Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0SBV6

Protein Details
Accession A0A1X0SBV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MKRKKDDDPPPPKAKRNKGKGVPFFVCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-20RKKDDDPPPPKAKRNKGK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010095  Transposase_IS605_OrfB_C  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0032196  P:transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF07282  OrfB_Zn_ribbon  
Amino Acid Sequences MKRKKDDDPPPPKAKRNKGKGVPFFVCTNANKFIQLMFKTYINKQKGTQEIAKRPFDNSKKYGTSSTAGAKNQNPNKSKHAPLPPADLPSSSQQKRITASGNSSFCSSIKGKRAAPTRRITEEIKRKCKQSNGETEFISVDEYLTSQICNKCKSKQLNNISIIGSKRRVYSVLKCKSCGTVWNRDVNSALNIYGIFVYKSKHDNESPPPFKRPSKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.85
3 0.85
4 0.86
5 0.85
6 0.88
7 0.87
8 0.86
9 0.78
10 0.71
11 0.62
12 0.54
13 0.5
14 0.42
15 0.37
16 0.33
17 0.3
18 0.27
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.26
23 0.25
24 0.23
25 0.26
26 0.29
27 0.35
28 0.42
29 0.39
30 0.4
31 0.39
32 0.44
33 0.46
34 0.49
35 0.51
36 0.51
37 0.56
38 0.61
39 0.63
40 0.57
41 0.55
42 0.58
43 0.56
44 0.55
45 0.48
46 0.48
47 0.46
48 0.47
49 0.46
50 0.4
51 0.35
52 0.3
53 0.33
54 0.31
55 0.29
56 0.31
57 0.32
58 0.38
59 0.43
60 0.48
61 0.45
62 0.44
63 0.51
64 0.52
65 0.52
66 0.51
67 0.53
68 0.51
69 0.5
70 0.53
71 0.47
72 0.44
73 0.41
74 0.33
75 0.27
76 0.26
77 0.32
78 0.26
79 0.29
80 0.28
81 0.3
82 0.31
83 0.31
84 0.29
85 0.22
86 0.26
87 0.27
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.23
92 0.19
93 0.21
94 0.19
95 0.17
96 0.22
97 0.25
98 0.26
99 0.31
100 0.4
101 0.43
102 0.49
103 0.51
104 0.5
105 0.49
106 0.51
107 0.48
108 0.48
109 0.52
110 0.54
111 0.58
112 0.56
113 0.56
114 0.57
115 0.6
116 0.6
117 0.58
118 0.59
119 0.55
120 0.55
121 0.52
122 0.48
123 0.42
124 0.33
125 0.26
126 0.14
127 0.09
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.1
134 0.14
135 0.17
136 0.23
137 0.25
138 0.29
139 0.37
140 0.46
141 0.52
142 0.58
143 0.64
144 0.68
145 0.68
146 0.66
147 0.58
148 0.53
149 0.45
150 0.39
151 0.34
152 0.27
153 0.25
154 0.24
155 0.26
156 0.27
157 0.35
158 0.42
159 0.48
160 0.49
161 0.5
162 0.5
163 0.51
164 0.47
165 0.46
166 0.41
167 0.42
168 0.43
169 0.5
170 0.49
171 0.47
172 0.47
173 0.4
174 0.37
175 0.27
176 0.22
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.14
186 0.19
187 0.21
188 0.27
189 0.3
190 0.37
191 0.46
192 0.55
193 0.6
194 0.61
195 0.64
196 0.65