Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A218YVX3

Protein Details
Accession A0A218YVX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-371QQTSNSRQTPKARQKNPRQVQQPGHydrophilic
805-831QKSRGVDPHKPRDQKPRDRQQVPSQQDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MDDLQARKIVSDDGFQPDKELEVGIKCFVNEQNPGFGGVLKQRYTDFLVNEIEPSGTVVHLTDDQVPTANREVSSTQQSETSANDSPAVPITKEIENIVHDSKTTTSENNPPTKNGKENVQPESSVTASAPVIPTKVAKVETAVPEPKIATPKSASLTKSDDVTESHPISPTASVLPIQNSVEPTTTAEPKVDDRPKTPDNPTRGSNAQLAAGIQALTSPKRTKSGAPSSEAGTPGGSLVSPEDEALLVGWFGSTLTKEIIDLYKRILAKPNAKAASFGEPLMSQPLLDKRFRGIIHGNIKRIFDFKIATSAYLDTGMLQIFASSGGGSWDAAPSQNSSGSQQFGSRQQTSNSRQTPKARQKNPRQVQQPGQPTGKLGWQDLGGEFLHFTLYKENKDTMEVISFIASRLKIKPKDFNFAGTKDRRAATVQRVSVRRQKAQSLARLNNQLLGSRIGNFKYEKHGLELGELSGNQFHITLRDCHFGDDAKLTVEARMELGNNVVGQAVKHLGEHGFLNYFGLQRFGTFGIGTDEVGLKILSGDFKGAVDAILTYSETSVNTPETGDHNFGDKISRDDKARALAIHEFRKGVSRNYFLDKMPRKFSAELAIMRHLGNGRNQGDYEGALMTINRNLRSMYVHAYQSLVWNSVVSERFTRYGTAVVEGDLVLITSKVVAQDEVDENGEVVIHAAADDTAISRDEVYQRARALTAEEAASGKYTIFDIVLPLPGFDMEYPTNAIGDFYKEFMGSERGGGIDPSNMRRKNKDFSLSGSYRKMIAEVKDCSFEIKSYTNDHEQLVETDWELLQKSRGVDPHKPRDQKPRDRQQVPSQQDARKIGNHKNARYTDQRQDIAKLREQYQGSAQLNAWKSLPSQLAITDKAVAEAANLARAQRKAGNPEELEVPVIKDTWIQTSPEDWTRRTGLKSTTVIGEKKDSESVNKTEDSTVSPVAESPIISSKSEAEAEAAVASIEQASIATGETAADPEPVASSSTMDVDVKELASTEVGVKRSADKISTAPGFPALTAEEEIEEKPILPKVAVIVKFSLGSSTYATMALRELMKAGGVKTYKPDFSGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.31
4 0.27
5 0.26
6 0.23
7 0.2
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.21
15 0.24
16 0.26
17 0.28
18 0.28
19 0.31
20 0.3
21 0.33
22 0.29
23 0.27
24 0.26
25 0.27
26 0.32
27 0.27
28 0.28
29 0.27
30 0.3
31 0.35
32 0.36
33 0.3
34 0.28
35 0.31
36 0.3
37 0.3
38 0.27
39 0.21
40 0.16
41 0.16
42 0.12
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.17
50 0.17
51 0.18
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.25
56 0.26
57 0.2
58 0.22
59 0.24
60 0.26
61 0.34
62 0.32
63 0.29
64 0.28
65 0.29
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.22
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.2
74 0.23
75 0.23
76 0.19
77 0.18
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.2
83 0.2
84 0.24
85 0.25
86 0.22
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.22
91 0.22
92 0.21
93 0.23
94 0.32
95 0.4
96 0.47
97 0.47
98 0.48
99 0.51
100 0.55
101 0.56
102 0.51
103 0.5
104 0.5
105 0.55
106 0.56
107 0.53
108 0.47
109 0.42
110 0.43
111 0.36
112 0.28
113 0.21
114 0.17
115 0.14
116 0.16
117 0.16
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.17
127 0.23
128 0.27
129 0.32
130 0.34
131 0.31
132 0.31
133 0.32
134 0.33
135 0.33
136 0.29
137 0.27
138 0.26
139 0.29
140 0.33
141 0.36
142 0.34
143 0.32
144 0.37
145 0.34
146 0.33
147 0.3
148 0.27
149 0.24
150 0.26
151 0.28
152 0.25
153 0.25
154 0.24
155 0.24
156 0.24
157 0.22
158 0.2
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.15
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.19
172 0.2
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.23
178 0.32
179 0.36
180 0.35
181 0.36
182 0.43
183 0.47
184 0.52
185 0.57
186 0.55
187 0.55
188 0.56
189 0.55
190 0.53
191 0.5
192 0.47
193 0.41
194 0.34
195 0.28
196 0.24
197 0.22
198 0.16
199 0.14
200 0.11
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.14
206 0.17
207 0.18
208 0.22
209 0.25
210 0.29
211 0.37
212 0.46
213 0.46
214 0.47
215 0.47
216 0.46
217 0.47
218 0.42
219 0.33
220 0.22
221 0.17
