Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A218YTH6

Protein Details
Accession A0A218YTH6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-51LEEQRPRKRATQSPEDLRRELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
538-594ANPRGGGNTRGGKGQNQRGGNQRGGGQRGGAPQRGRGGPPRASHAPGHMGRGGRPGG
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 11, nucl 6.5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MAESLADALEKVHLSVSNTEDTADDWIDHILEEQRPRKRATQSPEDLRRELEQNFLTPSTSFSAEWLNKLQQRWEAPTDYTALFKIAPTQTRTITRFTREGLSGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSFLRKPANKADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAAAALDDQALKSGNDDLVSIGAMGKLARVINLGDGGLMEIAPGLKRGLNFEKKKTSDGDEKEANEVLGVLDEEPDVELPLEKENSICSGDSDDASEEDGEDDIDSLLPVEFPALEPHGVLAASSSKRGGREWAHMVDIKKDITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQIFDEVGILTGDVQIAPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHYIWAEKGIYKIVDAEKRFLEKGWKDANDVLSGKNKVKALPPAEANPRGGGNTRGGKGQNQRGGNQRGGGQRGGAPQRGRGGPPRASHAPGHMGRGGRPGGRTSAAQDKTLWVHLVQFLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCSATEKSAIHMIIEKSIARLKPEDRVLPQIVRLRDMLGRGIAVHHGGMLPIVKEVVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDPVGSVIIVAPGGGEAPPVSELRQMILGDPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKVSEADLAKIKREPCDICDADLEACHQAVQNVRQLTLDLHLGLLATPVGRRMFSAKRLIVYNRDGIRTPGILLREGATGGPAPTVHVLEIKTQRDQRDSTDLLPYLPKFRKLFTKLPQAKKQVQTKALQILVADVECVTNTIVKGIIPDIFASGDVYQQAKEQLSRLCQSWEKDEWNELDWTRLKDMQLRDNLSKRTDEATIAQKSFAMCHDQWIIQENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLEFVDNNTRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLAPYEPAEIVALLSAFVFQEKTDTVPKLTGNLERGMKTIIEISEKVNERQTYHQVILSADDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPELFTKMQTCQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.2
3 0.23
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.22
8 0.2
9 0.21
10 0.18
11 0.14
12 0.11
13 0.12
14 0.12
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.18
19 0.26
20 0.34
21 0.41
22 0.45
23 0.5
24 0.56
25 0.6
26 0.64
27 0.64
28 0.67
29 0.69
30 0.76
31 0.81
32 0.8
33 0.73
34 0.67
35 0.62
36 0.56
37 0.47
38 0.44
39 0.36
40 0.32
41 0.34
42 0.31
43 0.28
44 0.24
45 0.25
46 0.21
47 0.22
48 0.19
49 0.17
50 0.25
51 0.26
52 0.29
53 0.32
54 0.36
55 0.38
56 0.4
57 0.43
58 0.41
59 0.45
60 0.48
61 0.48
62 0.44
63 0.42
64 0.41
65 0.4
66 0.34
67 0.3
68 0.24
69 0.2
70 0.17
71 0.15
72 0.21
73 0.23
74 0.27
75 0.3
76 0.34
77 0.38
78 0.45
79 0.48
80 0.47
81 0.47
82 0.48
83 0.47
84 0.46
85 0.46
86 0.41
87 0.41
88 0.39
89 0.37
90 0.33
91 0.3
92 0.33
93 0.28
94 0.27
95 0.27
96 0.24
97 0.2
98 0.21
99 0.23
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.27
113 0.28
114 0.33
115 0.4
116 0.45
117 0.5
118 0.59
119 0.61
120 0.61
121 0.62
122 0.63
123 0.58
124 0.54
125 0.52
126 0.41
127 0.35
128 0.29
