Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0RJL1

Protein Details
Accession A0A1X0RJL1    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-56SRGRSYSRGRHSRSYSSRRRSRSYSHydrophilic
63-88DYYRGKRYYHSRSPSPRYRSRSPRGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-42RH
44-44R
48-52SRRRS
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSDRSYSPTRGRSYSTRSSSPHSYYSHSRSGSRGRSYSRGRHSRSYSSRRRSRSYSGRSPSPDYYRGKRYYHSRSPSPRYRSRSPRGGHEGRPDCTVFVGNLSYDTNWYDLKDFMRDAGQVVHVDIMKLSNGKSKGCGIVEYRYPEDAKRAIQMLNEVRFMGRYVYVRYLRGPKGEKNFDSVKEAPEDCRIFVRNLPPNFSWQDLKDLFRKAGRVLHTDVFNDPETRRPNGTGVVIFDNLSDTRHAISTLNGYNLHGNRIEVMQEKFKDVQTDINQVTTSPRSAITAGVATPASTTAAINAYTTNIPPPPPMSSLSDNHYYRSSSSSPPPPPPPPPPPPSTMIEQPMPPSPYQNVHRFGEPVPPPPPVYPGVSLVGGPAADLPTHGHNQIYVNNLPFSTTWQDLIDLFRHVGPVMRAEILVINGYPKGAGYVRFEDAETCQRAIGKIRHTNVLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.62
3 0.6
4 0.58
5 0.62
6 0.64
7 0.6
8 0.59
9 0.51
10 0.51
11 0.52
12 0.56
13 0.57
14 0.52
15 0.49
16 0.49
17 0.56
18 0.58
19 0.57
20 0.57
21 0.54
22 0.6
23 0.67
24 0.7
25 0.71
26 0.73
27 0.72
28 0.75
29 0.76
30 0.77
31 0.8
32 0.81
33 0.81
34 0.81
35 0.84
36 0.83
37 0.83
38 0.79
39 0.79
40 0.79
41 0.78
42 0.78
43 0.76
44 0.77
45 0.75
46 0.74
47 0.71
48 0.67
49 0.65
50 0.61
51 0.61
52 0.62
53 0.63
54 0.6
55 0.6
56 0.62
57 0.64
58 0.68
59 0.69
60 0.69
61 0.73
62 0.8
63 0.83
64 0.82
65 0.81
66 0.79
67 0.81
68 0.81
69 0.8
70 0.8
71 0.73
72 0.74
73 0.75
74 0.74
75 0.7
76 0.7
77 0.67
78 0.6
79 0.6
80 0.51
81 0.41
82 0.35
83 0.3
84 0.19
85 0.15
86 0.14
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.1
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.18
121 0.2
122 0.23
123 0.22
124 0.24
125 0.21
126 0.24
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.27
131 0.27
132 0.25
133 0.26
134 0.24
135 0.21
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.24
141 0.26
142 0.26
143 0.25
144 0.23
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.15
149 0.12
150 0.11
151 0.13
152 0.19
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.31
157 0.31
158 0.35
159 0.36
160 0.36
161 0.43
162 0.49
163 0.46
164 0.44
165 0.45
166 0.41
167 0.43
168 0.38
169 0.31
170 0.28
171 0.28
172 0.24
173 0.27
174 0.26
175 0.2
176 0.22
177 0.22
178 0.19
179 0.22
180 0.28
181 0.29
182 0.3
183 0.34
184 0.32
185 0.34
186 0.35
187 0.34
188 0.28
189 0.21
190 0.26
191 0.23
192 0.25
193 0.25
194 0.25
195 0.25
196 0.24
197 0.24
198 0.19
199 0.22
200 0.23
201 0.22
202 0.24
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.23
207 0.21
208 0.19
209 0.18
210 0.14
211 0.18
212 0.2
213 0.21
214 0.22
215 0.2
216 0.2
217 0.2
218 0.21
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.17
241 0.17
242 0.18
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.17
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.24
258 0.22
259 0.28
260 0.25
261 0.25
262 0.24
263 0.22
264 0.24
265 0.18
266 0.16
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.16
298 0.18
299 0.21
300 0.24
301 0.26
302 0.29
303 0.35
304 0.33
305 0.33
306 0.32
307 0.28
308 0.25
309 0.27
310 0.26
311 0.22
312 0.29
313 0.36
314 0.39
315 0.44
316 0.5
317 0.5
318 0.53
319 0.57
320 0.59
321 0.58
322 0.59
323 0.57
324 0.55
325 0.54
326 0.5
327 0.47
328 0.44
329 0.4
330 0.36
331 0.33
332 0.31
333 0.33
334 0.32
335 0.27
336 0.25
337 0.24
338 0.29
339 0.34
340 0.39
341 0.39
342 0.39
343 0.4
344 0.4
345 0.38
346 0.4
347 0.36
348 0.35
349 0.32
350 0.33
351 0.33
352 0.32
353 0.34
354 0.27
355 0.28
356 0.24
357 0.24
358 0.24
359 0.22
360 0.21
361 0.17
362 0.16
363 0.12
364 0.1
365 0.08
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.09
370 0.12
371 0.14
372 0.15
373 0.14
374 0.16
375 0.18
376 0.21
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.24
381 0.24
382 0.24
383 0.22
384 0.23
385 0.22
386 0.21
387 0.2
388 0.19
389 0.21
390 0.2
391 0.23
392 0.2
393 0.17
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.18
399 0.16
400 0.17
401 0.17
402 0.17
403 0.16
404 0.16
405 0.18
406 0.15
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.11
415 0.12
416 0.15
417 0.2
418 0.24
419 0.27
420 0.28
421 0.28
422 0.27
423 0.29
424 0.34
425 0.32
426 0.28
427 0.26
428 0.27
429 0.29
430 0.35
431 0.37
432 0.39
433 0.45
434 0.47