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.2
252 0.21
253 0.23
254 0.29
255 0.32
256 0.38
257 0.43
258 0.49
259 0.47
260 0.47
261 0.47
262 0.41
263 0.41
264 0.34
265 0.28
266 0.2
267 0.17
268 0.18
269 0.19
270 0.17
271 0.1
272 0.12
273 0.18
274 0.21
275 0.22
276 0.22
277 0.22
278 0.28
279 0.28
280 0.3
281 0.28
282 0.32
283 0.42
284 0.46
285 0.48
286 0.45
287 0.46
288 0.42
289 0.39
290 0.32
291 0.24
292 0.21
293 0.17
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.18
299 0.16
300 0.15
301 0.14
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.13
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.17
331 0.22
332 0.28
333 0.28
334 0.28
335 0.29
336 0.38
337 0.42
338 0.49
339 0.5
340 0.49
341 0.52
342 0.58
343 0.65
344 0.68
345 0.72
346 0.72
347 0.75
348 0.81
349 0.87
350 0.88
351 0.86
352 0.81
353 0.78
354 0.76
355 0.74
356 0.71
357 0.65
358 0.58
359 0.49
360 0.44
361 0.38
362 0.34
363 0.27
364 0.19
365 0.15
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.14
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.08
377 0.13
378 0.15
379 0.17
380 0.19
381 0.21
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.17
386 0.16
387 0.15
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.14
396 0.23
397 0.27
398 0.31
399 0.4
400 0.41
401 0.49
402 0.47
403 0.49
404 0.45
405 0.42
406 0.47
407 0.41
408 0.4
409 0.35
410 0.35
411 0.3
412 0.29
413 0.31
414 0.31
415 0.35
416 0.36
417 0.39
418 0.41
419 0.44
420 0.49
421 0.49
422 0.46
423 0.42
424 0.43
425 0.44
426 0.47
427 0.51
428 0.52
429 0.5
430 0.49
431 0.51
432 0.47
433 0.43
434 0.38
435 0.3
436 0.23
437 0.21
438 0.17
439 0.15
440 0.17
441 0.13
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.2
446 0.23
447 0.21
448 0.22
449 0.24
450 0.22
451 0.22
452 0.21
453 0.15
454 0.13
455 0.12
456 0.09
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.08
464 0.11
465 0.13
466 0.17
467 0.17
468 0.18
469 0.19
470 0.18
471 0.17
472 0.15
473 0.13
474 0.09
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.06
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.09
549 0.1
550 0.12
551 0.11
552 0.12
553 0.12
554 0.12
555 0.14
556 0.12
557 0.14
558 0.14
559 0.16
560 0.16
561 0.18
562 0.19
563 0.19
564 0.2
565 0.17
566 0.17
567 0.21
568 0.24
569 0.25
570 0.25
571 0.22
572 0.21
573 0.26
574 0.25
575 0.25
576 0.24
577 0.24
578 0.26
579 0.3
580 0.32
581 0.28
582 0.36
583 0.39
584 0.39
585 0.39
586 0.39
587 0.37
588 0.36
589 0.36
590 0.33
591 0.29
592 0.27
593 0.25
594 0.25
595 0.22
596 0.21
597 0.21
598 0.17
599 0.15
600 0.16
601 0.2
602 0.2
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.18
607 0.17
608 0.15
609 0.08
610 0.07
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.08
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.11
620 0.13
621 0.14
622 0.16
623 0.17
624 0.17
625 0.17
626 0.18
627 0.17
628 0.18
629 0.17
630 0.14
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.13
635 0.14
636 0.13
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.16
641 0.17
642 0.13
643 0.15
644 0.14
645 0.14
646 0.12
647 0.11
648 0.11
649 0.1
650 0.09
651 0.06
652 0.06
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.08
663 0.09
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.06
671 0.05
672 0.04
673 0.03
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.07
685 0.09
686 0.13
687 0.15
688 0.17
689 0.18
690 0.18
691 0.18
692 0.17
693 0.17