129 0.26
130 0.19
131 0.14
132 0.14
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.09
189 0.15
190 0.25
191 0.35
192 0.4
193 0.47
194 0.57
195 0.57
196 0.6
197 0.58
198 0.55
199 0.54
200 0.54
201 0.53
202 0.49
203 0.48
204 0.47
205 0.44
206 0.37
207 0.27
208 0.22
209 0.15
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.11
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.12
237 0.13
238 0.12
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.07
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.24
272 0.22
273 0.28
274 0.33
275 0.34
276 0.35
277 0.38
278 0.38
279 0.35
280 0.34
281 0.28
282 0.24
283 0.24
284 0.24
285 0.23
286 0.27
287 0.24
288 0.23
289 0.27
290 0.25
291 0.27
292 0.25
293 0.24
294 0.19
295 0.25
296 0.24
297 0.2
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.11
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.23
353 0.26
354 0.26
355 0.3
356 0.38
357 0.38
358 0.46
359 0.47
360 0.52
361 0.53
362 0.54
363 0.61
364 0.52
365 0.45
366 0.42
367 0.41
368 0.34
369 0.3
370 0.29
371 0.17
372 0.17
373 0.15
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.07
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.16
459 0.22
460 0.26
461 0.29
462 0.33
463 0.37
464 0.39
465 0.44
466 0.41
467 0.41
468 0.45
469 0.52
470 0.51
471 0.51
472 0.49
473 0.45
474 0.46
475 0.4
476 0.33
477 0.31
478 0.35
479 0.32
480 0.34
481 0.35
482 0.33
483 0.32
484 0.3
485 0.24
486 0.17
487 0.14
488 0.13
489 0.09
490 0.08
491 0.11
492 0.15
493 0.2
494 0.2
495 0.22
496 0.22
497 0.24
498 0.24
499 0.22
500 0.26
501 0.21
502 0.27
503 0.32
504 0.31
505 0.31
506 0.33
507 0.34
508 0.3
509 0.29
510 0.24
511 0.22
512 0.24
513 0.23
514 0.24
515 0.23
516 0.21
517 0.24
518 0.29
519 0.26
520 0.28
521 0.28
522 0.29
523 0.34
524 0.35
525 0.32
526 0.26
527 0.24
528 0.21
529 0.2
530 0.17
531 0.16
532 0.18
533 0.18
534 0.2
535 0.2
536 0.25
537 0.3
538 0.35
539 0.37
540 0.34
541 0.37
542 0.42
543 0.46
544 0.41
545 0.36
546 0.34
547 0.31
548 0.32
549 0.29
550 0.21
551 0.19
552 0.24
553 0.25
554 0.24
555 0.21
556 0.21
557 0.25
558 0.25
559 0.25
560 0.26
561 0.29
562 0.31
563 0.31
564 0.35
565 0.34
566 0.35
567 0.34
568 0.3
569 0.31
570 0.26
571 0.28
572 0.24
573 0.22
574 0.2
575 0.24
576 0.23
577 0.17
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.15
582 0.15
583 0.14
584 0.22
585 0.22
586 0.22
587 0.21
588 0.21
589 0.21
590 0.21
591 0.19
592 0.1
593 0.1
594 0.13
595 0.16
596 0.16
597 0.16
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.14
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.13
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.17
612 0.17
613 0.23
614 0.24
615 0.26
616 0.27
617 0.32
618 0.34
619 0.34
620 0.37
621 0.32
622 0.3
623 0.28
624 0.28
625 0.22
626 0.19
627 0.13
628 0.08
629 0.06
630 0.11
631 0.11
632 0.1
633 0.14
