FuNGI

A0A218YXN0

Protein Details

Accession

A0A218YXN0

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-51	VRRAKAADPLRPRKKPVRRANVPPTAAS	Hydrophilic
513-532	RPKHSEPLKKVKNNLKRPGS	Basic
537-562	ESSGNESTRKKHKKKHHTSASGSSTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-43	RRAKAADPLRPRKKPVRRA
486-491	AKNKAK
505-533	KGTNAPSGRPKHSEPLKKVKNNLKRPGSP
542-552	ESTRKKHKKKH
630-639	PTKLKIRIKA

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNGRTPTPNAGPPQFVRRAKAADPLRPRKKPVRRANVPPTAASQKSNGLAPVGRQLPQYPVNGILPPRGLGTNQTVTGTGAENPGANGGWTHAPEGRYQDFPLVTSKRALREGLRYHIARFASKKPVDPSDQNEFTRPVVLQRRDPKQPPPGKGIKDEDQTMTDTPIDSKEQEKQEILKAEKEKQKAADLAQIAPTGNNAAALAAKKTQAFRNEKTTQVHRLDKTEEQKKMSDLKYEEALAWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVVLVIDGSVFKMIPVEKWYKFTCKGQFKTYTIEEAEAQLAKKTRESRWVMKSNEAKDSDRAVQDTRKALGSLFTVKAESNTFKSAGKREVQDMDELDFEEGDLFQDDDEQVTVEPDNDEDTKDAQDRVKRDRQGANVFDQANEADVDEEEEEDKKEQEQRKMLGKQVTKALRKRERNFVYNSDSDHPYSESSDDDTSDEEKQKEIDRKKDEEAKNKAKLESASKLPSVASSKGTNAPSGRPKHSEPLKKVKNNLKRPGSPNLSESSGNESTRKKHKKKHHTSASGSSTPAGGLQSMSTAASQSGQASRKNSVIKIKAPSGKLSDNGSSLPNPGSARSGAASDGEATGGEMSDGSKRPTKLKIRIKASPAGSRAGSPAPAGSATGSRSGSPATASVPSPAARGLSPGVNPVQAHEVIAALPASGITLKDLLKVFAGRVVNDNRADFIKLVKNHSAYGSDKMLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.45
3	0.48
4	0.5
5	0.47
6	0.49
7	0.48
8	0.55
9	0.56
10	0.53
11	0.51
12	0.5
13	0.52
14	0.48
15	0.54
16	0.52
17	0.52
18	0.59
19	0.66
20	0.71
21	0.72
22	0.78
23	0.79
24	0.83
25	0.85
26	0.85
27	0.85
28	0.84
29	0.88
30	0.91
31	0.9
32	0.82
33	0.73
34	0.68
35	0.65
36	0.57
37	0.48
38	0.4
39	0.35
40	0.34
41	0.34
42	0.28
43	0.24
44	0.23
45	0.22
46	0.28
47	0.26
48	0.26
49	0.25
50	0.26
51	0.29
52	0.33
53	0.34
54	0.27
55	0.28
56	0.28
57	0.3
58	0.3
59	0.27
60	0.24
61	0.22
62	0.22
63	0.2
64	0.18
65	0.18
66	0.24
67	0.24
68	0.24
69	0.24
70	0.23
71	0.22
72	0.23
73	0.21
74	0.16
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.12
80	0.1
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.11
85	0.12
86	0.14
87	0.16
88	0.17
89	0.19
90	0.26
91	0.26
92	0.26
93	0.26
94	0.28
95	0.25
96	0.26
97	0.31
98	0.28
99	0.26
100	0.29
101	0.32
102	0.32
103	0.35
104	0.36
105	0.32
106	0.39
107	0.43
108	0.44
109	0.48
110	0.44
111	0.43
112	0.45
113	0.43
114	0.38
115	0.37
116	0.37
117	0.4
118	0.41
119	0.45
120	0.45
121	0.5
122	0.51
123	0.52
124	0.52
125	0.51
126	0.55
127	0.51
128	0.49
129	0.45
130	0.39
131	0.36
132	0.3
133	0.28
134	0.32
135	0.34
136	0.4
137	0.47
138	0.53
139	0.59
140	0.64
141	0.64
142	0.65
143	0.69
144	0.65
145	0.65
146	0.67
147	0.62
148	0.64
149	0.63
150	0.59
151	0.54
152	0.52
153	0.45
154	0.39
155	0.37
156	0.31
157	0.26
158	0.2
159	0.16
160	0.15
161	0.15
162	0.15
163	0.14
164	0.16
165	0.22
166	0.25
167	0.28
168	0.29
169	0.29
170	0.33
171	0.39
172	0.38
173	0.38
174	0.38
175	0.44
176	0.48
177	0.49
178	0.47
179	0.43
180	0.45
181	0.41
182	0.39
183	0.36
184	0.31
185	0.29
186	0.27
187	0.26
188	0.21
189	0.18
190	0.17
191	0.11
192	0.09
193	0.08
194	0.06
195	0.05
196	0.07
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.11
201	0.13
202	0.15
203	0.2
204	0.27
205	0.34
206	0.36
207	0.44
208	0.46
209	0.49
210	0.52
211	0.53
212	0.52
213	0.52
214	0.55
215	0.48
216	0.48
217	0.47
218	0.49
219	0.53
220	0.52
221	0.5
222	0.45
223	0.45
224	0.45
225	0.48
226	0.43
227	0.41
228	0.34
229	0.32
230	0.31
231	0.3
232	0.27
233	0.2
234	0.2
235	0.13
236	0.12
237	0.09
238	0.08
239	0.07
240	0.09
241	0.12
242	0.14
243	0.14
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.14
248	0.14
249	0.12
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.11
275	0.17
276	0.17
277	0.22
278	0.24
279	0.28
280	0.31
281	0.36
282	0.41
283	0.45
284	0.47
285	0.5
286	0.54
287	0.5
288	0.53
289	0.47
290	0.41
291	0.32
292	0.3
293	0.23
294	0.18
295	0.18