694 0.14
695 0.13
696 0.11
697 0.1
698 0.1
699 0.1
700 0.1
701 0.08
702 0.07
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.05
708 0.07
709 0.07
710 0.1
711 0.09
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.07
717 0.11
718 0.08
719 0.09
720 0.11
721 0.1
722 0.11
723 0.1
724 0.11
725 0.07
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.1
730 0.1
731 0.1
732 0.11
733 0.14
734 0.11
735 0.11
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.09
741 0.1
742 0.12
743 0.17
744 0.26
745 0.3
746 0.33
747 0.4
748 0.44
749 0.48
750 0.52
751 0.54
752 0.47
753 0.48
754 0.54
755 0.5
756 0.5
757 0.45
758 0.39
759 0.34
760 0.32
761 0.28
762 0.23
763 0.24
764 0.25
765 0.26
766 0.27
767 0.28
768 0.28
769 0.28
770 0.25
771 0.22
772 0.19
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.25
777 0.27
778 0.28
779 0.28
780 0.26
781 0.24
782 0.23
783 0.22
784 0.18
785 0.13
786 0.13
787 0.12
788 0.12
789 0.11
790 0.11
791 0.1
792 0.12
793 0.13
794 0.16
795 0.21
796 0.26
797 0.35
798 0.44
799 0.53
800 0.6
801 0.65
802 0.67
803 0.73
804 0.78
805 0.8
806 0.81
807 0.82
808 0.83
809 0.81
810 0.83
811 0.82
812 0.82
813 0.75
814 0.74
815 0.7
816 0.63
817 0.65
818 0.62
819 0.54
820 0.5
821 0.51
822 0.5
823 0.53
824 0.57
825 0.55
826 0.6
827 0.6
828 0.59
829 0.62
830 0.61
831 0.59
832 0.59
833 0.59
834 0.51
835 0.54
836 0.56
837 0.52
838 0.52
839 0.47
840 0.43
841 0.46
842 0.45
843 0.41
844 0.38
845 0.42
846 0.36
847 0.34
848 0.32
849 0.32
850 0.33
851 0.32
852 0.28
853 0.19
854 0.19
855 0.22
856 0.23
857 0.17
858 0.16
859 0.18
860 0.21
861 0.22
862 0.22
863 0.2
864 0.18
865 0.17
866 0.17
867 0.14
868 0.1
869 0.12
870 0.11
871 0.12
872 0.12
873 0.13
874 0.17
875 0.18
876 0.2
877 0.23
878 0.27
879 0.31
880 0.36
881 0.43
882 0.39
883 0.41
884 0.41
885 0.35
886 0.32
887 0.26
888 0.22
889 0.14
890 0.14
891 0.12
892 0.11
893 0.12
894 0.16
895 0.17
896 0.17
897 0.18
898 0.19
899 0.24
900 0.3
901 0.32
902 0.28
903 0.31
904 0.34
905 0.37
906 0.38
907 0.39
908 0.35
909 0.39
910 0.41
911 0.38
912 0.39
913 0.41
914 0.39
915 0.37
916 0.38
917 0.32
918 0.33
919 0.35
920 0.31
921 0.31
922 0.35
923 0.36
924 0.35
925 0.34
926 0.33
927 0.31
928 0.31
929 0.28
930 0.26
931 0.24
932 0.21
933 0.19
934 0.18
935 0.18
936 0.18
937 0.14
938 0.13
939 0.18
940 0.19
941 0.19
942 0.2
943 0.2
944 0.22
945 0.23
946 0.21
947 0.15
948 0.14
949 0.14
950 0.13
951 0.11
952 0.08
953 0.06
954 0.06
955 0.05
956 0.04
957 0.04
958 0.03
959 0.04
960 0.04
961 0.05
962 0.05
963 0.05
964 0.05
965 0.06
966 0.07
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.07
971 0.08
972 0.08
973 0.1
974 0.09
975 0.1
976 0.1
977 0.12
978 0.13
979 0.12
980 0.12
981 0.12
982 0.13
983 0.12
984 0.11
985 0.1
986 0.09
987 0.09
988 0.1
989 0.13
990 0.16
991 0.17
992 0.18
993 0.19
994 0.22
995 0.26
996 0.27
997 0.24
998 0.22
999 0.24
1000 0.3
1001 0.33
1002 0.3
1003 0.27
1004 0.27
1005 0.26
1006 0.23
1007 0.22
1008 0.16
1009 0.15
1010 0.15
1011 0.14
1012 0.13
1013 0.14
1014 0.14
1015 0.15
1016 0.14
1017 0.12
1018 0.14
1019 0.17
1020 0.16
1021 0.15
1022 0.15
1023 0.18
1024 0.26
1025 0.27
1026 0.28
1027 0.26
1028 0.26
1029 0.27
1030 0.27
1031 0.24
1032 0.17
1033 0.16
1034 0.16
1035 0.16
1036 0.15
1037 0.16
1038 0.16
1039 0.14
1040 0.14
1041 0.16
1042 0.14
1043 0.13
1044 0.13
1045 0.12
1046 0.14
1047 0.16
1048 0.15
1049 0.19
1050 0.2
1051 0.21
1052 0.27
1053 0.33
1054 0.33
1055 0.33