634 0.14
635 0.14
636 0.16
637 0.16
638 0.12
639 0.15
640 0.15
641 0.12
642 0.13
643 0.12
644 0.1
645 0.14
646 0.14
647 0.12
648 0.14
649 0.14
650 0.19
651 0.22
652 0.24
653 0.22
654 0.27
655 0.28
656 0.25
657 0.29
658 0.28
659 0.26
660 0.24
661 0.23
662 0.19
663 0.19
664 0.19
665 0.15
666 0.1
667 0.1
668 0.08
669 0.09
670 0.07
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.05
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.07
714 0.08
715 0.1
716 0.14
717 0.19
718 0.23
719 0.28
720 0.28
721 0.29
722 0.34
723 0.37
724 0.38
725 0.41
726 0.41
727 0.36
728 0.41
729 0.4
730 0.34
731 0.29
732 0.25
733 0.19
734 0.15
735 0.15
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.11
741 0.11
742 0.11
743 0.12
744 0.12
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.12
749 0.1
750 0.1
751 0.09
752 0.08
753 0.06
754 0.06
755 0.04
756 0.04
757 0.03
758 0.02
759 0.03
760 0.03
761 0.03
762 0.02
763 0.03
764 0.05
765 0.05
766 0.06
767 0.08
768 0.08
769 0.08
770 0.11
771 0.11
772 0.1
773 0.14
774 0.15
775 0.14
776 0.15
777 0.16
778 0.17
779 0.2
780 0.2
781 0.19
782 0.24
783 0.29
784 0.32
785 0.37
786 0.36
787 0.38
788 0.38
789 0.36
790 0.32
791 0.25
792 0.22
793 0.15
794 0.13
795 0.09
796 0.07
797 0.06
798 0.05
799 0.06
800 0.06
801 0.07
802 0.09
803 0.11
804 0.13
805 0.14
806 0.14
807 0.14
808 0.16
809 0.17
810 0.17
811 0.19
812 0.19
813 0.23
814 0.25
815 0.25
816 0.25
817 0.26
818 0.26
819 0.24
820 0.22
821 0.19
822 0.18
823 0.18
824 0.17
825 0.16
826 0.15
827 0.14
828 0.13
829 0.16
830 0.15
831 0.16
832 0.2
833 0.18
834 0.19
835 0.22
836 0.23
837 0.21
838 0.25
839 0.26
840 0.24
841 0.32
842 0.31
843 0.29
844 0.28
845 0.27
846 0.22
847 0.21
848 0.19
849 0.11
850 0.1
851 0.09
852 0.08
853 0.08
854 0.12
855 0.14
856 0.18
857 0.18
858 0.19
859 0.18
860 0.19
861 0.18
862 0.16
863 0.14
864 0.09
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.06
870 0.05
871 0.04
872 0.04
873 0.07
874 0.07
875 0.08
876 0.08
877 0.14
878 0.18
879 0.23
880 0.31
881 0.3
882 0.32
883 0.36
884 0.38
885 0.38
886 0.37
887 0.39
888 0.34
889 0.34
890 0.32
891 0.3
892 0.3
893 0.25
894 0.23
895 0.18
896 0.16
897 0.15
898 0.15
899 0.15
900 0.13
901 0.13
902 0.11
903 0.09
904 0.08
905 0.08
906 0.08
907 0.06
908 0.07
909 0.08
910 0.08
911 0.08
912 0.1
913 0.1
914 0.17
915 0.23
916 0.25
917 0.3
918 0.34
919 0.36
920 0.39
921 0.39
922 0.37
923 0.38
924 0.38
925 0.34
926 0.35
927 0.32
928 0.29
929 0.31
930 0.28
931 0.29
932 0.29
933 0.34
934 0.3
935 0.32
936 0.41
937 0.44
938 0.52
939 0.51
940 0.6
941 0.63
942 0.71
943 0.77
944 0.75
945 0.77
946 0.76
947 0.77
948 0.74
949 0.71
950 0.65
951 0.61
952 0.59
953 0.52
954 0.44
955 0.35
956 0.28
957 0.22
958 0.19
959 0.14
960 0.07
961 0.07
962 0.06
963 0.07
964 0.06
965 0.06
966 0.06
967 0.07
968 0.07
969 0.07
970 0.08
971 0.09