296	0.14
297	0.13
298	0.11
299	0.13
300	0.12
301	0.16
302	0.19
303	0.2
304	0.29
305	0.34
306	0.4
307	0.47
308	0.55
309	0.53
310	0.56
311	0.6
312	0.53
313	0.54
314	0.49
315	0.41
316	0.35
317	0.37
318	0.32
319	0.27
320	0.26
321	0.21
322	0.21
323	0.23
324	0.23
325	0.21
326	0.18
327	0.17
328	0.16
329	0.16
330	0.14
331	0.15
332	0.13
333	0.12
334	0.13
335	0.12
336	0.13
337	0.14
338	0.14
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.17
344	0.19
345	0.22
346	0.24
347	0.23
348	0.24
349	0.26
350	0.25
351	0.24
352	0.21
353	0.18
354	0.15
355	0.14
356	0.11
357	0.08
358	0.07
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.1
382	0.11
383	0.12
384	0.13
385	0.17
386	0.2
387	0.27
388	0.33
389	0.35
390	0.39
391	0.42
392	0.46
393	0.49
394	0.48
395	0.44
396	0.42
397	0.39
398	0.33
399	0.29
400	0.22
401	0.16
402	0.14
403	0.1
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.05
408	0.06
409	0.05
410	0.06
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.15
416	0.2
417	0.26
418	0.3
419	0.33
420	0.41
421	0.44
422	0.47
423	0.48
424	0.44
425	0.41
426	0.44
427	0.48
428	0.47
429	0.49
430	0.54
431	0.56
432	0.64
433	0.66
434	0.69
435	0.67
436	0.66
437	0.66
438	0.61
439	0.57
440	0.49
441	0.48
442	0.41
443	0.37
444	0.32
445	0.29
446	0.24
447	0.19
448	0.18
449	0.15
450	0.12
451	0.12
452	0.12
453	0.12
454	0.11
455	0.12
456	0.13
457	0.15
458	0.18
459	0.16
460	0.16
461	0.17
462	0.22
463	0.3
464	0.34
465	0.4
466	0.43
467	0.46
468	0.52
469	0.6
470	0.61
471	0.62
472	0.66
473	0.66
474	0.67
475	0.66
476	0.61
477	0.54
478	0.5
479	0.46
480	0.4
481	0.37
482	0.32
483	0.3
484	0.29
485	0.26
486	0.26
487	0.24
488	0.21
489	0.19
490	0.17
491	0.2
492	0.25
493	0.26
494	0.26
495	0.24
496	0.28
497	0.33
498	0.37
499	0.39
500	0.38
501	0.4
502	0.46
503	0.54
504	0.58
505	0.57
506	0.63
507	0.68
508	0.69
509	0.75
510	0.76
511	0.77
512	0.78
513	0.8
514	0.78
515	0.76
516	0.75
517	0.77
518	0.73
519	0.65
520	0.57
521	0.5
522	0.44
523	0.37
524	0.33
525	0.31
526	0.28
527	0.27
528	0.28
529	0.28
530	0.32
531	0.42
532	0.52
533	0.53
534	0.59
535	0.69
536	0.76
537	0.85
538	0.9
539	0.9
540	0.89
541	0.87
542	0.86
543	0.83
544	0.74
545	0.63
546	0.52
547	0.41
548	0.31
549	0.25
550	0.16
551	0.09
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.09
563	0.14
564	0.17
565	0.21
566	0.23
567	0.26
568	0.3
569	0.33
570	0.36
571	0.39
572	0.41
573	0.43
574	0.46
575	0.51
576	0.53
577	0.51
578	0.51
579	0.47
580	0.45
581	0.42
582	0.4
583	0.35
584	0.3
585	0.29
586	0.27
587	0.23
588	0.22
589	0.2
590	0.19
591	0.17
592	0.17
593	0.18
594	0.16
595	0.17
596	0.16
597	0.16
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.11
602	0.1
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.05
611	0.1
612	0.12
613	0.15
614	0.2
615	0.23
616	0.27
617	0.37
618	0.46
619	0.52
620	0.6
621	0.67
622	0.69
623	0.75
624	0.75
625	0.74
626	0.7
627	0.67
628	0.59
629	0.53
630	0.46
631	0.39
632	0.37
633	0.31
634	0.26
635	0.19
636	0.17
637	0.14
638	0.14
639	0.13
640	0.12
641	0.12
642	0.13
643	0.16
644	0.17
645	0.16
646	0.17
647	0.17
648	0.16
649	0.15
650	0.15
651	0.13
652	0.15
653	0.15
654	0.16
655	0.18
656	0.18
657	0.18
658	0.17
659	0.16
660	0.14
661	0.16
662	0.16
663	0.17
664	0.17
665	0.2
666	0.21
667	0.23
668	0.22
669	0.22
670	0.24
671	0.21
672	0.21
673	0.17
674	0.16
675	0.13
676	0.14
677	0.12
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.07
685	0.1
686	0.11
687	0.15
688	0.16
689	0.17
690	0.19
691	0.2
692	0.19
693	0.22
694	0.23
695	0.2
696	0.26
697	0.31
698	0.34
699	0.36
700	0.36
701	0.33
702	0.33
703	0.34
704	0.27
705	0.28
706	0.3
707	0.31
708	0.37
709	0.42
710	0.42
711	0.42
712	0.44
713	0.43
714	0.37
715	0.38
716	0.39
717	0.36

A0A218YXN0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer