Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A1PAU0

Protein Details
Accession A0A0A1PAU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-62SPDLKSSKSKSRRPFDVTKYGQHydrophilic
409-430DTDKVKKEKYHLKQMSKLERDQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5mito_nucl 12.5, mito 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MKQILSNLRNLFYGKCSYNNLSRQQLITRITELENELKQLSPDLKSSKSKSRRPFDVTKYGQRRIALKVAYIGWNYYGFSRIRSNNVPTVETELFKALQESNLISSPDDCNFSRAGRTDTDVSGLGQVVALDVRSNQLKTLQQNDAEISEHLPYLRMINSFLPDDIRVLAWAPVPSTFNARFDCISRTYKYFFKKGSLDLDKMIEAGSHLVGSHDFRNFCLIDASRNLPHYERDILSFDINHVEDDFYAVKIRGTGFLWHQVRYIMSILFLVGQKLESPNVVKDLLDINKVPARPGYPLASGKPLVLYDCEYRDIEWIYDKNTKGWPASAIKTHNHFFELWNTNAIKGLLYKECMKMIEDFPVEMDNQSVRVADCLSDFKKNRHQVLLGEGKSIVTKKYINILDLPMSDTDKVKKEKYHLKQMSKLERDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.35
4 0.38
5 0.46
6 0.51
7 0.54
8 0.54
9 0.55
10 0.54
11 0.51
12 0.53
13 0.48
14 0.43
15 0.38
16 0.34
17 0.32
18 0.31
19 0.31
20 0.3
21 0.27
22 0.26
23 0.25
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.19
29 0.24
30 0.26
31 0.31
32 0.39
33 0.44
34 0.51
35 0.58
36 0.65
37 0.7
38 0.74
39 0.77
40 0.78
41 0.82
42 0.79
43 0.8
44 0.79
45 0.79
46 0.78
47 0.74
48 0.7
49 0.64
50 0.59
51 0.53
52 0.53
53 0.43
54 0.36
55 0.34
56 0.33
57 0.34
58 0.31
59 0.26
60 0.2
61 0.2
62 0.19
63 0.16
64 0.18
65 0.14
66 0.16
67 0.23
68 0.24
69 0.3
70 0.35
71 0.39
72 0.41
73 0.43
74 0.41
75 0.35
76 0.39
77 0.35
78 0.3
79 0.26
80 0.22
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.19
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.23
108 0.2
109 0.18
110 0.16
111 0.14
112 0.11
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.13
125 0.18
126 0.21
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.26
133 0.23
134 0.19
135 0.15
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.12
152 0.1
153 0.09
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.18
169 0.19
170 0.21
171 0.2
172 0.23
173 0.22
174 0.24
175 0.25
176 0.3
177 0.33
178 0.35
179 0.32
180 0.33
181 0.33
182 0.33
183 0.39
184 0.38
185 0.35
186 0.31
187 0.3
188 0.25
189 0.23
190 0.2
191 0.11
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.13
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.11
243 0.12
244 0.21
245 0.22
246 0.22
247 0.22
248 0.21
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.11
270 0.12
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.2
277 0.2
278 0.2
279 0.17
280 0.17
281 0.17
282 0.19
283 0.2
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.27
288 0.25
289 0.23
290 0.22
291 0.19
292 0.15
293 0.14
294 0.16
295 0.14
296 0.16
297 0.18
298 0.17
299 0.17
300 0.19
301 0.19
302 0.16
303 0.18
304 0.18
305 0.2
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.29
310 0.31
311 0.27
312 0.27
313 0.28
314 0.27
315 0.3
316 0.33
317 0.34
318 0.35
319 0.39
320 0.4
321 0.36
322 0.33
323 0.3
324 0.26
325 0.31
326 0.32
327 0.28
328 0.31
329 0.3
330 0.28
331 0.29
332 0.28
333 0.19
334 0.15
335 0.19
336 0.16
337 0.19
338 0.22
339 0.22
340 0.24
341 0.24
342 0.24
343 0.24
344 0.23
345 0.27
346 0.24
347 0.22
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.17
352 0.17
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.17
363 0.19
364 0.28
365 0.31
366 0.36
367 0.46
368 0.54
369 0.57
370 0.56
371 0.57
372 0.5
373 0.57
374 0.6
375 0.5
376 0.43
377 0.38
378 0.33
379 0.33
380 0.32
381 0.23
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.28
386 0.3
387 0.29
388 0.31
389 0.33
390 0.33
391 0.32
392 0.32
393 0.25
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.26
398 0.3
399 0.35
400 0.39
401 0.43
402 0.5
403 0.59
404 0.66
405 0.72
406 0.74
407 0.77
408 0.8
409 0.84
410 0.86