Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A218YSD2

Protein Details
Accession A0A218YSD2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-52DSSPVPAVKRGRGRPKKIQKTLEETVGHydrophilic
74-103ESSPPAPVKRGRGRPKKVRKGKDNNVEDTVHydrophilic
113-137EAVISKGRGRPKKALKKIEKSSGEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-42VKRGRGRPKK
80-95PVKRGRGRPKKVRKGK
118-131KGRGRPKKALKKIE
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MAPSTRRSLEPNSSSVPKGTKRSHEDSSPVPAVKRGRGRPKKIQKTLEETVGGSEDSVMDDGVEEDVEVGKQLESSPPAPVKRGRGRPKKVRKGKDNNVEDTVMENGVVDQKEAVISKGRGRPKKALKKIEKSSGEASEDMEGNEQVAKQSNSGADEQANEPEKADADSEKIIHNNVDDEKAIARQTNDKSDEKEAGAPKEIGDDVNEDANGEKAIATQPNDDKEEQEVDAPNETGDHVDEDAHNGKDIATQTNENTDEKEVDAPKETGENVENIKAHDIEDDKEVAKQIDGSLDKPQSNGNDVQGEKNAFDEVKADTDDFKEAADQEQEAATEDIKTSAKSIVKDDEREGAIPSSILEKGIIYFFFRGRVGVEDPQGIEDVARSYIVLRPLPLGAKLGDGPLEDSGNSRLLALPKKMLPKSRQDRFLVFVEQPKASIKDLREHLASNEYATKTSGTSRSPAATPFAEGIYAITSTGRESHLAYHITIPAIGEVQRELGLNVKGSFVLSAKNPQAPGPANASLPQPAQYPENIQSKFRDLRWMPLEPALLDYTHTQFLLIGEGMGEMDQAVEETSKDAKHDEKEKPLHEMEKLGQEDQERVEHLKQDDPIFADLGLSSKEYPKMQTTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.48
4 0.45
5 0.49
6 0.52
7 0.55
8 0.6
9 0.65
10 0.67
11 0.65
12 0.63
13 0.58
14 0.59
15 0.55
16 0.49
17 0.43
18 0.43
19 0.42
20 0.46
21 0.51
22 0.52
23 0.58
24 0.66
25 0.74
26 0.8
27 0.87
28 0.9
29 0.9
30 0.9
31 0.87
32 0.85
33 0.81
34 0.76
35 0.66
36 0.55
37 0.47
38 0.39
39 0.3
40 0.21
41 0.17
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.21
64 0.26
65 0.28
66 0.33
67 0.37
68 0.43
69 0.5
70 0.59
71 0.64
72 0.69
73 0.78
74 0.85
75 0.91
76 0.92
77 0.93
78 0.93
79 0.93
80 0.93
81 0.93
82 0.93
83 0.89
84 0.84
85 0.77
86 0.67
87 0.56
88 0.46
89 0.37
90 0.26
91 0.18
92 0.12
93 0.09
94 0.13
95 0.13
96 0.11
97 0.09
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.24
105 0.31
106 0.4
107 0.45
108 0.51
109 0.59
110 0.65
111 0.74
112 0.77
113 0.81
114 0.82
115 0.85
116 0.87
117 0.88
118 0.8
119 0.74
120 0.68
121 0.62
122 0.54
123 0.44
124 0.37
125 0.29
126 0.25
127 0.21
128 0.17
129 0.13
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.14
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.21
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.16
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.19
173 0.22
174 0.29
175 0.33
176 0.34
177 0.36
178 0.38
179 0.39
180 0.33
181 0.36
182 0.32
183 0.29
184 0.29
185 0.26
186 0.23
187 0.22
188 0.21
189 0.15
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.07
203 0.1
204 0.11
205 0.15
206 0.17
207 0.21
208 0.24
209 0.23
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.12
220 0.1
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.1
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.14
236 0.14
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.18
241 0.2
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.18
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.1
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.16
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.2
285 0.17
286 0.19
287 0.19
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.18
294 0.15
295 0.14
296 0.13
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.16
330 0.21
331 0.23
332 0.25
333 0.26
334 0.25
335 0.23
336 0.23
337 0.22
338 0.15
339 0.13
340 0.11
341 0.1
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.12
366 0.09
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.08
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.14
399 0.18
400 0.18
401 0.2
402 0.22
403 0.3
404 0.33
405 0.39
406 0.39
407 0.46
408 0.55
409 0.59
410 0.63
411 0.58
412 0.58
413 0.54
414 0.53
415 0.46
416 0.38
417 0.36
418 0.32
419 0.28
420 0.27
421 0.25
422 0.24
423 0.22
424 0.24
425 0.21
426 0.25
427 0.28
428 0.3
429 0.29
430 0.28
431 0.28
432 0.28
433 0.26
434 0.2
435 0.23
436 0.2
437 0.19
438 0.19
439 0.18
440 0.14
441 0.18
442 0.21
443 0.17
444 0.19
445 0.2
446 0.22
447 0.22
448 0.22
449 0.22
450 0.19
451 0.18
452 0.17
453 0.15
454 0.13
455 0.12
456 0.11
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.13
468 0.17
469 0.19
470 0.19
471 0.2
472 0.2
473 0.19
474 0.19
475 0.16
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.09
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.14
493 0.1
494 0.12
495 0.11
496 0.18
497 0.2
498 0.24
499 0.24
500 0.24
501 0.29
502 0.29
503 0.3
504 0.3
505 0.29
506 0.26
507 0.27
508 0.28
509 0.25
510 0.23
511 0.22
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.18
516 0.22
517 0.26
518 0.34
519 0.34
520 0.35
521 0.36
522 0.42
523 0.45
524 0.41
525 0.44
526 0.37
527 0.45
528 0.48
529 0.49
530 0.43
531 0.42
532 0.43
533 0.33
534 0.34
535 0.26
536 0.2
537 0.18
538 0.18
539 0.17
540 0.17
541 0.17
542 0.14
543 0.13
544 0.14
545 0.15
546 0.12
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.07
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.15
565 0.2
566 0.27
567 0.36
568 0.41
569 0.49
570 0.56
571 0.58
572 0.62
573 0.62
574 0.58
575 0.51
576 0.49
577 0.43
578 0.44
579 0.44
580 0.38
581 0.35
582 0.33
583 0.34
584 0.31
585 0.3
586 0.24
587 0.26
588 0.28
589 0.31
590 0.32
591 0.34
592 0.36
593 0.36
594 0.36
595 0.35
596 0.33
597 0.28
598 0.25
599 0.21
600 0.16
601 0.16
602 0.13
603 0.12
604 0.12
605 0.16
606 0.2
607 0.22
608 0.26