Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X0RXC6

Protein Details
Accession A0A1X0RXC6    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27GPEQQQQQQQQQQQQKQQQQQQQAVPHydrophilic
388-412KEGGDDDKPKKKKKKDQGGISARYMBasic
505-528ADDQPRGRGRPKRRKSGSGPDVPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
395-402KPKKKKKK
510-533RGRGRPKRRKSGSGPDVPAVKKPK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MGPEQQQQQQQQQQQQKQQQQQQQAVPSVSEQQSRVIAPQGLMNPAMTPQPRPSAAAGGNINRKVKIGVLKVIRTGSSSMTLFDNLTSQLTPERKERFIELFKKLQSNSVTANQFLAQARLLLDQQQYQQLENLKNKPVQPMMPRPISIQPQTSQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQQQQQLDYNALKRTMSGTQLRPEDAHQRAILQPQLKRADIPIPQQQQPQQQPVPIYRSNTAPPSTIDHQHIGMQPDTIDPAIKNETDGEQISIVQDFMNLDILKGLIAKISASLDTVNVQPEVYSMIALATQERIQKLIKDMIEASKYRMDSQTFTQPPPDETGRYPYKIVDVQDVKKQLLAIERVEREEERRRREYISERERRSQMGDDDKEGGDDDKPKKKKKKDQGGISARYMSDDVRNKSTNETALMIAGGVKKSWMLTGLAGGTKDMPPFTPSRPPASSPPNNLPPSSTAAAPTNASSPTGGQIQSPTLFQHPTISSPMSPPDADDQPRGRGRPKRRKSGSGPDVPAVKKPKAFRDGLFLPPSTIGRPQHRFFGEQGVRKVTVRDALFVLEDEYENKKEYAPRTLLKTYTCYLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.81
4 0.82
5 0.83
6 0.82
7 0.81
8 0.8
9 0.76
10 0.73
11 0.68
12 0.59
13 0.51
14 0.44
15 0.42
16 0.38
17 0.35
18 0.3
19 0.28
20 0.29
21 0.3
22 0.3
23 0.26
24 0.25
25 0.21
26 0.26
27 0.25
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.18
32 0.17
33 0.23
34 0.19
35 0.2
36 0.22
37 0.28
38 0.29
39 0.31
40 0.32
41 0.33
42 0.33
43 0.36
44 0.36
45 0.37
46 0.44
47 0.46
48 0.46
49 0.4
50 0.39
51 0.34
52 0.34
53 0.34
54 0.31
55 0.34
56 0.39
57 0.41
58 0.43
59 0.44
60 0.4
61 0.34
62 0.31
63 0.25
64 0.23
65 0.21
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.17
77 0.19
78 0.22
79 0.28
80 0.33
81 0.33
82 0.36
83 0.4
84 0.41
85 0.47
86 0.52
87 0.5
88 0.52
89 0.53
90 0.57
91 0.52
92 0.51
93 0.44
94 0.4
95 0.38
96 0.39
97 0.37
98 0.31
99 0.32
100 0.27
101 0.28
102 0.25
103 0.22
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.25
114 0.24
115 0.23
116 0.26
117 0.28
118 0.33
119 0.38
120 0.41
121 0.4
122 0.43
123 0.44
124 0.46
125 0.44
126 0.43
127 0.43
128 0.48
129 0.5
130 0.5
131 0.49
132 0.46
133 0.49
134 0.48
135 0.44
136 0.38
137 0.32
138 0.36
139 0.38
140 0.42
141 0.41
142 0.41
143 0.47
144 0.51
145 0.57
146 0.6
147 0.66
148 0.68
149 0.71
150 0.73
151 0.71
152 0.7
153 0.72
154 0.7
155 0.7
156 0.67
157 0.66
158 0.67
159 0.68
160 0.68
161 0.66
162 0.66
163 0.63
164 0.64
165 0.59
166 0.53
167 0.48
168 0.42
169 0.39
170 0.33
171 0.3
172 0.26
173 0.24
174 0.22
175 0.19
176 0.21
177 0.19
178 0.22
179 0.24
180 0.25
181 0.3
182 0.32
183 0.33
184 0.31
185 0.31
186 0.34
187 0.3
188 0.3
189 0.24
190 0.24
191 0.25
192 0.27
193 0.29
194 0.25
195 0.25
196 0.29
197 0.32
198 0.3
199 0.29
200 0.28
201 0.3
202 0.29
203 0.32
204 0.33