972 0.1
973 0.09
974 0.09
975 0.09
976 0.09
977 0.09
978 0.1
979 0.09
980 0.08
981 0.1
982 0.1
983 0.1
984 0.11
985 0.13
986 0.13
987 0.14
988 0.17
989 0.19
990 0.24
991 0.26
992 0.26
993 0.28
994 0.31
995 0.32
996 0.35
997 0.36
998 0.36
999 0.36
1000 0.38
1001 0.35
1002 0.33
1003 0.35
1004 0.28
1005 0.29
1006 0.29
1007 0.29
1008 0.28
1009 0.29
1010 0.28
1011 0.31
1012 0.35
1013 0.38
1014 0.41
1015 0.44
1016 0.47
1017 0.51
1018 0.54
1019 0.5
1020 0.47
1021 0.41
1022 0.36
1023 0.32
1024 0.27
1025 0.25
1026 0.3
1027 0.33
1028 0.32
1029 0.3
1030 0.29
1031 0.27
1032 0.27
1033 0.24
1034 0.23
1035 0.17
1036 0.21
1037 0.24
1038 0.23
1039 0.24
1040 0.27
1041 0.27
1042 0.2
1043 0.22
1044 0.2
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.2
1048 0.16
1049 0.16
1050 0.16
1051 0.15
1052 0.19
1053 0.18
1054 0.24
1055 0.23
1056 0.26
1057 0.25
1058 0.25
1059 0.24
1060 0.2
1061 0.19
1062 0.19
1063 0.23
1064 0.21
1065 0.23
1066 0.24
1067 0.26
1068 0.25
1069 0.27
1070 0.24
1071 0.2
1072 0.23
1073 0.24
1074 0.24
1075 0.22
1076 0.24
1077 0.26
1078 0.26
1079 0.26
1080 0.24
1081 0.23
1082 0.22
1083 0.25
1084 0.28
1085 0.29
1086 0.33
1087 0.34
1088 0.38
1089 0.38
1090 0.39
1091 0.39
1092 0.35
1093 0.3
1094 0.25
1095 0.24
1096 0.17
1097 0.17
1098 0.16
1099 0.13
1100 0.11
1101 0.08
1102 0.07
1103 0.07
1104 0.07
1105 0.06
1106 0.05
1107 0.05
1108 0.05
1109 0.05
1110 0.05
1111 0.05
1112 0.05
1113 0.07
1114 0.07
1115 0.06
1116 0.07
1117 0.07
1118 0.07
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.05
1122 0.05
1123 0.05
1124 0.05
1125 0.05
1126 0.06
1127 0.05
1128 0.08
1129 0.08
1130 0.12
1131 0.18
1132 0.2
1133 0.21
1134 0.24
1135 0.24
1136 0.26
1137 0.29
1138 0.3
1139 0.28
1140 0.32
1141 0.34
1142 0.32
1143 0.33
1144 0.31
1145 0.27
1146 0.23
1147 0.24
1148 0.19
1149 0.2
1150 0.2
1151 0.21
1152 0.27
1153 0.3
1154 0.32
1155 0.35
1156 0.35
1157 0.35
1158 0.4
1159 0.45
1160 0.43
1161 0.42
1162 0.42
1163 0.36
1164 0.35
1165 0.34
1166 0.29
1167 0.23
1168 0.17
1169 0.15
1170 0.14
1171 0.14
1172 0.14
1173 0.11
1174 0.13
1175 0.14
1176 0.17
1177 0.17
1178 0.18
1179 0.17
1180 0.17
1181 0.23
1182 0.22
1183 0.23
1184 0.21
1185 0.23
1186 0.21
1187 0.21
1188 0.2
1189 0.14
1190 0.13
1191 0.1
1192 0.12
1193 0.16
1194 0.2
1195 0.2
1196 0.25
1197 0.26
1198 0.27
1199 0.29
1200 0.27
1201 0.22
1202 0.21
1203 0.19
1204 0.15
1205 0.15
1206 0.14
1207 0.12
1208 0.14
1209 0.11
1210 0.09
1211 0.1
1212 0.1
1213 0.11
1214 0.16
1215 0.17
1216 0.19
1217 0.24
1218 0.29
1219 0.35
1220 0.37
1221 0.38
1222 0.36
1223 0.39
1224 0.43
1225 0.44
1226 0.42
1227 0.37
1228 0.36
1229 0.38
1230 0.41
1231 0.37
1232 0.29
1233 0.25
1234 0.27
1235 0.25
1236 0.24
1237 0.22
1238 0.19
1239 0.25
1240 0.26
1241 0.26
1242 0.3
1243 0.37
1244 0.43
1245 0.44
1246 0.46
1247 0.4
1248 0.39
1249 0.4
1250 0.34
1251 0.28