Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A218YT16

Protein Details
Accession A0A218YT16    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
559-578DDERLNGLRRKGKKKVGFVIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
567-573RRKGKKK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_mito 9, nucl 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MEVNQSNFRRQLLPILRHIADASFVTFDLEMSGINIRPKHSTGDRSLDVGKPSLQQQYDEMRSAAETFQVLQVGITCVEEDREKGPDGKSSLFCTSSSHDVDFYLARPFNFNLNPLSAEGVDLRLDRTFTFSTSACDFLSKNSFDFGKVFKEGVPYLSRDEEDERREEYAQRAMKNARIPDIIISPEDVSTLEFSRSTRKTIAAWAKQQEAEHDFVNIGNDAGPMNAFQRRIVHQIVRNEFPALRVFARNDGSFMQVEKLDQERENNFQKRHAARFNTLIGRQKGLRWIFEALAGGDLSGIDPEWFYDKSAPDSEEQRARVQAELASITSLIRTKKHILVGHNLFADLAFLFATFVGHLPVNVKHFQEDIHALFPHVIDTKFVASYGTDAMNPRVGLKDLLAPLRKIHVPLIVLHEKHTAYGASFGKEHEAGFDSWMTAELFVKLAAQKYREAKALPDAPFSDSDSDSDTPGGGGATLLDPTDGNGHSPAEWHARQLNAGSDNMFAVLTDEFDQKSGSGIGTPKQWLPSFHSKFWDLYMNKLRVNASESGMCDLAEREDDERLNGLRRKGKKKVGFVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.52
3 0.5
4 0.48
5 0.48
6 0.38
7 0.3
8 0.25
9 0.19
10 0.13
11 0.12
12 0.13
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.11
20 0.12
21 0.17
22 0.19
23 0.2
24 0.24
25 0.25
26 0.31
27 0.35
28 0.41
29 0.43
30 0.49
31 0.49
32 0.48
33 0.5
34 0.47
35 0.42
36 0.37
37 0.32
38 0.26
39 0.29
40 0.33
41 0.3
42 0.28
43 0.3
44 0.37
45 0.39
46 0.38
47 0.34
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.23
52 0.16
53 0.12
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.15
70 0.17
71 0.2
72 0.21
73 0.25
74 0.28
75 0.31
76 0.32
77 0.34
78 0.35
79 0.33
80 0.32
81 0.3
82 0.3
83 0.3
84 0.3
85 0.27
86 0.23
87 0.22
88 0.24
89 0.21
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.25
97 0.26
98 0.26
99 0.22
100 0.22
101 0.24
102 0.21
103 0.22
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.17
118 0.16
119 0.19
120 0.2
121 0.21
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.23
127 0.21
128 0.19
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.18
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.19
143 0.21
144 0.22
145 0.21
146 0.2
147 0.24
148 0.26
149 0.27
150 0.27
151 0.26
152 0.26
153 0.27
154 0.27
155 0.25
156 0.28
157 0.29
158 0.28
159 0.31
160 0.31
161 0.34
162 0.37
163 0.36
164 0.31
165 0.28
166 0.27
167 0.24
168 0.24
169 0.21
170 0.16
171 0.16
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.17
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.3
189 0.39
190 0.38
191 0.43
192 0.43
193 0.44
194 0.44
195 0.43
196 0.38
197 0.31
198 0.27
199 0.21
200 0.18
201 0.15
202 0.13
203 0.14
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.13
217 0.15
218 0.2
219 0.22
220 0.26
221 0.28
222 0.35
223 0.38
224 0.37
225 0.35
226 0.33
227 0.29
228 0.26
229 0.23
230 0.17
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.17
235 0.2
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.15
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.15
250 0.16
251 0.21
252 0.29
253 0.33
254 0.32
255 0.33
256 0.4
257 0.41
258 0.45
259 0.46
260 0.41
261 0.38
262 0.41
263 0.42
264 0.38
265 0.37
266 0.38
267 0.32
268 0.3
269 0.28
270 0.26
271 0.29
272 0.26
273 0.24
274 0.19
275 0.2
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.03
288 0.02
289 0.02
290 0.03
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.1
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.18
301 0.2
302 0.22
303 0.24
304 0.22
305 0.22
306 0.22
307 0.21
308 0.18
309 0.16
310 0.12
311 0.11
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.13
321 0.17
322 0.2
323 0.26
324 0.29
325 0.29
326 0.37
327 0.39
328 0.39
329 0.35
330 0.32
331 0.26
332 0.22
333 0.19
334 0.1
335 0.07
336 0.04
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.07
347 0.09
348 0.13
349 0.15
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.18
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.07
372 0.09
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.12
384 0.11
385 0.15
386 0.15
387 0.21
388 0.22
389 0.22
390 0.22
391 0.25
392 0.25
393 0.22
394 0.21
395 0.18
396 0.17
397 0.19
398 0.26
399 0.28
400 0.27
401 0.27
402 0.29
403 0.26
404 0.25
405 0.24
406 0.17
407 0.12
408 0.18
409 0.18
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.18
414 0.19
415 0.18
416 0.13
417 0.14
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.12
424 0.1
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.13
433 0.16
434 0.17
435 0.22
436 0.27
437 0.3
438 0.32
439 0.31
440 0.29
441 0.34
442 0.4
443 0.36
444 0.35
445 0.33
446 0.32
447 0.32
448 0.32
449 0.27
450 0.2
451 0.19
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.17
456 0.15
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.1
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.16
477 0.2
478 0.2
479 0.22
480 0.25
481 0.25
482 0.26
483 0.27
484 0.29
485 0.23
486 0.24
487 0.21
488 0.18
489 0.17
490 0.17
491 0.15
492 0.09
493 0.08
494 0.07
495 0.08
496 0.1
497 0.12
498 0.12
499 0.12
500 0.13
501 0.11
502 0.13
503 0.12
504 0.1
505 0.12
506 0.14
507 0.16
508 0.2
509 0.23
510 0.24
511 0.29
512 0.31
513 0.31
514 0.37
515 0.45
516 0.47
517 0.49
518 0.51
519 0.48
520 0.47
521 0.47
522 0.48
523 0.38
524 0.41
525 0.47
526 0.46
527 0.45
528 0.47
529 0.45
530 0.38
531 0.42
532 0.35
533 0.29
534 0.28
535 0.28
536 0.28
537 0.27
538 0.24
539 0.21
540 0.19
541 0.17
542 0.15
543 0.16
544 0.14
545 0.18
546 0.19
547 0.19
548 0.22
549 0.23
550 0.29
551 0.32
552 0.38
553 0.43
554 0.52
555 0.61
556 0.67
557 0.75
558 0.76