205 0.34
206 0.37
207 0.4
208 0.43
209 0.45
210 0.46
211 0.48
212 0.41
213 0.39
214 0.39
215 0.38
216 0.4
217 0.34
218 0.33
219 0.27
220 0.28
221 0.28
222 0.29
223 0.27
224 0.22
225 0.2
226 0.23
227 0.25
228 0.26
229 0.26
230 0.24
231 0.23
232 0.25
233 0.27
234 0.23
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.1
241 0.08
242 0.06
243 0.08
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.14
301 0.18
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.21
313 0.19
314 0.18
315 0.2
316 0.28
317 0.27
318 0.27
319 0.29
320 0.27
321 0.27
322 0.29
323 0.28
324 0.2
325 0.19
326 0.26
327 0.26
328 0.27
329 0.26
330 0.22
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.24
335 0.25
336 0.26
337 0.3
338 0.32
339 0.29
340 0.27
341 0.26
342 0.2
343 0.2
344 0.2
345 0.18
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.23
351 0.24
352 0.32
353 0.36
354 0.38
355 0.41
356 0.42
357 0.43
358 0.48
359 0.52
360 0.53
361 0.57
362 0.59
363 0.59
364 0.64
365 0.63
366 0.58
367 0.52
368 0.46
369 0.4
370 0.4
371 0.37
372 0.33
373 0.34
374 0.32
375 0.29
376 0.26
377 0.21
378 0.13
379 0.19
380 0.23
381 0.3
382 0.38
383 0.47
384 0.57
385 0.66
386 0.75
387 0.79
388 0.84
389 0.85
390 0.88
391 0.89
392 0.89
393 0.84
394 0.75
395 0.67
396 0.55
397 0.46
398 0.36
399 0.26
400 0.24
401 0.26
402 0.27
403 0.3
404 0.32
405 0.32
406 0.34
407 0.36
408 0.3
409 0.25
410 0.23
411 0.18
412 0.16
413 0.15
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.13
434 0.11
435 0.1
436 0.12
437 0.15
438 0.19
439 0.27
440 0.28
441 0.34
442 0.37
443 0.39
444 0.44
445 0.51
446 0.54
447 0.51
448 0.57
449 0.59
450 0.58
451 0.55
452 0.5
453 0.42
454 0.41
455 0.36
456 0.28
457 0.21
458 0.22
459 0.23
460 0.22
461 0.2
462 0.16
463 0.15
464 0.15
465 0.13
466 0.12
467 0.13
468 0.15
469 0.14
470 0.13
471 0.14
472 0.17
473 0.17
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.17
479 0.21
480 0.19
481 0.21
482 0.24
483 0.25
484 0.23
485 0.24
486 0.27
487 0.24
488 0.23
489 0.22
490 0.23
491 0.27
492 0.29
493 0.34
494 0.34
495 0.39
496 0.44
497 0.45
498 0.48
499 0.52
500 0.6
501 0.65
502 0.72
503 0.75
504 0.78
505 0.85
506 0.85
507 0.87
508 0.86
509 0.84
510 0.79
511 0.72
512 0.7
513 0.62
514 0.6
515 0.55
516 0.49
517 0.45
518 0.46
519 0.51
520 0.52
521 0.55
522 0.49
523 0.52
524 0.52
525 0.54
526 0.52
527 0.43
528 0.37
529 0.36
530 0.36
531 0.29
532 0.31
533 0.3
534 0.36
535 0.43
536 0.43
537 0.5
538 0.51
539 0.51
540 0.47
541 0.51
542 0.5
543 0.49
544 0.52
545 0.49
546 0.48
547 0.46
548 0.46
549 0.38
550 0.38
551 0.32
552 0.29
553 0.25
554 0.25
555 0.25
556 0.23
557 0.21
558 0.15
559 0.15
560 0.15
561 0.19
562 0.19
563 0.21
564 0.21
565 0.23
566 0.28
567 0.31
568 0.38
569 0.4
570 0.43
571 0.49
572 0.54
573 0.54
574 0.51
575 0.53