 0.29
532 0.34
533 0.39
534 0.46
535 0.55
536 0.63
537 0.7
538 0.71
539 0.74
540 0.78
541 0.81
542 0.83
543 0.84
544 0.86
545 0.89
546 0.93
547 0.94
548 0.94
549 0.93
550 0.92
551 0.92
552 0.9
553 0.88
554 0.86
555 0.82
556 0.79
557 0.79
558 0.77
559 0.75
560 0.75
561 0.72
562 0.66
563 0.62
564 0.6
565 0.58
566 0.56
567 0.54
568 0.52
569 0.57
570 0.65
571 0.73
572 0.78
573 0.79
574 0.83
575 0.87
576 0.9
577 0.89
578 0.9
579 0.9
580 0.9
581 0.9
582 0.83
583 0.81
584 0.77
585 0.69
586 0.61
587 0.53
588 0.45
589 0.37
590 0.32
591 0.24
592 0.19
593 0.16
594 0.18
595 0.18
596 0.18
597 0.22
598 0.29
599 0.35
600 0.44
601 0.5
602 0.56
603 0.64
604 0.74
605 0.8